; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh10G009200 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh10G009200
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionE3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X2
Genome locationCmo_Chr10:4558491..4564067
RNA-Seq ExpressionCmoCh10G009200
SyntenyCmoCh10G009200
Gene Ontology termsGO:0016567 - protein ubiquitination (biological process)
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InterPro domainsIPR001841 - Zinc finger, RING-type
IPR013083 - Zinc finger, RING/FYVE/PHD-type


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022961100.1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X1 [Cucurbita moschata]8.2e-210100Show/hide
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A0A6J1H987 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X32.4e-20799.23Show/hide
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A0A6J1H9E6 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X25.8e-209100Show/hide
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A0A6J1HB23 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X14.0e-210100Show/hide
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A0A6J1HD02 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X43.2e-207100Show/hide
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A0A6J1JKS1 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A-like isoform X15.0e-20597.42Show/hide
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Q2HIJ8 Probable E3 ubiquitin-protein ligase RHB1A3.8e-0843.64Show/hide
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Q4TU14 E3 ubiquitin-protein ligase RHF1A1.0e-3236.16Show/hide
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        V+RE+NAGI  V+RM+ER++    R   S+   +S A  S        +++  N  +N   D  E
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Q8LE94 E3 ubiquitin-protein ligase At3g022901.4e-0745.45Show/hide
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        +D C  CLE +   +P  +T C H FHL C+ EW +RS  CP+C
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Q93ZF6 E3 ubiquitin-protein ligase AIRP15.5e-0743.14Show/hide
Query:  DACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKD
        D C ICLE +   +P  +T C H+FHL C+L W +RS  CP+C + + L +
Subjt:  DACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKD

Q9ZT42 E3 ubiquitin-protein ligase RHF2A3.7e-11259.9Show/hide
Query:  ETKKSEAHLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKDPTSQELLEGVEQERSFRLNPARNS
        ET  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ ISLKDPTSQELLE VEQER+FR NP RN+
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Query:  TIFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGRARHGARREGHRNRSGVHGRSQFLVFSSHPNSSSTSPPHGDNREGETAPRIMVAAVSPPP
        TIFRHPTLGDFELQHLP G ++A++EERI+QHLAAAAAMGRARHG RREGHR+RS   G  QF+VFSS PN+SS  PPH                  PP 
Subjt:  TIFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGRARHGARREGHRNRSGVHGRSQFLVFSSHPNSSSTSPPHGDNREGETAPRIMVAAVSPPP

Query:  PAGEESPQLNTSVSPI------QTDQSSPSVPQSSLH--SSSQLGSPSRDRSSSQSVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTKGWRE
        P+       + +VS +      +    S + P +S H    S   S S  R  +QS P+ QDRAGPSELQSFS+SLKSR NA+S RYK+SI+K+T+ W++
Subjt:  PAGEESPQLNTSVSPI------QTDQSSPSVPQSSLH--SSSQLGSPSRDRSSSQSVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTKGWRE

Query:  KLFSRNTSMSDIGSEVKREVNAGIETVSRMMERLETRDARKSSSPESSNAGDSSPVSESNNRQIPENGGNNPLSDTNEKGPRPAESSSS
        +LFSRNTSM+D+GSEVKREV+AGI TVSRMMERLETR+  + S+   S+  ++    E+NN       G+      NE+G +   ++ S
Subjt:  KLFSRNTSMSDIGSEVKREVNAGIETVSRMMERLETRDARKSSSPESSNAGDSSPVSESNNRQIPENGGNNPLSDTNEKGPRPAESSSS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G00335.1 RING-H2 finger B1A2.7e-0943.64Show/hide
Query:  DACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKD
        D  +D C IC E++   +P   T C+HEFHL C+LEW +RS +CP+C + +   D
Subjt:  DACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKD

AT4G14220.1 RING-H2 group F1A7.1e-3436.16Show/hide
Query:  TSAAAFVEGGIQDACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKDPTSQELLEGVEQERSFRL-NPARNSTIFRHPTL
        +S+A  V     +  DDACSICLE F   DPST+TSCKHE+HLQC++EW QRS +CP+CWQ   L+DP SQELL  VE+ER  +  N + +S I  H + 
Subjt:  TSAAAFVEGGIQDACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKDPTSQELLEGVEQERSFRL-NPARNSTIFRHPTL

