; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G006570 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G006570
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionDomain of unknown function (DUF303)
Genome locationCmo_Chr12:4288287..4289045
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G006570
SyntenyCmoCh12G006570
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585826.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.9e-146100Show/hide
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KAG6585833.1 Carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.2e-14699.6Show/hide
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KAG6585835.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.8e-14296.83Show/hide
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KAG6585850.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.6e-14599.21Show/hide
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XP_022951909.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]1.9e-146100Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GIT2 probable carbohydrate esterase At4g342151.7e-13793.25Show/hide
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A0A6J1GJF6 probable carbohydrate esterase At4g342157.0e-13994.05Show/hide
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A0A6J1GK48 probable carbohydrate esterase At4g342159.1e-147100Show/hide
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A0A6J1I774 probable carbohydrate esterase At4g342155.9e-13894.09Show/hide
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A0A6J1IKT8 probable carbohydrate esterase At4g342155.9e-13894.09Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342151.4e-4036.95Show/hide
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            +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y  N+ + I ++R+D+    LP+I V IA    +       +  VREA+  +  +
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        L +++ +D+  LP+          D+ HL T  ++ LG  LA  YL+++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)6.0e-4239.76Show/hide
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        MAGRGGV   T     VWDG +P EC+S+PSILRL  + +W+ A EPLH+ IDI  T G+G G+PFA+++  + GQ    VGLVPC+ GGT + QW K  
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               Y+  ++R K +     GG  RA+ WYQGESD      A  YK+ L KF +D+RND++   LP+I V +A            L AVR+A+  ++
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Query:  KELPDIITIDSLELPINLTTFEGFSWDHGHLNTATEIALGKWLADTYLA
         +L ++  +D+  LP+          D  HL T++++ LG  +A+++LA
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AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)1.0e-4136.95Show/hide
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        MAGRGGV K   N + VWD  +P EC  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID G   G+G G+ FA+ +K +    + ++GLVPCA GGT I++W +  
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            +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y  N+ + I ++R+D+    LP+I V IA    +       +  VREA+  +  +
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        L +++ +D+  LP+          D+ HL T  ++ LG  LA  YL+++
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AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)1.0e-4136.95Show/hide
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        MAGRGGV K   N + VWD  +P EC  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID G   G+G G+ FA+ +K +    + ++GLVPCA GGT I++W +  
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            +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y  N+ + I ++R+D+    LP+I V IA    +       +  VREA+  +  +
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Query:  LPDIITIDSLELPINLTTFEGFSWDHGHLNTATEIALGKWLADTYLAHY
        L +++ +D+  LP+          D+ HL T  ++ LG  LA  YL+++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCTGGTCGAGGTGGGGTAGAGAAAACTCAAAATGGGAAACTTGTGTGGGATGGCAAGGTCCCATTAGAGTGTCAATCCGACCCATCCATCCTACGGTTGAACCCTGA
GCGCCAATGGGAGATAGCACATGAACCTCTCCATTTGGGGATTGACATCGGCCACACTCCAGGGATTGGTTCGGGAATACCGTTTGCTCACCAGTTGAAAGAAAAAGCTG
GACAAAAGGCAGGTATCGTGGGTTTAGTTCCTTGTGCTAGGGGTGGCACTTTAATTGAACAATGGATTAAAAACCCTAGCAATCCTAGTGCAACTTTTTATCAAAATTTC
ATTGAACGAATTAAAACATCAGAAAAAGAAGGTGGGGTTGTGCGTGCTTTGTTTTGGTATCAAGGAGAAAGCGATGCGGCTATGAATGACACTGCTCAAAGATACAAAGA
AAACTTAAAGAAGTTCATCACCGACATCCGCAATGATATAAAACCTAGATTTTTACCTGTCATTATTGTTAAGATAGCCCTCTATGACTTTTTTATGAAGCACGATACTC
ATAATTTGCCAGCAGTAAGAGAAGCTGAAGATGCCGTCCAAAAAGAGCTTCCAGACATCATTACTATTGACTCTTTGGAGTTGCCTATCAACTTGACCACATTTGAAGGC
TTCTCCTGGGATCATGGTCATTTGAATACCGCAACTGAGATTGCTTTGGGTAAATGGTTGGCTGACACATATCTCGCCCACTATGGTCATTTACTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCTGGTCGAGGTGGGGTAGAGAAAACTCAAAATGGGAAACTTGTGTGGGATGGCAAGGTCCCATTAGAGTGTCAATCCGACCCATCCATCCTACGGTTGAACCCTGA
GCGCCAATGGGAGATAGCACATGAACCTCTCCATTTGGGGATTGACATCGGCCACACTCCAGGGATTGGTTCGGGAATACCGTTTGCTCACCAGTTGAAAGAAAAAGCTG
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AAACTTAAAGAAGTTCATCACCGACATCCGCAATGATATAAAACCTAGATTTTTACCTGTCATTATTGTTAAGATAGCCCTCTATGACTTTTTTATGAAGCACGATACTC
ATAATTTGCCAGCAGTAAGAGAAGCTGAAGATGCCGTCCAAAAAGAGCTTCCAGACATCATTACTATTGACTCTTTGGAGTTGCCTATCAACTTGACCACATTTGAAGGC
TTCTCCTGGGATCATGGTCATTTGAATACCGCAACTGAGATTGCTTTGGGTAAATGGTTGGCTGACACATATCTCGCCCACTATGGTCATTTACTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAGRGGVEKTQNGKLVWDGKVPLECQSDPSILRLNPERQWEIAHEPLHLGIDIGHTPGIGSGIPFAHQLKEKAGQKAGIVGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPSATFYQNF
IERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKENLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMKHDTHNLPAVREAEDAVQKELPDIITIDSLELPINLTTFEG
FSWDHGHLNTATEIALGKWLADTYLAHYGHLL