; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh10G008290 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh10G008290
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptiontranscription factor Pur-alpha 1-like
Genome locationCmo_Chr10:3898070..3901733
RNA-Seq ExpressionCmoCh10G008290
SyntenyCmoCh10G008290
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
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GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
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GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006628 - Purine-rich element binding protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6590067.1 Transcription factor Pur-alpha 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.4e-16796.54Show/hide
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KAG7023734.1 Transcription factor Pur-alpha 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.9e-16699.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LZP1 Uncharacterized protein2.4e-15896.38Show/hide
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A0A6J1EUL9 transcription factor Pur-alpha 1-like1.6e-15996.07Show/hide
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A0A6J1H823 transcription factor Pur-alpha 1-like3.7e-167100Show/hide
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A0A6J1HVP1 transcription factor Pur-alpha 1-like1.9e-16096.41Show/hide
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A0A6J1JGC7 transcription factor Pur-alpha 1-like4.9e-16498.69Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
P42669 Transcriptional activator protein Pur-alpha7.4e-1629.23Show/hide
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        G G+G GG   GG   GG  GGGG  GG      EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D    +I       
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                   D+P   + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++        R T+      NR  G  + +          +   LP Q   E  + L
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          L DD G                           +++   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q00577 Transcriptional activator protein Pur-alpha9.7e-1629.12Show/hide
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        G G+G GG   GG   GG  GGGGG  G       EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D    +I      
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                    D+P   + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++        R T+      NR  G  + +          +   LP Q   E  + 
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Q6PAC9 Transcriptional activator protein Pur-beta-A8.2e-1528.97Show/hide
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        G   GG SGG GG   +        EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E  +    + +    G+      +  D   +Y  +    PE    
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         L DD G     G     A                   G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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Q8AVS4 Transcriptional activator protein Pur-beta-B1.4e-1429.05Show/hide
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        G   GG SGG  G   +        EL  K L +++K FY D+K+N +GR++KI+E     ++S + +  +    F D    +I          PE    
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              G  DD G G  SG S   A    +              G L     I  D KRFFFD+GSN  G FLR+SEV  + R+SI +PL    +F
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