Query:  GDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGRARHGARREGHRNRSGVHGRSQFLVFSSHPNSSSTSPPHGDNREGETA-PRIMVAAVSPPPPAGEESP
         DF  +     +  +  +E+ L+HL  AA         RR   R R G    S  LV SS P  ++  P    N    +A   +     +P P  G  +P
Subjt:  GDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGRARHGARREGHRNRSGVHGRSQFLVFSSHPNSSSTSPPHGDNREGETA-PRIMVAAVSPPPPAGEESP

Query:  QLNTSVSPIQTDQSSPSVPQSSLHSSSQLGSPSRDRSSSQSVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTKGWREKLFSRNTSMSDIGSE
              SP+       S+P  S + S     PS  RSS    P S       E  S  +++KS+  A S +YK+SI+KS +G +EKL +RN S+ ++   
Subjt:  QLNTSVSPIQTDQSSPSVPQSSLHSSSQLGSPSRDRSSSQSVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTKGWREKLFSRNTSMSDIGSE

Query:  VKREVNAGIETVSRMMERLETRDAR--KSSSPESSNAGDSSPVSESNNRQIPENGGNNPLSDTNE
        V+RE+NAGI  V+RM+ER++    R   S+   +S A  S        +++  N  +N   D  E
Subjt:  VKREVNAGIETVSRMMERLETRDAR--KSSSPESSNAGDSSPVSESNNRQIPENGGNNPLSDTNE

AT5G22000.1 RING-H2 group F2A2.6e-11359.9Show/hide
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        ET  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ ISLKDPTSQELLE VEQER+FR NP RN+
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Query:  TIFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGRARHGARREGHRNRSGVHGRSQFLVFSSHPNSSSTSPPHGDNREGETAPRIMVAAVSPPP
        TIFRHPTLGDFELQHLP G ++A++EERI+QHLAAAAAMGRARHG RREGHR+RS   G  QF+VFSS PN+SS  PPH                  PP 
Subjt:  TIFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGRARHGARREGHRNRSGVHGRSQFLVFSSHPNSSSTSPPHGDNREGETAPRIMVAAVSPPP

Query:  PAGEESPQLNTSVSPI------QTDQSSPSVPQSSLH--SSSQLGSPSRDRSSSQSVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTKGWRE
        P+       + +VS +      +    S + P +S H    S   S S  R  +QS P+ QDRAGPSELQSFS+SLKSR NA+S RYK+SI+K+T+ W++
Subjt:  PAGEESPQLNTSVSPI------QTDQSSPSVPQSSLH--SSSQLGSPSRDRSSSQSVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTKGWRE

Query:  KLFSRNTSMSDIGSEVKREVNAGIETVSRMMERLETRDARKSSSPESSNAGDSSPVSESNNRQIPENGGNNPLSDTNEKGPRPAESSSS
        +LFSRNTSM+D+GSEVKREV+AGI TVSRMMERLETR+  + S+   S+  ++    E+NN       G+      NE+G +   ++ S
Subjt:  KLFSRNTSMSDIGSEVKREVNAGIETVSRMMERLETRDARKSSSPESSNAGDSSPVSESNNRQIPENGGNNPLSDTNEKGPRPAESSSS

AT5G22000.2 RING-H2 group F2A1.0e-11259.79Show/hide
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        T  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ ISLKDPTSQELLE VEQER+FR NP RN+T
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Query:  IFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGRARHGARREGHRNRSGVHGRSQFLVFSSHPNSSSTSPPHGDNREGETAPRIMVAAVSPPPP
        IFRHPTLGDFELQHLP G ++A++EERI+QHLAAAAAMGRARHG RREGHR+RS   G  QF+VFSS PN+SS  PPH                  PP P
Subjt:  IFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGRARHGARREGHRNRSGVHGRSQFLVFSSHPNSSSTSPPHGDNREGETAPRIMVAAVSPPPP

Query:  AGEESPQLNTSVSPI------QTDQSSPSVPQSSLH--SSSQLGSPSRDRSSSQSVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTKGWREK
        +       + +VS +      +    S + P +S H    S   S S  R  +QS P+ QDRAGPSELQSFS+SLKSR NA+S RYK+SI+K+T+ W+++
Subjt:  AGEESPQLNTSVSPI------QTDQSSPSVPQSSLH--SSSQLGSPSRDRSSSQSVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTKGWREK

