; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G004810 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G004810
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptioncalmodulin-like
Genome locationCmo_Chr12:2963099..2963590
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G004810
SyntenyCmoCh12G004810
Gene Ontology termsGO:0005509 - calcium ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002048 - EF-hand domain
IPR011992 - EF-hand domain pair
IPR018247 - EF-Hand 1, calcium-binding site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022144156.1 probable calcium-binding protein CML15 [Momordica charantia]1.4e-4163.58Show/hide
Query:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEEL-SAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGA-SMKLSRSQIKEIFMEHD
        M+  SLQLHR  +H  EAEA E++Q YDKN DS ++KEE+   A++H              K +V PKAQKVPA+ A EK A  +K SRSQIKEIFMEHD
Subjt:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEEL-SAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGA-SMKLSRSQIKEIFMEHD

Query:  IDGDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK
        IDGDG LSVSEL KAFSF GS+IPLYKAHYGLA+AD DGDGLISEEEL+KLVDYAE+ + +K
Subjt:  IDGDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK

XP_022951879.1 calmodulin-like [Cucurbita moschata]4.0e-81100Show/hide
Query:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID
        MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID
Subjt:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID

Query:  GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF
        GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF
Subjt:  GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF

XP_022951880.1 calmodulin-like [Cucurbita moschata]9.9e-4060.13Show/hide
Query:  LHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDIDGDGYLSV
        +H D  + +EA+A  L++ YDKN DS L+K+EL+A I    ++  G        KD+  K +K PAK  E+KG  M+LSRS+I++IF+EHDIDGDGYL+V
Subjt:  LHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDIDGDGYLSV

Query:  SELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK
        SELTKAFSF GS++PLYKAHYGL YADADGDG ISEEELEKLVDYAER +++K
Subjt:  SELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK

XP_023002888.1 calmodulin-like [Cucurbita maxima]3.1e-7896.93Show/hide
Query:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID
        M+EASLQLHRD AHGAEAEAQE +QNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSH PEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID
Subjt:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID

Query:  GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF
        GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF
Subjt:  GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF

XP_023002889.1 calmodulin-A-like [Cucurbita maxima]6.4e-3960.13Show/hide
Query:  LHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDIDGDGYLSV
        +H D  + +EA+A  L++ YDKN DS L+K+EL+A I    ++  G        KDV  K +K PAK  E+KG  M+LSRS+I++IF+EHDIDGDGYL+V
Subjt:  LHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDIDGDGYLSV

Query:  SELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK
        SELTKAFSF GS++PLYKAHYGL YADADGDG ISEEEL KLVDYAER +++K
Subjt:  SELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1CSH1 probable calcium-binding protein CML156.7e-4263.58Show/hide
Query:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEEL-SAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGA-SMKLSRSQIKEIFMEHD
        M+  SLQLHR  +H  EAEA E++Q YDKN DS ++KEE+   A++H              K +V PKAQKVPA+ A EK A  +K SRSQIKEIFMEHD
Subjt:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEEL-SAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGA-SMKLSRSQIKEIFMEHD

Query:  IDGDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK
        IDGDG LSVSEL KAFSF GS+IPLYKAHYGLA+AD DGDGLISEEEL+KLVDYAE+ + +K
Subjt:  IDGDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK

A0A6J1GK16 calmodulin-like1.9e-81100Show/hide
Query:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID
        MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID
Subjt:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID

Query:  GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF
        GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF
Subjt:  GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF

A0A6J1GK54 calmodulin-like4.8e-4060.13Show/hide
Query:  LHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDIDGDGYLSV
        +H D  + +EA+A  L++ YDKN DS L+K+EL+A I    ++  G        KD+  K +K PAK  E+KG  M+LSRS+I++IF+EHDIDGDGYL+V
Subjt:  LHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDIDGDGYLSV

Query:  SELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK
        SELTKAFSF GS++PLYKAHYGL YADADGDG ISEEELEKLVDYAER +++K
Subjt:  SELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK

A0A6J1KRR4 calmodulin-A-like3.1e-3960.13Show/hide
Query:  LHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDIDGDGYLSV
        +H D  + +EA+A  L++ YDKN DS L+K+EL+A I    ++  G        KDV  K +K PAK  E+KG  M+LSRS+I++IF+EHDIDGDGYL+V
Subjt:  LHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDIDGDGYLSV

Query:  SELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK
        SELTKAFSF GS++PLYKAHYGL YADADGDG ISEEEL KLVDYAER +++K
Subjt:  SELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKK

A0A6J1KUW2 calmodulin-like1.5e-7896.93Show/hide
Query:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID
        M+EASLQLHRD AHGAEAEAQE +QNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSH PEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID
Subjt:  MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDID

Query:  GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF
        GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF
Subjt:  GDGYLSVSELTKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGAAGCTTCTCTTCAACTTCACAGGGACCATGCTCATGGAGCTGAAGCTGAAGCTCAAGAGCTCATGCAAAACTATGACAAAAATGCTGATTCAAGCCTCTCCAA
GGAGGAGCTAAGTGCAGCCATCCACCACAACCAAGCTAAGAACCCAGGATCACACAATCCAGAAGCCAAGAAGAAGGATGTTGCACCCAAAGCTCAGAAGGTGCCTGCTA
AGGCTGCCGAAGAGAAGGGGGCGAGTATGAAGCTTAGTAGGAGCCAAATCAAGGAGATATTCATGGAGCATGATATCGATGGTGATGGGTACCTCAGTGTTAGTGAGTTA
ACAAAGGCTTTTAGTTTCTTTGGTTCTATCATTCCACTCTACAAAGCTCATTATGGTTTAGCTTATGCTGATGCTGATGGAGATGGGCTTATTAGTGAGGAGGAGCTTGA
AAAACTTGTTGATTATGCTGAGAGAACCAACAAAAAGAAGAGAGGGTTTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGAAGCTTCTCTTCAACTTCACAGGGACCATGCTCATGGAGCTGAAGCTGAAGCTCAAGAGCTCATGCAAAACTATGACAAAAATGCTGATTCAAGCCTCTCCAA
GGAGGAGCTAAGTGCAGCCATCCACCACAACCAAGCTAAGAACCCAGGATCACACAATCCAGAAGCCAAGAAGAAGGATGTTGCACCCAAAGCTCAGAAGGTGCCTGCTA
AGGCTGCCGAAGAGAAGGGGGCGAGTATGAAGCTTAGTAGGAGCCAAATCAAGGAGATATTCATGGAGCATGATATCGATGGTGATGGGTACCTCAGTGTTAGTGAGTTA
ACAAAGGCTTTTAGTTTCTTTGGTTCTATCATTCCACTCTACAAAGCTCATTATGGTTTAGCTTATGCTGATGCTGATGGAGATGGGCTTATTAGTGAGGAGGAGCTTGA
AAAACTTGTTGATTATGCTGAGAGAACCAACAAAAAGAAGAGAGGGTTTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAEASLQLHRDHAHGAEAEAQELMQNYDKNADSSLSKEELSAAIHHNQAKNPGSHNPEAKKKDVAPKAQKVPAKAAEEKGASMKLSRSQIKEIFMEHDIDGDGYLSVSEL
TKAFSFFGSIIPLYKAHYGLAYADADGDGLISEEELEKLVDYAERTNKKKRGF