; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh11G013810 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh11G013810
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionprotein RALF-like 4
Genome locationCmo_Chr11:9652881..9653249
RNA-Seq ExpressionCmoCh11G013810
SyntenyCmoCh11G013810
Gene Ontology termsGO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022927734.1 protein RALF-like 4 [Cucurbita moschata]3.1e-62100Show/hide
Query:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
Subjt:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

XP_022927735.1 protein RALF-like 4 [Cucurbita moschata]2.2e-5286.07Show/hide
Query:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        MET+KLCLFLL V A V+PP SFA+HETS+ SS  +  S+YSFFGGDSSEA+TEDSRRQLFQYGFAYN+EARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
Subjt:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

XP_022989015.1 protein RALF-like 4 [Cucurbita maxima]2.5e-5186.89Show/hide
Query:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        MET+K+CLFLL V AVVA P S A+HETS DSS V+D SKYSFFGGDSSE+MTEDSRRQLFQYGFAYN EAR+RFLTYYALSKNNIPCGRRG+SYYDCKK
Subjt:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

XP_023531827.1 protein RALF-like 4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.6e-5084.68Show/hide
Query:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDS--SYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDC
        MET KLCLFLL V A V+PPLSFA+HETS+ S  S  +D S+YSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYN EAR+R L+YYALSKNNIPCGRRGTSYYDC
Subjt:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDS--SYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDC

Query:  KKRRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        KKRRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  KKRRRINPYRRGCAAITGCARFTD

XP_023531888.1 protein RALF-like 4 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.0e-4983.61Show/hide
Query:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        M T+KLC+FLL V  VV  P SFA+HETS+ SS ++DISKYSFFGGDSSEAMTED+RRQLFQYGFAYN EAR+R L+YYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
Subjt:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1EIG3 rapid alkalinization factor 23-like9.4e-4982.79Show/hide
Query:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        MET+K+ L LL V   VA PLSFA+HE S+ SS ++D S+YSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGF YNKEAR+RFL+YYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
Subjt:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

A0A6J1EIU0 protein RALF-like 41.5e-62100Show/hide
Query:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
Subjt:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

A0A6J1EPT5 protein RALF-like 41.1e-5286.07Show/hide
Query:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        MET+KLCLFLL V A V+PP SFA+HETS+ SS  +  S+YSFFGGDSSEA+TEDSRRQLFQYGFAYN+EARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
Subjt:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

A0A6J1JIT9 protein RALF-like 42.5e-4983.87Show/hide
Query:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSS--EAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDC
        MET+K+CLFLL V A+VA PLSFA+HETS+ SS V+D S+YSFFGG SS  EAMTEDSRRQLF+YGFAYN+EAR+RFLTYYALSKNNIPCGRRG SYYDC
Subjt:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSS--EAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDC

Query:  KKRRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        KKRRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  KKRRRINPYRRGCAAITGCARFTD

A0A6J1JL71 protein RALF-like 41.2e-5186.89Show/hide
Query:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK
        MET+K+CLFLL V AVVA P S A+HETS DSS V+D SKYSFFGGDSSE+MTEDSRRQLFQYGFAYN EAR+RFLTYYALSKNNIPCGRRG+SYYDCKK
Subjt:  METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKK

Query:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
        RRRINPYRRGCAAITGCARFTD
Subjt:  RRRINPYRRGCAAITGCARFTD

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q6NME6 Protein RALF-like 195.6e-1445.38Show/hide
Query:  VKLCLFL-LFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRR
        +K+ L L L  LAVVA   +  +  T    S VN        G       +E +RRQL          ARR +++Y AL KNN+PC RRG SYYDCKKR+
Subjt:  VKLCLFL-LFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRR

Query:  RINPYRRGCAAITGCARFT
        R NPYRRGC+ IT C R T
Subjt:  RINPYRRGCAAITGCARFT

Q945T0 Rapid alkalinization factor6.4e-1055.32Show/hide
Query:  ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGC
        A +++++Y AL KN++PC RRG SYY+CK   + NPY RGC+AIT C
Subjt:  ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGC

Q9FZA0 Protein RALF-like 45.0e-1544.44Show/hide
Query:  LCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAM--TEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRR
        L +F L +LA+VA  ++  Y  T +  +    I +      D  E++  +E +RRQL +          RR++ Y AL KNN+PC RRG SYYDCKKRRR
Subjt:  LCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAM--TEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRR

Query:  INPYRRGCAAITGCARF
         NPYRRGC+AIT C R+
Subjt:  INPYRRGCAAITGCARF

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 233.7e-1041.76Show/hide
Query:  SSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDS---RRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR
        S+ + D     + GG+  E    DS   RR L          A RR+++Y AL +N IPC RRG SYY+C++  + NPY RGC+AIT C R
Subjt:  SSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDS---RRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR

Q9MA62 Protein RALF-like 225.4e-0935.8Show/hide
Query:  SKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR
        S +S   G  +E + E+   + F    +    A++++++Y A+ +N++PC RRG SYY+C++  + NPY RGC+ IT C R
Subjt:  SKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28270.1 ralf-like 43.6e-1644.44Show/hide
Query:  LCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAM--TEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRR
        L +F L +LA+VA  ++  Y  T +  +    I +      D  E++  +E +RRQL +          RR++ Y AL KNN+PC RRG SYYDCKKRRR
Subjt:  LCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAM--TEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRR

Query:  INPYRRGCAAITGCARF
         NPYRRGC+AIT C R+
Subjt:  INPYRRGCAAITGCARF

AT2G33775.1 ralf-like 193.9e-1545.38Show/hide
Query:  VKLCLFL-LFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRR
        +K+ L L L  LAVVA   +  +  T    S VN        G       +E +RRQL          ARR +++Y AL KNN+PC RRG SYYDCKKR+
Subjt:  VKLCLFL-LFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRR

Query:  RINPYRRGCAAITGCARFT
        R NPYRRGC+ IT C R T
Subjt:  RINPYRRGCAAITGCARFT

AT3G05490.1 ralf-like 223.8e-1035.8Show/hide
Query:  SKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR
        S +S   G  +E + E+   + F    +    A++++++Y A+ +N++PC RRG SYY+C++  + NPY RGC+ IT C R
Subjt:  SKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 232.6e-1141.76Show/hide
Query:  SSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDS---RRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR
        S+ + D     + GG+  E    DS   RR L          A RR+++Y AL +N IPC RRG SYY+C++  + NPY RGC+AIT C R
Subjt:  SSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDS---RRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRGCAAITGCAR

AT4G15800.1 ralf-like 331.1e-0932.11Show/hide
Query:  VLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKE--ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRG
        ++A++     FA   + +   +V   SK +    + S +  E+     F+     N+   A  ++++Y AL +N +PC RRG SYY+C++  + NPY RG
Subjt:  VLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKE--ARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRG

Query:  CAAITGCAR
        C+AIT C R
Subjt:  CAAITGCAR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAAACTGTGAAGCTCTGCCTCTTTCTCCTCTTCGTCTTGGCTGTCGTTGCTCCTCCACTCTCCTTTGCCTACCATGAAACCTCCAACGATTCATCTTACGTCAACGA
TATTTCTAAATACAGCTTCTTTGGCGGAGACTCCTCGGAAGCCATGACTGAAGATAGTCGGCGACAACTTTTCCAATATGGATTCGCTTATAATAAGGAAGCTCGCAGGA
GGTTTTTGACCTACTATGCACTTAGTAAGAATAATATCCCTTGCGGCCGTCGTGGTACCTCCTACTATGATTGCAAGAAGCGTAGAAGGATCAATCCTTATCGTCGTGGT
TGTGCTGCCATCACTGGATGTGCTCGATTCACCGATTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAAACTGTGAAGCTCTGCCTCTTTCTCCTCTTCGTCTTGGCTGTCGTTGCTCCTCCACTCTCCTTTGCCTACCATGAAACCTCCAACGATTCATCTTACGTCAACGA
TATTTCTAAATACAGCTTCTTTGGCGGAGACTCCTCGGAAGCCATGACTGAAGATAGTCGGCGACAACTTTTCCAATATGGATTCGCTTATAATAAGGAAGCTCGCAGGA
GGTTTTTGACCTACTATGCACTTAGTAAGAATAATATCCCTTGCGGCCGTCGTGGTACCTCCTACTATGATTGCAAGAAGCGTAGAAGGATCAATCCTTATCGTCGTGGT
TGTGCTGCCATCACTGGATGTGCTCGATTCACCGATTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
METVKLCLFLLFVLAVVAPPLSFAYHETSNDSSYVNDISKYSFFGGDSSEAMTEDSRRQLFQYGFAYNKEARRRFLTYYALSKNNIPCGRRGTSYYDCKKRRRINPYRRG
CAAITGCARFTD