; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G006210 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G006210
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionPentatricopeptide repeat-containing protein
Genome locationCmo_Chr12:3893979..3895484
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G006210
SyntenyCmoCh12G006210
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR002885 - Pentatricopeptide repeat
IPR011990 - Tetratricopeptide-like helical domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585791.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.7e-28299.4Show/hide
Query:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
        MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
Subjt:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY

Query:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
        FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPK+RPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
Subjt:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK

Query:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
        VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
Subjt:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL

Query:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
        LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
Subjt:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK

Query:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
        YREALSVVWEMEAAN PFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAK KEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
Subjt:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK

Query:  R
        R
Subjt:  R

KAG7020726.1 Pentatricopeptide repeat-containing protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.5e-28399.6Show/hide
Query:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
        MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
Subjt:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY

Query:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
        FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEEN+SK
Subjt:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK

Query:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
        VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
Subjt:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL

Query:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
        LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
Subjt:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK

Query:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
        YREALSVVWEMEAAN PFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
Subjt:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK

Query:  R
        R
Subjt:  R

XP_022951807.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g01860 isoform X1 [Cucurbita moschata]2.9e-284100Show/hide
Query:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
        MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
Subjt:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY

Query:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
        FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
Subjt:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK

Query:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
        VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
Subjt:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL

Query:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
        LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
Subjt:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK

Query:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
        YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
Subjt:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK

Query:  R
        R
Subjt:  R

XP_023001961.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g01860 isoform X1 [Cucurbita maxima]8.5e-27696.41Show/hide
Query:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
        MDSLFSTT +SSILVKRNGGISCQIP+AHF TNS+RRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTS P PDTS+PDLI SEKIGLPEEELDE+EETAADNY
Subjt:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY

Query:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
        FANDDNDSD+VWD EEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDL+PEENVSK
Subjt:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK

Query:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
        VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
Subjt:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL

Query:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
        LVAAKNGKRMLDPSV+VKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNL+QQDTSAIIKVSTRLGKFEIAE+LYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
Subjt:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK

Query:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
        YREALSVVWEMEAAN PFDLPAYSVV+KLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
Subjt:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK

Query:  R
        R
Subjt:  R

XP_023537574.1 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g01860 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.4e-27897.6Show/hide
Query:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
        MDSLFSTTTISSILVKRNGG+SCQIP+AHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGP PDTS PDLI SEKIG PEEELDE+EETAADNY
Subjt:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY

Query:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
        FANDDNDSD+VWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDL+PEENVSK
Subjt:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK

Query:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
        VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
Subjt:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL

Query:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
        LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
Subjt:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK

Query:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
        YREALSVVWEMEAA  PFDLPAYSVV+KLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
Subjt:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK

Query:  R
        R
Subjt:  R

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1DI37 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g01860 isoform X11.7e-22981.53Show/hide
Query:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
        MD +FS++ +SSI+VK NGGISCQI +A F  N+RRR PKNLL PRRTKLPPDPGVNQFLK  TSG  P  SF D  SSEKI  PEEE D+ EE   +NY
Subjt:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY

Query:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
        F  DD D +++WDS+EIEAI+SLF+GRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIR RT V SRA +SKQVYKRPDFLIGLARAIRDL  EENVSK
Subjt:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK

Query:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
        VLNRWAPFL KGSLSLTI+ELGHMGLADRAL++FCW QEQPRL+PDDRVLASTVEVL+RNHELK+P NL+EFT+LASRGVLEAM+RGFIKGG L+LAWKL
Subjt:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL

Query:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
        LV AK G RMLDPSVYVKLILE+GKNPDKNMLVL LLDELGQREAL LNQQDT+AI+KV TRLGKFEIAERLY WYVES HEPSVVMYTAL+H+RYSE+K
Subjt:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK

Query:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQ
        YREALSVVWEMEAAN PFDLPAY+VV+KLFVALGDLSRA RYFAKLKEAGF PTY IYRNLITIYL +GRLAKCKEIYKEA+NAG+++DKQITS LLQ
Subjt:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQ

A0A6J1GIP2 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g01860 isoform X11.4e-284100Show/hide
Query:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
        MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
Subjt:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY

Query:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
        FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
Subjt:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK

Query:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
        VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
Subjt:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL

Query:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
        LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
Subjt:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK

Query:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
        YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
Subjt:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK

Query:  R
        R
Subjt:  R

A0A6J1GIR9 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g01860 isoform X23.4e-26293.81Show/hide
Query:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
        MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
Subjt:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY

Query:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
        FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
Subjt:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK

Query:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
        VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
Subjt:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL

Query:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
        LVAAKN                               DELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
Subjt:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK

Query:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
        YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
Subjt:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK

Query:  R
        R
Subjt:  R

A0A6J1KI41 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g01860 isoform X22.6e-25490.42Show/hide
Query:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
        MDSLFSTT +SSILVKRNGGISCQIP+AHF TNS+RRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTS P PDTS+PDLI SEKIGLPEEELDE+EETAADNY
Subjt:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY

Query:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
        FANDDNDSD+VWD EEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDL+PEENVSK
Subjt:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK

Query:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
        VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
Subjt:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL

Query:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
        LVAAKN                               DELGQREALNL+QQDTSAIIKVSTRLGKFEIAE+LYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
Subjt:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK

Query:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
        YREALSVVWEMEAAN PFDLPAYSVV+KLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
Subjt:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK

Query:  R
        R
Subjt:  R

A0A6J1KK31 pentatricopeptide repeat-containing protein At2g01860 isoform X14.1e-27696.41Show/hide
Query:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY
        MDSLFSTT +SSILVKRNGGISCQIP+AHF TNS+RRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTS P PDTS+PDLI SEKIGLPEEELDE+EETAADNY
Subjt:  MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNY

Query:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK
        FANDDNDSD+VWD EEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDL+PEENVSK
Subjt:  FANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSK

Query:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
        VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL
Subjt:  VLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKL

Query:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
        LVAAKNGKRMLDPSV+VKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNL+QQDTSAIIKVSTRLGKFEIAE+LYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK
Subjt:  LVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERK

Query:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
        YREALSVVWEMEAAN PFDLPAYSVV+KLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK
Subjt:  YREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAK

Query:  R
        R
Subjt:  R

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O64624 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g18940, chloroplastic1.8e-1024.19Show/hide
Query:  KPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWV---QEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHEL--------KIPFNLDEFTKLASRGVL
        +P   +S+  +     L +  L   +K L   G  +RA+  F W+        L  D +V+   V +L R  +         KIP  L E+  L      
Subjt:  KPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWV---QEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHEL--------KIPFNLDEFTKLASRGVL

Query:  EAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPS---VYVKLILEI-GKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYV
          ++  + + G+   A  L    K     + PS   V   +IL++ GK       +L +LDE+ + + L  ++   S ++    R G    A+  ++   
Subjt:  EAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPS---VYVKLILEI-GKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYV

Query:  ESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEI
          G+EP  V Y AL+        Y EALSV+ EME  + P D   Y+ ++  +V  G    A      + + G  P    Y  +I  Y  AG+  +  ++
Subjt:  ESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEI

Query:  YKEAENAGYV
        +   + AG V
Subjt:  YKEAENAGYV

Q5XET4 Pentatricopeptide repeat-containing protein At2g018606.9e-13555.27Show/hide
Query:  QTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNYFANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQ
        Q N  ++  KNL  PRRTKLPPD GVN FL+K    P                + +++ ++++E+       NDD+D+ VVW+ EEIEAI+SLF+ RIPQ
Subjt:  QTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNYFANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQ

Query:  KPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRAL--MSKQVYKRPDFLIGLARAIRDL-KPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLA
        KP K +R RPLPLP PHKLRP GLP PK   +  + S AL  +SKQVYK P FLIGLAR I+ L   + +VS VLN+W  FL+KGSLS TI+ELGHMGL 
Subjt:  KPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRAL--MSKQVYKRPDFLIGLARAIRDL-KPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLA

Query:  DRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNP
        +RAL+T+ W ++   L PD+R+LAST++VLA++HELK+   L     LAS+ V+EAM++G I+GG L+LA KL++ +K+  R+LD SVYVK+ILEI KNP
Subjt:  DRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNP

Query:  DKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVM
        DK  LV+ALL+EL +RE L L+QQD ++I+K+  +LG+FE+ E L+ W+  S  EPSVVMYT ++H+RYSE+KYREA+SVVWEME +N   DLPAY VV+
Subjt:  DKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVM

Query:  KLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAKR
        KLFVAL DL RA+RY++KLKEAGF+PTY IYR++I++Y A+GRL KCKEI KE E+AG  +DK  +  LLQ ++
Subjt:  KLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAKR

Q66GP4 Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g13770, chloroplastic2.4e-1025.32Show/hide
Query:  LDEFTKLASRGVLEA------MMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGK--NPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVS
        L+   ++  +G+ E+      ++R F +   + +  KL   A   K + DP + +K++L   +  N +  + V+A +    ++  L +      AI+   
Subjt:  LDEFTKLASRGVLEA------MMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGK--NPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVS

Query:  TRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRN
        ++   F  A ++Y W ++   E   V Y   ++      KY +A  +  EM        + AYS +M ++     LS AVR  AK+K+ G  P   IY +
Subjt:  TRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRN

Query:  LITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDK-QITSML
        LI ++  A  L + ++I+KE + A  + DK   TSM+
Subjt:  LITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDK-QITSML

Q8GZ63 Pentatricopeptide repeat-containing protein At5g256303.4e-0928.69Show/hide
Query:  IIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTY
        ++ V    G+   A+ ++    E+GH PS++ YT L+     +++Y    S+V E+E + +  D   ++ V+  F   G++  AV+   K+KE G  PT 
Subjt:  IIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTY

Query:  CIYRNLITIYLAAGRLAKCKEI
          Y  LI  Y  AG+  +  E+
Subjt:  CIYRNLITIYLAAGRLAKCKEI

Q9S7Q2 Pentatricopeptide repeat-containing protein At1g74850, chloroplastic3.9e-1321.12Show/hide
Query:  LARAIRDLKPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGV----
        L   +  L P  ++++ L+ +   L     +L  KE    G   R+L+ F ++Q Q    P++ +    + +L R  E  +   L+ F ++ S+GV    
Subjt:  LARAIRDLKPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGV----

Query:  --LEAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSV--YVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWY
            A++  + + GR   + +LL   KN K  + PS+  Y  +I    +       +L L  E+ + E +  +    + ++      G  + AE ++   
Subjt:  --LEAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSV--YVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWY

Query:  VESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKE
         + G  P +  Y+ LV      R+  +   ++ EM +  S  D+ +Y+V+++ +   G +  A+  F +++ AG TP    Y  L+ ++  +GR    ++
Subjt:  VESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKE

Query:  IYKEAENAGYVMDKQITSMLLQ
        ++ E +++    D    ++L++
Subjt:  IYKEAENAGYVMDKQITSMLLQ

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G74850.1 plastid transcriptionally active 22.8e-1421.12Show/hide
Query:  LARAIRDLKPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGV----
        L   +  L P  ++++ L+ +   L     +L  KE    G   R+L+ F ++Q Q    P++ +    + +L R  E  +   L+ F ++ S+GV    
Subjt:  LARAIRDLKPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGV----

Query:  --LEAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSV--YVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWY
            A++  + + GR   + +LL   KN K  + PS+  Y  +I    +       +L L  E+ + E +  +    + ++      G  + AE ++   
Subjt:  --LEAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSV--YVKLILEIGKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWY

Query:  VESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKE
         + G  P +  Y+ LV      R+  +   ++ EM +  S  D+ +Y+V+++ +   G +  A+  F +++ AG TP    Y  L+ ++  +GR    ++
Subjt:  VESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKE

Query:  IYKEAENAGYVMDKQITSMLLQ
        ++ E +++    D    ++L++
Subjt:  IYKEAENAGYVMDKQITSMLLQ

AT2G01860.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein4.9e-13655.27Show/hide
Query:  QTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNYFANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQ
        Q N  ++  KNL  PRRTKLPPD GVN FL+K    P                + +++ ++++E+       NDD+D+ VVW+ EEIEAI+SLF+ RIPQ
Subjt:  QTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNYFANDDNDSDVVWDSEEIEAITSLFRGRIPQ

Query:  KPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRAL--MSKQVYKRPDFLIGLARAIRDL-KPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLA
        KP K +R RPLPLP PHKLRP GLP PK   +  + S AL  +SKQVYK P FLIGLAR I+ L   + +VS VLN+W  FL+KGSLS TI+ELGHMGL 
Subjt:  KPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRAL--MSKQVYKRPDFLIGLARAIRDL-KPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLA

Query:  DRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNP
        +RAL+T+ W ++   L PD+R+LAST++VLA++HELK+   L     LAS+ V+EAM++G I+GG L+LA KL++ +K+  R+LD SVYVK+ILEI KNP
Subjt:  DRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNP

Query:  DKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVM
        DK  LV+ALL+EL +RE L L+QQD ++I+K+  +LG+FE+ E L+ W+  S  EPSVVMYT ++H+RYSE+KYREA+SVVWEME +N   DLPAY VV+
Subjt:  DKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVM

Query:  KLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAKR
        KLFVAL DL RA+RY++KLKEAGF+PTY IYR++I++Y A+GRL KCKEI KE E+AG  +DK  +  LLQ ++
Subjt:  KLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAKR

AT2G18940.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein1.3e-1124.19Show/hide
Query:  KPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWV---QEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHEL--------KIPFNLDEFTKLASRGVL
        +P   +S+  +     L +  L   +K L   G  +RA+  F W+        L  D +V+   V +L R  +         KIP  L E+  L      
Subjt:  KPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKELGHMGLADRALKTFCWV---QEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHEL--------KIPFNLDEFTKLASRGVL

Query:  EAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPS---VYVKLILEI-GKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYV
          ++  + + G+   A  L    K     + PS   V   +IL++ GK       +L +LDE+ + + L  ++   S ++    R G    A+  ++   
Subjt:  EAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPS---VYVKLILEI-GKNPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYV

Query:  ESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEI
          G+EP  V Y AL+        Y EALSV+ EME  + P D   Y+ ++  +V  G    A      + + G  P    Y  +I  Y  AG+  +  ++
Subjt:  ESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEI

Query:  YKEAENAGYV
        +   + AG V
Subjt:  YKEAENAGYV

AT5G13770.1 Pentatricopeptide repeat (PPR-like) superfamily protein1.7e-1125.32Show/hide
Query:  LDEFTKLASRGVLEA------MMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGK--NPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVS
        L+   ++  +G+ E+      ++R F +   + +  KL   A   K + DP + +K++L   +  N +  + V+A +    ++  L +      AI+   
Subjt:  LDEFTKLASRGVLEA------MMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGK--NPDKNMLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVS

Query:  TRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRN
        ++   F  A ++Y W ++   E   V Y   ++      KY +A  +  EM        + AYS +M ++     LS AVR  AK+K+ G  P   IY +
Subjt:  TRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTYCIYRN

Query:  LITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDK-QITSML
        LI ++  A  L + ++I+KE + A  + DK   TSM+
Subjt:  LITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDK-QITSML

AT5G25630.1 Tetratricopeptide repeat (TPR)-like superfamily protein2.4e-1028.69Show/hide
Query:  IIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTY
        ++ V    G+   A+ ++    E+GH PS++ YT L+     +++Y    S+V E+E + +  D   ++ V+  F   G++  AV+   K+KE G  PT 
Subjt:  IIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAVRYFAKLKEAGFTPTY

Query:  CIYRNLITIYLAAGRLAKCKEI
          Y  LI  Y  AG+  +  E+
Subjt:  CIYRNLITIYLAAGRLAKCKEI


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGATTCCCTGTTCTCAACCACTACAATCTCTTCCATTCTGGTGAAACGAAATGGAGGAATTAGCTGCCAGATTCCGGTGGCTCATTTCCAGACCAACTCCAGAAGGCG
ACCACCAAAAAACCTCCTCTATCCACGGCGGACCAAGCTTCCCCCTGATCCCGGCGTCAATCAATTCTTGAAGAAACGAACCTCTGGCCCTCAGCCTGACACATCCTTCC
CAGATTTGATTTCGAGCGAGAAAATCGGATTGCCGGAAGAAGAACTTGACGAGATTGAAGAAACCGCTGCGGATAACTATTTCGCCAATGATGATAACGACAGTGATGTT
GTTTGGGATTCGGAAGAAATTGAAGCTATTACATCACTCTTCCGAGGGAGAATTCCTCAGAAACCTGGTAAATTGAACCGGGAGAGACCTCTTCCTCTCCCACTTCCTCA
CAAGCTACGACCACCAGGACTTCCTAACCCTAAAATTCGCCCAAGAACAGCGGTTTCTTCGCGTGCACTGATGTCTAAGCAAGTCTATAAACGCCCCGATTTTCTTATTG
GACTTGCAAGAGCGATTAGAGATTTGAAACCGGAGGAGAATGTGTCCAAAGTTCTCAACAGGTGGGCACCATTTTTGCAGAAGGGGTCGCTGTCGTTAACGATCAAGGAA
CTAGGTCATATGGGTCTTGCTGATAGAGCTCTAAAGACGTTCTGTTGGGTACAAGAGCAACCTCGACTCTATCCAGATGATCGTGTTTTGGCCTCTACCGTTGAGGTCCT
CGCAAGGAACCATGAACTTAAAATACCTTTCAACCTGGATGAGTTCACTAAACTTGCGAGTCGTGGTGTGCTCGAGGCAATGATGAGAGGGTTCATCAAAGGTGGGAGGT
TAAGCCTTGCTTGGAAGCTTCTTGTAGCTGCCAAGAACGGTAAGAGAATGTTGGATCCTAGCGTTTATGTGAAGTTGATATTGGAGATTGGTAAGAACCCTGATAAAAAC
ATGCTGGTACTTGCCTTACTAGATGAACTAGGACAAAGAGAAGCCTTGAATTTAAACCAGCAAGATACATCAGCTATCATTAAGGTCAGCACAAGGCTTGGTAAATTTGA
AATTGCTGAAAGACTTTATAGCTGGTATGTTGAATCTGGGCATGAACCCAGTGTGGTTATGTACACTGCTTTAGTTCATAATCGCTATTCAGAGAGGAAGTATAGGGAGG
CATTATCTGTAGTGTGGGAAATGGAGGCTGCAAACTCTCCTTTTGATCTTCCTGCTTATAGTGTAGTGATGAAGCTTTTTGTTGCTCTTGGGGATCTTTCAAGGGCTGTT
AGATACTTTGCAAAGCTTAAGGAAGCTGGTTTTACCCCTACATATTGTATATATAGGAACTTGATTACCATTTATTTAGCTGCTGGCAGGTTAGCCAAGTGTAAGGAAAT
CTACAAGGAAGCAGAGAATGCTGGATATGTCATGGACAAACAAATTACCTCAATGTTGTTGCAAGCAAAAAGATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGATTCCCTGTTCTCAACCACTACAATCTCTTCCATTCTGGTGAAACGAAATGGAGGAATTAGCTGCCAGATTCCGGTGGCTCATTTCCAGACCAACTCCAGAAGGCG
ACCACCAAAAAACCTCCTCTATCCACGGCGGACCAAGCTTCCCCCTGATCCCGGCGTCAATCAATTCTTGAAGAAACGAACCTCTGGCCCTCAGCCTGACACATCCTTCC
CAGATTTGATTTCGAGCGAGAAAATCGGATTGCCGGAAGAAGAACTTGACGAGATTGAAGAAACCGCTGCGGATAACTATTTCGCCAATGATGATAACGACAGTGATGTT
GTTTGGGATTCGGAAGAAATTGAAGCTATTACATCACTCTTCCGAGGGAGAATTCCTCAGAAACCTGGTAAATTGAACCGGGAGAGACCTCTTCCTCTCCCACTTCCTCA
CAAGCTACGACCACCAGGACTTCCTAACCCTAAAATTCGCCCAAGAACAGCGGTTTCTTCGCGTGCACTGATGTCTAAGCAAGTCTATAAACGCCCCGATTTTCTTATTG
GACTTGCAAGAGCGATTAGAGATTTGAAACCGGAGGAGAATGTGTCCAAAGTTCTCAACAGGTGGGCACCATTTTTGCAGAAGGGGTCGCTGTCGTTAACGATCAAGGAA
CTAGGTCATATGGGTCTTGCTGATAGAGCTCTAAAGACGTTCTGTTGGGTACAAGAGCAACCTCGACTCTATCCAGATGATCGTGTTTTGGCCTCTACCGTTGAGGTCCT
CGCAAGGAACCATGAACTTAAAATACCTTTCAACCTGGATGAGTTCACTAAACTTGCGAGTCGTGGTGTGCTCGAGGCAATGATGAGAGGGTTCATCAAAGGTGGGAGGT
TAAGCCTTGCTTGGAAGCTTCTTGTAGCTGCCAAGAACGGTAAGAGAATGTTGGATCCTAGCGTTTATGTGAAGTTGATATTGGAGATTGGTAAGAACCCTGATAAAAAC
ATGCTGGTACTTGCCTTACTAGATGAACTAGGACAAAGAGAAGCCTTGAATTTAAACCAGCAAGATACATCAGCTATCATTAAGGTCAGCACAAGGCTTGGTAAATTTGA
AATTGCTGAAAGACTTTATAGCTGGTATGTTGAATCTGGGCATGAACCCAGTGTGGTTATGTACACTGCTTTAGTTCATAATCGCTATTCAGAGAGGAAGTATAGGGAGG
CATTATCTGTAGTGTGGGAAATGGAGGCTGCAAACTCTCCTTTTGATCTTCCTGCTTATAGTGTAGTGATGAAGCTTTTTGTTGCTCTTGGGGATCTTTCAAGGGCTGTT
AGATACTTTGCAAAGCTTAAGGAAGCTGGTTTTACCCCTACATATTGTATATATAGGAACTTGATTACCATTTATTTAGCTGCTGGCAGGTTAGCCAAGTGTAAGGAAAT
CTACAAGGAAGCAGAGAATGCTGGATATGTCATGGACAAACAAATTACCTCAATGTTGTTGCAAGCAAAAAGATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDSLFSTTTISSILVKRNGGISCQIPVAHFQTNSRRRPPKNLLYPRRTKLPPDPGVNQFLKKRTSGPQPDTSFPDLISSEKIGLPEEELDEIEETAADNYFANDDNDSDV
VWDSEEIEAITSLFRGRIPQKPGKLNRERPLPLPLPHKLRPPGLPNPKIRPRTAVSSRALMSKQVYKRPDFLIGLARAIRDLKPEENVSKVLNRWAPFLQKGSLSLTIKE
LGHMGLADRALKTFCWVQEQPRLYPDDRVLASTVEVLARNHELKIPFNLDEFTKLASRGVLEAMMRGFIKGGRLSLAWKLLVAAKNGKRMLDPSVYVKLILEIGKNPDKN
MLVLALLDELGQREALNLNQQDTSAIIKVSTRLGKFEIAERLYSWYVESGHEPSVVMYTALVHNRYSERKYREALSVVWEMEAANSPFDLPAYSVVMKLFVALGDLSRAV
RYFAKLKEAGFTPTYCIYRNLITIYLAAGRLAKCKEIYKEAENAGYVMDKQITSMLLQAKR