CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh11G009600
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	WRKY transcription factor SUSIBA2-like
Genome location	Cmo_Chr11:5051171..5051925
RNA-Seq Expression	CmoCh11G009600
Synteny	CmoCh11G009600
Gene Ontology terms	GO:0006355 - regulation of transcription, DNA-templated (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0003700 - DNA-binding transcription factor activity (molecular function) GO:0043565 - sequence-specific DNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR044810 - WRKY transcription factor, plant

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6588278.1 putative WRKY transcription factor 2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

4.2e-71

100

Show/hide

Query:  MQFMEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKD
        MQFMEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKD
Subjt:  MQFMEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKD

Query:  ENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ
        ENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ
Subjt:  ENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ

KAG7022198.1 WRKY transcription factor WRKY24, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

2.3e-61

90.44

Show/hide

Query:  MQFMEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKD
        MQFMEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIM+ +         G FPIHSIKD
Subjt:  MQFMEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKD

Query:  ENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ
        ENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ
Subjt:  ENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ

XP_022927490.1 probable WRKY transcription factor 2 [Cucurbita moschata]

3.0e-69

100

Show/hide

Query:  MEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENS
        MEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENS
Subjt:  MEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENS

Query:  LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ
        LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ
Subjt:  LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ

XP_023003130.1 WRKY transcription factor SUSIBA2-like [Cucurbita maxima]

9.0e-66

96.99

Show/hide

Query:  MEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENS
        MEVYGEHRASKFGDDDV VDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDI SPTTG FPIHSIKDENS
Subjt:  MEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENS

Query:  LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ
        LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELR ENQ
Subjt:  LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ

XP_023520684.1 WRKY transcription factor WRKY24-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

5.6e-68

97.06

Show/hide

Query:  MQFMEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKD
        + FMEVYGEHRASKFGDDDV VDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKD
Subjt:  MQFMEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKD

Query:  ENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ
        ENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRL NQ
Subjt:  ENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0M0L1 Uncharacterized protein

6.5e-30

60.16

Show/hide

Query:  DDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTF-PIHSIKDENSLLNPIMLEDGSS
        DD V VD N GS A  R SKR RNG+   +      S ++ SP LTIP G +PT+LLDSP+MLLNT D+PSPTTGTF PIH IKDE SLLNP+M EDG S
Subjt:  DDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTF-PIHSIKDENSLLNPIMLEDGSS

Query:  YGSEDSYYRFTPRGE-------LRLENQ
        +GSEDS++RF P+GE       LR+ENQ
Subjt:  YGSEDSYYRFTPRGE-------LRLENQ

A0A6J1EP38 probable WRKY transcription factor 2

1.4e-69

100

Show/hide

Query:  MEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENS
        MEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENS
Subjt:  MEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENS

Query:  LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ
        LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ
Subjt:  LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ

A0A6J1HD23 WRKY transcription factor SUSIBA2-like isoform X1

7.5e-42

62.73

Show/hide

Query:  MQFMEVYGEHRAS------KFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIA---------MARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDI
        M+FM+  GE+  S      KF DD+V VD N GSL   RASKRGRNGFN++             PLGS MVRSP LTIP G SPT+LLDSPI LLNT D+
Subjt:  MQFMEVYGEHRAS------KFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIA---------MARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDI

Query:  PSPTTGTFPIHSIKDENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGEL-------RLENQVID
        PSPTTGTFPIH IKDE+SLLNP+M EDGSS+GSEDSY+RFTP GEL       RLENQ  D
Subjt:  PSPTTGTFPIHSIKDENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGEL-------RLENQVID

A0A6J1JK30 WRKY transcription factor WRKY24-like isoform X1

1.1e-42

63.35

Show/hide

Query:  MQFMEVYGEH------RASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIA---------MARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDI
        M+FM+  GE+        SKF DD+V VD NGGSL   RASKRGRNGFN++             PLGS MVRSP LTIP G SPT+LLDSPI LLNT D+
Subjt:  MQFMEVYGEH------RASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIA---------MARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDI

Query:  PSPTTGTFPIHSIKDENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGEL-------RLENQVID
        PSPTTGTFPIH IKDE+SLLNP+M EDGSS+GSEDSY+RFTP GEL       RLENQ  D
Subjt:  PSPTTGTFPIHSIKDENSLLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGEL-------RLENQVID

A0A6J1KQX2 WRKY transcription factor SUSIBA2-like

4.3e-66

96.99

Show/hide

Query:  MEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENS
        MEVYGEHRASKFGDDDV VDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDI SPTTG FPIHSIKDENS
Subjt:  MEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENS

Query:  LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ
        LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELR ENQ
Subjt:  LLNPIMLEDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQ

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q6VWJ6 WRKY transcription factor SUSIBA2

9.2e-05

45.31

Show/hide

Query:  ARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENSLLNPIML
        AR P+     R   LTIP+GFSP+ LLDSP++L N    PSPTTG+  + +I  +++  +P ML
Subjt:  ARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENSLLNPIML

Q9C5T3 Probable WRKY transcription factor 26

4.9e-06

45.76

Show/hide

Query:  SPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIK-DENSLL---NPIMLED
        SP+ T+P G +P   LDSP++  +++ +PSPTTGTFP  S+  + N LL   N I  ED
Subjt:  SPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIK-DENSLL---NPIMLED

Q9FG77 Probable WRKY transcription factor 2

7.0e-05

38.04

Show/hide

Query:  EHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGS-----SMVRSPFLTIPS-GFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFP
        E  +S    D    +V  G L++R A++ G N   +        +     S +RSP LTI S G SP  LL+SP+ L N    PSPTTG FP
Subjt:  EHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGS-----SMVRSPFLTIPS-GFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFP

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G26640.2 WRKY family transcription factor family protein

6.1e-04

35.44

Show/hide

Query:  GSLADRRASKRGRNGFN-----IAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTF----PIH
        G L  +  S  G  G       ++ A+ P+     RS  +TIP G SPT  L+SP+ + N    PSPTTG+     P+H
Subjt:  GSLADRRASKRGRNGFN-----IAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTF----PIH

AT5G07100.1 WRKY DNA-binding protein 26

3.5e-07

45.76

Show/hide

Query:  SPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIK-DENSLL---NPIMLED
        SP+ T+P G +P   LDSP++  +++ +PSPTTGTFP  S+  + N LL   N I  ED
Subjt:  SPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIK-DENSLL---NPIMLED

AT5G56270.1 WRKY DNA-binding protein 2

5.0e-06

38.04

Show/hide

Query:  EHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGS-----SMVRSPFLTIPS-GFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFP
        E  +S    D    +V  G L++R A++ G N   +        +     S +RSP LTI S G SP  LL+SP+ L N    PSPTTG FP
Subjt:  EHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGS-----SMVRSPFLTIPS-GFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCAGTTCATGGAGGTCTATGGCGAGCACAGAGCCTCTAAATTTGGTGATGATGATGTTCATGTGGATGTCAATGGTGGCAGCTTGGCTGATAGACGAGCTTCCAAGAG
AGGGAGAAATGGGTTCAATATCGCTATGGCTCGGTGCCCATTGGGTTCGTCGATGGTTCGATCTCCTTTCCTCACAATTCCTTCCGGGTTTAGCCCGACCGTGTTGCTTG
ATTCGCCGATTATGTTGCTCAATACCCATGATATTCCATCTCCAACAACGGGGACGTTTCCGATACATTCCATAAAGGATGAGAATTCGTTGCTGAATCCTATCATGCTT
GAAGATGGGAGTAGCTATGGCAGTGAGGATTCGTACTACAGGTTCACGCCTCGTGGGGAGCTCCGGCTTGAAAATCAGGTAATTGATTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MQFMEVYGEHRASKFGDDDVHVDVNGGSLADRRASKRGRNGFNIAMARCPLGSSMVRSPFLTIPSGFSPTVLLDSPIMLLNTHDIPSPTTGTFPIHSIKDENSLLNPIML
EDGSSYGSEDSYYRFTPRGELRLENQVID

CmoCh11G009600 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome