; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh10G007850 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh10G007850
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionDNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4
Genome locationCmo_Chr10:3638762..3641860
RNA-Seq ExpressionCmoCh10G007850
SyntenyCmoCh10G007850
Gene Ontology termsGO:0006383 - transcription by RNA polymerase III (biological process)
GO:0005666 - RNA polymerase III complex (cellular component)
GO:0003677 - DNA binding (molecular function)
GO:0003899 - DNA-directed 5'-3' RNA polymerase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007811 - DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6590029.1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.7e-15698.96Show/hide
Query:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
        MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
Subjt:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG

Query:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
        SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDE TTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
Subjt:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS

Query:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
        ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGM CGFAQDVAAINVEGKYCC IGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
Subjt:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL

XP_022961283.1 uncharacterized protein LOC111461827 [Cucurbita moschata]7.1e-158100Show/hide
Query:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
        MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
Subjt:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG

Query:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
        SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
Subjt:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS

Query:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
        ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
Subjt:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL

XP_022988288.1 uncharacterized protein LOC111485583 [Cucurbita maxima]4.3e-15597.92Show/hide
Query:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
        MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNE+TLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTS+TIRSFGISKAGNRLGNEDG
Subjt:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG

Query:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
        SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLP+RSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
Subjt:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS

Query:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
        ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGM CGFAQDVAAINVEGKYCC IGELSKRAILTPDVESMLKN+EDL
Subjt:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL

XP_023515454.1 uncharacterized protein LOC111779607 [Cucurbita pepo subsp. pepo]6.7e-15698.62Show/hide
Query:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
        MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
Subjt:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG

Query:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
        SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLP+RSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
Subjt:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS

Query:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
        ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGM CGFAQDVAAINVEGKYCC IGELSKRAILTPDVESMLKN+EDL
Subjt:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL

XP_038878504.1 uncharacterized protein LOC120070724 [Benincasa hispida]2.1e-13383.62Show/hide
Query:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
        ME D  KN TA  RK+KFAPKAP RRIPKPEVK EIAEDADAAQARDLLKRFNE+TLR +Q+IG+KAAPTQVAFGSGGTSST+RS+G+SKAGNR  NEDG
Subjt:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG

Query:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
        +LPS+TSKEYVEPWDYYSYYPVTLP+R PYSGNPDSLNEEEFGE SE  +YDE TTTPA+DLGLLEENPE D+FFLQLPPMVP++KQSSTVEG GAANS 
Subjt:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS

Query:  E----SQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
        E    SQPRQK C MNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGM CGFAQDVAA+NVEGK CC +GELSKRAILTPDV+S+LKNIEDL
Subjt:  E----SQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LWX7 Uncharacterized protein1.4e-13081.57Show/hide
Query:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
        ME +  KN TA  RK+KFAPKAP RRIPKPEVK E+AEDADAAQARDLLKRFNE+T RA+QR+G+KAAPTQVAFGSGG+SST+RS+G+SKAGNR  NEDG
Subjt:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG

Query:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
        +LP++TSKEYVEPWDYYSYYPVTLP+R PYSGNPDSLNEEEFGE SE L+YDE TTT A++LGLLEENPE D+ FLQLPPMVP+IKQSS+VE +G+ NSS
Subjt:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS

Query:  E----SQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
        E    SQPRQKTCSMNELPSGS+GKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGM CGFAQ+VAAINVEGK CC +GELSKRAILTPDV+SMLKNIEDL
Subjt:  E----SQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL

A0A1S3BPR1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC48.9e-13080.89Show/hide
Query:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
        ME D  KN TA  RK+KFAPKAP RR+PKPEVK E+AED DAAQARDLLKRFNE+T RA+QR+G+KAAPTQVAFGSGG+SST+RS+G+SKAGNR  NEDG
Subjt:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG

Query:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
        +LP++TSKEYVEPWDYYSYYPVTLP+R PYSGNPDSLNEEEFGE SE  +YDE TTT A++LGLLEENPETD+FFLQLPPMVP+IKQSSTVE +G+ N S
Subjt:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS

Query:  E----SQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
        E    SQ RQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGM CGFAQ+VAAIN+EGK+CC +GELSKRAILTPDV+SML+NIEDL
Subjt:  E----SQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL

A0A6J1D2P1 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc44.4e-12980.55Show/hide
Query:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
        ME D  KN+T  QRKMKFAPKAPPRR+PKPEVK EI E+ADAAQA+DLLKRFNE+T+RA+Q++GKKAAPTQVAFGSGGTS+TIRS+GI KAGNR  NEDG
Subjt:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG

Query:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
        +LPS+ SKEYVEPWDYYSYYPVTLP+R PYSG+PDSLNEEEFGE SE  +YDE  TTPA+DLGLLEENPET++FFLQ+PPMVPV KQSSTVEG+ AA+SS
Subjt:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS

Query:  E----SQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
        E    S+ RQ  CS+NELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDI+YDVSSGM CGFAQDVAAINVEGK+CC +GELSKRAILTPDV+SMLK+IEDL
Subjt:  E----SQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL

A0A6J1HBC9 uncharacterized protein LOC1114618273.4e-158100Show/hide
Query:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
        MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
Subjt:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG

Query:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
        SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
Subjt:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS

Query:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
        ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
Subjt:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL

A0A6J1JLT3 uncharacterized protein LOC1114855832.1e-15597.92Show/hide
Query:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG
        MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNE+TLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTS+TIRSFGISKAGNRLGNEDG
Subjt:  MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDG

Query:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
        SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLP+RSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS
Subjt:  SLPSTTSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSS

Query:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
        ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGM CGFAQDVAAINVEGKYCC IGELSKRAILTPDVESMLKN+EDL
Subjt:  ESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O74857 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc41.7e-0534.38Show/hide
Query:  PSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPD
        P+G +G L V++SG   L++G + + V SG  C F Q++A ++ + K    +G   +R I++PD
Subjt:  PSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPD

P05423 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC44.8e-0827.48Show/hide
Query:  ETDIFFLQLPPMVP--------------VIKQSSTVEGIGAANSSESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAA
        E ++ FLQLP  +P              V  +   V  I      E++  +  C++ +L  G +GKLL+ +SG V+L LG +  DV+ G  C F Q++ +
Subjt:  ETDIFFLQLPPMVP--------------VIKQSSTVEGIGAANSSESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAA

Query:  INVEGK---YCCFIGELSKRAILTPDVESML
        + +          +G +  + + +PD ES+L
Subjt:  INVEGK---YCCFIGELSKRAILTPDVESML

Q5E9Z7 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC43.7e-0826.72Show/hide
Query:  ETDIFFLQLPPMVP--------------VIKQSSTVEGIGAANSSESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAA
        E ++ FLQLP  +P              V  +   +  I      E++  + TC++ +L  G +GKLL+ +SG V+L LG +  DV+ G  C F Q++ +
Subjt:  ETDIFFLQLPPMVP--------------VIKQSSTVEGIGAANSSESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAA

Query:  INVEGKY---CCFIGELSKRAILTPDVESML
        + +          +G +  + + +P+ ES+L
Subjt:  INVEGKY---CCFIGELSKRAILTPDVESML

Q8T1V7 DNA-directed RNA polymerase III subunit rpc45.0e-0532.05Show/hide
Query:  SMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEG-----KYCCFIGELSKRAILTPDVESM
        S+ E+PSG +G L +Y+SG   LK+G + YD+SSG +  F ++V     +G       C  +G  S+  +  P +  +
Subjt:  SMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEG-----KYCCFIGELSKRAILTPDVESM

Q91WD1 DNA-directed RNA polymerase III subunit RPC41.1e-0726.72Show/hide
Query:  ETDIFFLQLPPMVP-------VIKQSSTVEG-------IGAANSSESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAA
        + ++ FLQLP  +P       +    + V+G       I      E++  +  C++ +L  G +GKLL+ +SG V+L LG +  DV+ G  C F Q++ +
Subjt:  ETDIFFLQLPPMVP-------VIKQSSTVEG-------IGAANSSESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAA

Query:  INVEGK---YCCFIGELSKRAILTPDVESML
        + +          +G +  + + +PD ES+L
Subjt:  INVEGK---YCCFIGELSKRAILTPDVESML

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G25180.1 RNA polymerase III RPC41.2e-3835.06Show/hide
Query:  QRKMKFAPKAPPRRIP-KPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISK---------------------
        +R+ +  P  P RR+P  P    E  ED +  +A    ++F+   +  R +   KA+  +VAF    +   IRSFG+ K                     
Subjt:  QRKMKFAPKAPPRRIP-KPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISK---------------------

Query:  ----AGNRLGNEDGSLPSTTSKEYVEPWDY-YSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLE-ENPETDIFFLQLPPMVPV
            A    G E  +  + T  +YVEPWDY  SYYP  LP+R P SG+ + L++EEFGE ++   YDE T   A +LGL   ++ +  +F  ++P  +PV
Subjt:  ----AGNRLGNEDGSLPSTTSKEYVEPWDY-YSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLE-ENPETDIFFLQLPPMVPV

Query:  IKQ---SSTVEGIGAANSSESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVES
        +KQ   ++T   +   +S  S P         LP G MGK+LVY+SGAVKLK+GD ++DVS G       DV AI+++G+ C  IG  +K   +TPDVES
Subjt:  IKQ---SSTVEGIGAANSSESQPRQKTCSMNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVES

Query:  MLKNIEDL
        +L    D+
Subjt:  MLKNIEDL

AT5G09380.1 RNA polymerase III RPC41.6e-6246.59Show/hide
Query:  RKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAED-ADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDGSLPSTTSK--EY
        RKMKFAPKAPP+R+PKPEVK E+ ED +++AQA +LL+R NE +LR + +  KK   +QVA+  G  +ST       ++   L   +G+  ST+++  EY
Subjt:  RKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAED-ADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDGSLPSTTSK--EY

Query:  VEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSSESQPRQKTCS
         EPWDYYSYYP+TLPMR PY+G+P+ L+ EEF +      + E +   A +LGL+E++ E  +FF++L P VP+   S+  E +    + +    +KT  
Subjt:  VEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSSESQPRQKTCS

Query:  MNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL
        +  LP G MGKLLVY+SGAVK+KLG+++YDVS G++  FAQDV  +N E K CC +G++ K A+LTPD++S+LK+IE++
Subjt:  MNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAATGATCTGCTCAAAAACAGTACAGCTGGTCAAAGGAAGATGAAATTTGCGCCAAAAGCACCTCCTCGTCGTATACCAAAACCTGAAGTCAAAGAAGAA
ATAGCAGAGGACGCTGATGCTGCTCAAGCCAGGGATTTACTTAAACGCTTTAATGAAACCACCCTAAGGGCAAGGCAAAGAATTGGGAAAAAAGCGGCACCTACA
CAAGTTGCATTTGGTTCTGGAGGTACATCAAGCACCATAAGATCATTTGGTATTTCAAAAGCTGGAAATAGACTCGGAAATGAAGATGGATCACTTCCGTCTACT
ACGAGTAAGGAGTATGTAGAACCATGGGATTATTACAGTTATTATCCTGTAACTCTTCCTATGCGGAGTCCATATTCAGGAAATCCAGATTCTCTTAACGAGGAA
GAATTTGGAGAGGGTTCAGAAACCTTAAGCTATGATGAAAGAACAACAACTCCAGCAGTGGATCTTGGTCTATTGGAGGAGAATCCAGAAACAGACATATTTTTT
CTGCAATTACCACCTATGGTGCCTGTGATAAAGCAATCCTCTACTGTAGAAGGGATTGGAGCAGCCAACAGCTCAGAATCACAACCTAGACAGAAAACCTGCTCT
ATGAATGAGTTACCTTCTGGCTCCATGGGTAAATTGCTCGTGTATAGGAGCGGTGCTGTCAAGTTAAAGCTTGGTGATATTATATATGATGTTTCTTCTGGAATG
CAATGTGGTTTTGCACAAGATGTTGCAGCTATCAATGTGGAAGGAAAGTATTGCTGCTTCATTGGGGAGCTTAGCAAGCGTGCCATTTTAACACCAGACGTGGAG
TCAATGTTAAAGAACATAGAGGATTTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTAATTAGGTCGACAAAGCCATTTTAAGATAAAGACGTGATAAGACTTGGGAATTTGACAACTAATTGTAAGTGATCATTATTTTTTCTTTTCAGTTTTGGACGA
AGATTTGACTACTAATAGCCATGGAGAATGATCTGCTCAAAAACAGTACAGCTGGTCAAAGGAAGATGAAATTTGCGCCAAAAGCACCTCCTCGTCGTATACCAA
AACCTGAAGTCAAAGAAGAAATAGCAGAGGACGCTGATGCTGCTCAAGCCAGGGATTTACTTAAACGCTTTAATGAAACCACCCTAAGGGCAAGGCAAAGAATTG
GGAAAAAAGCGGCACCTACACAAGTTGCATTTGGTTCTGGAGGTACATCAAGCACCATAAGATCATTTGGTATTTCAAAAGCTGGAAATAGACTCGGAAATGAAG
ATGGATCACTTCCGTCTACTACGAGTAAGGAGTATGTAGAACCATGGGATTATTACAGTTATTATCCTGTAACTCTTCCTATGCGGAGTCCATATTCAGGAAATC
CAGATTCTCTTAACGAGGAAGAATTTGGAGAGGGTTCAGAAACCTTAAGCTATGATGAAAGAACAACAACTCCAGCAGTGGATCTTGGTCTATTGGAGGAGAATC
CAGAAACAGACATATTTTTTCTGCAATTACCACCTATGGTGCCTGTGATAAAGCAATCCTCTACTGTAGAAGGGATTGGAGCAGCCAACAGCTCAGAATCACAAC
CTAGACAGAAAACCTGCTCTATGAATGAGTTACCTTCTGGCTCCATGGGTAAATTGCTCGTGTATAGGAGCGGTGCTGTCAAGTTAAAGCTTGGTGATATTATAT
ATGATGTTTCTTCTGGAATGCAATGTGGTTTTGCACAAGATGTTGCAGCTATCAATGTGGAAGGAAAGTATTGCTGCTTCATTGGGGAGCTTAGCAAGCGTGCCA
TTTTAACACCAGACGTGGAGTCAATGTTAAAGAACATAGAGGATTTATAATTATTTTCTCTGAAGGCGGGGTTTTTCCCTAGACATCAATGTAGAGATATTGACG
AGAGTGATATTCTTCATCAAAGCTCCAAGTGGATATAACATCAAACGATACCAGCAGAAAAAAATGCACTGGTTCGTGAAAAGCAGAAGAGTGACTATTTTCTCT
CTTGTTTAGTCCCGGGTGCCTAGATTTTTAATTACGAACAATTTTCATACGATCAAGTAGATCGAATGTATTAATTACAATTTTGACAAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENDLLKNSTAGQRKMKFAPKAPPRRIPKPEVKEEIAEDADAAQARDLLKRFNETTLRARQRIGKKAAPTQVAFGSGGTSSTIRSFGISKAGNRLGNEDGSLPST
TSKEYVEPWDYYSYYPVTLPMRSPYSGNPDSLNEEEFGEGSETLSYDERTTTPAVDLGLLEENPETDIFFLQLPPMVPVIKQSSTVEGIGAANSSESQPRQKTCS
MNELPSGSMGKLLVYRSGAVKLKLGDIIYDVSSGMQCGFAQDVAAINVEGKYCCFIGELSKRAILTPDVESMLKNIEDL