; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh10G012560 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh10G012560
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionATP citrate synthase
Genome locationCmo_Chr10:12750369..12756588
RNA-Seq ExpressionCmoCh10G012560
SyntenyCmoCh10G012560
Gene Ontology termsGO:0016740 - transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR016102 - Succinyl-CoA synthetase-like
IPR032263 - ATP-citrate synthase, citrate-binding domain


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6590508.1 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.9e-20674.16Show/hide
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KAG7024041.1 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]6.0e-21066.46Show/hide
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XP_022961536.1 ATP-citrate synthase alpha chain protein 2 [Cucurbita moschata]2.5e-21166.82Show/hide
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A0A1S3BNS4 ATP citrate synthase1.7e-20565.03Show/hide
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A0A5A7U535 ATP citrate synthase6.3e-20564.87Show/hide
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A0A5D3CJ91 ATP citrate synthase1.7e-20565.03Show/hide
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A0A6J1HAM6 ATP citrate synthase1.2e-21166.82Show/hide
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A0A6J1HYY6 ATP citrate synthase4.5e-21166.61Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O80526 ATP-citrate synthase alpha chain protein 37.2e-19059.52Show/hide
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        E CAPLIATLPLE                +R KIG+FIMG F+VFQ       DLDF+F+EMNPFTLV+GEP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG++EFPL
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        PFGRVL+ TE+F+H LDEK                                                                       TSASLKFTVL
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                  V+GPEATMTGICK+AI+CIM
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Q2QNG7 ATP-citrate synthase alpha chain protein 33.8e-19159.59Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLL+EHLKRL  IDL I SAQV +STDF EL N EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLDLAQV +FVK RLGV+        
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                  VEMGGCKAPITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDK                      VKT+FLPTEK +TP
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        +ACAPLIATLPLE                +R KIGDFI GV+SVFQ       DLDF+FLEMNPFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGN++FPL
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Query:  PFGRVLNPTESFVHSLDEKVTHFILNTMIWSDDQKDIVSLTRGFKPFKIFKALFHKIERSINNLVQIIIIKNGKGKCIKLEFASLQQKAETSASLKFTVL
        PFGRVL+P+ESF+H LDEK                                                                       TS+SLKFTVL
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        NPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATF+GIIRALREKE+KLK
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        AARM+IYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E                                                                  
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                  V+GPEATMTGICKQAI+CIM+
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Q2QZ86 ATP-citrate synthase alpha chain protein 22.8e-19460.44Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRL  IDLQI SAQV QSTDF EL N +PWLS+ +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK RLGV+        
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                  VEMGGCKAPITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDK                      VKTIFLPTEKP+TP
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Query:  EACAPLIATLPLEFSYNSVILTAPFAFAQIRGKIGDFIMGVFSVFQEWLKFSTDLDFTFLEMNPFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNVEFPL
        +ACAPLIATLPLE                 RGKIGDFI GVF+VFQ       DLDF+FLEMNPFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGN+EFPL
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Query:  PFGRVLNPTESFVHSLDEKVTHFILNTMIWSDDQKDIVSLTRGFKPFKIFKALFHKIERSINNLVQIIIIKNGKGKCIKLEFASLQQKAETSASLKFTVL
        PFGRVL+ TE F+H LDEK                                                                       TSASLKFTVL
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Query:  NPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKETKLK
        NPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKE+KLK
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        AARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E                                                                  
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Q53JY8 ATP-citrate synthase subunit alpha chain protein 13.5e-17656.87Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRL  IDLQI SAQV QSTDF EL N +PWLS+ +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD+AQV EFVK RLGV+        
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                  VEMGGCKAPITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVSERLG TISFSECGGIEIEENWDK                      VKTIFL TEKP+TP
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        +ACAPLIATLPLE                 RGKIGDFI GVF+VFQ       DLDF+FLEMNPFT+VNGEPYPLDMRGELDDTAAFK  + KWGN+EFP
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        LPFGRVL+ TE F+H LDEK                                                                       TSASLKFTV
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        LNPKGRIWTMVAGG                 EL NYAEYSGAPNEEEVLQYARVV+DCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDV ATF+GIIRALREKE+KL
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        KAARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMR LG ELGVP+E                                                                 
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                   V+GPEATMTGICKQAIEC+M+A
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Q9SGY2 ATP-citrate synthase alpha chain protein 12.1e-17361.42Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL   +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +        
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                  VEM GCK PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDK                      VKTIFLPT   LTP
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        E CAPL+ATLPLE                I+ +I +FI  +F++FQ       DLDFTFLEMNPFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG++EFPL
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        PFGRV++PTESF+H LDEK                                                                       TSASLKFTVL
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        NPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE KLK
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        AARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G09430.1 ATP-citrate lyase A-35.1e-19159.52Show/hide
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        MARKKIREYDSKRLLKEHLKRL NIDLQI SAQV +STDF ELTN E WLSST+LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LDLA+VA+FVK RLG +        
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                  VEM GCKAPITTFIVEPFVPHDQEYYLSIVS+RLGCTISFSECGGIEIEENWDK                      VKTIFLP EK +T 
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        E CAPLIATLPLE                +R KIG+FIMG F+VFQ       DLDF+F+EMNPFTLV+GEP+PLDMRGELDDTAAFKNF KWG++EFPL
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        PFGRVL+ TE+F+H LDEK                                                                       TSASLKFTVL
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        NPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCAT+DPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKET+LK
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        A+RMHIYVRRGGPNYQTGLA+MRALGEELGVPLE                                                                  
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Query:  CFELTALSPQVFGPEATMTGICKQAIECIM
                  V+GPEATMTGICK+AI+CIM
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AT1G10670.1 ATP-citrate lyase A-11.5e-17461.42Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL   +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +        
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                  VEM GCK PITTFIVEPFVPH++EYYL++VS+RLGC+ISFSECGGIEIEENWDK                      VKTIFLPT   LTP
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        E CAPL+ATLPLE                I+ +I +FI  +F++FQ       DLDFTFLEMNPFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG++EFPL
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        PFGRV++PTESF+H LDEK                                                                       TSASLKFTVL
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        NPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE KLK
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        AARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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AT1G10670.2 ATP-citrate lyase A-11.5e-17461.42Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL   +L I S Q+N++TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVAL LD A VA FVK RLG +        
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        E CAPL+ATLPLE                I+ +I +FI  +F++FQ       DLDFTFLEMNPFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG++EFPL
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        PFGRV++PTESF+H LDEK                                                                       TSASLKFTVL
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        AARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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AT1G10670.4 ATP-citrate lyase A-11.5e-17461.42Show/hide
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        E CAPL+ATLPLE                I+ +I +FI  +F++FQ       DLDFTFLEMNPFTLV+G PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG++EFPL
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        PFGRV++PTESF+H LDEK                                                                       TSASLKFTVL
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        NPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE KLK
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Query:  AARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        AARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMRALG+++GVP+E
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AT1G60810.1 ATP-citrate lyase A-25.3e-17260.67Show/hide
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        MARKKIREYDSKRL+KEH KRL   +L I S Q+NQ TD  EL   EPWLSS +LVVKPDMLFGKRGKSGLVALNLD A VA FVK RLG +        
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                  VEM GCK PITTFIVEPFVPH++E+YL+IVS+RLGC+ISFSECGGI+IEENWDK                      VKTI +PT   LT 
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Query:  EACAPLIATLPLEFSYNSVILTAPFAFAQIRGKIGDFIMGVFSVFQEWLKFSTDLDFTFLEMNPFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNVEFPL
        E CAPL+ATLPLE                I+G++ DFI  +F++F+       DLDFTFLEMNPFTLV+G+PYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWG++EFP+
Subjt:  EACAPLIATLPLEFSYNSVILTAPFAFAQIRGKIGDFIMGVFSVFQEWLKFSTDLDFTFLEMNPFTLVNGEPYPLDMRGELDDTAAFKNFKKWGNVEFPL

