CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh11G019580
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Microtubule-associated protein 6, putative
Genome location	Cmo_Chr11:13487248..13487943
RNA-Seq Expression	CmoCh11G019580
Synteny	CmoCh11G019580
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6589221.1 hypothetical protein SDJN03_17786, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.4e-116

97.84

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRD+A
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA

Query:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS
        DRR   SKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS
Subjt:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS

Query:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
        TKGKSS KKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
Subjt:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN

KAG7022921.1 hypothetical protein SDJN02_16657, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

1.9e-116

97.84

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA

Query:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS
        DRR   SKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDR LEVNGIDESVMKIVEEINDQS
Subjt:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS

Query:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
        TKGKSS KKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
Subjt:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN

XP_022930708.1 uncharacterized protein LOC111437106 [Cucurbita moschata]

7.3e-121

100

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA

Query:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS
        DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS
Subjt:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS

Query:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
        TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
Subjt:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN

XP_022989501.1 uncharacterized protein LOC111486558 [Cucurbita maxima]

6.2e-112

94.37

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDP LSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGN+NKLR EREKIAKKKKVET ERSDSD+RDDA
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA

Query:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS
         RR   SKK KSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEIND+S
Subjt:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS

Query:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
        TKGKSS KKLENDSISA RTSPRLANKRRSN
Subjt:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN

XP_023530343.1 uncharacterized protein LOC111792943 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

2.3e-114

96.54

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLR EREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA

Query:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS
         RR   SKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAE+DDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS
Subjt:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS

Query:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
        TKGKSS KKLENDSISA RTSPRLANKRRSN
Subjt:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3C0M4 uncharacterized protein LOC103495510

2.7e-81

71.78

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKK-KVE----TPERSDSD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVK NDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGN++KLR EREK+AKKK K E     P+RSD D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKK-KVE----TPERSDSD

Query:  LRDDADRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEE
           DA R   + KK++SV+PPP P+ATKRRRLM LF+ ++DDVG  KEEI VVKRRLVKKLGDDFDRVA E K+NQLKG +DR+ E+N ++ESVMKIVEE
Subjt:  LRDDADRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEE

Query:  INDQSTKGK--------SSVKKLENDSISAIRTSPRLANKR
        IN+++TK K         +V K+E+ S+S  RTSPRLANKR
Subjt:  INDQSTKGK--------SSVKKLENDSISAIRTSPRLANKR

A0A5A7SPW2 Uncharacterized protein

2.7e-81

71.78

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKK-KVE----TPERSDSD
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVK NDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGN++KLR EREK+AKKK K E     P+RSD D
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKK-KVE----TPERSDSD

Query:  LRDDADRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEE
           DA R   + KK++SV+PPP P+ATKRRRLM LF+ ++DDVG  KEEI VVKRRLVKKLGDDFDRVA E K+NQLKG +DR+ E+N ++ESVMKIVEE
Subjt:  LRDDADRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEE

Query:  INDQSTKGK--------SSVKKLENDSISAIRTSPRLANKR
        IN+++TK K         +V K+E+ S+S  RTSPRLANKR
Subjt:  INDQSTKGK--------SSVKKLENDSISAIRTSPRLANKR

A0A6J1D3X9 uncharacterized protein LOC111016810

1.2e-81

74.07

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKV----ETPERSDSDL
        MVV LGPGKFYGSSLPRPRYYTDVK NDERVDPPTPVLDPLL WANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNI+KLR EREKIAKKKK        +RSD D 
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKV----ETPERSDSDL

Query:  RDDADRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEI
          D  RR     KSKSVSPPP PIATKRRRL+ LFD EDDD GE+KEEI VVKRRLVKKLGDDFDRVA E K+NQLK SRDR   V+GI ESVMKIVEEI
Subjt:  RDDADRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEI

Query:  NDQSTKGK--------SSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
        N   T+GK         +V K E+ S+S  RTSPRLANKR SN
Subjt:  NDQSTKGK--------SSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN

A0A6J1EW46 uncharacterized protein LOC111437106

3.5e-121

100

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA

Query:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS
        DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS
Subjt:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS

Query:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
        TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
Subjt:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN

A0A6J1JK90 uncharacterized protein LOC111486558

3.0e-112

94.37

Show/hide

Query:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA
        MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDP LSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGN+NKLR EREKIAKKKKVET ERSDSD+RDDA
Subjt:  MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDA

Query:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS
         RR   SKK KSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEIND+S
Subjt:  DRRSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQS

Query:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
        TKGKSS KKLENDSISA RTSPRLANKRRSN
Subjt:  TKGKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT1G52270.1 unknown protein

5.0e-11

29.41

Show/hide

Query:  PGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDADRRSKK
        P  FY + LPRPR++ + +FN  RVD P  VLDPLLSWA                              + EK                           
Subjt:  PGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDADRRSKK

Query:  SKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIV
               S P  PI  KRRR +     +D+++G   E++ VV  R+ +KL DDFDRVA E K   ++ +  + +E +  +E + KIV
Subjt:  SKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIV

AT4G28310.1 unknown protein

2.6e-39

44.1

Show/hide

Query:  VPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDADR
        + + P  FYG+ LPRPR++ + KFND RVDPP  VLDPLLSWA +AHWSMGGL+F RLRLQGRIEGN+NKLR + EK        TP + +S        
Subjt:  VPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDADR

Query:  RSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQSTK
          +K K+S S SPP  PI  KRRR + L D++D++VG   E +  ++R    KL DDFDRVA E K   ++ ++ ++++   +++   +++E        
Subjt:  RSKKSKKSKSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQSTK

Query:  GKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN
         K  + K+  +  S+ R+SPRLA KR SN
Subjt:  GKSSVKKLENDSISAIRTSPRLANKRRSN

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGTTGTTCCTCTCGGACCCGGCAAGTTCTACGGCAGCAGTCTCCCCCGTCCCCGCTACTACACCGACGTCAAGTTCAACGATGAGCGTGTAGATCCACCCACGCCGGT
CCTCGATCCGCTTCTCTCATGGGCGAACGAGGCTCACTGGTCAATGGGAGGTCTCAGCTTCAATCGCCTGAGACTTCAGGGTCGAATCGAAGGCAATATCAACAAGCTTC
GAAATGAGCGTGAGAAGATTGCTAAGAAGAAGAAAGTAGAGACGCCTGAGAGATCCGACTCAGATCTCAGAGATGATGCCGATCGCCGGTCGAAAAAGTCGAAAAAGTCG
AAATCAGTATCACCACCGCCAGTGCCAATTGCAACGAAGAGACGGCGATTGATGCCATTGTTTGACGCTGAGGATGATGATGTTGGTGAGCACAAGGAAGAAATTAGGGT
TGTGAAGAGGAGATTGGTGAAGAAGCTGGGAGATGATTTCGATCGAGTCGCGGTGGAGGGGAAGAAGAACCAGTTGAAAGGTTCGAGGGATCGAAATTTGGAAGTCAATG
GGATCGATGAATCTGTAATGAAGATTGTTGAGGAGATTAACGATCAAAGTACAAAGGGGAAGAGTAGTGTTAAAAAACTGGAAAATGATTCAATTTCTGCCATTAGAACT
TCTCCCAGATTAGCTAATAAGCGTAGATCAAATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MVVPLGPGKFYGSSLPRPRYYTDVKFNDERVDPPTPVLDPLLSWANEAHWSMGGLSFNRLRLQGRIEGNINKLRNEREKIAKKKKVETPERSDSDLRDDADRRSKKSKKS
KSVSPPPVPIATKRRRLMPLFDAEDDDVGEHKEEIRVVKRRLVKKLGDDFDRVAVEGKKNQLKGSRDRNLEVNGIDESVMKIVEEINDQSTKGKSSVKKLENDSISAIRT
SPRLANKRRSN

CmoCh11G019580 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome