; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G005400 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G005400
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionSmall VCP/p97-interacting protein
Genome locationCmo_Chr12:3295315..3296644
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G005400
SyntenyCmoCh12G005400
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR031632 - Small VCP/p97-interacting protein


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAE8652065.1 hypothetical protein Csa_018778 [Cucumis sativus]4.3e-2390.67Show/hide
Query:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLKVI
        MGQCVSCLD  QKQQRKEEERLASVEAR+KAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQ+AANAKQSA ANKGEPVLK +
Subjt:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLKVI

KAG7020610.1 hypothetical protein SDJN02_17296 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.5e-26100Show/hide
Query:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
        MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
Subjt:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK

XP_008444542.1 PREDICTED: uncharacterized protein LOC103487833 [Cucumis melo]5.1e-2494.52Show/hide
Query:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
        MGQCVSCLDE QKQQRKEEERLASVEAR+KAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQ+AANAKQSAN NKGEPVLK
Subjt:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK

XP_022951067.1 uncharacterized protein LOC111454028 [Cucurbita moschata]5.5e-26100Show/hide
Query:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
        MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
Subjt:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK

XP_038886006.1 uncharacterized protein LOC120076314 [Benincasa hispida]1.1e-2393.15Show/hide
Query:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
        MGQCVSCLDE +KQQRKEEERLASVEAR+KAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQ+AANAKQSAN NKGEPVLK
Subjt:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LN85 Uncharacterized protein1.6e-2390.79Show/hide
Query:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLKVIQ
        MGQCVSCLD  QKQQRKEEERLASVEAR+KAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQ+AANAKQSA ANKGEPVLK+ Q
Subjt:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLKVIQ

A0A1S3BAJ0 uncharacterized protein LOC1034878332.5e-2494.52Show/hide
Query:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
        MGQCVSCLDE QKQQRKEEERLASVEAR+KAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQ+AANAKQSAN NKGEPVLK
Subjt:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK

A0A6J1GGM5 uncharacterized protein LOC1114540282.7e-26100Show/hide
Query:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
        MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
Subjt:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK

A0A6J1K846 uncharacterized protein LOC1114920131.0e-2289.04Show/hide
Query:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
        MGQC SCLDE Q+Q+RKEEERLASVEAR+KAAEAAQ+RQEEFEKSAAGRAARAQ+AANAKQSAN NKGEPVLK
Subjt:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK

A0A6J1KLT2 uncharacterized protein LOC1114964242.7e-26100Show/hide
Query:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
        MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
Subjt:  MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G63905.1 unknown protein4.1e-1975.71Show/hide
Query:  CVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK
        C SC D  QK+QRKEEER AS EAR+KAAEAAQRR+E+F+KSAAGRAA+AQ+   AKQSAN NKGEPVLK
Subjt:  CVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLK


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGGCAATGCGTGAGTTGTCTGGACGAAGACCAAAAGCAACAGAGAAAAGAGGAAGAAAGATTGGCCTCCGTTGAAGCTCGGTCCAAAGCTGCCGAAGCAGCTCAGAG
AAGGCAAGAAGAATTTGAAAAATCTGCTGCAGGAAGAGCTGCACGTGCTCAGATGGCAGCAAATGCAAAGCAATCTGCTAACGCTAACAAGGGAGAACCAGTTCTTAAGG
TCATTCAAATTCCAGTTGTGCTTGTTGTTTGTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTCGAGGGAAAACCTGCAAGTGCAAGCAAAGCGATGGGGCAATGCGTGAGTTGTCTGGACGAAGACCAAAAGCAACAGAGAAAAGAGGAAGAAAGATTGGCCTCCGTTGA
AGCTCGGTCCAAAGCTGCCGAAGCAGCTCAGAGAAGGCAAGAAGAATTTGAAAAATCTGCTGCAGGAAGAGCTGCACGTGCTCAGATGGCAGCAAATGCAAAGCAATCTG
CTAACGCTAACAAGGGAGAACCAGTTCTTAAGGTCATTCAAATTCCAGTTGTGCTTGTTGTTTGTTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGQCVSCLDEDQKQQRKEEERLASVEARSKAAEAAQRRQEEFEKSAAGRAARAQMAANAKQSANANKGEPVLKVIQIPVVLVVC