Query:  PFGRVLNPTESFVHSLDEKVTHFILNTMIWSDDQKDIVSLTRGFKPFKIFKALFHKIERSINNLVQIIIIKNGKGKCIKLEFASLQQKAETSASLKFTVL
        PFGRV++ TESF+H LDEK                                                                       TSASLKFTVL
Subjt:  PFGRVLNPTESFVHSLDEKVTHFILNTMIWSDDQKDIVSLTRGFKPFKIFKALFHKIERSINNLVQIIIIKNGKGKCIKLEFASLQQKAETSASLKFTVL

Query:  NPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKETKLK
        NPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAP E+EVLQYARVVIDCAT++PDG+ RAL+IGGGIANFTDVAATFNGIIRAL+EKE KLK
Subjt:  NPKGRIWTMVAGGGASVIYADTVGDLGYASELGNYAEYSGAPNEEEVLQYARVVIDCATSDPDGRKRALLIGGGIANFTDVAATFNGIIRALREKETKLK

Query:  AARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE
        AARMHI+VRRGGPNYQ GLAKMR+LG+E+GVP+E
Subjt:  AARMHIYVRRGGPNYQTGLAKMRALGEELGVPLE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTAGGAAGAAGATTCGAGAGTACGACTCTAAGAGGCTTCTCAAGGAGCATCTCAAACGCCTCGTTAATATCGACCTCCAGATCTGCTCTGCTCAGGTAAATCAGTC
GACCGACTTCGCTGAGCTGACGAATAATGAACCATGGCTGTCATCCACCCGGTTGGTAGTGAAACCGGATATGTTATTTGGGAAACGTGGAAAGAGTGGTTTGGTAGCTT
TGAATTTGGATCTAGCTCAAGTTGCTGAGTTTGTGAAGACACGCCTTGGTGTGCAGGTGATTATTCTTTCGCACCTTCATGATCTTTTGAATTCTATCTATCTCTGTTTG
GTTGAGATGGGTGGTTGCAAGGCTCCAATTACGACATTCATTGTTGAGCCATTTGTTCCCCATGATCAAGAGTATTACCTATCTATTGTCTCTGAAAGGCTTGGCTGCAC
AATAAGTTTTTCAGAGTGTGGGGGTATTGAAATTGAAGAGAACTGGGATAAGGTAGGCATTGGATTTTCACTAACTTCTTCTCGGTACTGCAATTATGTTTGCTCATCTC
AGATTCGGGTCAAGACGATTTTCTTACCAACTGAAAAACCTCTTACACCTGAGGCATGTGCTCCGTTAATAGCTACACTTCCTTTGGAGTTTTCCTATAATTCTGTTATA
CTTACTGCACCATTTGCATTTGCCCAGATTCGAGGAAAGATTGGTGACTTCATTATGGGTGTGTTTAGTGTATTTCAAGAGTGGCTTAAATTCTCTACAGATCTGGACTT
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GAAACGTTGAATTTCCTTTGCCCTTTGGTCGAGTGCTAAACCCTACAGAAAGCTTTGTGCACTCTTTAGATGAGAAGGTAACTCATTTTATATTAAACACTATGATTTGG
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