; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G006580 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G006580
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionDomain of unknown function (DUF303)
Genome locationCmo_Chr12:4303149..4303982
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G006580
SyntenyCmoCh12G006580
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585825.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]9.9e-15797.11Show/hide
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KAG6585847.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.8e-15898.56Show/hide
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KAG6585849.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.8e-15797.47Show/hide
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XP_022951659.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 [Cucurbita moschata]1.3e-15697.11Show/hide
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XP_023536887.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.3e-15696.75Show/hide
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        KAG VGLVPCARGGTLIEQW+KNPSNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLK FITDIRNDIKPRFLPVIIVKIS+Y
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GIT2 probable carbohydrate esterase At4g342151.1e-15697.47Show/hide
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A0A6J1GJF6 probable carbohydrate esterase At4g342156.2e-15797.11Show/hide
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A0A6J1GK48 probable carbohydrate esterase At4g342152.9e-13893.25Show/hide
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        NPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYK+NLK FITDIRNDIKPRFLPVIIVKI+LYDFFMKHDTHNLPAVR AEDAVQKEL
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        PDIITIDS ELP+N TTFEGFSWDHGH NT TEI LGKWLADTYLAHYGHLL
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A0A6J1I774 probable carbohydrate esterase At4g342151.5e-14791.73Show/hide
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        IL SPSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK   G+L WDGKVP ECQSDPSILR NPERQWE+AHEPLHLGID+  + TPGIGPGIPFAHQ KEKAG
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A0A6J1KIR8 probable carbohydrate esterase At4g342156.5e-14691.34Show/hide
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        DFFMKHDTH+LPAVRAAEDAVQKELPDIITIDS ELP+NFTTFEGF  DHGHFNT TEI LGKWLADTYLAHY HLL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342151.2e-4536.06Show/hide
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        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV K + N +  WD  +P EC  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID     G+GPG+ FA+  K +    + +
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        +GLVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y +N+   I ++R+D+    LP+I V I+    ++
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Query:  KHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLADTYLAHY
                  +  E  +  +L +++ +D++ LP+          D+ H  TE ++ LG  LA  YL+++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)1.3e-4540.22Show/hide
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        P L   T   N  IFILAGQSNMAGRGGV          WDG +P EC+S+PSILRL  + +W+ A EPLH+ IDI+ T G+GPG+PFA++   + GQ  
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Query:  GIVGLVPCARGGTLIEQWMKNPSNPSATFYQNFIERIKTSEKE--GGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKTFITDIRNDIKPRFLPVIIVKISLY
          VGLVPC+ GGT + QW K         Y+  ++R K +     GG  RA+ WYQGESD      A  YK  L  F +D+RND++   LP+I V ++  
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Query:  DFFMKHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLADTYLA
                  L AVR A+  ++ +L ++  +D+R LP+          D  H  T +++ LG  +A+++LA
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AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)8.9e-4736.06Show/hide
Query:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK-NQNGKLAWDGKVPLECQSDPSILRLNPERQWEMAHEPLHLGIDISHTPGIGPGIPFAHQFKEKAGQKAGI
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV K + N +  WD  +P EC  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID     G+GPG+ FA+  K +    + +
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        +GLVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y +N+   I ++R+D+    LP+I V I+    ++
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Query:  KHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLADTYLAHY
                  +  E  +  +L +++ +D++ LP+          D+ H  TE ++ LG  LA  YL+++
Subjt:  KHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLADTYLAHY

AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)8.9e-4736.06Show/hide
Query:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK-NQNGKLAWDGKVPLECQSDPSILRLNPERQWEMAHEPLHLGIDISHTPGIGPGIPFAHQFKEKAGQKAGI
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV K + N +  WD  +P EC  + SILRL+ + +WE AHEPLH+ ID     G+GPG+ FA+  K +    + +
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        +GLVPCA GGT I++W +      +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y +N+   I ++R+D+    LP+I V I+    ++
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Query:  KHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLADTYLAHY
                  +  E  +  +L +++ +D++ LP+          D+ H  TE ++ LG  LA  YL+++
Subjt:  KHDTHNLPAVRAAEDAVQKELPDIITIDSRELPVNFTTFEGFSWDHGHFNTETEIVLGKWLADTYLAHY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATATTGTTTAGCCCTTCCCTTTCAGGGGCTACTTCTCCCACAAACATATTCATCCTTGCCGGTCAGAGCAACATGGCAGGGCGAGGTGGGGTAGAGAAAAATCAAAA
TGGGAAACTTGCGTGGGATGGAAAGGTCCCATTAGAGTGTCAATCCGACCCATCCATCCTACGGTTGAACCCTGAGCGCCAATGGGAGATGGCACATGAACCTCTCCATT
TGGGGATTGACATTAGTCACACTCCAGGGATTGGTCCGGGGATACCGTTTGCTCACCAGTTCAAAGAAAAAGCTGGACAAAAGGCTGGCATTGTGGGTTTGGTTCCTTGT
GCTAGAGGTGGCACTTTAATTGAACAATGGATGAAAAACCCTAGCAATCCTAGTGCAACTTTTTACCAGAATTTCATTGAACGAATTAAAACATCAGAAAAAGAAGGTGG
AGTTGTGCGTGCTTTGTTTTGGTATCAAGGAGAAAGCGATGCGGCTATGAATGACACCGCTCAAAGATACAAAGACAACTTAAAGACGTTCATCACCGACATCCGCAATG
ATATAAAACCTAGATTTTTACCGGTCATTATTGTTAAGATATCCCTTTATGACTTTTTTATGAAGCACGATACTCATAACTTGCCGGCAGTGAGAGCAGCTGAAGATGCA
GTCCAAAAAGAGCTTCCAGACATCATTACTATCGACTCTCGGGAGTTGCCTGTAAACTTTACCACATTTGAAGGCTTTTCGTGGGATCATGGTCATTTTAATACGGAAAC
AGAGATTGTTTTGGGTAAATGGTTGGCAGACACATATCTCGCCCACTATGGTCATTTACTATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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