; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G006880 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G006880
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionRrna intron-encoded homing endonuclease
Genome locationCmo_Chr12:4938439..4938639
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G006880
SyntenyCmoCh12G006880
Gene Ontology termsGO:0090305 - nucleic acid phosphodiester bond hydrolysis (biological process)
GO:0004519 - endonuclease activity (molecular function)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG8365712.1 hypothetical protein BUALT_Bualt17G0000400 [Buddleja alternifolia]3.0e-2796.97Show/hide
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PPR87549.1 hypothetical protein GOBAR_AA33147 [Gossypium barbadense]7.1e-2998.48Show/hide
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TKR78379.1 uncharacterized protein D5086_0000283000 [Populus alba]3.0e-2796.97Show/hide
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TXG51768.1 hypothetical protein EZV62_024292 [Acer yangbiense]1.2e-2898.48Show/hide
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XP_020965480.1 uncharacterized protein LOC110266056 [Arachis ipaensis]2.1e-2896.97Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0P1AX64 Rrna intron-encoded homing endonuclease2.5e-2793.94Show/hide
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A0A2P5W8Y1 Uncharacterized protein3.4e-2998.48Show/hide
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A0A4U5PNX9 Uncharacterized protein1.4e-2796.97Show/hide
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A0A4U5R3F9 Uncharacterized protein1.9e-2795.45Show/hide
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A0A5C7H450 Uncharacterized protein5.9e-2998.48Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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TGAATGGTCCGGTGAAGTGTTCGGATCGTGGCGACGTGGGCGGTTCGCTGCCTGCGACGTCGCGAGAAGTCCACTGAACCTTATCATTTAG
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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