; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh11G013170 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh11G013170
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionNEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like
Genome locationCmo_Chr11:9107359..9111195
RNA-Seq ExpressionCmoCh11G013170
SyntenyCmoCh11G013170
Gene Ontology termsGO:0045116 - protein neddylation (biological process)
GO:0005634 - nucleus (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0019788 - NEDD8 transferase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000608 - Ubiquitin-conjugating enzyme E2
IPR016135 - Ubiquitin-conjugating enzyme/RWD-like
IPR023313 - Ubiquitin-conjugating enzyme, active site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036519.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucumis melo var. makuwa]3.2e-10194.18Show/hide
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KAG7022419.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.7e-10890.61Show/hide
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XP_022931623.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita moschata]9.1e-104100Show/hide
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XP_023530137.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.7e-10399.45Show/hide
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XP_038888942.1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like [Benincasa hispida]7.2e-10197.27Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3BHD5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.1e-9996.17Show/hide
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A0A5D3CPZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like1.6e-10194.18Show/hide
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A0A6J1C2V1 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like6.0e-10196.72Show/hide
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A0A6J1EZ82 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like4.4e-104100Show/hide
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A0A6J1JMG9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like4.4e-104100Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A3KN22 NEDD8-conjugating enzyme Ubc125.6e-6462.3Show/hide
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Q6DCZ9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc123.3e-6462.3Show/hide
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Q6P8D9 NEDD8-conjugating enzyme Ubc123.3e-6462.3Show/hide
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Q9SDY5 NEDD8-conjugating enzyme Ubc121.6e-8783.7Show/hide
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Q9ZU75 Probable NEDD8-conjugating enzyme Ubc12-like8.3e-8481.08Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT2G18600.1 Ubiquitin-conjugating enzyme family protein5.9e-8581.08Show/hide
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AT3G08690.1 ubiquitin-conjugating enzyme 111.0e-2337.78Show/hide
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         +  L T PN +DPL  + A + + +   +ES  R
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AT3G08690.2 ubiquitin-conjugating enzyme 111.0e-2337.78Show/hide
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        R+ K++ +L      + S     +++ +++ TI  P E  Y GG FL S    P YP +PPKV  KTKVYHPNI+  G++CL+IL+E W P L I+ ++ 
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AT4G36800.1 RUB1 conjugating enzyme 11.2e-8883.7Show/hide
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        VYHPNIDLEGNVCLNILREDWKPVLNINT+IYGLFHLFT+PN EDPLNHDAAAVLRDNPK+FE+NVRRAM GGYVG TFF RC+
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AT4G36800.2 RUB1 conjugating enzyme 11.2e-8883.7Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACGCCGGTCCTCAGTGGAAGCTCGAAAGCGAAGGGATCCGAATTTGGCCCTGGAAAGCGTACGACGATAATTTCACAGAGGAAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAGAAA
GAGCTCTGAATCAAACCCATCTTCCTCCGTTCTCTCCCACTTTCTACACGCTTTCTTTCCTCCCAACCTCTGCTTCAGCTTTATCCTTTCGAGAATTGGTGTCTACTCGT
TCGAATCCAGGCAAGCTTTAGTCTCCTCTCTGTTCTTTTGTTTTCTTTCTGCTGCGATCGGCTCCATTTCTGTTTCAGCTTGCTTTCATTTTCTTTTTCATTCTCGATTG
ATTGATGGATTGATCCAGGGTTGGAGCTTCATTGATTTTGTGTTAGTGTTTTATGCGTGTCGAATGAAGCGTATCTTGATTACGCCTTGCATCATTAGTGCTCCAAATTT
GATATCCCTATTTATACAGTACCCTGCAGGAACGATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATCGCAAAAAATGCCGATGGAAAACCTCCTGTCAAGA
AGCAAACTGCAGGAGAATTGCGTCTTCAAAAAGATATCAGTGAACTGAACCTGCCAAAAACGTGTAGTATATCCTTTCCTAATGGCAAGGATGAGTTGATGAACTTTGAG
GTCACTATTCATCCTGATGAAGGATATTATCTAGGTGGTACATTTCTCTTCTCTTTCCAAGTTTCCCCTGTCTACCCTCACGAGCCACCAAAAGTGAAGTGCAAGACAAA
GGTGTATCATCCTAATATCGACTTGGAAGGAAATGTTTGTCTCAATATTTTAAGAGAGGACTGGAAGCCCGTTCTGAATATCAACACTATAATATACGGATTATTTCATC
TTTTCACGCAACCAAATCATGAAGACCCCCTCAACCACGATGCCGCTGCTGTTTTGAGGGATAACCCAAAGATGTTCGAATCCAATGTGCGAAGAGCCATGGCTGGAGGT
TACGTGGGGCACACTTTCTTCACACGTTGCATGTAG
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GAGCTCTGAATCAAACCCATCTTCCTCCGTTCTCTCCCACTTTCTACACGCTTTCTTTCCTCCCAACCTCTGCTTCAGCTTTATCCTTTCGAGAATTGGTGTCTACTCGT
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ATTGATGGATTGATCCAGGGTTGGAGCTTCATTGATTTTGTGTTAGTGTTTTATGCGTGTCGAATGAAGCGTATCTTGATTACGCCTTGCATCATTAGTGCTCCAAATTT
GATATCCCTATTTATACAGTACCCTGCAGGAACGATGATTAAGCTTTTTAAAGTGAAGGAAAAGCAGAGAGAGATCGCAAAAAATGCCGATGGAAAACCTCCTGTCAAGA
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TACGTGGGGCACACTTTCTTCACACGTTGCATGTAGATTCTACATGAATTGTAAAGCACCAGATACATTATTTGAAAGCACGGACTCGGCAAGGTTGTCGAACTTCTGTG
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TTTTTTTGTCATCATCACAAGATTGGAAAGCTTTTAT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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