; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G006660 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G006660
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionDomain of unknown function (DUF303)
Genome locationCmo_Chr12:4404774..4405774
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G006660
SyntenyCmoCh12G006660
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR005181 - Sialate O-acetylesterase domain
IPR036514 - SGNH hydrolase superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6585826.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]4.8e-15289.74Show/hide
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KAG6585835.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-15390.4Show/hide
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KAG6585850.1 putative carbohydrate esterase, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]6.3e-15289.74Show/hide
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XP_023536885.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 isoform X1 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.5e-15387.86Show/hide
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XP_023536887.1 probable carbohydrate esterase At4g34215 isoform X2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]7.5e-15387.86Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A6J1GIT2 probable carbohydrate esterase At4g342157.1e-14985.3Show/hide
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A0A6J1GJF6 probable carbohydrate esterase At4g342151.7e-15086.26Show/hide
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        LA+TYLAHYGHLL
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A0A6J1GK48 probable carbohydrate esterase At4g342158.7e-13988.81Show/hide
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A0A6J1I774 probable carbohydrate esterase At4g342157.1e-14986.03Show/hide
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        MNDTAQRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMKHDTHNLPAVR AEDAVQKELPDIITIDS ELP+NLTTFEGFSWDHGH NTATEIALG
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        KWLADTYLAHYGHLL
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A0A6J1KIR8 probable carbohydrate esterase At4g342159.9e-14383.07Show/hide
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        M+LLKLS LLCMILF PSLS ATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVE NQ G+L WDGKVPLECQSDPSILRLN  RQWEIA EPLHLGIDIG TPGIG GIP
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        FAHQ K KAGQKAG VGLVPCARGGTLIEQWIKNP                         SNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAM+
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Query:  DTAQRYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMKHDTHNLPAVREAEDAVQKELPDIITIDSLELPINLTTFEGFSWDHGHLNTATEIALGKW
        DTA RYKDNLKKFITDIRNDIKPRFLPVIIVKI++YDFFMKHDTH+LPAVR AEDAVQKELPDIITIDS ELPIN TTFEGF  DHGH NTATEIALGKW
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        LADTYLAHY HLL
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9J9 Probable carbohydrate esterase At4g342152.9e-4334.69Show/hide
Query:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK-NQNGELVWDGKVPLECQSDPSILRLNSERQWEIAHEPLHLGIDIGHTPGIGLGIPFAHQLKEKAGQKAGT
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV K + N   VWD  +P EC  + SILRL+++ +WE AHEPLH+ ID G   G+G G+ FA+ +K +    +  
Subjt:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK-NQNGELVWDGKVPLECQSDPSILRLNSERQWEIAHEPLHLGIDIGHTPGIGLGIPFAHQLKEKAGQKAGT

Query:  VGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPTILVQLFTRISLNELKHQKKKASNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFIT
        +GLVPCA GGT I++W +                               +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y +N+ + I 
Subjt:  VGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPTILVQLFTRISLNELKHQKKKASNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFIT

Query:  DIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMKHDTHNLPAVREAEDAVQKELPDIITIDSLELPINLTTFEGFSWDHGHLNTATEIALGKWLADTYLAHY
        ++R+D+    LP+I V IA    +       +  VREA+  +  +L +++ +D+  LP+          D+ HL T  ++ LG  LA  YL+++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G53010.1 Domain of unknown function (DUF303)1.4e-4337.84Show/hide
Query:  PSLSGATSPTN--IFILAGQSNMAGRGGV-EKNQNGELVWDGKVPLECQSDPSILRLNSERQWEIAHEPLHLGIDIGHTPGIGLGIPFAHQLKEKAGQKA
        P L   T   N  IFILAGQSNMAGRGGV         VWDG +P EC+S+PSILRL S+ +W+ A EPLH+ IDI  T G+G G+PFA+++  + GQ  
Subjt:  PSLSGATSPTN--IFILAGQSNMAGRGGV-EKNQNGELVWDGKVPLECQSDPSILRLNSERQWEIAHEPLHLGIDIGHTPGIGLGIPFAHQLKEKAGQKA

Query:  GTVGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPTILVQLFTRISLNELKHQKKKASNPSATFYQNFIERIKTSEKE--GGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLK
          VGLVPC+ GGT + QW K                                  Y+  ++R K +     GG  RA+ WYQGESD      A  YK  L 
Subjt:  GTVGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPTILVQLFTRISLNELKHQKKKASNPSATFYQNFIERIKTSEKE--GGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLK

