| GenBank top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| ALO21718.1 RpoC2 [Cucurbita argyrosperma] | 1.9e-147 | 98.86 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| ALO22384.1 RpoC2 [Cucurbita moschata] | 1.9e-147 | 98.86 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| ALO22570.1 RpoC2 [Cucurbita pepo subsp. fraterna] | 1.9e-147 | 98.86 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| YP_009447525.1 RNA polymerase beta'' subunit [Cucurbita moschata] | 1.9e-147 | 98.86 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| YP_009505070.1 RNA polymerase beta'' subunit [Cucurbita pepo] | 1.9e-147 | 98.86 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| TrEMBL top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| A0A0S2IDT9 DNA-directed RNA polymerase | 9.3e-148 | 98.86 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| A0A0S2IDY7 DNA-directed RNA polymerase | 9.3e-148 | 98.86 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| A0A0S2IFZ6 DNA-directed RNA polymerase | 9.3e-148 | 98.86 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| A0A0S2IHI7 DNA-directed RNA polymerase | 9.3e-148 | 98.86 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| A0A2H4T1Y3 DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' | 9.3e-148 | 98.86 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| SwissProt top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| B1A925 DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' | 8.4e-146 | 95.44 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFR+TDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSP+N+ +PERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCI IRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
+NRFITF+TQ ISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| P38550 DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' | 1.4e-145 | 95.44 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGT RGISVSP N M+PERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCI RNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
+NRFITF+ QPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| Q3C1G9 DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' | 1.4e-145 | 95.44 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGT RGISVSP N M+PERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCI RNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
+NRFITF+ QPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| Q49L08 DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' | 4.5e-147 | 95.82 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIE+WYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRG+SVSP N M+PERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCI IRNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
+NRFITF+TQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| Q4VZP3 DNA-directed RNA polymerase subunit beta'' | 2.4e-148 | 97.34 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGI VSP N+MIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIG+RNQDIGIGL
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGL
Query: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: INRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| Arabidopsis top hits | e value | %identity | Alignment |
|---|
| AT3G57660.1 nuclear RNA polymerase A1 | 5.3e-10 | 26.21 | Show/hide |
Query: NPVHIMSFSGARG---NASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMID---LP--------------IQSNLREGLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRR
N + +M+ SGA+G N Q+ +G + L +M+ LP I GL EY C R+G+VDTAV+TS +GYL R
Subjt: NPVHIMSFSGARG---NASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMID---LP--------------IQSNLREGLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRR
Query: LVEVVQHIVVRRTDC------GTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGLINRFITFQTQPISIR---------TPFT
L++ ++ + V DC G+I + + FI+ + D+ + +C ++D+ G + PIS++ P
Subjt: LVEVVQHIVVRRTDC------GTIRGISVSPENKMIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGIGLINRFITFQTQPISIR---------TPFT
Query: CRSTSWICR----LCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
R S R L +S L + GE VG++A QS+GEP Q++
Subjt: CRSTSWICR----LCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
| AT4G35800.1 RNA polymerase II large subunit | 2.1e-06 | 38.33 | Show/hide |
Query: IQSNLREGLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIR
++++ GL+ E+ G R+G++DTAV+TS+ GY+ RRLV+ ++ I+V+ GT+R
Subjt: IQSNLREGLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIR
|
|
| AT5G60040.1 nuclear RNA polymerase C1 | 7.9e-06 | 34.92 | Show/hide |
Query: IQSNLREGLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGIS
+ ++ GL+ TE+ G R+G+VDTAV+T+ GY++RRL++ ++ ++V + T+R S
Subjt: IQSNLREGLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGIS
|
|
| AT5G60040.2 nuclear RNA polymerase C1 | 7.9e-06 | 34.92 | Show/hide |
Query: IQSNLREGLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGIS
+ ++ GL+ TE+ G R+G+VDTAV+T+ GY++RRL++ ++ ++V + T+R S
Subjt: IQSNLREGLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGIS
|
|
| ATCG00170.1 DNA-directed RNA polymerase family protein | 1.3e-141 | 92.45 | Show/hide |
Query: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
VQDAEQQS ILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVH+MSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Subjt: VQDAEQQSLILEKHHHYGNVHAVEKLRQSIEIWYATSEYLRQEMNPNFRMTDPFNPVHIMSFSGARGNASQVHQLVGMRGLMSDPQGQMIDLPIQSNLRE
Query: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENK--MIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGI
GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSP NK M+ ERIFIQTLIGRVLADDIY+G RC+ RNQD+GI
Subjt: GLSLTEYIISCYGARKGVVDTAVRTSDAGYLTRRLVEVVQHIVVRRTDCGTIRGISVSPENK--MIPERIFIQTLIGRVLADDIYMGPRCIGIRNQDIGI
Query: GLINRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
GL+NR ITF TQ ISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPG Q++
Subjt: GLINRFITFQTQPISIRTPFTCRSTSWICRLCYGRSPTHGDLVELGEAVGIIAGQSIGEPGDQIS
|
|
