CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh12G004780
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	calmodulin-like protein 12
Genome location	Cmo_Chr12:2918128..2918793
RNA-Seq Expression	CmoCh12G004780
Synteny	CmoCh12G004780
Gene Ontology terms	GO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domains	IPR002048 - EF-hand domain IPR011992 - EF-hand domain pair IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022951114.1 uncharacterized protein LOC111454058 [Cucurbita moschata]

2.7e-66

88.16

Show/hide

Query:  DGDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDGYLNKR
        DGDG+LN +EL FF RDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNA++NSKI++QDKATKSSTKV SEKAS  PLSREQIKKIFKYY+ DKDG+LNKR
Subjt:  DGDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDGYLNKR

Query:  EVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
        EVTKAFSFLGSINPYYRAQYALD+AD NNDGLISEDELDKLIDY SKIIKKK
Subjt:  EVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK

XP_022951743.1 uncharacterized protein LOC111454484 [Cucurbita moschata]

1.4e-70

93.42

Show/hide

Query:  DGDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDGYLNKR
        DGDG+LNK+EL FF RDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNA+TNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDE LSREQIKKIFKYYD DKD +LNKR
Subjt:  DGDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDGYLNKR

Query:  EVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
        EVTKAFSFLGS+NPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
Subjt:  EVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK

XP_022951798.1 probable calcium-binding protein CML11 [Cucurbita moschata]

1.6e-58

79.62

Show/hide

Query:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG
        K+YD  GDGVL KEEL  FLRDVRGSTQLN++  LSKIPKTND  AH LSSNA+TN KIQVQ  ATKSSTKV SEK S+ PLSREQIKKIFKYYD DKDG
Subjt:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG

Query:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
        +LN REVTKAFSFLGSINP+Y+AQYA+ +ADANNDGLISE EL+KLIDYA KIIKKK
Subjt:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK

XP_023002693.1 calmodulin-like protein 12 [Cucurbita maxima]

4.8e-63

85.35

Show/hide

Query:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG
        K++D  GDGVL+KEEL FFLRDVR STQLNNREILSKI KTNDNAAHMLSSN +T SKIQVQDKAT+ STKV S KASD PL+REQIKKIFK YD +KDG
Subjt:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG

Query:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
        +LNKREVTKAFSFLGS+NPYYRAQYALDYADANNDGLISEDE DKLIDYASKIIKKK
Subjt:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK

XP_023538396.1 probable calcium-binding protein CML11 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

8.5e-60

79.62

Show/hide

Query:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG
        K+YD  GDGVL KEEL FFLRDVRGSTQLNN+  LSKIPKTND  AH LSSNA+TN KIQVQ KAT SSTKVF EK S+ PLSREQIKKIFKYYD DKDG
Subjt:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG

Query:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
        +LN+REVTKAFSFLGSINP+Y+AQYA+ +ADANNDGLISE EL+KL+DYA KII+KK
Subjt:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A6J1GGN5 uncharacterized protein LOC111454058

1.3e-66

88.16

Show/hide

Query:  DGDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDGYLNKR
        DGDG+LN +EL FF RDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNA++NSKI++QDKATKSSTKV SEKAS  PLSREQIKKIFKYY+ DKDG+LNKR
Subjt:  DGDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDGYLNKR

Query:  EVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
        EVTKAFSFLGSINPYYRAQYALD+AD NNDGLISEDELDKLIDY SKIIKKK
Subjt:  EVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK

A0A6J1GIK4 uncharacterized protein LOC111454484

6.8e-71

93.42

Show/hide

Query:  DGDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDGYLNKR
        DGDG+LNK+EL FF RDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNA+TNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDE LSREQIKKIFKYYD DKD +LNKR
Subjt:  DGDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDGYLNKR

Query:  EVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
        EVTKAFSFLGS+NPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
Subjt:  EVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK

A0A6J1GIQ8 probable calcium-binding protein CML11

7.8e-59

79.62

Show/hide

Query:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG
        K+YD  GDGVL KEEL  FLRDVRGSTQLN++  LSKIPKTND  AH LSSNA+TN KIQVQ  ATKSSTKV SEK S+ PLSREQIKKIFKYYD DKDG
Subjt:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG

Query:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
        +LN REVTKAFSFLGSINP+Y+AQYA+ +ADANNDGLISE EL+KLIDYA KIIKKK
Subjt:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK

A0A6J1GJT8 probable calcium-binding protein CML11

1.7e-58

79.62

Show/hide

Query:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG
        K+YD  GDGVL KEEL  FLRDVRGSTQLN++  LSKIPKTND  AH LSSNA+TN KIQVQ K TKSSTKV SEK S+ PLSREQIKKIFKYYD DKDG
Subjt:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG

Query:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
        +LN REVTKAFSFLGSINP+Y+AQYA+ +ADANNDGLISE EL+KLIDYA KIIKKK
Subjt:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK

A0A6J1KUB3 calmodulin-like protein 12

2.3e-63

85.35

Show/hide

Query:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG
        K++D  GDGVL+KEEL FFLRDVR STQLNNREILSKI KTNDNAAHMLSSN +T SKIQVQDKAT+ STKV S KASD PL+REQIKKIFK YD +KDG
Subjt:  KEYD--GDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDG

Query:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK
        +LNKREVTKAFSFLGS+NPYYRAQYALDYADANNDGLISEDE DKLIDYASKIIKKK
Subjt:  YLNKREVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT4G14640.1 calmodulin 8

5.4e-04

22.38

Show/hide

Query:  DGDGVLNKEELLFFLRDV-RGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDGYLNK
        DGDG +  EEL   +R + +  T+    +I+++I   ++              K+Q  D                   + E++K+ FK +D D++GY++ 
Subjt:  DGDGVLNKEELLFFLRDV-RGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDGYLNK

Query:  REVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLI
         E++     LG        +  +  AD + DG ++ DE  K++
Subjt:  REVTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLI

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTTCCATTCACCTGAAAAGGAATATGACGGTGATGGAGTGCTCAATAAAGAAGAGTTACTATTCTTTCTCCGTGATGTTCGAGGATCAACTCAACTCAACAATCGAGA
AATTTTATCTAAGATCCCAAAGACAAACGACAATGCTGCACACATGTTAAGCTCAAATGCTTATACAAACTCAAAGATACAAGTACAAGACAAAGCTACAAAATCCTCGA
CAAAAGTTTTTAGTGAAAAGGCATCTGATGAGCCACTTAGTAGAGAGCAAATAAAGAAGATTTTCAAATATTACGACGATGATAAAGATGGTTATCTCAACAAAAGAGAG
GTAACAAAAGCTTTTAGTTTTCTGGGTTCAATTAATCCATACTACAGGGCTCAATACGCTTTGGATTATGCTGATGCTAATAATGATGGTCTTATCAGTGAAGATGAGCT
TGACAAACTCATAGATTATGCCAGTAAAATCATCAAGAAGAAATGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MFHSPEKEYDGDGVLNKEELLFFLRDVRGSTQLNNREILSKIPKTNDNAAHMLSSNAYTNSKIQVQDKATKSSTKVFSEKASDEPLSREQIKKIFKYYDDDKDGYLNKRE
VTKAFSFLGSINPYYRAQYALDYADANNDGLISEDELDKLIDYASKIIKKK

CmoCh12G004780 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome