; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G005120 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G005120
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionDomain of unknown function (DUF303)
Genome locationCmo_Chr12:3155943..3156776
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G005120
SyntenyCmoCh12G005120
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
XP_022951885.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]4.2e-147100Show/hide
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XP_022951887.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]1.7e-14598.81Show/hide
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XP_023002177.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita maxima]1.6e-14691.7Show/hide
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XP_023536885.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.3e-14590.61Show/hide
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XP_023537881.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.7e-14598.81Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GIR0 probable carbohydrate esterase At4g342152.0e-147100Show/hide
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A0A6J1GIW6 probable carbohydrate esterase At4g342158.4e-14698.81Show/hide
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A0A6J1GJF6 probable carbohydrate esterase At4g342155.1e-14388.81Show/hide
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        KAG+VGLVPCARGGTLIEQW KNPSN SATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAM+DTA RYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIS+Y
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A0A6J1I774 probable carbohydrate esterase At4g342155.1e-14388.49Show/hide
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        +L SPSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVE    G LVWDGKVP +CQSDPSILR NPERQWEIAHEPLHLGID+G  KTPGIGPGI FAH+   KAG
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        +KAG+VGLVPCARGGTLIEQW KNPSN SATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAM+DTA RYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKI++
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        YDFFMKHDTH+LPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSWELP+N TT+EGFSWDHGHFN+ATEIALGKWLADTYL+HYGHLL
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A0A6J1KIR8 probable carbohydrate esterase At4g342157.6e-14791.7Show/hide
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        M+LF PSLS ATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVENN +G L WDGKVPL+CQSDPSILRLNP RQWEIA EPLHLGIDIGKTPGIGPGI FAH+F AKAG+
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        DFFMKHDTHDLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSWELPINFTT+EGF  DHGHFN+ATEIALGKWLADTYL+HY HLL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342152.4e-4436.06Show/hide
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        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV +++     VWD  +P +C  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID GK  G+GPG+AFA+    +    + V
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        +GLVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++
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Query:  KHDTHDLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSWELPINFTTYEGFSWDHGHFNSATEIALGKWLADTYLSHY
                  +  E  +  +L +++ +D+  LP+          D+ H  +  ++ LG  LA  YLS++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)2.2e-4539.85Show/hide
Query:  PSLSGATSPTN--IFILAGQSNMAGRGGVENNT-EGILVWDGKVPLDCQSDPSILRLNPERQWEIAHEPLHLGIDIGKTPGIGPGIAFAHEFIAKAGKKA
        P L   T   N  IFILAGQSNMAGRGGV N+T     VWDG +P +C+S+PSILRL  + +W+ A EPLH+ IDI KT G+GPG+ FA+  + + G+  
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Query:  GVVGLVPCARGGTLIEQWSKNPSNTSATFYQNFIERIKTSEKE--GGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISMY
          VGLVPC+ GGT + QW K         Y+  ++R K +     GG  RA+ WYQGESD      A  YK  L KF +D+RND++   LP+I V ++  
