; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G005130 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G005130
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionDomain of unknown function (DUF303)
Genome locationCmo_Chr12:3162462..3163220
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G005130
SyntenyCmoCh12G005130
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585684.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]3.9e-13699.58Show/hide
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XP_022951885.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]1.6e-14598.81Show/hide
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XP_022951887.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]2.2e-147100Show/hide
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XP_023537877.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.2e-14598.41Show/hide
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XP_023537881.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.1e-14699.21Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GIR0 probable carbohydrate esterase At4g342157.7e-14698.81Show/hide
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A0A6J1GIW6 probable carbohydrate esterase At4g342151.1e-147100Show/hide
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A0A6J1IKT8 probable carbohydrate esterase At4g342152.8e-13288.98Show/hide
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        ELPDIITIDSWELP+N TT+EGFSWDHGHFN+ATEIALGKWLADTYLAHYGHLL
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A0A6J1KIR8 probable carbohydrate esterase At4g342153.2e-13692.86Show/hide
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        MAGRGGVENN +G L WDGKVPL+CQSDPSILRLNP RQWEIA EPLHLGIDIGKTPGIGPGI FAH+F AKAGQKAG+VGLVPCARGGTLIEQW KNPS
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        PDIITIDSWELPINFTT+EGF  DHGHFN+ATEIALGKWLADTYLAHY HLL
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A0A6J1KKV2 probable carbohydrate esterase At4g342153.2e-13692.86Show/hide
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        MAGRGGVENN +G L WDGKVPL+CQSDPSILRLNP RQWEIA EPLHLGIDIGKTPGIGPGI FAH+F AKAGQKAG+VGLVPCARGGTLIEQW KNPS
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        N SATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISMYDFFMKHDTHDLPAVRAAEDAVQKEL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342151.3e-3834.94Show/hide
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        MAGRGGV  +   N  VWD  +P +C  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID GK  G+GPG+AFA+    +    + V+GLVPCA GGT I++W +  
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            +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++          +  E  +  +
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        L +++ +D+  LP+          D+ H  +  ++ LG  LA  YL+++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)1.0e-4139.36Show/hide
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        MAGRGGV N+T  N  VWDG +P +C+S+PSILRL  + +W+ A EPLH+ IDI KT G+GPG+ FA+  + + GQ    VGLVPC+ GGT + QW K  
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               Y+  ++R K +     GG  RA+ WYQGESD      A  YK  L KF +D+RND++   LP+I V ++            L AVR A+  ++
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Query:  KELPDIITIDSWELPINFTTYEGFSWDHGHFNSATEIALGKWLADTYLA
         +L ++  +D+  LP+          D  H  +++++ LG  +A+++LA
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AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)9.6e-4034.94Show/hide
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        MAGRGGV  +   N  VWD  +P +C  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID GK  G+GPG+AFA+    +    + V+GLVPCA GGT I++W +  
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            +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++          +  E  +  +
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        L +++ +D+  LP+          D+ H  +  ++ LG  LA  YL+++
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AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)9.6e-4034.94Show/hide
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        MAGRGGV  +   N  VWD  +P +C  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID GK  G+GPG+AFA+    +    + V+GLVPCA GGT I++W +  
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Query:  SNTSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISMYDFFMKHDTHDLPAVRAAEDAVQKE
            +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A  Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++          +  E  +  +
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Query:  LPDIITIDSWELPINFTTYEGFSWDHGHFNSATEIALGKWLADTYLAHY
        L +++ +D+  LP+          D+ H  +  ++ LG  LA  YL+++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGTCGAGGTGGGGTAGAGAACAATACAGAGGGGAATCTTGTGTGGGATGGGAAGGTCCCATTAGATTGTCAATCCGACCCATCCATCCTACGGTTGAAC
CCTGAGCGCCAGTGGGAGATAGCACATGAACCTCTCCATTTGGGGATTGACATCGGCAAAACTCCAGGGATTGGTCCAGGAATAGCATTTGCTCACGAGTTCATA
GCCAAAGCTGGACAAAAGGCAGGCGTCGTGGGTTTAGTTCCTTGTGCTAGAGGTGGCACTTTAATTGAACAATGGAGTAAAAACCCTAGCAATACTAGTGCAACT
TTTTACCAAAATTTCATTGAACGAATTAAAACATCAGAAAAAGAAGGCGGGGTTGTGCGTGCTTTGTTTTGGTATCAAGGAGAAAGCGATGCGGCTATGAGTGAC
ACTGCTCATAGATACAAAGACAACTTAAAGAAGTTCATCACCGACATCCGCAATGATATAAAACCTAGATTTTTGCCTGTCATTATTGTTAAGATATCCATGTAT
GACTTTTTTATGAAGCACGATACTCATGATTTGCCAGCAGTGAGAGCAGCTGAAGATGCAGTTCAAAAAGAGCTTCCAGACATCATTACTATTGACTCTTGGGAG
TTGCCTATAAACTTTACCACATATGAAGGCTTTAGCTGGGATCATGGTCATTTTAATAGTGCAACTGAGATTGCTTTAGGTAAATGGTTGGCTGACACATATCTT
GCCCACTATGGCCATTTACTCTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGGTCGAGGTGGGGTAGAGAACAATACAGAGGGGAATCTTGTGTGGGATGGGAAGGTCCCATTAGATTGTCAATCCGACCCATCCATCCTACGGTTGAAC
CCTGAGCGCCAGTGGGAGATAGCACATGAACCTCTCCATTTGGGGATTGACATCGGCAAAACTCCAGGGATTGGTCCAGGAATAGCATTTGCTCACGAGTTCATA
GCCAAAGCTGGACAAAAGGCAGGCGTCGTGGGTTTAGTTCCTTGTGCTAGAGGTGGCACTTTAATTGAACAATGGAGTAAAAACCCTAGCAATACTAGTGCAACT
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GACTTTTTTATGAAGCACGATACTCATGATTTGCCAGCAGTGAGAGCAGCTGAAGATGCAGTTCAAAAAGAGCTTCCAGACATCATTACTATTGACTCTTGGGAG
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GCCCACTATGGCCATTTACTCTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGRGGVENNTEGNLVWDGKVPLDCQSDPSILRLNPERQWEIAHEPLHLGIDIGKTPGIGPGIAFAHEFIAKAGQKAGVVGLVPCARGGTLIEQWSKNPSNTSAT
FYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMSDTAHRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISMYDFFMKHDTHDLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSWE
LPINFTTYEGFSWDHGHFNSATEIALGKWLADTYLAHYGHLL