; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh10G005380 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh10G005380
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionSerine-rich protein-like protein
Genome locationCmo_Chr10:2430988..2431608
RNA-Seq ExpressionCmoCh10G005380
SyntenyCmoCh10G005380
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7023479.1 hypothetical protein SDJN02_14504, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.0e-9898.09Show/hide
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XP_023516526.1 putative protein TPRXL [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-9798.07Show/hide
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XP_038879100.1 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like [Benincasa hispida]8.3e-8489.37Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C124 uncharacterized protein DDB_G0271670-like8.4e-8286.96Show/hide
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A0A6J1F5M8 uncharacterized protein LOC1114410573.8e-8287.86Show/hide
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A0A6J1H8W9 uncharacterized protein LOC1114615682.8e-101100Show/hide
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A0A6J1HNK6 uncharacterized protein LOC1114659174.1e-8187.38Show/hide
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A0A6J1JI11 uncharacterized serine-rich protein C215.13-like1.9e-9496.15Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G67910.1 unknown protein5.7e-0643.75Show/hide
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        H +     G   + ++ S  K  CLCSPTTHPGSFRC +H+ +  Q T
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AT5G11090.1 serine-rich protein-related4.0e-4456.16Show/hide
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        S  KS+GPV+RS SPSGRFC  YS +  S  SSSSAFASSTSS  +   ++FF             RS SP+RV+L   ++   + S R++LD RSISP 
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        N+ ISV      NQ         R C+CSPTTHPGSFRCSLHK V +   Q T  Y++N LN RRSAMTNSLVRIGGVEG+ VRRAL +LIRPSSH  +R
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        RA + PRPSRLSIM+KAD+
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AT5G20370.1 serine-rich protein-related1.5e-1136.57Show/hide
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        A+  SS S   P S  +R  +    H +  S S    ++   L +  SP      SV+T    +Q        KR CLCSPTTHPGSFRCS H+ +  + 
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AT5G25280.1 serine-rich protein-related1.7e-4253.46Show/hide
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        + PR SRL+ MSKA+DL
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AT5G25280.2 serine-rich protein-related1.7e-4253.46Show/hide
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        ++R +    +RS SPSGRFC  YS+   SS  SSS FASSTSS  +   T+FF           RS SP+RV+L  S+  T   S R+++D RSISPNR 
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        + PR SRL+ MSKA+DL
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGTTTCTTCTAGAAAATCGAGCGGCCCTGTTATGAGGTCTCTCTCACCTTCTGGGAGATTCTGTCGCTCCTATTCTTCTTCTTCTTCTTCTTCTTTTTCTTCCTC
ATCGGCGTTTGCGTCCTCCACATCAAGCTTTTCCACTGAAAACCCTACTTCCTTTTTCCGTAGATCTCTGTCTCCGTCTCGTGTTCATCTACAAGGTTCTTCTTCTTCTA
CGTCGGCGTCGTCCGTGAGATTTGCACTGGACCGGTCTATTTCTCCGAATCGGCATATCTCTGTTTTGACTCGTGGCGGTGGGAATCAAGTAGTGAAGAGGCAGAGCAAC
CAGAAGAGGACGTGCTTGTGCTCTCCGACCACGCATCCTGGTTCGTTTCGGTGTAGTCTCCATAAAGGCGTTCCGTCGCAGCCTACGACTCCTTACTCGTCTAATCGGCT
CAACGCGCGGAGATCGGCGATGACGAACTCTTTGGTTAGAATCGGAGGAGTTGAAGGCGATTTAGTGAGGCGGGCCCTGGCGTCTCTCATTCGACCTTCGTCTCACAGCC
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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QKRTCLCSPTTHPGSFRCSLHKGVPSQPTTPYSSNRLNARRSAMTNSLVRIGGVEGDLVRRALASLIRPSSHSQRRRADFCPRPSRLSIMSKADDL