; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh11G008540 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh11G008540
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionprotein mago nashi homolog
Genome locationCmo_Chr11:4354350..4357439
RNA-Seq ExpressionCmoCh11G008540
SyntenyCmoCh11G008540
Gene Ontology termsGO:0008380 - RNA splicing (biological process)
GO:0035145 - exon-exon junction complex (cellular component)
InterPro domainsIPR004023 - Mago nashi protein
IPR036605 - Mago nashi superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7022084.1 Protein mago nashi-like 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.7e-82100Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

KAG7028477.1 Protein mago nashi-like 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.4e-8097.37Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        M+ ED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

XP_004133764.1 protein mago nashi homolog [Cucumis sativus]3.7e-8198.68Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

XP_008437772.1 PREDICTED: protein mago nashi homolog [Cucumis melo]8.3e-8198.03Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        M+AED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

XP_022933981.1 protein mago nashi homolog [Cucurbita moschata]5.7e-82100Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0L898 Uncharacterized protein1.8e-8198.68Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

A0A1S3AVD6 protein mago nashi homolog4.0e-8198.03Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        M+AED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

A0A5A7TYX4 Protein mago nashi-like protein4.0e-8198.03Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        M+AED+ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

A0A6J1F0J2 protein mago nashi homolog2.8e-82100Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

A0A6J1HTH0 protein mago nashi homolog2.8e-82100Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A0P0XB70 Protein mago nashi homolog 15.0e-7390.97Show/hide
Query:  GEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFTTS
        GEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYK DTMIRKEV+++P+VLRE  RII +SEIMKEDD+NWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFTTS
Subjt:  GEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFTTS

Query:  KIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        KIGSLVDVQ+SKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLI+LH+KIKPI
Subjt:  KIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

O23676 Protein mago nashi homolog5.0e-7387.5Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAE  E  EFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFR DGKLRYANNSNYKNDT+IRKEV+LTPAVL+EC+RI+S+SEI+KEDDNNWPEPDRVG+QELEIV+GN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISF TSKIGSLVD QSS DPEGLRIFYYLVQDLKC VFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

O65806 Protein mago nashi homolog2.7e-7491.78Show/hide
Query:  ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFT
        E+ EFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEV+LTPAVL+ECRRII++SEIMKEDD NWP PDRVGRQELEIVMGNE+ISFT
Subjt:  ENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFT

Query:  TSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        TSKIGSLVDVQ SKDPEGLRIFYYLV DLKCFVFSLISLH+KIKPI
Subjt:  TSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

P49030 Protein mago nashi homolog 21.1e-7590.13Show/hide
Query:  AAEDME-NGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        A ED+   GEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEV+++P+VLRE RRII +SEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
Subjt:  AAEDME-NGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISFTTSKIGSLVDVQ+SKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLI+LH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

Q566Y8 Protein mago nashi homolog6.0e-6680.95Show/hide
Query:  MENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISF
        M   +FYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKND MIRKE Y+  +V+ E +RII DSEI KEDD  WP PDRVGRQELEIV+G+EHISF
Subjt:  MENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISF

Query:  TTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        TTSKIGSL+DV  SKDPEGLR+FYYLVQDLKC VFSLI LH+KIKPI
Subjt:  TTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02140.1 mago nashi family protein3.6e-7487.5Show/hide
Query:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN
        MAAE  E  EFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFR DGKLRYANNSNYKNDT+IRKEV+LTPAVL+EC+RI+S+SEI+KEDDNNWPEPDRVG+QELEIV+GN
Subjt:  MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGN

Query:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI
        EHISF TSKIGSLVD QSS DPEGLRIFYYLVQDLKC VFSLISLH+KIKPI
Subjt:  EHISFTTSKIGSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCGGCCGAGGATATGGAGAATGGTGAGTTTTACTTGAGATATTATGTAGGGCACAAAGGAAAATTTGGGCACGAGTTCTTGGAGTTCGAATTCCGACCTGATGGCAA
GCTTCGCTACGCTAACAACTCCAATTACAAGAACGATACGATGATTCGCAAGGAAGTCTACCTCACTCCTGCTGTCCTCCGGGAATGCCGTCGAATCATCTCCGATAGCG
AGATAATGAAGGAAGATGACAATAATTGGCCAGAACCCGATCGGGTTGGACGACAGGAGCTGGAGATTGTGATGGGAAACGAGCATATCTCCTTTACTACATCTAAGATT
GGATCTCTTGTTGATGTGCAAAGCAGCAAGGATCCTGAAGGATTGCGGATATTCTATTATCTTGTTCAGGATCTGAAATGCTTTGTATTTTCTCTCATTTCACTCCACTA
CAAGATCAAGCCAATTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GCTCCACGCACCTTCTTCCCCACGCCGTTACCTCCTCCGTTTCAGCAGCTCAGCGGCGCCATCGTCGTCGGCAATTCTCCTATATATAAGGGATATATTCGAGTCGCTGA
GGCTGCGCGGGAGAGAAAGAAGGTTTACTGCGGGTGCCATGGCGGCCGAGGATATGGAGAATGGTGAGTTTTACTTGAGATATTATGTAGGGCACAAAGGAAAATTTGGG
CACGAGTTCTTGGAGTTCGAATTCCGACCTGATGGCAAGCTTCGCTACGCTAACAACTCCAATTACAAGAACGATACGATGATTCGCAAGGAAGTCTACCTCACTCCTGC
TGTCCTCCGGGAATGCCGTCGAATCATCTCCGATAGCGAGATAATGAAGGAAGATGACAATAATTGGCCAGAACCCGATCGGGTTGGACGACAGGAGCTGGAGATTGTGA
TGGGAAACGAGCATATCTCCTTTACTACATCTAAGATTGGATCTCTTGTTGATGTGCAAAGCAGCAAGGATCCTGAAGGATTGCGGATATTCTATTATCTTGTTCAGGAT
CTGAAATGCTTTGTATTTTCTCTCATTTCACTCCACTACAAGATCAAGCCAATTTAAAGACGGCCCAAAATTCCTAGTGTGCAATCTGAGGAACACTTCTCTCCAAACTG
TGAAATCTTATTTTGGGCATTTTTTGAACTGCAAAATTCGGGATTCAGAATCATTATTGTTTTTAGAGTTCTCTGGATTTCATGTATATGCACAGACGATGGGCGTTGTA
TGACCTTTATTTTAATTAGAATATGTCCTGGATAGATAGAATGCCGGCTGATGGCATCTGCATGCTTTCTTTTTTCAGCTTAGAATATGCTTTCCTTTCATGAAACTGTA
ATTAAATTTGAAGTTTCCTGATTGAAGTTTGGATTATGTGATGTCACAATCACTCACACACTCACAGAGTGATTGCACCTATTCTCACCGAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAAEDMENGEFYLRYYVGHKGKFGHEFLEFEFRPDGKLRYANNSNYKNDTMIRKEVYLTPAVLRECRRIISDSEIMKEDDNNWPEPDRVGRQELEIVMGNEHISFTTSKI
GSLVDVQSSKDPEGLRIFYYLVQDLKCFVFSLISLHYKIKPI