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Query:  DFFMKHDTHDLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSWELPINFTTYEGFSWDHGHFNSATEIALGKWLADTYLS
                  L AVR A+  ++ +L ++  +D+  LP+          D  H  +++++ LG  +A+++L+
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AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)1.7e-4536.06Show/hide
Query:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGV-ENNTEGILVWDGKVPLDCQSDPSILRLNPERQWEIAHEPLHLGIDIGKTPGIGPGIAFAHEFIAKAGKKAGV
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV +++     VWD  +P +C  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID GK  G+GPG+AFA+    +    + V
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Query:  VGLVPCARGGTLIEQWSKNPSNTSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISMYDFFM
        +GLVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++
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Query:  KHDTHDLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSWELPINFTTYEGFSWDHGHFNSATEIALGKWLADTYLSHY
                  +  E  +  +L +++ +D+  LP+          D+ H  +  ++ LG  LA  YLS++
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AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)1.7e-4536.06Show/hide
Query:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGV-ENNTEGILVWDGKVPLDCQSDPSILRLNPERQWEIAHEPLHLGIDIGKTPGIGPGIAFAHEFIAKAGKKAGV
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV +++     VWD  +P +C  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID GK  G+GPG+AFA+    +    + V
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Query:  VGLVPCARGGTLIEQWSKNPSNTSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISMYDFFM
        +GLVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++
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Query:  KHDTHDLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSWELPINFTTYEGFSWDHGHFNSATEIALGKWLADTYLSHY
                  +  E  +  +L +++ +D+  LP+          D+ H  +  ++ LG  LA  YLS++
Subjt:  KHDTHDLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSWELPINFTTYEGFSWDHGHFNSATEIALGKWLADTYLSHY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGTTGTTTAGCCCTTCCCTTTCAGGAGCTACTTCTCCTACAAATATATTTATCCTTGCCGGTCAGAGCAACATGGCTGGTCGAGGTGGGGTAGAGAACAATACAGA
GGGGATTCTTGTGTGGGATGGGAAAGTCCCATTAGATTGTCAATCCGACCCATCCATCCTACGGTTGAACCCTGAGCGCCAGTGGGAGATAGCACATGAACCTCTCCATT
TGGGGATTGACATCGGCAAAACTCCAGGGATTGGTCCAGGAATAGCATTTGCTCACGAGTTCATAGCTAAAGCTGGAAAAAAGGCAGGCGTCGTGGGTTTAGTTCCTTGT
GCTAGAGGTGGCACTTTAATTGAACAATGGAGTAAAAACCCTAGCAATACTAGTGCAACTTTTTACCAAAATTTCATTGAACGAATTAAAACATCAGAAAAAGAAGGTGG
GGTTGTGCGTGCTTTGTTTTGGTATCAAGGAGAGAGCGATGCGGCTATGAGTGACACTGCTCATAGATACAAAGACAACTTAAAGAAGTTCATCACCGACATCCGCAATG
ATATAAAGCCTAGATTTTTACCTGTCATTATTGTTAAGATATCCATGTATGACTTTTTTATGAAGCACGATACTCATGATTTGCCAGCAGTGAGAGCAGCTGAAGATGCA
GTCCAAAAAGAGCTTCCAGACATCATTACTATCGACTCTTGGGAGTTGCCTATAAACTTTACCACATATGAAGGCTTTAGCTGGGATCATGGTCATTTTAATAGTGCAAC
TGAGATTGCTTTGGGTAAATGGTTGGCTGATACCTATCTCTCCCACTATGGTCATTTACTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGTTGTTTAGCCCTTCCCTTTCAGGAGCTACTTCTCCTACAAATATATTTATCCTTGCCGGTCAGAGCAACATGGCTGGTCGAGGTGGGGTAGAGAACAATACAGA
GGGGATTCTTGTGTGGGATGGGAAAGTCCCATTAGATTGTCAATCCGACCCATCCATCCTACGGTTGAACCCTGAGCGCCAGTGGGAGATAGCACATGAACCTCTCCATT
TGGGGATTGACATCGGCAAAACTCCAGGGATTGGTCCAGGAATAGCATTTGCTCACGAGTTCATAGCTAAAGCTGGAAAAAAGGCAGGCGTCGTGGGTTTAGTTCCTTGT
GCTAGAGGTGGCACTTTAATTGAACAATGGAGTAAAAACCCTAGCAATACTAGTGCAACTTTTTACCAAAATTTCATTGAACGAATTAAAACATCAGAAAAAGAAGGTGG
GGTTGTGCGTGCTTTGTTTTGGTATCAAGGAGAGAGCGATGCGGCTATGAGTGACACTGCTCATAGATACAAAGACAACTTAAAGAAGTTCATCACCGACATCCGCAATG
ATATAAAGCCTAGATTTTTACCTGTCATTATTGTTAAGATATCCATGTATGACTTTTTTATGAAGCACGATACTCATGATTTGCCAGCAGTGAGAGCAGCTGAAGATGCA
GTCCAAAAAGAGCTTCCAGACATCATTACTATCGACTCTTGGGAGTTGCCTATAAACTTTACCACATATGAAGGCTTTAGCTGGGATCATGGTCATTTTAATAGTGCAAC
TGAGATTGCTTTGGGTAAATGGTTGGCTGATACCTATCTCTCCCACTATGGTCATTTACTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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ARGGTLIEQWSKNPSNTSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISMYDFFMKHDTHDLPAVRAAEDA
VQKELPDIITIDSWELPINFTTYEGFSWDHGHFNSATEIALGKWLADTYLSHYGHLL