CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh10G002410
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	Cmo_Chr10:1076404..1077789
RNA-Seq Expression	CmoCh10G002410
Synteny	CmoCh10G002410
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

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GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6589539.1 hypothetical protein SDJN03_14962, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7023227.1 hypothetical protein SDJN02_14252 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

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XP_022921503.1 uncharacterized protein LOC111429751 [Cucurbita moschata]

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XP_022988462.1 uncharacterized protein LOC111485701 [Cucurbita maxima]

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XP_023515520.1 uncharacterized protein LOC111779653 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

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Alignment

A0A1S3BLN6 uncharacterized protein LOC103491201

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A0A6J1C336 uncharacterized protein LOC111007492 isoform X1

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A0A6J1C568 uncharacterized protein LOC111007492 isoform X2

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A0A6J1E431 uncharacterized protein LOC111429751

4.4e-82

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A0A6J1JD30 uncharacterized protein LOC111485701

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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G07950.1 unknown protein

2.4e-35

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        M    F  P S    S S S+ + S SP    S +RLWRP+AQRN+RNQWS LS+ +QQW  + S GRSHAT +VN+YLSQKYMP MELG LSDM DI  
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        KA  KL  QQ              V VVV+MVN  R +RCY K  S+ +LIQFS + ED  S DAGD GGI VF    +  F
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Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGCTCAGCATTTCTCTACGCCTCCTTCTAAAGGAGCTATTTCGAAATCTGGCAGCATTACAACACCAAGCTCGTCGCCTCTACTTCCTTCTGTTATAAGGTTATG
GCGGCCATCAGCGCAAAGGAACATTCGGAATCAGTGGTCGAAGTTGTCTTCACTCAAACAACAATGGGCTTCTTCTTCCTCTACCGGGCGATCTCATGCTACATCTGTTG
TCAATGCCTATCTATCACAAAAGTATATGCCTTCTATGGAGCTAGGTTCTCTCAGCGACATGCTTGATATACGAAATAAAGCTTGTTTAAAATTGTCTAAGCAGCAGGTT
GATGTTGTAGTTCAGATGGTCAACACTTGCAGATTGATGAGATGTTATTTCAAGGGAACAAGTAGTAGCACGCTCATACAATTTTCCACTAGCTTTGAGGACAATCAAAG
TGAAGATGCTGGAGATGGTGGTGGCATCTCCGTATTTACATCATTGGCAATCCCTTGCTTTGGTGCGTATGAAGTTTCTAAGACCTCATTAATCAGGCTTGCACTTTTGA
GTTCGTATGAATGA

mRNA sequence

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CCGCACTTCAATTGCCTCGACGACCGGACAAAAAGCCTGATCGCCATGGAGGCTCAGCATTTCTCTACGCCTCCTTCTAAAGGAGCTATTTCGAAATCTGGCAGCATTAC
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GGGCTTCTTCTTCCTCTACCGGGCGATCTCATGCTACATCTGTTGTCAATGCCTATCTATCACAAAAGTATATGCCTTCTATGGAGCTAGGTTCTCTCAGCGACATGCTT
GATATACGAAATAAAGCTTGTTTAAAATTGTCTAAGCAGCAGGTTGATGTTGTAGTTCAGATGGTCAACACTTGCAGATTGATGAGATGTTATTTCAAGGGAACAAGTAG
TAGCACGCTCATACAATTTTCCACTAGCTTTGAGGACAATCAAAGTGAAGATGCTGGAGATGGTGGTGGCATCTCCGTATTTACATCATTGGCAATCCCTTGCTTTGGTG
CGTATGAAGTTTCTAAGACCTCATTAATCAGGCTTGCACTTTTGAGTTCGTATGAATGA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

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DVVVQMVNTCRLMRCYFKGTSSSTLIQFSTSFEDNQSEDAGDGGGISVFTSLAIPCFGAYEVSKTSLIRLALLSSYE

CmoCh10G002410 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome