; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh10G007360 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh10G007360
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionTranscription factor
Genome locationCmo_Chr10:3373191..3374930
RNA-Seq ExpressionCmoCh10G007360
SyntenyCmoCh10G007360
Gene Ontology termsGO:0009725 - response to hormone (biological process)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0008270 - zinc ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001005 - SANT/Myb domain
IPR001878 - Zinc finger, CCHC-type
IPR006447 - Myb domain, plants
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017884 - SANT domain
IPR017930 - Myb domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6589987.1 Transcription factor MYBS3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.6e-16899.39Show/hide
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KAG7023651.1 Transcription factor MYBS3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.7e-16698.48Show/hide
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XP_022987786.1 uncharacterized protein DDB_G0271670-like [Cucurbita maxima]5.2e-16597.55Show/hide
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XP_023515620.1 uncharacterized protein DDB_G0271670-like isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-16899.39Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BPK2 transcription factor MYB1R1-like isoform X24.6e-8274.61Show/hide
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        FDMVGTAY+TTTT ALSQCLKISSNSQ   + +  NI      KKEL L L+E+ +
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A0A1S3BR73 probable serine/threonine-protein kinase DDB_G0282963 isoform X15.0e-9765.75Show/hide
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        FDMVGTAY+TTTT ALSQCLKISSNSQ   + +  N I    N   + S ITTTFA SSQQL         ++MEV+NN N       +SSSSSS+W+YG
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A0A6J1D2T3 myb-like protein J1.2e-8761.88Show/hide
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        RI +D + +   P NGYLSDGLL  +Q+RKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTT+TPTQVASHAQKYFLRQST+NKKNRRSSLFDMVG 
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                T   TTT   SQCLK+SSNSQ  S   +    ++L LPLL+   TT+F S+    + MEV+N             A+SSSS +W+YGLI DS
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        QLK +S        CSS   SS A GPDLELTLAAP  ASNLE + +KKA  GSLLV PI V
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A0A6J1H8A8 uncharacterized protein DDB_G0271670-like1.5e-170100Show/hide
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A0A6J1JFB4 uncharacterized protein DDB_G0271670-like2.5e-16597.55Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B8BI93 Transcription factor MYBS25.8e-2671.43Show/hide
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        QERKKGVPWTEEEH+ FL GL +LG+GDWRGIS+N+VT++T TQVASHAQKYFLRQ+   KK RR+SLFD+V    D
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Q2V9B0 Transcription factor MYB1R16.2e-2872.97Show/hide
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        N  +ERK+GVPWTEEEH++FL+GL+K+G+GDWRGISRN+V T+TPTQVASHAQKYFLR+S +N++ RRSSLFD+
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Q7XC57 Transcription factor MYBS32.4e-3246.11Show/hide
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        M R+CSHC + GHNSRTC N               +++FGV L   S   S+S  + S                    LSS++ S+S   S    D    
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             +GY SD  + G     ++RKKGVPWTEEEHR FL+GL+KLG+GDWRGISRN+V ++TPTQVASHAQKYF+RQS + ++ RRSSLFDMV
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Q9FKF9 Probable transcription factor At5g616204.8e-2840.82Show/hide
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        + + CSHCG+ GHN+RTC N          V    ++LFGV++ S        +              A++KS S    D L ++  S+        +D 
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                 GY SDG ++  +     E+KKG PWTEEEHR FLIGL KLG+GDWRGI++++V+T+TPTQVASHAQKYF+R +  +K+ RR+SLFD+
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Q9LVS0 Transcription factor KUA14.2e-3247.4Show/hide
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        M R+CSHC + GHNSRTC N               ++LFGV L   S   S+S  + S  + S +                + S++  S   +  DH   
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             +GY S+  + G    +ERKKG PWTEEEHR+FL+GL+KLG+GDWRGISRNYVTT+TPTQVASHAQKYF+RQS V+++ RRSSLFDMV
Subjt:  PSKPTNGYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQSTVNKKNRRSSLFDMV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G70000.1 myb-like transcription factor family protein3.9e-3336.2Show/hide
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        M R CS CGN GHNSRTC     +   N + G G   I LFGV +  +SSS                            C   S S ++ S    Q D  
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Query:  LEPSKPTN--GYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQSTVNKKNRRSSLFDMVGTAY
         +P+ PT+  GY SD +++    ++ERK+G PWTEEEHR+FL GL K+G+GDWRGISRN+V T+TPTQVASHAQKYFLR++  N++ RRSSLFD+   ++
Subjt:  LEPSKPTN--GYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQSTVNKKNRRSSLFDMVGTAY

Query:  DTTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPL----------LESKITTTFASSQQLGSSMEVMNNNNQASSSSS
                    I S+ + +  +  + + + + +P+          L      T A+++    S+ +   ++  SSSS+
Subjt:  DTTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPL----------LESKITTTFASSQQLGSSMEVMNNNNQASSSSS

AT1G70000.2 myb-like transcription factor family protein3.9e-3336.2Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSG--LIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSFSTSRIQIDHN
        M R CS CGN GHNSRTC     +   N + G G   I LFGV +  +SSS                            C   S S ++ S    Q D  
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSG--LIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSFSTSRIQIDHN

Query:  LEPSKPTN--GYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQSTVNKKNRRSSLFDMVGTAY
         +P+ PT+  GY SD +++    ++ERK+G PWTEEEHR+FL GL K+G+GDWRGISRN+V T+TPTQVASHAQKYFLR++  N++ RRSSLFD+   ++
Subjt:  LEPSKPTN--GYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQSTVNKKNRRSSLFDMVGTAY

Query:  DTTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPL----------LESKITTTFASSQQLGSSMEVMNNNNQASSSSS
                    I S+ + +  +  + + + + +P+          L      T A+++    S+ +   ++  SSSS+
Subjt:  DTTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPL----------LESKITTTFASSQQLGSSMEVMNNNNQASSSSS

AT3G16350.1 Homeodomain-like superfamily protein1.3e-3340Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSG-----------LIRLFGVHL-DSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSF
        M R+CSHC N GHNSRTC             G G            ++LFGV L D S    S+S  + S  + ++AAA   + S S+   +S+ + S  
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSG-----------LIRLFGVHL-DSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSF

Query:  S--TSRIQIDHNLEPSKPTNGYLSDGLLNGD------QERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQSTVNKKN
        S       + HN        GYLSD   +G        ERK+GVPWTEEEHR+FL+GL+KLG+GDWRGISRNYVT++TPTQVASHAQKYF+R ++ +++ 
Subjt:  S--TSRIQIDHNLEPSKPTNGYLSDGLLNGD------QERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQSTVNKKN

Query:  RRSSLFDMV--GTAYDTTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEM-NIKKELNLPLLESKITTTFASSQQLGSSMEVMN
        RRSSLFDMV      D++ T   Q L  SS S+    K+ + +++  LN      ++  T    ++   ++E  N
Subjt:  RRSSLFDMV--GTAYDTTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEM-NIKKELNLPLLESKITTTFASSQQLGSSMEVMN

AT5G47390.1 myb-like transcription factor family protein3.0e-3347.4Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSGLIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSFSTSRIQIDHNLE
        M R+CSHC + GHNSRTC N               ++LFGV L   S   S+S  + S  + S +                + S++  S   +  DH   
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSGLIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSFSTSRIQIDHNLE

Query:  PSKPTNGYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQSTVNKKNRRSSLFDMV
             +GY S+  + G    +ERKKG PWTEEEHR+FL+GL+KLG+GDWRGISRNYVTT+TPTQVASHAQKYF+RQS V+++ RRSSLFDMV
Subjt:  PSKPTNGYLSDGLLNG---DQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQSTVNKKNRRSSLFDMV

AT5G56840.1 myb-like transcription factor family protein6.1e-4744.04Show/hide
Query:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSGLIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCL-SSSSSSSSFSTSRIQIDHNL
        MGR+CSHCGN+GHNSRTC++++  +          +RLFGVHLD       ++SSS       S  A AIKKSFS DCL + SSSSSSF+          
Subjt:  MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSGLIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCL-SSSSSSSSFSTSRIQIDHNL

Query:  EPSKPTNGYLSDGLLNGDQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQ-STVNKKNRRSSLFDMVGTAYDTTTT
               GYLSDGL +   +RKKGVPWT EEHR FLIGLEKLG+GDWRGISRN+V TK+PTQVASHAQKYFLRQ +T++ K RR+SLFDMV         
Subjt:  EPSKPTNGYLSDGLLNGDQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQ-STVNKKNRRSSLFDMVGTAYDTTTT

Query:  ALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPLLESKITTTFASSQQLGSSMEVMNNNNQASSSSSSIWLYGLIDSQLKSASQTMICSSSSGAGGPDLELTL
               +  NS T                    +I                   N+   SSS  +W  GL++ +L      +  S S  +GG DLEL L
Subjt:  ALSQCLKISSNSQTHSNKNEMNIKKELNLPLLESKITTTFASSQQLGSSMEVMNNNNQASSSSSSIWLYGLIDSQLKSASQTMICSSSSGAGGPDLELTL