Query:  KFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMKHDTHNLPAVREAEDAVQKELPDIITIDSLELPINLTTFEGFSWDHGHLNTATEIALGKWLADTYLA
        KF +D+RND++   LP+I V +A            L AVR+A+  ++ +L ++  +D+  LP+          D  HL T++++ LG  +A+++LA
Subjt:  KFITDIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMKHDTHNLPAVREAEDAVQKELPDIITIDSLELPINLTTFEGFSWDHGHLNTATEIALGKWLADTYLA

AT4G34215.1 Domain of unknown function (DUF303)2.1e-4434.69Show/hide
Query:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK-NQNGELVWDGKVPLECQSDPSILRLNSERQWEIAHEPLHLGIDIGHTPGIGLGIPFAHQLKEKAGQKAGT
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV K + N   VWD  +P EC  + SILRL+++ +WE AHEPLH+ ID G   G+G G+ FA+ +K +    +  
Subjt:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK-NQNGELVWDGKVPLECQSDPSILRLNSERQWEIAHEPLHLGIDIGHTPGIGLGIPFAHQLKEKAGQKAGT

Query:  VGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPTILVQLFTRISLNELKHQKKKASNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFIT
        +GLVPCA GGT I++W +                               +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y +N+ + I 
Subjt:  VGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPTILVQLFTRISLNELKHQKKKASNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFIT

Query:  DIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMKHDTHNLPAVREAEDAVQKELPDIITIDSLELPINLTTFEGFSWDHGHLNTATEIALGKWLADTYLAHY
        ++R+D+    LP+I V IA    +       +  VREA+  +  +L +++ +D+  LP+          D+ HL T  ++ LG  LA  YL+++
Subjt:  DIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMKHDTHNLPAVREAEDAVQKELPDIITIDSLELPINLTTFEGFSWDHGHLNTATEIALGKWLADTYLAHY

AT4G34215.2 Domain of unknown function (DUF303)2.1e-4434.69Show/hide
Query:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK-NQNGELVWDGKVPLECQSDPSILRLNSERQWEIAHEPLHLGIDIGHTPGIGLGIPFAHQLKEKAGQKAGT
        P +     P  IFIL+GQSNMAGRGGV K + N   VWD  +P EC  + SILRL+++ +WE AHEPLH+ ID G   G+G G+ FA+ +K +    +  
Subjt:  PSLSGATSPTNIFILAGQSNMAGRGGVEK-NQNGELVWDGKVPLECQSDPSILRLNSERQWEIAHEPLHLGIDIGHTPGIGLGIPFAHQLKEKAGQKAGT

Query:  VGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPTILVQLFTRISLNELKHQKKKASNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFIT
        +GLVPCA GGT I++W +                               +  Y+  ++R + S K GG ++A+ WYQGESD      A+ Y +N+ + I 
Subjt:  VGLVPCARGGTLIEQWIKNPSNPTILVQLFTRISLNELKHQKKKASNPSATFYQNFIERIKTSEKEGGVVRALFWYQGESDAAMNDTAQRYKDNLKKFIT

Query:  DIRNDIKPRFLPVIIVKIALYDFFMKHDTHNLPAVREAEDAVQKELPDIITIDSLELPINLTTFEGFSWDHGHLNTATEIALGKWLADTYLAHY
        ++R+D+    LP+I V IA    +       +  VREA+  +  +L +++ +D+  LP+          D+ HL T  ++ LG  LA  YL+++
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CAAAAGGCAGGCACCGTGGGTTTAGTTCCTTGTGCTAGGGGTGGCACTTTAATTGAACAATGGATTAAAAACCCTAGCAATCCTACAATCCTAGTGCAACTTTTTACCAG
AATTTCATTGAACGAATTAAAACATCAGAAAAAGAAGGCTAGCAATCCTAGTGCAACTTTTTACCAGAATTTCATTGAACGAATTAAAACATCAGAAAAAGAAGGTGGAG
TTGTGCGTGCTTTGTTTTGGTATCAAGGAGAAAGCGATGCGGCTATGAATGACACTGCTCAAAGATACAAAGACAACTTAAAGAAGTTCATCACCGACATCCGCAATGAT
ATAAAACCTAGATTTTTACCTGTCATTATTGTTAAGATAGCCCTCTATGACTTTTTTATGAAGCACGATACTCATAATTTGCCAGCAGTAAGAGAAGCTGAAGATGCCGT
CCAAAAAGAGCTTCCAGACATCATTACTATTGACTCTTTGGAGTTGCCTATAAACTTGACCACATTTGAAGGCTTCTCCTGGGATCATGGTCATTTGAATACCGCAACTG
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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IKPRFLPVIIVKIALYDFFMKHDTHNLPAVREAEDAVQKELPDIITIDSLELPINLTTFEGFSWDHGHLNTATEIALGKWLADTYLAHYGHLL