; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh11G003610 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh11G003610
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionBasic helix-loop-helix transcription factor
Genome locationCmo_Chr11:1780118..1783310
RNA-Seq ExpressionCmoCh11G003610
SyntenyCmoCh11G003610
Gene Ontology termsGO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function)
GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0046983 - protein dimerization activity (molecular function)
InterPro domainsIPR011598 - Myc-type, basic helix-loop-helix (bHLH) domain
IPR036638 - Helix-loop-helix DNA-binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6587729.1 Transcription factor basic helix-loop-helix 35, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-12097.05Show/hide
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KAG7021695.1 Transcription factor bHLH35 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.7e-12197.47Show/hide
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XP_023531024.1 transcription factor bHLH35-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.8e-12298.31Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1C2W6 transcription factor bHLH35-like2.4e-8877.73Show/hide
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A0A6J1E262 transcription factor bHLH35-like1.8e-8876.05Show/hide
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A0A6J1EXI5 transcription factor bHLH35-like1.0e-123100Show/hide
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A0A6J1JJ79 transcription factor bHLH35-like3.6e-8976.47Show/hide
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A0A6J1KNJ5 transcription factor bHLH35-like6.2e-12198.31Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q0JEB7 Transcription factor BHLH64.7e-3334.93Show/hide
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         P+E+ +L V+ +G+R +VVS+TC KR D+M ++C+  E L+L++ITANIT+V+G L+ T+F+E    +   +K  +E AL+ L    SP+S
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Q0V7X4 Transcription factor FER-LIKE IRON DEFICIENCY-INDUCED TRANSCRIPTION FACTOR5.9e-1232.28Show/hide
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        S+ ++SER RR ++ D+L+ALR++VPNI+KMDKASI+ DA+ ++Q+L+ Q ++++++I  LE+  S      Y+        H P   KT+ F   +  A
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        ++    +++ + V  + E+   V L C K       L K  ESL   ++  +N+++ S
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Q2HIV9 Transcription factor bHLH352.5e-5553.59Show/hide
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        NY E   F+  ED     SW L++ +   YDSSSP+G  S S ASKNIVSERNRR+KLN RLFALR+VVPNI+KMDKASIIKDAI +I+ L+ +E+++E 
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        EI ELES          +F++++ +  T K+ K         S +  S IEVL+L VT+MGERT+VVS+TC KR D+MVKLC+VFESL LKI+T+N+T+ 
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        SG +  TVFIEA +EE+++L++KIET +   N+ QSP
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Q700E3 Transcription factor bHLH271.0e-4045.37Show/hide
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        I ELES  +  +  +  Y+    E  L      N  ++++F   D S+  +  PIEVL++ VT+MGE+T+VV +TC K+ ++MV+LCKV ESL L I+T 
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        N ++ + RL  T+F++
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Q9LSE2 Transcription factor ICE11.3e-1129.35Show/hide
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        +KN+++ER RR+KLNDRL+ LR+VVP ISKMD+ASI+ DAID++++L ++   +  E+     G      + +      PL  TP+            S+
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              +   + V     R + + + C +R   ++   K  ++L L +  A I+  +G  L     E  QE +++L  +I+  L
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G29930.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein6.9e-4845.19Show/hide
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        NY E  +F      +  SW +++      +SSSP+G  +  A+SKN+VSERNRR+KLN RLFALR+VVPNISK+DKAS+IKD+ID++Q+L +QE+ +E E
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        N ++ + RL  T+F++A +EE   ++ KI+ A+A  NDP
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AT5G57150.1 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein8.1e-5752.97Show/hide
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        I ELES          +F++++ +  T K+ K         S +  S IEVL+L VT+MGERT+VVS+TC KR D+MVKLC+VFESL LKI+T+N+T+ S
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        G +  TVFIEA +EE+++L++KIET +   N+ QSP
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AT5G57150.2 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.1e-4854.5Show/hide
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AT5G57150.4 basic helix-loop-helix (bHLH) DNA-binding superfamily protein3.1e-4854.5Show/hide
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