Query:  AA
        A+
Subjt:  AA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGCAGAAAGTGCTCACATTGTGGCAACATAGGTCACAATTCAAGGACTTGCACCAACTTTAGACCCTCAATCACACCCAATTTCAACGTTGGAAGCGGCTTAATTAG
GCTCTTTGGAGTTCATCTTGATTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCTACTACTTCTTCTTCAAGTGCTGCTGCTTTCGCCATTAAGAAAAGCT
TTAGCACCGATTGCTTGTCGTCGTCCTCGTCGTCCTCGTCTTTCTCTACTTCTCGAATTCAAATCGATCATAATCTTGAACCTTCTAAGCCCACCAATGGCTATCTCTCT
GATGGCCTTCTCAATGGAGACCAAGAAAGGAAGAAAGGGGTTCCATGGACAGAAGAGGAGCACAGAATATTCCTAATTGGGCTTGAAAAGCTTGGAAGAGGAGATTGGAG
AGGCATCTCGAGAAACTACGTCACAACGAAAACTCCGACCCAAGTGGCTAGTCACGCTCAAAAGTATTTTCTTAGACAATCGACCGTCAACAAAAAGAACCGTCGCTCGA
GCCTCTTCGACATGGTTGGGACAGCATATGATACAACAACGACAGCACTGTCTCAATGTTTGAAGATATCTTCAAATTCTCAAACTCATAGCAATAAGAATGAGATGAAT
ATCAAGAAGGAGCTGAATTTGCCTCTTTTAGAGAGTAAAATCACCACTACTTTTGCAAGCTCCCAACAATTGGGTTCTTCCATGGAAGTGATGAACAACAATAATCAAGC
TTCTTCTTCTTCATCATCAATTTGGCTTTATGGGTTGATTGATTCACAGCTCAAATCAGCTTCTCAAACCATGATTTGTTCTTCATCTTCTGGAGCAGGTGGGCCAGATC
TTGAGCTCACTTTGGCAGCCCCAAGAGCTTCCAATTTGGAGTATGAACAAACCAAAAAGGCATCAACTGGTTCCCTCCTTGTTGACCCAATCAGGGTTCCCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCACACCAATTTATCACTTATTTTGCTGCTCTCCCATTTCTCTCCTCCTCTACACTTTGTTTTTTTTTTTCAACTTTTTTTAGGGTTTTCATCATAGTAAGAGGCAAAAG
ATTTCAAGTGTGGGTGAAAAAACATGGGCAGAAAGTGCTCACATTGTGGCAACATAGGTCACAATTCAAGGACTTGCACCAACTTTAGACCCTCAATCACACCCAATTTC
AACGTTGGAAGCGGCTTAATTAGGCTCTTTGGAGTTCATCTTGATTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCTTCTTCCTCTTCTACTACTTCTTCTTCAAGTGCTGC
TGCTTTCGCCATTAAGAAAAGCTTTAGCACCGATTGCTTGTCGTCGTCCTCGTCGTCCTCGTCTTTCTCTACTTCTCGAATTCAAATCGATCATAATCTTGAACCTTCTA
AGCCCACCAATGGCTATCTCTCTGATGGCCTTCTCAATGGAGACCAAGAAAGGAAGAAAGGGGTTCCATGGACAGAAGAGGAGCACAGAATATTCCTAATTGGGCTTGAA
AAGCTTGGAAGAGGAGATTGGAGAGGCATCTCGAGAAACTACGTCACAACGAAAACTCCGACCCAAGTGGCTAGTCACGCTCAAAAGTATTTTCTTAGACAATCGACCGT
CAACAAAAAGAACCGTCGCTCGAGCCTCTTCGACATGGTTGGGACAGCATATGATACAACAACGACAGCACTGTCTCAATGTTTGAAGATATCTTCAAATTCTCAAACTC
ATAGCAATAAGAATGAGATGAATATCAAGAAGGAGCTGAATTTGCCTCTTTTAGAGAGTAAAATCACCACTACTTTTGCAAGCTCCCAACAATTGGGTTCTTCCATGGAA
GTGATGAACAACAATAATCAAGCTTCTTCTTCTTCATCATCAATTTGGCTTTATGGGTTGATTGATTCACAGCTCAAATCAGCTTCTCAAACCATGATTTGTTCTTCATC
TTCTGGAGCAGGTGGGCCAGATCTTGAGCTCACTTTGGCAGCCCCAAGAGCTTCCAATTTGGAGTATGAACAAACCAAAAAGGCATCAACTGGTTCCCTCCTTGTTGACC
CAATCAGGGTTCCCTAATCACTAATCAAACCCATCCCCAAAAATTCAATATCCAGCAAGAAATAACACAAAGACATATTGTTCTTCATGATTACAGTGTTTAATTTGGTT
GTTTTATGAGCAGCTACCTTACTGAAAGTGACAAATTTATATATATATTATTCGTCTTAATTTGTTTAGCTATAGCCTATGCTCGAGAAGAAGCACAAAGGTTGTAAAAT
GGCTCTTTAATGTCCTAATCCGTTTAGCTATGCTTGAAAAGAAGCACAAAGTTTGTAAAATGACTCTTTAATGTCTTAATCCGTTGAGCTATACTCGAAAAGAAGCACAA
AGGTTGTAAAAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGRKCSHCGNIGHNSRTCTNFRPSITPNFNVGSGLIRLFGVHLDSSSSSSSSSSSSSSTTSSSSAAAFAIKKSFSTDCLSSSSSSSSFSTSRIQIDHNLEPSKPTNGYLS
DGLLNGDQERKKGVPWTEEEHRIFLIGLEKLGRGDWRGISRNYVTTKTPTQVASHAQKYFLRQSTVNKKNRRSSLFDMVGTAYDTTTTALSQCLKISSNSQTHSNKNEMN
IKKELNLPLLESKITTTFASSQQLGSSMEVMNNNNQASSSSSSIWLYGLIDSQLKSASQTMICSSSSGAGGPDLELTLAAPRASNLEYEQTKKASTGSLLVDPIRVP