; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh10G011540 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh10G011540
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionSignal peptidase complex subunit 3
Genome locationCmo_Chr10:9885253..9887932
RNA-Seq ExpressionCmoCh10G011540
SyntenyCmoCh10G011540
Gene Ontology termsGO:0006465 - signal peptide processing (biological process)
GO:0005787 - signal peptidase complex (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0008233 - peptidase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR007653 - Signal peptidase complex subunit 3


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_004135628.1 signal peptidase complex subunit 3B [Cucumis sativus]1.1e-7068.04Show/hide
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XP_038878575.1 signal peptidase complex subunit 3B-like [Benincasa hispida]3.1e-7370.32Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BQR8 Signal peptidase complex subunit 35.8e-7369.86Show/hide
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A0A5D3CE33 Signal peptidase complex subunit 35.8e-7369.86Show/hide
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A0A6J1BP73 Signal peptidase complex subunit 39.2e-7167.58Show/hide
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A0A6J1HAK0 Signal peptidase complex subunit 32.9e-8076.26Show/hide
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A0A6J1HY85 Signal peptidase complex subunit 32.9e-8076.26Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
B0G180 Signal peptidase complex subunit 33.0e-1024.31Show/hide
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        +N L+QV                           +WD I+  K  A       +KY  I+Q                 G  L+     LT +++V+P +G
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         ++  ++  + ++ P  Y
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P28687 Signal peptidase complex subunit 37.9e-1127.55Show/hide
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        RAN+L  F+++++A +      +  F   S    + V       T+ ++  F      +D   +T +I+ DLQS+F WN KQ+F++++AEY T  N+LNQ
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        V                           LWD II   +N + F     +KY F D                  G+ L+G +   LTL W+V+P  G
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Q53YF3 Signal peptidase complex subunit 3B1.8e-6360.27Show/hide
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        KN+LNQV                          SLWD IIP KE+AKF I  SNKYRFIDQ                 G NLRGK+FNLTLHWHVMPKTG
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        KM ADKIVM+GYRLP  YR
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Q9LGB4 Probable signal peptidase complex subunit 36.9e-2334.4Show/hide
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        MHS+  R     T A  +L   C  AS  D F+ PS  A+           V  INRF KQ++GND                     +VFVF+ AEYE  
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        KNSLNQV                          SLWD IIP K+ A   +   +KY  IDQ                 GS+LRGK+  L LHWHVMPK G
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         M  D++ ++ + LP  Y
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Q9MA96 Signal peptidase complex subunit 3A4.0e-6359.36Show/hide
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        KNSLNQV                          SLWD IIP+KE+AKF I  SNKYRFIDQ                 G NLRGK+FNLTLHWHVMPKTG
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        KM ADKIV+ GY LP  YR
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G05230.1 Signal peptidase subunit2.8e-6459.36Show/hide
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        KM ADKIV+ GY LP  YR
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AT3G05230.2 Signal peptidase subunit1.6e-4660.49Show/hide
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AT5G27430.1 Signal peptidase subunit1.3e-6460.27Show/hide
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        MHSFGYRANAL+TFAVTILA +C +ASFSDNF++ +P+A++Q         +L+IN FQKQ HGNDEV++TLNI+ DLQSLFTWNTKQVF FVAAEYET 
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        KN+LNQV                          SLWD IIP KE+AKF I  SNKYRFIDQ                 G NLRGK+FNLTLHWHVMPKTG
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        KM ADKIVM+GYRLP  YR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CGGTC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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