; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh10G007080 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh10G007080
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionLeucine-rich repeat family protein / extensin family protein
Genome locationCmo_Chr10:3249917..3251146
RNA-Seq ExpressionCmoCh10G007080
SyntenyCmoCh10G007080
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001611 - Leucine-rich repeat
IPR013210 - Leucine-rich repeat-containing N-terminal, plant-type
IPR032675 - Leucine-rich repeat domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589963.1 Leucine-rich repeat extensin-like protein 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.9e-23198.53Show/hide
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XP_022960570.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Cucurbita moschata]1.7e-234100Show/hide
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XP_022987724.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Cucurbita maxima]3.2e-22898.05Show/hide
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XP_023515395.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.3e-22697.31Show/hide
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XP_038878651.1 leucine-rich repeat extensin-like protein 6 [Benincasa hispida]3.4e-19885.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BQ04 leucine-rich repeat extensin-like protein 41.2e-19180.82Show/hide
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A0A5D3CI93 Leucine-rich repeat extensin-like protein 45.2e-19281.06Show/hide
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        FP +T L+FF+LTN+P T+SF V +NGGIG+GVTIGGGGGG G  VWIGGNNG  TPRLNRAYTALQ+WKSAITSDPLGIL +WVGPNVCSY+GVFCAQV
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        CGTL    ++D SSS P
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A0A6J1EUL1 leucine-rich repeat extensin-like protein 41.4e-19280.66Show/hide
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        NFPI+TCL+FFLLTN  ATE+F V       +NGGIG+G+TIG GGG G   VWIGGN     +GP TPRLNR Y ALQAWKSAITSDPLGIL SWVGPN
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        VCSYKGVFCAQV+DE TSS VDIIAGIDLNHANLAGTLV +LS+LTEITLFHLNSNRFSGTVP++F++MSSLQELDLSNN+FSGPFPI TLYIPNLVYLD
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Query:  LRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNS
        LRFNDF GPIPED+FNKKLDAIFLNNNHF+GELPQNLGNSPASVINLANNKLSGN+PTGF +LGS+L+EIL LNNQLTGCIPEG GLFSEMQV D+SFNS
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        LMGHLPDTLSCLN+IQI+N GHNRLSGVLPDLICSLK+LVNLTVSFNFFSG+SQECS   LGNLGFDF+GNCIPGR+MQRP PECS+ P  GSLNCLR+ 
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            PLVCGTLA++ D+D  SSSP
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A0A6J1H9G2 leucine-rich repeat extensin-like protein 68.4e-235100Show/hide
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A0A6J1JJN8 leucine-rich repeat extensin-like protein 61.5e-22898.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O48809 Leucine-rich repeat extensin-like protein 24.8e-8648.48Show/hide
Query:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF
        + P L +AY ALQ+WK AI SDP     +W G +VCSY G+FCA      +S    ++AGIDLNHA++AG L  EL  LT++ LFHLNSNRF G VP +F
Subjt:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF

Query:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST
        K M  L ELDLSNN F G FP   L +P+L +LDLR+N+F G IP  LF+K+LDAIFLN+N F   +P+N+GNSP S + LA+N L G +P    L+G T
Subjt:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST

Query:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGF
        L EI+L N+ LTGC+P   G    + V D+SFN L G LP ++  +  ++ +N+ +NR +GV+P  IC L NL N T S NFF+G +  C      N+  
Subjt:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGF

Query:  DFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNC
        + + NCI G++ QR   ECS  PA+ S++C
Subjt:  DFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNC

Q9LHF1 Leucine-rich repeat extensin-like protein 45.1e-8848.12Show/hide
Query:  GGGGASVWIGGNNGPQTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLF
        G  G +V +  +   + PRL  AY ALQAWK AI SDP  I  +W+G NVC+Y GVFC++  D   +  +  +AGIDLNHA++AG L  EL  LT++ LF
Subjt:  GGGGASVWIGGNNGPQTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLF

Query:  HLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNK
        H+NSNRF GTVP  FK++  L ELDLSNN F+G FP   L++P+L +LDLRFN+F G +P++LF+K LDAIF+N+N F  ELP+N G+SP SVI LANN 
Subjt:  HLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNK

Query:  LSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSG
          G +PT    +   L EI+ +NN L  C+P   G    + V D+SFN L+G LP+++  + E++ +N+ HN LSG +P  IC L  L N T S+NFF+G
Subjt:  LSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSG

Query:  LSQECSRQSLGNLGFDFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNC
         +  C R S     FD   NC+PGR  QR   +CS F +  S++C
Subjt:  LSQECSRQSLGNLGFDFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNC

Q9LUI1 Leucine-rich repeat extensin-like protein 64.6e-8946.88Show/hide
Query:  PRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKE
        PRL +A+TALQAWK  ITSDP G   +W GPNVC+Y GVFCA   D   +  V  +AGIDLNHAN+AG L  EL  LT++ LFH+NSNRF G +P++ K 
Subjt:  PRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKE

Query:  MSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGN-LPTGFSLLGSTL
        +  L ELD+SNN  SG FP     +P+L +LD+RFN+F G +P  LF+  LDA+F+N+N F+  LP+N+GNSP SV+ LANN L G+ +P  F  +G TL
Subjt:  MSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGN-LPTGFSLLGSTL

Query:  REILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGFD
         EI++ N+QLTGC+    GL +++ V D+S+N+L+G LP+T+  +  ++ +N+ HN+ SG +P+ IC L  L N T S+NFFSG    C R       FD
Subjt:  REILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGFD

Query:  FTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNCLRIPLVCGTLADSPDTDPSSSSP
           NC+P R MQR   EC  F +         P+ C +   SP + P    P
Subjt:  FTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNCLRIPLVCGTLADSPDTDPSSSSP

Q9SN46 Leucine-rich repeat extensin-like protein 54.1e-8545.98Show/hide
Query:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF
        + PRL  AY ALQAWK AI SDP     +W+G +VCSY GV+CA   D   +  +  +AGIDLNHA++AG L  EL  LT++ LFH+NSNRF GTVP  F
Subjt:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF

Query:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST
          +  L ELDLSNN F+G FP   L +P+L +LDLRFN+F GP+P +LF+K LDAIF+N+N F  ELP NLG+SP SVI +ANN   G +PT    +   
Subjt:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST

Query:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGF
        L EI+ + N    C+P   G    + V D SFN L+G LP ++  +  ++ +N+ HNR SG +P  IC L  L N T S+NFF+G    C    LG  GF
Subjt:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGF

Query:  DFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPA-----AGSLNC---LRIPLVCGTLADSPDTDPSSSSP
        D   NC+P R  QR   +C+ F +      GS  C    R P+V  +   +P    S  SP
Subjt:  DFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPA-----AGSLNC---LRIPLVCGTLADSPDTDPSSSSP

Q9T0K5 Leucine-rich repeat extensin-like protein 34.1e-8547.27Show/hide
Query:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF
        + PRL  AY ALQAWK AI SDP     +W+G NVC+Y GVFC+   D   +  +  +AGIDLNHA++AG L  EL  L+++ LFH+NSNRF GTVP  F
Subjt:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF

Query:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST
          +  L ELDLSNN F+G FP   L +P+L +LDLRFN+F G +P++LF+K LDAIF+N+N F  ELP+N G+SP SVI LANN+  G +P+    +   
Subjt:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST

Query:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGF
        L EI+ +NN L  C+P   G    + V D+SFN L+G LP+++  +  ++ +N+ HN LSG +P  IC L  L N T S+NFF+G +  C R       F
Subjt:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGF

Query:  DFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNC
        D   NC+PGR  QR   +C  F +   +NC
Subjt:  DFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNC

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G62440.1 leucine-rich repeat/extensin 23.4e-8748.48Show/hide
Query:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF
        + P L +AY ALQ+WK AI SDP     +W G +VCSY G+FCA      +S    ++AGIDLNHA++AG L  EL  LT++ LFHLNSNRF G VP +F
Subjt:  QTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESF

Query:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST
        K M  L ELDLSNN F G FP   L +P+L +LDLR+N+F G IP  LF+K+LDAIFLN+N F   +P+N+GNSP S + LA+N L G +P    L+G T
Subjt:  KEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGST

Query:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGF
        L EI+L N+ LTGC+P   G    + V D+SFN L G LP ++  +  ++ +N+ +NR +GV+P  IC L NL N T S NFF+G +  C      N+  
Subjt:  LREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGF

Query:  DFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNC
        + + NCI G++ QR   ECS  PA+ S++C
Subjt:  DFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNC

AT2G19780.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein1.8e-13361.06Show/hide
Query:  FFLLTNTPATESFVVDINGGIGIGVTIGGGGGGGGASVWIGGNNGPQTP--------RLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQV
        F LL+ +      ++     IG+GV IGGG G  G  VWIGG N    P          N AY ALQ+WKSAIT DP G+L++WVG +VCSY+GVFC   
Subjt:  FFLLTNTPATESFVVDINGGIGIGVTIGGGGGGGGASVWIGGNNGPQTP--------RLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQV

Query:  EDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPE
           S SS    I  IDLN ANL GT+V +LS L+++T+ HLNSNRFSG +P+SFK + SLQELDLSNN FSG FP  TLYIPNLVYLDLRFN+F G IPE
Subjt:  EDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPE

Query:  DLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCL
        +LFNK+LDAI LNNN F GE+P NLG S ASVINLANNKLSG +PT F + GS L+E+L LNNQLTGCIPE  GLFS+++V D+SFNSLMGH+PDT+SCL
Subjt:  DLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCL

Query:  NEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGFDFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNCLRI---PLVCGTLA
        +EI+++NLGHN+ SG LPDL+C+L+NL+NLTVSFNFFSG S +CS  S   +GFDFTGNCIPG+  QRP+P+CS  P  G L+C RI   PL C  ++
Subjt:  NEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGFDFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNCLRI---PLVCGTLA

AT3G22800.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein3.3e-9046.88Show/hide
Query:  PRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKE
        PRL +A+TALQAWK  ITSDP G   +W GPNVC+Y GVFCA   D   +  V  +AGIDLNHAN+AG L  EL  LT++ LFH+NSNRF G +P++ K 
Subjt:  PRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKE

Query:  MSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGN-LPTGFSLLGSTL
        +  L ELD+SNN  SG FP     +P+L +LD+RFN+F G +P  LF+  LDA+F+N+N F+  LP+N+GNSP SV+ LANN L G+ +P  F  +G TL
Subjt:  MSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGN-LPTGFSLLGSTL

Query:  REILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGFD
         EI++ N+QLTGC+    GL +++ V D+S+N+L+G LP+T+  +  ++ +N+ HN+ SG +P+ IC L  L N T S+NFFSG    C R       FD
Subjt:  REILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGFD

Query:  FTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNCLRIPLVCGTLADSPDTDPSSSSP
           NC+P R MQR   EC  F +         P+ C +   SP + P    P
Subjt:  FTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNCLRIPLVCGTLADSPDTDPSSSSP

AT3G24480.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein3.6e-8948.12Show/hide
Query:  GGGGASVWIGGNNGPQTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLF
        G  G +V +  +   + PRL  AY ALQAWK AI SDP  I  +W+G NVC+Y GVFC++  D   +  +  +AGIDLNHA++AG L  EL  LT++ LF
Subjt:  GGGGASVWIGGNNGPQTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLF

Query:  HLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNK
        H+NSNRF GTVP  FK++  L ELDLSNN F+G FP   L++P+L +LDLRFN+F G +P++LF+K LDAIF+N+N F  ELP+N G+SP SVI LANN 
Subjt:  HLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNK

Query:  LSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSG
          G +PT    +   L EI+ +NN L  C+P   G    + V D+SFN L+G LP+++  + E++ +N+ HN LSG +P  IC L  L N T S+NFF+G
Subjt:  LSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTLSCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSG

Query:  LSQECSRQSLGNLGFDFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNC
         +  C R S     FD   NC+PGR  QR   +CS F +  S++C
Subjt:  LSQECSRQSLGNLGFDFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNC

AT4G29240.1 Leucine-rich repeat (LRR) family protein2.2e-13459.6Show/hide
Query:  LVFFLLTNTPATESFVVDINGGIGIGVTIGGGGGGGGASVWIGG--NNG------PQTPRLNR-AYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFC
        L FFL             + GG+G+G  IGGGGGGGG  VW+GG  NNG      P +   NR AY ALQ WKSA+  DP  +L++WVG +VCSYKGVFC
Subjt:  LVFFLLTNTPATESFVVDINGGIGIGVTIGGGGGGGGASVWIGG--NNG------PQTPRLNR-AYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFC

Query:  AQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGP
        +             I  IDLNHANL GTLV +L+ L+++ + HLNSNRFSG +P+SFK ++SLQELDLSNN  SGPFP+ TLYIPNLVYLDLRFN   G 
Subjt:  AQVEDESTSSLVDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGP

Query:  IPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTL
        IPE+LFNK+LDAI LNNN F GE+P+NLGNSPASVINLANN+ SG +PT F L GS ++E+LLLNNQLTGCIPE  G+FSE++V D+S+N+LMGH+PDT+
Subjt:  IPEDLFNKKLDAIFLNNNHFEGELPQNLGNSPASVINLANNKLSGNLPTGFSLLGSTLREILLLNNQLTGCIPEGFGLFSEMQVLDMSFNSLMGHLPDTL

Query:  SCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGFDFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNCLRI---PLVCGTL
        SCL+ I+I+NL HN+ SG +PDL+CSL+NL+NLTV+FNFFSG S ECS  S  + GFDF GNCIPGR+ QRP+P+CS + + G+++C RI   PL C  +
Subjt:  SCLNEIQIMNLGHNRLSGVLPDLICSLKNLVNLTVSFNFFSGLSQECSRQSLGNLGFDFTGNCIPGRDMQRPRPECSVFPAAGSLNCLRI---PLVCGTL

Query:  A
        +
Subjt:  A


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACTTCCCAATCGTCACTTGTCTCGTCTTCTTCCTCCTCACAAACACCCCTGCAACTGAAAGCTTCGTAGTAGACATCAATGGCGGAATCGGAATCGGCGTCACCAT
CGGCGGCGGTGGCGGAGGAGGAGGAGCAAGCGTTTGGATTGGGGGAAACAATGGACCCCAGACGCCGAGACTGAACAGAGCTTACACCGCACTCCAAGCATGGAAATCTG
CCATTACAAGCGATCCATTAGGGATTTTACGAAGTTGGGTCGGCCCCAATGTGTGTTCTTACAAAGGGGTTTTTTGTGCACAAGTTGAAGACGAATCAACGTCGTCCCTC
GTCGACATTATCGCCGGAATCGACCTGAATCACGCCAATCTCGCAGGTACTCTCGTGACAGAGCTCTCGTTTCTCACCGAAATCACTCTGTTTCATCTCAACAGCAACCG
ATTTTCCGGCACTGTGCCGGAATCCTTTAAAGAAATGTCGTCACTTCAAGAATTAGACCTCAGCAACAACATGTTTTCAGGTCCATTTCCGATTGCCACATTATACATTC
CAAATCTGGTGTATTTAGACCTGAGATTCAACGATTTCCACGGCCCAATTCCTGAAGATCTCTTCAACAAAAAACTAGATGCAATTTTCCTCAATAACAACCATTTCGAA
GGCGAACTCCCTCAAAACCTGGGGAATTCCCCTGCTTCTGTGATTAATCTAGCTAACAACAAGCTAAGTGGAAATCTCCCAACTGGGTTTAGCCTCTTGGGTTCGACACT
GAGAGAAATCCTGCTTTTAAACAACCAATTAACAGGGTGTATTCCTGAAGGATTCGGGCTTTTCTCTGAAATGCAAGTGTTGGATATGAGCTTCAATTCGTTAATGGGTC
ATTTGCCGGACACTCTGTCTTGTTTAAACGAAATCCAGATCATGAATTTGGGGCACAACAGGCTTTCTGGTGTTCTTCCGGATTTGATCTGTTCGTTGAAAAACTTGGTG
AATCTGACGGTTTCTTTCAATTTCTTTTCTGGGTTGAGCCAAGAATGTTCGCGCCAATCTCTTGGGAATCTGGGCTTTGATTTCACGGGAAATTGCATTCCTGGACGGGA
CATGCAGAGGCCTCGCCCTGAATGCTCTGTTTTTCCTGCTGCTGGGAGCTTGAACTGCCTTAGAATACCTCTTGTTTGTGGGACACTGGCTGATAGCCCAGACACTGATC
CCAGTTCTTCATCGCCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAACTTCCCAATCGTCACTTGTCTCGTCTTCTTCCTCCTCACAAACACCCCTGCAACTGAAAGCTTCGTAGTAGACATCAATGGCGGAATCGGAATCGGCGTCACCAT
CGGCGGCGGTGGCGGAGGAGGAGGAGCAAGCGTTTGGATTGGGGGAAACAATGGACCCCAGACGCCGAGACTGAACAGAGCTTACACCGCACTCCAAGCATGGAAATCTG
CCATTACAAGCGATCCATTAGGGATTTTACGAAGTTGGGTCGGCCCCAATGTGTGTTCTTACAAAGGGGTTTTTTGTGCACAAGTTGAAGACGAATCAACGTCGTCCCTC
GTCGACATTATCGCCGGAATCGACCTGAATCACGCCAATCTCGCAGGTACTCTCGTGACAGAGCTCTCGTTTCTCACCGAAATCACTCTGTTTCATCTCAACAGCAACCG
ATTTTCCGGCACTGTGCCGGAATCCTTTAAAGAAATGTCGTCACTTCAAGAATTAGACCTCAGCAACAACATGTTTTCAGGTCCATTTCCGATTGCCACATTATACATTC
CAAATCTGGTGTATTTAGACCTGAGATTCAACGATTTCCACGGCCCAATTCCTGAAGATCTCTTCAACAAAAAACTAGATGCAATTTTCCTCAATAACAACCATTTCGAA
GGCGAACTCCCTCAAAACCTGGGGAATTCCCCTGCTTCTGTGATTAATCTAGCTAACAACAAGCTAAGTGGAAATCTCCCAACTGGGTTTAGCCTCTTGGGTTCGACACT
GAGAGAAATCCTGCTTTTAAACAACCAATTAACAGGGTGTATTCCTGAAGGATTCGGGCTTTTCTCTGAAATGCAAGTGTTGGATATGAGCTTCAATTCGTTAATGGGTC
ATTTGCCGGACACTCTGTCTTGTTTAAACGAAATCCAGATCATGAATTTGGGGCACAACAGGCTTTCTGGTGTTCTTCCGGATTTGATCTGTTCGTTGAAAAACTTGGTG
AATCTGACGGTTTCTTTCAATTTCTTTTCTGGGTTGAGCCAAGAATGTTCGCGCCAATCTCTTGGGAATCTGGGCTTTGATTTCACGGGAAATTGCATTCCTGGACGGGA
CATGCAGAGGCCTCGCCCTGAATGCTCTGTTTTTCCTGCTGCTGGGAGCTTGAACTGCCTTAGAATACCTCTTGTTTGTGGGACACTGGCTGATAGCCCAGACACTGATC
CCAGTTCTTCATCGCCATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNFPIVTCLVFFLLTNTPATESFVVDINGGIGIGVTIGGGGGGGGASVWIGGNNGPQTPRLNRAYTALQAWKSAITSDPLGILRSWVGPNVCSYKGVFCAQVEDESTSSL
VDIIAGIDLNHANLAGTLVTELSFLTEITLFHLNSNRFSGTVPESFKEMSSLQELDLSNNMFSGPFPIATLYIPNLVYLDLRFNDFHGPIPEDLFNKKLDAIFLNNNHFE
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