; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G005490 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G005490
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionTransmembrane protein
Genome locationCmo_Chr12:3379219..3381697
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G005490
SyntenyCmoCh12G005490
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR021414 - Protein of unknown function DUF3054


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585718.1 hypothetical protein SDJN03_18451, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.9e-14198.08Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
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A0A6J1K997 uncharacterized protein LOC1114922681.3e-12486.54Show/hide
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A0A6J1KPE7 uncharacterized protein LOC1114964141.5e-14197.69Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G44920.1 unknown protein4.8e-7959.32Show/hide
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            SS   KW   ALLAGGDVLALL+FS+IGRFSHGFPVF  +TL TADPFIAGWFLSAYFLGGY E+GRG+ G SKAV AA+KSW +G PLG+IIR+A
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        +SGHIP  +F+ VTMGSTAVLL+GWRA+ + V P ++ KK+D YR+G+ FELFELLTSL+RRW
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CTTCTCCCTCCGACCAGACGGTTTTCGTCGGCGATGAGAGTGTTCCGTTGGAAGGCGTCATTCAGTTTGATAAGCCCGATAGGTCTTCTCGATGGAGAAAATGGAGTCAT
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TCCTTTTATTGCTGGTTGGTTTCTGAGTGCTTACTTTCTCGGAGGTTATGGAGAGGATGGGCGTGGTTTAAATGGTTATTCCAAGGCTGTTTTTGCAGCTTCTAAATCAT
GGGCTTTGGGAATTCCTCTTGGTCTAATAATAAGAGCTGCAACGTCTGGCCATATTCCACCAAATAATTTCATAGGGGTAACGATGGGAAGCACGGCTGTCTTGCTCGTT
GGATGGAGAGCGATACGATATAAAGTTTTTCCAGTCGATAACGGGAAGAAGAACGATGTATATCGTCGTGGCAACCCATTTGAGCTATTTGAGTTGTTGACATCATTGGT
GAGAAGATGGTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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TTAG
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GWRAIRYKVFPVDNGKKNDVYRRGNPFELFELLTSLVRRW