; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh11G016680 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh11G016680
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionLOB domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr11:11836728..11837243
RNA-Seq ExpressionCmoCh11G016680
SyntenyCmoCh11G016680
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR004883 - Lateral organ boundaries, LOB


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6588944.1 LOB domain-containing protein 25, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.0e-8898.25Show/hide
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KAG7022712.1 LOB domain-containing protein 25, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-8898.83Show/hide
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XP_022928544.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita moschata]1.7e-90100Show/hide
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XP_022989224.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita maxima]5.6e-8697.08Show/hide
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XP_023530211.1 LOB domain-containing protein 25-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-8797.66Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LI15 LOB domain-containing protein1.3e-8090.29Show/hide
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A0A1S3B938 LOB domain-containing protein 25-like1.3e-8090.29Show/hide
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A0A5D3BPW0 LOB domain-containing protein 25-like1.3e-8090.29Show/hide
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A0A6J1EL51 LOB domain-containing protein 25-like8.2e-91100Show/hide
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A0A6J1JNR8 LOB domain-containing protein 25-like2.7e-8697.08Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A2WXT0 LOB domain-containing protein 64.5e-3861.98Show/hide
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           L +Y  +   A ++S+S+
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O04479 Protein ASYMMETRIC LEAVES 23.5e-3850Show/hide
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        +S+ +NSPCAACKFLRRKC P CVFAPYFP ++PQKFANVHK+FGASNV+KLLNE+ P QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCVG IS+LQ Q+ +LQ +
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        L    + L +Y    + A +  S        ++      ++T+   HY+   +F           P G+++D G
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Q8L8Q3 LOB domain-containing protein 251.2e-4982.88Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  +CVFAPYFP EEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQREL
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Query:  DATNANLIRYA
        + TNA+L+RYA
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Q8LQH4 LOB domain-containing protein 64.5e-3861.98Show/hide
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        + SPCAACKFLRRKC P+CVFAPYFP + PQKF +VH++FGASNV+KLLNE+ P+QREDAVNSLAYEA+ R++DPVYGCV  ISILQR + +LQ++L   
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           L +Y  +   A ++S+S+
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Q9FML4 Protein LATERAL ORGAN BOUNDARIES3.7e-4880Show/hide
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        ELDA NA+L  Y  S
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G27650.1 LOB domain-containing protein 258.2e-5182.88Show/hide
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        S Y+NSPCAACKFLRRKC  +CVFAPYFP EEP KFANVH+IFGASNVSK+L+EV PHQREDAVNSLAYEAEAR+KDPVYGCVGAIS+LQRQV++LQREL
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Query:  DATNANLIRYA
        + TNA+L+RYA
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AT5G63090.1 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.6e-4980Show/hide
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        ELDA NA+L  Y  S
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AT5G63090.2 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.6e-4980Show/hide
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Query:  ELDATNANLIRYACS
        ELDA NA+L  Y  S
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AT5G63090.3 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.6e-4980Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFP EEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQ+
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Query:  ELDATNANLIRYACS
        ELDA NA+L  Y  S
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AT5G63090.4 Lateral organ boundaries (LOB) domain family protein2.6e-4980Show/hide
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        SSS   NSPCAACKFLRRKC+P C+FAPYFP EEP KFANVHKIFGASNV+KLLNE+ PHQREDAVNSLAYEAEAR++DPVYGCVGAIS LQRQV +LQ+
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Query:  ELDATNANLIRYACS
        ELDA NA+L  Y  S
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCTTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGTCTCCCGAACTGCGTTTTCGCGCCGTATTTCCCGTCGGAGGAGCCACA
AAAGTTCGCCAACGTTCACAAGATCTTCGGAGCTAGCAATGTCAGCAAACTACTAAACGAGGTCCAGCCACACCAACGAGAGGACGCCGTGAACTCGCTCGCTTACGAGG
CCGAGGCAAGGATGAAAGACCCCGTCTACGGCTGCGTCGGCGCCATCTCGATCCTCCAAAGACAAGTCATCAAGCTTCAAAGAGAACTCGACGCTACCAACGCTAACCTC
ATTCGCTACGCCTGCAGTGAACTCCCTGCCCCATCATCGTCGTCGTCATCGCAGTATGCTCGGAGATCGTCGTCAACAAGTCACATCGGAAGCTCATCGACCTCTAGCTA
TGGCCATTACTATTCTGGCCTCTACTTTTGTGGCCCTTGTGGAGATGACCATGACAAAGGAGAAGAACACAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTCTTCTTCCACCTACTCCAATTCTCCTTGTGCAGCCTGCAAGTTCCTACGTCGAAAATGTCTCCCGAACTGCGTTTTCGCGCCGTATTTCCCGTCGGAGGAGCCACA
AAAGTTCGCCAACGTTCACAAGATCTTCGGAGCTAGCAATGTCAGCAAACTACTAAACGAGGTCCAGCCACACCAACGAGAGGACGCCGTGAACTCGCTCGCTTACGAGG
CCGAGGCAAGGATGAAAGACCCCGTCTACGGCTGCGTCGGCGCCATCTCGATCCTCCAAAGACAAGTCATCAAGCTTCAAAGAGAACTCGACGCTACCAACGCTAACCTC
ATTCGCTACGCCTGCAGTGAACTCCCTGCCCCATCATCGTCGTCGTCATCGCAGTATGCTCGGAGATCGTCGTCAACAAGTCACATCGGAAGCTCATCGACCTCTAGCTA
TGGCCATTACTATTCTGGCCTCTACTTTTGTGGCCCTTGTGGAGATGACCATGACAAAGGAGAAGAACACAAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSSSTYSNSPCAACKFLRRKCLPNCVFAPYFPSEEPQKFANVHKIFGASNVSKLLNEVQPHQREDAVNSLAYEAEARMKDPVYGCVGAISILQRQVIKLQRELDATNANL
IRYACSELPAPSSSSSSQYARRSSSTSHIGSSSTSSYGHYYSGLYFCGPCGDDHDKGEEHK