Query:  LFSRNTSMSDIGSEVKREVNAGIETVSRMMERLETRDARKSSSPESSNAGDSSPVSESNNRQIPENGGNNPLSDTNEKGPRPAESSSS
        LFSRNTSM+D+GSEVKREV+AGI TVSRMMERLETR+  + S+   S+  ++    E+NN       G+      NE+G +   ++ S
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AT5G22000.3 RING-H2 group F2A2.6e-11359.9Show/hide
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        ET  SE HLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLE+FC+SDPST+TSCKHE+HLQC+LEWCQRSSQCPMCWQ ISLKDPTSQELLE VEQER+FR NP RN+
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Query:  TIFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGRARHGARREGHRNRSGVHGRSQFLVFSSHPNSSSTSPPHGDNREGETAPRIMVAAVSPPP
        TIFRHPTLGDFELQHLP G ++A++EERI+QHLAAAAAMGRARHG RREGHR+RS   G  QF+VFSS PN+SS  PPH                  PP 
Subjt:  TIFRHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGRARHGARREGHRNRSGVHGRSQFLVFSSHPNSSSTSPPHGDNREGETAPRIMVAAVSPPP

Query:  PAGEESPQLNTSVSPI------QTDQSSPSVPQSSLH--SSSQLGSPSRDRSSSQSVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTKGWRE
        P+       + +VS +      +    S + P +S H    S   S S  R  +QS P+ QDRAGPSELQSFS+SLKSR NA+S RYK+SI+K+T+ W++
Subjt:  PAGEESPQLNTSVSPI------QTDQSSPSVPQSSLH--SSSQLGSPSRDRSSSQSVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTKGWRE

Query:  KLFSRNTSMSDIGSEVKREVNAGIETVSRMMERLETRDARKSSSPESSNAGDSSPVSESNNRQIPENGGNNPLSDTNEKGPRPAESSSS
        +LFSRNTSM+D+GSEVKREV+AGI TVSRMMERLETR+  + S+   S+  ++    E+NN       G+      NE+G +   ++ S
Subjt:  KLFSRNTSMSDIGSEVKREVNAGIETVSRMMERLETRDARKSSSPESSNAGDSSPVSESNNRQIPENGGNNPLSDTNEKGPRPAESSSS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGTCTCCAACTATGGACGAAACAAAAAAATCTGAAGCGCATTTGACATCAGCTGCGGCTTTTGTCGAAGGTGGAATCCAGGATGCTTGTGATGATGCTTGCAGTAT
ATGTTTAGAAAACTTCTGTGATAGTGATCCTTCAACGATGACCAGTTGCAAACATGAGTTTCATCTGCAGTGCGTTCTTGAATGGTGTCAGAGAAGCTCCCAATGCCCTA
TGTGTTGGCAACCTATTAGTCTGAAGGATCCAACCAGCCAGGAGTTGCTCGAAGGTGTAGAACAAGAGAGAAGTTTTAGACTTAATCCAGCTAGAAATTCAACAATATTT
CGCCATCCCACTCTTGGTGACTTCGAGTTACAGCATCTACCAGCTGGTGCTAATGATGCTGATCTTGAAGAGCGTATACTCCAACACCTAGCTGCAGCAGCTGCCATGGG
ACGAGCACGCCATGGTGCTAGAAGGGAAGGCCACAGAAATCGGTCAGGAGTTCATGGCCGTTCCCAGTTCTTGGTGTTCTCTTCCCATCCCAATTCTTCGTCGACCTCTC
CACCTCATGGTGACAATCGAGAGGGTGAAACAGCCCCAAGAATCATGGTAGCTGCTGTATCCCCACCTCCACCTGCAGGAGAAGAGTCCCCACAACTCAACACATCAGTA
TCTCCCATACAAACTGACCAGTCTTCTCCTTCCGTGCCTCAATCCAGTTTACATTCTTCTAGTCAACTTGGATCTCCTTCGAGGGATAGATCTTCCAGTCAATCCGTGCC
CAATAGTCAAGATAGGGCCGGACCATCAGAGTTACAATCATTCTCGGATTCGCTGAAGTCTCGATTTAATGCAATGTCAATGAGGTACAAAGATTCAATCACAAAGAGCA
CAAAAGGTTGGAGGGAAAAATTGTTCTCCCGCAACACTTCAATGTCAGATATTGGCTCTGAAGTTAAAAGAGAGGTCAATGCAGGAATAGAAACGGTATCGCGCATGATG
GAACGTCTCGAAACAAGAGATGCTAGAAAAAGTAGCAGTCCTGAGTCCAGTAATGCAGGGGATAGTAGCCCAGTTTCAGAATCAAATAACAGACAGATACCAGAGAATGG
AGGAAACAATCCTTTGAGTGACACAAATGAAAAAGGGCCACGCCCTGCAGAATCCAGTTCAAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GGCCACGCGTTGAGAAAATGAACCCATCAGATTCATACAACAAATACATTCATAACTGAGCCGACGACCGACCAAACCCAAACTCAGCACTCAGCACTCAGCAGCAGCCT
TTTCCAAGTCAAGACCGGAGCCTCCACCGCCACCTCCGCCCCAATTCTCCTCCTCCTCCTTCCCTTAGGGTTTCTCCGATTCCAATCCATTCAACATCGTCCTGCGCATG
CTCGATTCACATGGAGTCTCCAACTATGGACGAAACAAAAAAATCTGAAGCGCATTTGACATCAGCTGCGGCTTTTGTCGAAGGTGGAATCCAGGATGCTTGTGATGATG
CTTGCAGTATATGTTTAGAAAACTTCTGTGATAGTGATCCTTCAACGATGACCAGTTGCAAACATGAGTTTCATCTGCAGTGCGTTCTTGAATGGTGTCAGAGAAGCTCC
CAATGCCCTATGTGTTGGCAACCTATTAGTCTGAAGGATCCAACCAGCCAGGAGTTGCTCGAAGGTGTAGAACAAGAGAGAAGTTTTAGACTTAATCCAGCTAGAAATTC
AACAATATTTCGCCATCCCACTCTTGGTGACTTCGAGTTACAGCATCTACCAGCTGGTGCTAATGATGCTGATCTTGAAGAGCGTATACTCCAACACCTAGCTGCAGCAG
CTGCCATGGGACGAGCACGCCATGGTGCTAGAAGGGAAGGCCACAGAAATCGGTCAGGAGTTCATGGCCGTTCCCAGTTCTTGGTGTTCTCTTCCCATCCCAATTCTTCG
TCGACCTCTCCACCTCATGGTGACAATCGAGAGGGTGAAACAGCCCCAAGAATCATGGTAGCTGCTGTATCCCCACCTCCACCTGCAGGAGAAGAGTCCCCACAACTCAA
CACATCAGTATCTCCCATACAAACTGACCAGTCTTCTCCTTCCGTGCCTCAATCCAGTTTACATTCTTCTAGTCAACTTGGATCTCCTTCGAGGGATAGATCTTCCAGTC
AATCCGTGCCCAATAGTCAAGATAGGGCCGGACCATCAGAGTTACAATCATTCTCGGATTCGCTGAAGTCTCGATTTAATGCAATGTCAATGAGGTACAAAGATTCAATC
ACAAAGAGCACAAAAGGTTGGAGGGAAAAATTGTTCTCCCGCAACACTTCAATGTCAGATATTGGCTCTGAAGTTAAAAGAGAGGTCAATGCAGGAATAGAAACGGTATC
GCGCATGATGGAACGTCTCGAAACAAGAGATGCTAGAAAAAGTAGCAGTCCTGAGTCCAGTAATGCAGGGGATAGTAGCCCAGTTTCAGAATCAAATAACAGACAGATAC
CAGAGAATGGAGGAAACAATCCTTTGAGTGACACAAATGAAAAAGGGCCACGCCCTGCAGAATCCAGTTCAAGTTGAACAGTCTCAGAATTGGCTTCACTCAAAGGCTCA
CATCTTATAAAAGGTGACTACTGCAATTAATTGTTTTACCTCTTCCATATGTACAAGAAATGCATGGAGTTGACGGATGTTTTAAAATTTGAAGAAAAAAAAAAAAGAGA
AACTTCAAAATATTCACAAAAGTGTCTCAAGTTTTAGTTTATTTTATGATTAGTTAGAGTATATTTATATATTAGTCAGTATATCATTTAAACTTGTAATAAAATAGCTT
ATTTACTCGTAAGTTAAAAGGCCATATTCTGCTTTTTCCCATC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESPTMDETKKSEAHLTSAAAFVEGGIQDACDDACSICLENFCDSDPSTMTSCKHEFHLQCVLEWCQRSSQCPMCWQPISLKDPTSQELLEGVEQERSFRLNPARNSTIF
RHPTLGDFELQHLPAGANDADLEERILQHLAAAAAMGRARHGARREGHRNRSGVHGRSQFLVFSSHPNSSSTSPPHGDNREGETAPRIMVAAVSPPPPAGEESPQLNTSV
SPIQTDQSSPSVPQSSLHSSSQLGSPSRDRSSSQSVPNSQDRAGPSELQSFSDSLKSRFNAMSMRYKDSITKSTKGWREKLFSRNTSMSDIGSEVKREVNAGIETVSRMM
ERLETRDARKSSSPESSNAGDSSPVSESNNRQIPENGGNNPLSDTNEKGPRPAESSSS