; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G001710 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G001710
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionUnknown protein
Genome locationCmo_Chr12:1133639..1134251
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G001710
SyntenyCmoCh12G001710
Gene Ontology termsGO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7020268.1 hypothetical protein SDJN02_16951, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.6e-7985.64Show/hide
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         + RDD+SSIK PR  NKDQIRTF   + RPIKKQRSPE    P PPPPPP  RR+P+AV+D LRRTRSEEISHR+GIQRPVIFRNKVRRYKLLDEVSS
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XP_022951049.1 uncharacterized protein LOC111454013 [Cucurbita moschata]2.1e-8993.09Show/hide
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XP_023002810.1 uncharacterized protein LOC111496564 [Cucurbita maxima]3.4e-8490.48Show/hide
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XP_023537720.1 uncharacterized protein LOC111798664 [Cucurbita pepo subsp. pepo]5.6e-8791.53Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LLR8 Uncharacterized protein2.9e-4962.92Show/hide
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        S S++ECCMCGDFGFS ELF CKICQFRSQHR             YCSNLYPKADCYRICNWCLT  +ES  KSPNSS+S                N DQ
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           F     +PIKKQ S      P PPPPPPPRR+ I+V++ LRRTRSEEISHR+GI+RPVIFRNKVRRYKLLDEVSS
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A0A1S3BCA2 uncharacterized protein LOC1034881032.5e-4862.57Show/hide
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        S S++ECC CGDFG S ELF CKICQFRSQHR             YCSNLYPKADCYRICNWCLTQ +ES  KSPNSS+S  +             N DQ
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           F     +PIKKQ S       P PPPPPPPRR+ I+V+D LRRTRSEEISHR+GI+RPVIFRNKVRRYKLLDEVSS
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A0A6J1BR47 uncharacterized protein LOC1110050071.4e-6270.35Show/hide
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        MTS GAA   S +    ECCMCGDFGFS ELF+CKICQ+RSQHR             YCSNLYPKA+CYRICNWCL+QKEESKAKSPNSSNSS      +
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A0A6J1GHL7 uncharacterized protein LOC1114540139.9e-9093.09Show/hide
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A0A6J1KQ08 uncharacterized protein LOC1114965641.6e-8490.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02070.1 unknown protein2.1e-0739.36Show/hide
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        E  CCMCGD GFSD+LF C  C+ R QH              YCSN Y + A+   IC+WC +  +K  + A+   SS+   SSS+   +D S+
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AT3G60520.1 unknown protein7.5e-0532.31Show/hide
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        CCMCGD GF D+LF C  C  R QH              YCS+ Y  +AD  +IC+WC  + K  + AK   +  SS  + R ++SS      + +I   
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           QT       + +  +   P P P  RR
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGACATCAACCGGAGCAGCACCCGCCAGTTCGCCGTCGGAAGCAGAGTGCTGCATGTGCGGAGATTTCGGCTTCTCCGACGAGCTTTTCCGGTGCAAAATCTGCCAATT
CAGATCCCAACACAGGCAATTTCCTTCAAATTCTTTGTGTTTGTTCTTAATTGGGTACTGTAGCAATTTGTACCCAAAAGCCGATTGTTACAGAATATGCAATTGGTGTC
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ATTCGCACTTTTCTACCCCTACAAACCAGACCCATCAAAAAACAGAGGTCGCCGGAAGCTTCTGAACGTCCACAACCACCGCCACCGCCGCCGCCTCGGAGAAAACCAAT
CGCCGTGGAGGACAATCTCCGGCGGACGAGATCGGAGGAGATTTCTCACCGGAGTGGAATCCAACGGCCGGTGATTTTCCGGAACAAGGTGAGAAGGTACAAACTTCTTG
ACGAGGTTTCCAGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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