; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh11G007770 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh11G007770
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptiontranscription factor Pur-alpha 1-like
Genome locationCmo_Chr11:3801726..3806317
RNA-Seq ExpressionCmoCh11G007770
SyntenyCmoCh11G007770
Gene Ontology termsGO:0006357 - regulation of transcription by RNA polymerase II (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0000977 - RNA polymerase II regulatory region sequence-specific DNA binding (molecular function)
GO:0000981 - DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific (molecular function)
GO:0003729 - mRNA binding (molecular function)
GO:0032422 - purine-rich negative regulatory element binding (molecular function)
InterPro domainsIPR006628 - Purine-rich element binding protein family


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588115.1 Transcription factor Pur-alpha 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.1e-16899.67Show/hide
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KAG7022000.1 Transcription factor Pur-alpha 1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.8e-16696.21Show/hide
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XP_022967890.1 transcription factor Pur-alpha 1-like [Cucurbita maxima]1.5e-16699.02Show/hide
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XP_023531642.1 transcription factor Pur-alpha 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.7e-16899.67Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1D0R2 transcription factor Pur-alpha 16.0e-16195.74Show/hide
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A0A6J1EUL9 transcription factor Pur-alpha 1-like1.0e-168100Show/hide
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A0A6J1H823 transcription factor Pur-alpha 1-like3.2e-16296.08Show/hide
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A0A6J1HVP1 transcription factor Pur-alpha 1-like7.3e-16799.02Show/hide
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A0A6J1JGC7 transcription factor Pur-alpha 1-like1.2e-16196.07Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O35295 Transcriptional activator protein Pur-beta5.1e-1629Show/hide
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        G  GGGG   GG        GG  GG GG     EL  K L +++K FY D+K+N +GR+LKI+E     ++S + +  +    F D    +I       
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           PE               + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++ + +V+R         G     G            ++ +   LP Q   E  
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        + L  L DD G      AG   G +  PG                   G L     I  D KRFFFD+G N  G FLR+SEV  + R++I +P     +F
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P42669 Transcriptional activator protein Pur-alpha7.9e-1728.62Show/hide
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        G++ G G S+G   +GS + GG  GGGGGGG+               EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F D
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Query:  LFNYYIN----------------SDDPE--VFSKELQLDTKVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWTAFRNILAEINEASRLFI
            +I                  D+P   + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++        R T+    G    +G T                 
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        LP Q   E  + L  L DD G                           ++E   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q00577 Transcriptional activator protein Pur-alpha1.0e-1628.52Show/hide
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        G++ G G S+G   +GS + GG  GGGGGGG+                EL  K + +++K FY D+K+N +GR+LKI+E      +S + +  S    F 
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Query:  DLFNYYIN----------------SDDPE--VFSKELQLDTKVFYFDIGENRRGRFLKVSEASVSRNRSTIIVPAGSNRDEGWTAFRNILAEINEASRLF
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         LP Q   E  + L  L DD G                           ++E   L     +  D KRFFFD+GSN  G F+R+SEV    R+SI +P
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Q68A21 Transcriptional activator protein Pur-beta2.8e-1428.33Show/hide
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        + G  G   GG   GS       GGG GG  +  EL  K L +++K FY D+K+N +GR+LKI+E     ++S + +  +    F D    +I       
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           PE               + S+ L  + + +Y D+ EN+RGRFL++ + +V+R         G     G            ++ +   LP Q   E  
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        + L  L DD G      AG   G +  PG                   G L     I  D KRFFFD+G N  G FLR+SEV  + R++I +P     +F
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Sequences Show/hide sequences
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GTTGATGTGCAAAACATTGCAGGTGGAGCACAAATTGTTCTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGCCGATATCTGAAGATTTCAGAGAAGACGTCGGCTACAAGGT
CAACGATCATTGTTCCCTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAGGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTCGACACC
AAGGTGTTCTACTTTGACATTGGTGAAAATCGTAGGGGTCGATTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCTGTCAGTAGAAACCGCAGCACCATTATCGTTCCTGCTGGAAGCAA
TCGGGACGAGGGATGGACTGCGTTCAGAAACATTTTGGCAGAGATCAATGAAGCGTCTAGGCTTTTCATACTGCCCAATCAGGAAAATTCCGAACATTCAGAACGTCTAG
TCGGACTTTCGGATGATGTAGGTGCTGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAACCTGGTCCAACCTCTGACTTGAATGTAGACAGACAAGTAGACTTATCAGCTCAAGAT
GAAATGGGCAATCTGGGGGTATCAAAAGTTATCCGAGCTGATCAGAAGCGATTCTTTTTCGATCTTGGAAGTAACAACCGGGGTCATTTTTTGAGGATATCTGAGGTTGC
AGGGGCAGATCGTTCTTCGATCATTCTCCCATTGTCGGGGCTAAAGCAGTTCTATGAAATAGTTGGACATTTCGTGGAGATCACCAAAGATAGGATTGAAGGAATGACGG
GCGTGAATGTTAGGACGGTGGATCCGCCTCATAGATGA
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TTGGGTTCTTCTTCCTGATTCAGGCGGGTCGAGATTGAGAATCACCCGTTCATGGGATGCTGCCAATGGCGACTGCAATCAGAAAGCCCAGCCTTTGACCGAAGTTGACT
ACGAAGATTGTCAACATTACGATACAGTGGCAACATAGTTGCAGACGCTGAAAGGAATTATTAGTAGAATCTGAGTCAGAGCTGGGAGTGGGAGATGGAGGGGAGTTCCG
GCGGAGGTGGAGTGAGTATTGGGGGAACGACGGCGGGCAGCGTGGCGGTGGGTGGAGTGACGGGTGGCGGCGGCGGAGGAGGTAACGACGTGGAGTTGATGTGCAAAACA
TTGCAGGTGGAGCACAAATTGTTCTACTTCGATCTGAAGGAGAATCCCAGAGGCCGATATCTGAAGATTTCAGAGAAGACGTCGGCTACAAGGTCAACGATCATTGTTCC
CTTCTCTGGGATTCCATGGTTCTTAGATCTCTTCAATTACTATATCAATTCTGATGATCCGGAGGTTTTTAGCAAGGAATTGCAGCTCGACACCAAGGTGTTCTACTTTG
ACATTGGTGAAAATCGTAGGGGTCGATTCTTGAAGGTATCTGAAGCTTCTGTCAGTAGAAACCGCAGCACCATTATCGTTCCTGCTGGAAGCAATCGGGACGAGGGATGG
ACTGCGTTCAGAAACATTTTGGCAGAGATCAATGAAGCGTCTAGGCTTTTCATACTGCCCAATCAGGAAAATTCCGAACATTCAGAACGTCTAGTCGGACTTTCGGATGA
TGTAGGTGCTGGCTTCATATCAGGTCATAGTAGTCAACCTGGTCCAACCTCTGACTTGAATGTAGACAGACAAGTAGACTTATCAGCTCAAGATGAAATGGGCAATCTGG
GGGTATCAAAAGTTATCCGAGCTGATCAGAAGCGATTCTTTTTCGATCTTGGAAGTAACAACCGGGGTCATTTTTTGAGGATATCTGAGGTTGCAGGGGCAGATCGTTCT
TCGATCATTCTCCCATTGTCGGGGCTAAAGCAGTTCTATGAAATAGTTGGACATTTCGTGGAGATCACCAAAGATAGGATTGAAGGAATGACGGGCGTGAATGTTAGGAC
GGTGGATCCGCCTCATAGATGAACACTATAGGCCCGGGGGGTTTGTGGTGAATAATTTCGGTTAATGTTTGTGTAGATGATGTTCGAGTAGGGTTGAAATTGTGGTGGGT
GTGGTTTGATATTGTGTTGTCGTTGTCGTCGTCGTCGTCTTGATTTTCTAGTTCTAAGTCTGAATAATCCATGCTGCTTGATCAGCAGAGGCTATGGAAAATGCTTGAGA
AGCTTAATTATTCTTCTTCCATGAATAACACAAGAGAGGGGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGAAAGCGATGCTTGTAATTGTCACTTTATAATAATGGTGAGTTCAGGTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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