; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G008840 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G008840
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionATP synthase subunit beta, chloroplastic
Genome locationCmo_Chr12:8072996..8073517
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G008840
SyntenyCmoCh12G008840
Gene Ontology termsGO:0015986 - ATP synthesis coupled proton transport (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0045261 - proton-transporting ATP synthase complex, catalytic core F(1) (cellular component)
GO:0005524 - ATP binding (molecular function)
GO:0046933 - proton-transporting ATP synthase activity, rotational mechanism (molecular function)
GO:0046961 - proton-transporting ATPase activity, rotational mechanism (molecular function)
InterPro domainsIPR000194 - ATPase, F1/V1/A1 complex, alpha/beta subunit, nucleotide-binding domain
IPR027417 - P-loop containing nucleoside triphosphate hydrolase


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
ACN66353.1 ATP synthase beta chain, partial [Cocculus balfourii]2.1e-8093.64Show/hide
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ADQ64335.1 ATP synthase beta subunit, partial [Anomospermum chloranthum]1.6e-8093.64Show/hide
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AOO76878.1 ATP synthase beta subunit, partial [Clinopodium gracile]9.4e-8193.64Show/hide
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CAB89998.1 ATP synthase beta subunit, partial [Solanum nodiflorum]2.1e-8093.64Show/hide
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QHE64455.1 AtpB [Coffea humilis]7.2e-8194.22Show/hide
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A0A0C5CEC7 ATP synthase subunit beta, chloroplastic1.0e-8093.64Show/hide
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A0A1C9HCB8 ATP synthase subunit beta (Fragment)4.5e-8193.64Show/hide
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A0A6B9QBU7 ATP synthase subunit beta, chloroplastic3.5e-8194.22Show/hide
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A0A6B9QCT5 ATP synthase subunit beta, chloroplastic3.5e-8194.22Show/hide
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E7DN05 ATP synthase subunit beta (Fragment)7.8e-8193.64Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
A0A342 ATP synthase subunit beta, chloroplastic2.7e-8393.64Show/hide
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Q2MI93 ATP synthase subunit beta, chloroplastic2.7e-8393.64Show/hide
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Q2MII0 ATP synthase subunit beta, chloroplastic6.1e-8393.06Show/hide
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Q2VEH0 ATP synthase subunit beta, chloroplastic6.1e-8393.06Show/hide
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Q8S8W8 ATP synthase subunit beta, chloroplastic8.0e-8393.06Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G78900.1 vacuolar ATP synthase subunit A1.2e-0929.3Show/hide
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        V+   GER  E  ++ M+  +  +     +E  V  +  LV    N  + AR     T +T+AEYFRD+   +V +  D+  R+ +A  E+   L  MP+
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          GY   L+  + S  ER    K        GS+T + AV  P  D +DP  + T +
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AT5G08670.1 ATP synthase alpha/beta family protein2.8e-6776.88Show/hide
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AT5G08680.1 ATP synthase alpha/beta family protein2.8e-6776.88Show/hide
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AT5G08690.1 ATP synthase alpha/beta family protein2.8e-6776.88Show/hide
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ATCG00480.1 ATP synthase subunit beta1.4e-8290.75Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGCGATTGATCAACAACATTGTCAAAGCTCATAGAGGTGTATCCGTATTTGGAAGAGTAGGTGAACGTACTCGTGAAGGAAATGATCTTTACATGGAAATGAAAGAATT
CGGAGTAATTAATAAAGAAAATATTGTAGAATCAAAAGTGGCTCTAGTCTACGGTCAGATGAATGAACTGTTGGGAGCTCGTATGAGAGTTGGTTTAACTGCCCTAACTA
TGGCGGAATATTTTCGAGATGTTAATGAACAAGACGTGCTTCTATTTATCGACAATATCTTCCGTTTTGTTCAAGCGGGATCTGAAGTATTCGCGTTACTGGGTAGAATG
CCTTCGGTTGTGGGTTATCAACCGAATCTTAGTACTGAAATGGGTTCCTTACAAGAAAGAATTACTTCTACCAAGGAAGGGTCCATTACTTCTATTCAAGCAGTTTATGT
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mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
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