; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G006560 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G006560
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionDomain of unknown function (DUF303)
Genome locationCmo_Chr12:4280473..4281306
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G006560
SyntenyCmoCh12G006560
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585825.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-15998.56Show/hide
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KAG6585847.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.8e-15897.83Show/hide
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KAG6585849.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.9e-15897.47Show/hide
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XP_022951659.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]6.0e-162100Show/hide
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XP_023536887.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.1e-15897.47Show/hide
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        KAG VGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIS+Y
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GIT2 probable carbohydrate esterase At4g342151.6e-15797.47Show/hide
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A0A6J1GJF6 probable carbohydrate esterase At4g342152.9e-162100Show/hide
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A0A6J1GK48 probable carbohydrate esterase At4g342154.5e-13994.05Show/hide
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        PDIITIDS ELP+N TTFEGFSWDHGH NT TEI LGKWLA+TYLAHYGHLL
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A0A6J1I774 probable carbohydrate esterase At4g342154.1e-14892.09Show/hide
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        IL +PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK   G+LVWDGKVP ECQ DPSILR NPERQWEIAHEPLHLGID+  + TPGIGPGIPFAHQ KEKAG
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        QKAGIVGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKI+L
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        YDFFMKHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDS ELP+N TTFEGFSWDHGHFNT TEI LGKWLA+TYLAHYGHLL
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A0A6J1KIR8 probable carbohydrate esterase At4g342151.1e-14591.34Show/hide
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        MILF+PSLS ATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVE  Q GKL WDGKVPLECQ DPSILRLNP RQWEIA EPLHLGIDI  TPGIGPGIPFAHQFK KAGQ
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        KAGIVGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAM+DTA RYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIS+Y
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Query:  DFFMKHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLANTYLAHYGHLL
        DFFMKHDTH+LPAVRAAEDAVQKELPDIITIDS ELP+NFTTFEGF  DHGHFNT TEI LGKWLA+TYLAHY HLL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342157.3e-4636.43Show/hide
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        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV K   N + VWD  +P EC  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID     G+GPG+ FA+  K +    + +
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Query:  VGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISLYDFFM
        +GLVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++
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Query:  KHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLANTYLAHY
                  +  E  +  +L +++ +D++ LP+          D+ H  TE ++ LG  LA  YL+++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)7.5e-4640.59Show/hide
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        P L   T   N  IFILAGQSNMAGRGGV         VWDG +P EC+ +PSILRL  + +W+ A EPLH+ IDI+ T G+GPG+PFA++   + GQ  
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Query:  GIVGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPSATFYQNFIERIKTSEKE--GGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISLY
          VGLVPC+ GGT + QW K         Y+  ++R K +     GG  RA+ WYQGESD      A  YK  L KF +D+RND++   LP+I V ++  
Subjt:  GIVGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPSATFYQNFIERIKTSEKE--GGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISLY

Query:  DFFMKHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLANTYLA
                  L AVR A+  ++ +L ++  +D+R LP+          D  H  T +++ LG  +A ++LA
Subjt:  DFFMKHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLANTYLA

AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)5.2e-4736.43Show/hide
Query:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK-IQNGKLVWDGKVPLECQFDPSILRLNPERQWEIAHEPLHLGIDISHTPGIGPGIPFAHQFKEKAGQKAGI
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV K   N + VWD  +P EC  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID     G+GPG+ FA+  K +    + +
Subjt:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK-IQNGKLVWDGKVPLECQFDPSILRLNPERQWEIAHEPLHLGIDISHTPGIGPGIPFAHQFKEKAGQKAGI

Query:  VGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISLYDFFM
        +GLVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++
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Query:  KHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLANTYLAHY
                  +  E  +  +L +++ +D++ LP+          D+ H  TE ++ LG  LA  YL+++
Subjt:  KHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLANTYLAHY

AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)5.2e-4736.43Show/hide
Query:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK-IQNGKLVWDGKVPLECQFDPSILRLNPERQWEIAHEPLHLGIDISHTPGIGPGIPFAHQFKEKAGQKAGI
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV K   N + VWD  +P EC  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID     G+GPG+ FA+  K +    + +
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Query:  VGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISLYDFFM
        +GLVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y +N+ + I ++R+D+    LP+I V I+    ++
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Query:  KHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLANTYLAHY
                  +  E  +  +L +++ +D++ LP+          D+ H  TE ++ LG  LA  YL+++
Subjt:  KHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLANTYLAHY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATATTGTTTAACCCTTCCCTTTCAGGGGCTACTTCTCCCACCAACATATTCATCCTTGCCGGTCAGAGCAACATGGCTGGTCGAGGTGGGGTAGAGAAAATTCAAAA
CGGGAAACTTGTGTGGGATGGAAAGGTCCCATTAGAGTGTCAATTCGACCCATCCATCCTACGGTTGAACCCTGAGCGCCAATGGGAGATAGCACATGAACCTCTCCATT
TGGGGATTGACATTAGTCACACTCCAGGGATTGGTCCAGGGATACCGTTTGCTCACCAGTTCAAAGAAAAAGCTGGACAAAAGGCAGGCATCGTGGGTTTAGTTCCTTGT
GCTAGAGGTGGCACTTTAATTGAACAATGGATAAAAAACCCTAGCAATCCTAGTGCAACATTTTACCAGAATTTCATTGAACGAATTAAAACTTCAGAAAAAGAAGGTGG
AGTTGTGCGTGCTTTGTTTTGGTATCAAGGAGAAAGCGATGCGGCTATGAATGACACCGCTCAAAGATACAAAGACAACTTAAAGAAGTTCATCACCGACATCCGCAATG
ATATAAAACCTAGATTTTTACCGGTCATTATTGTTAAGATATCCCTTTACGACTTTTTTATGAAGCACGATACTCATAACTTGCCGGCAGTGAGAGCAGCTGAAGATGCA
GTCCAAAAAGAGCTTCCAGACATCATTACTATCGACTCTCGGGAGTTGCCTGTAAACTTTACCACATTTGAAGGGTTTTCGTGGGATCATGGTCATTTTAATACGGAAAC
AGAGATTGTTTTGGGTAAATGGTTGGCAAACACATATCTCGCCCACTATGGTCATTTACTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATATTGTTTAACCCTTCCCTTTCAGGGGCTACTTCTCCCACCAACATATTCATCCTTGCCGGTCAGAGCAACATGGCTGGTCGAGGTGGGGTAGAGAAAATTCAAAA
CGGGAAACTTGTGTGGGATGGAAAGGTCCCATTAGAGTGTCAATTCGACCCATCCATCCTACGGTTGAACCCTGAGCGCCAATGGGAGATAGCACATGAACCTCTCCATT
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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