; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh11G003480 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh11G003480
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionhomeobox-leucine zipper protein HAT3-like
Genome locationCmo_Chr11:1702662..1703910
RNA-Seq ExpressionCmoCh11G003480
SyntenyCmoCh11G003480
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001356 - Homeobox domain
IPR003106 - Leucine zipper, homeobox-associated
IPR009057 - Homeobox-like domain superfamily
IPR017970 - Homeobox, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587716.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.7e-10599.02Show/hide
Query:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ
        MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKS TDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ
Subjt:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ

Query:  KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP
        KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA+P
Subjt:  KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP

Query:  NSPPL
        NSPPL
Subjt:  NSPPL

KAG7021681.1 Homeobox-leucine zipper protein HAT3, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.8e-7099.32Show/hide
Query:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
        TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL
Subjt:  TTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL

Query:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEPNSPPL
        RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA+PNSPPL
Subjt:  RSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEPNSPPL

XP_022931479.1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like [Cucurbita moschata]4.1e-107100Show/hide
Query:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ
        MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ
Subjt:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ

Query:  KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP
        KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP
Subjt:  KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP

Query:  NSPPL
        NSPPL
Subjt:  NSPPL

XP_023531587.1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.9e-10599.02Show/hide
Query:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ
        MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKS TDLSFTLVPKQEL INSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ
Subjt:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ

Query:  KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP
        KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP
Subjt:  KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP

Query:  NSPPL
        NSPPL
Subjt:  NSPPL

XP_038879995.1 homeobox-leucine zipper protein HOX17-like [Benincasa hispida]3.1e-6759.29Show/hide
Query:  MGD-QDDLCNIRLGLSLGSGFG--EYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTN----------------------------------
        MGD QD++CNI   LSLG GFG  +YVPKKMQKIN+N         LSFTL+PK+EL IN++  +N                                  
Subjt:  MGD-QDDLCNIRLGLSLGSGFG--EYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTN----------------------------------

Query:  --------------------------------------SLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRAR
                                              S G+   RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKL+TTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRAR
Subjt:  --------------------------------------SLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRAR

Query:  TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA-EPNSPP
        TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHEL+S+KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRT AANAAA + NSPP
Subjt:  TKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA-EPNSPP

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0M012 Homeobox domain-containing protein3.9e-6360.37Show/hide
Query:  QDDLCNIRLGLSLGSGFG-EYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAI-------------NSS------------------------------
        +D++CNI   LSLG GFG +YVPKK+QK      N +    LSFTL+PK+EL I             NSS                              
Subjt:  QDDLCNIRLGLSLGSGFG-EYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAI-------------NSS------------------------------

Query:  ------------------TTTN-------SLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
                           TTN       S GSE  RERKKLRLSKEQ+TLLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD
Subjt:  ------------------TTTN-------SLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVD

Query:  CEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEPNSPP
        CEFLKKCCERLNEENRRLKKEL+ELRS+KLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPA +A    NSPP
Subjt:  CEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEPNSPP

A0A6J1BYS3 homeobox-leucine zipper protein HAT22-like5.8e-6770Show/hide
Query:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQE---LAINSSTT-------------------TNSLGSERERERKKLRL
        MG  D++CNIRLGL LG G  EYVPKK  KIN NH NPK  +DLSFTL+PK+E   + I +S++                   ++S+      ERKKLRL
Subjt:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQE---LAINSSTT-------------------TNSLGSERERERKKLRL

Query:  SKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAAT
        SKEQ+ LLEESFKLHTTLNPAQKQALA QLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKE+ ELRS+K+GASQLYIQLPKAAT
Subjt:  SKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAAT

Query:  LTICPSCDKITRTPAANAAA
        LTICPSC+K+TR  AA AAA
Subjt:  LTICPSCDKITRTPAANAAA

A0A6J1E158 homeobox-leucine zipper protein ATHB-4-like isoform X11.7e-6669.47Show/hide
Query:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAIN--------------------SST--TTNSLGSERERERKKLRL
        MGDQD+LCN RLGL+L  GFG+YVPKKMQK N     PK  +DLSF+L+P+QE AIN                    SST    N++    ERERKKLRL
Subjt:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAIN--------------------SST--TTNSLGSERERERKKLRL

Query:  SKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAAT
        S+EQ TLLEE+FKLHTTLN AQK ALA QLNLK RQVEVWFQNRRAR+KLKQTEVDCEFLKK CERL EEN RLKKEL ELRS KLGASQLYIQLPKAAT
Subjt:  SKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAAT

Query:  LTICPSCDKITRTPAANAAAEPNSPP
        LTICPSCDK TR PA  AA E +SPP
Subjt:  LTICPSCDKITRTPAANAAAEPNSPP

A0A6J1EUD1 homeobox-leucine zipper protein HAT3-like2.0e-107100Show/hide
Query:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ
        MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ
Subjt:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQ

Query:  KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP
        KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP
Subjt:  KQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP

Query:  NSPPL
        NSPPL
Subjt:  NSPPL

A0A6J1JA40 homeobox-leucine zipper protein ATHB-4-like isoform X11.2e-6467.26Show/hide
Query:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAIN--------------------SST--TTNSLGSERERERKKLRL
        MGDQD+LCN RLGL+L  GFG+YVPK MQK N     PK  +DLSF+L+P+QE AIN                    SST    N++    ER+RKKLRL
Subjt:  MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAIN--------------------SST--TTNSLGSERERERKKLRL

Query:  SKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAAT
        S+EQ TLLEE+FKLHTTLN AQK ALA QLNLK+RQVEVWFQNRRAR+KLKQTEVDCEFLKK CERL EEN RLKKEL ELRS K+GASQLYIQLPKAAT
Subjt:  SKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAAT

Query:  LTICPSCDKITRTPAANAAAEPNSPP
        LTICPSCDK TR     AA E +SPP
Subjt:  LTICPSCDKITRTPAANAAAEPNSPP

SwissProt top hitse value%identityAlignment
P46602 Homeobox-leucine zipper protein HAT34.4e-4063.7Show/hide
Query:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG
        G+  +  RKKLRLSKEQA +LEE+FK H+TLNP QK ALA QLNL+TRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L +ENRRL+KE+ ELR++KL 
Subjt:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG

Query:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP
        +  LY+ +    TLT+CPSC+++  T ++++ A P
Subjt:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP

P46604 Homeobox-leucine zipper protein HAT223.8e-3971.55Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+Q+ LLE++FKLH+TLNP QKQALA QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRRL+KEL +L+++KL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKI
        +P AATLT+CPSC+++
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKI

P92953 Homeobox-leucine zipper protein ATHB-43.2e-3863.16Show/hide
Query:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG
        G   +  RKKLRLSK+QA +LEE+FK H+TLNP QK ALA QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CC+ L EENRRL+KE+ ELR++KL 
Subjt:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG

Query:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA
        +  LY+ +    TLT+CPSC++++ + A   AA
Subjt:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA

Q01I23 Homeobox-leucine zipper protein HOX172.4e-3864.29Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+Q+ +LE+SF+ H TLNP QK  LA QL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK+CCE L EENRRL+KE+ ELR++KL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA
        +    TLT+CPSC++++ T   ++AA
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA

Q0JB92 Homeobox-leucine zipper protein HOX172.4e-3864.29Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ
        RKKLRLSK+Q+ +LE+SF+ H TLNP QK  LA QL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLK+CCE L EENRRL+KE+ ELR++KL +  LY+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA
        +    TLT+CPSC++++ T   ++AA
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G44910.1 homeobox-leucine zipper protein 42.3e-3963.16Show/hide
Query:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG
        G   +  RKKLRLSK+QA +LEE+FK H+TLNP QK ALA QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CC+ L EENRRL+KE+ ELR++KL 
Subjt:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG

Query:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA
        +  LY+ +    TLT+CPSC++++ + A   AA
Subjt:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA

AT3G60390.1 homeobox-leucine zipper protein 33.2e-4163.7Show/hide
Query:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG
        G+  +  RKKLRLSKEQA +LEE+FK H+TLNP QK ALA QLNL+TRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L +ENRRL+KE+ ELR++KL 
Subjt:  GSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLG

Query:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP
        +  LY+ +    TLT+CPSC+++  T ++++ A P
Subjt:  ASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEP

AT4G16780.1 homeobox protein 21.1e-3855.9Show/hide
Query:  SSTTTNSLGSERERE--------------------RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEF
        +ST ++S G   ERE                    RKKLRLSK+Q+ +LEE+FK H+TLNP QKQALA QL L+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEF
Subjt:  SSTTTNSLGSERERE--------------------RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEF

Query:  LKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA
        L++CCE L EENRRL+KE+ ELR++KL + Q Y+ +    TLT+CPSC+ ++  P    AA
Subjt:  LKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAA

AT4G37790.1 Homeobox-leucine zipper protein family2.7e-4071.55Show/hide
Query:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ
        RKKLRL+K+Q+ LLE++FKLH+TLNP QKQALA QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCE L +ENRRL+KEL +L+++KL +   Y+ 
Subjt:  RKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQ

Query:  LPKAATLTICPSCDKI
        +P AATLT+CPSC+++
Subjt:  LPKAATLTICPSCDKI

AT5G06710.1 homeobox from Arabidopsis thaliana8.6e-3964.44Show/hide
Query:  ERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGAS
        E    RKKLRLSK+Q+  LE+SFK H+TLNP QK ALA QLNL+ RQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCE+LK+CCE L EENRRL+KE+ ELR++K  ++
Subjt:  ERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNLKTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGAS

Query:  QLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEPNS
          Y+QLP A TLT+CPSC+++     A +AA+P++
Subjt:  QLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEPNS


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAGACCAAGACGACCTCTGCAACATCAGGCTCGGCCTTAGCCTCGGCTCTGGATTTGGGGAATACGTCCCCAAAAAGATGCAGAAAATCAACAGTAATCATAACAA
CCCTAAATCCTGCACTGACCTCTCCTTCACCCTGGTTCCGAAGCAAGAATTGGCCATTAATTCTTCAACCACAACCAACAGCCTCGGCTCCGAACGTGAAAGAGAGAGAA
AAAAGCTTCGGCTTTCTAAAGAACAAGCCACTTTGCTCGAAGAAAGCTTCAAACTTCACACCACTTTGAATCCTGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCACCAATTAAACCTC
AAAACACGACAAGTGGAAGTCTGGTTCCAAAACAGACGTGCAAGGACGAAATTGAAGCAAACGGAAGTGGACTGCGAGTTCTTGAAGAAATGCTGCGAGAGGCTGAACGA
AGAGAATCGGAGGTTGAAGAAAGAGTTGCATGAATTAAGATCCATCAAACTCGGAGCTTCCCAGTTGTATATTCAGCTCCCCAAGGCGGCGACGCTCACAATTTGCCCCT
CATGCGACAAGATCACCAGGACACCCGCCGCCAACGCCGCCGCCGAGCCCAACTCTCCGCCACTATAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
AATAATAATTAAAACCCCTACGAGATCATCATAACTGATATTCAACTCGAAACCTCTTTCCTTCAAACCCTCTCTTAATACCCTCTCCCTCTCATCCCTCTCTTTCTCTC
TCTACATCCGCCATGGGAGACCAAGACGACCTCTGCAACATCAGGCTCGGCCTTAGCCTCGGCTCTGGATTTGGGGAATACGTCCCCAAAAAGATGCAGAAAATCAACAG
TAATCATAACAACCCTAAATCCTGCACTGACCTCTCCTTCACCCTGGTTCCGAAGCAAGAATTGGCCATTAATTCTTCAACCACAACCAACAGCCTCGGCTCCGAACGTG
AAAGAGAGAGAAAAAAGCTTCGGCTTTCTAAAGAACAAGCCACTTTGCTCGAAGAAAGCTTCAAACTTCACACCACTTTGAATCCTGCTCAGAAACAGGCACTTGCCCAC
CAATTAAACCTCAAAACACGACAAGTGGAAGTCTGGTTCCAAAACAGACGTGCAAGGACGAAATTGAAGCAAACGGAAGTGGACTGCGAGTTCTTGAAGAAATGCTGCGA
GAGGCTGAACGAAGAGAATCGGAGGTTGAAGAAAGAGTTGCATGAATTAAGATCCATCAAACTCGGAGCTTCCCAGTTGTATATTCAGCTCCCCAAGGCGGCGACGCTCA
CAATTTGCCCCTCATGCGACAAGATCACCAGGACACCCGCCGCCAACGCCGCCGCCGAGCCCAACTCTCCGCCACTATAATTTAATGTCATTTTTTGTAGTACAGGAAAA
GGGATCAATAATTTAAGCTCAATAACTTTACAGCCTTTTTAGATTATTATATGAATCATTTCTATTTTTTTTTTAATTAATTAAGAACTAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGDQDDLCNIRLGLSLGSGFGEYVPKKMQKINSNHNNPKSCTDLSFTLVPKQELAINSSTTTNSLGSERERERKKLRLSKEQATLLEESFKLHTTLNPAQKQALAHQLNL
KTRQVEVWFQNRRARTKLKQTEVDCEFLKKCCERLNEENRRLKKELHELRSIKLGASQLYIQLPKAATLTICPSCDKITRTPAANAAAEPNSPPL