; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G009600 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G009600
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionPSI subunit V
Genome locationCmo_Chr12:8965693..8967470
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G009600
SyntenyCmoCh12G009600
Gene Ontology termsGO:0015979 - photosynthesis (biological process)
GO:0009535 - chloroplast thylakoid membrane (cellular component)
GO:0009538 - photosystem I reaction center (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR003757 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI
IPR022980 - Photosystem I, reaction centre subunit XI
IPR036592 - Photosystem I PsaL, reaction centre subunit XI superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586150.1 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.2e-11499.54Show/hide
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XP_023536879.1 photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.8e-11499.08Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B555 PSI subunit V1.8e-11196.31Show/hide
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A0A6J1D7U0 PSI subunit V2.8e-11296.77Show/hide
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A0A6J1FBZ4 PSI subunit V4.6e-115100Show/hide
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A0A6J1HKH3 PSI subunit V3.9e-11498.62Show/hide
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A0A6J1KBZ8 PSI subunit V2.4e-11195.85Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O78469 Photosystem I reaction center subunit XI1.5e-3348Show/hide
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P23993 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic5.1e-7969.72Show/hide
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Q39654 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic7.1e-11394.93Show/hide
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Q41385 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic9.0e-9277.63Show/hide
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Q9SUI4 Photosystem I reaction center subunit XI, chloroplastic1.1e-9278.08Show/hide
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT4G12800.1 photosystem I subunit l7.6e-9478.08Show/hide
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Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
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CATACCTGCAAGAACACACTCCTTCACCATCAGAGCCATACAAGCTGATAAGCCAACTTACCAAGTGATTCAGCCCATCAATGGAGACCCCTTCATTGGAAGCCTTGAGA
CTCCAGTAACCTCAAGCCCTCTGATAGCCTGGTACCTCTCAAACCTCCCAGCTTACAGGACAGCAGTCAGTCCATTGCTGAGGGGAATTGAAGTCGGTTTGGCACATGGT
TTTTTTCTCGTCGGTCCGTTTGTTAAAGCTGGTCCTCTGAGGAACACAGCCTACGCCGGAGGAGCTGGCTCGCTGGCCGCTGGCGGCCTCATTGTCATTTTGAGCATCTG
CTTGACAATGTATGGAGTTGCATCCTTCAATGAAGGAGAGCCATCCACTGCACCGTCGTTGACCTTGACCGGTCGGAAGAAGACCCCGGATCAGCTGCAAACAGCTGACG
GGTGGGCAAAATTCTCTGGCGGGTTCTTCTTTGGCGGGATCTCCGGCGTGATCTGGGCGTACTTCCTCCTCTATGTCTTGGACCTTCCTTACTTCGTCAAGTAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TAACAATAAACCAACACCCAAAGCCAAATCTAAAATCCTCACCTCATTCTTCTCCTTCTCTGCCATTGATCCTTTCACAAACCAAAGGCAGCAGAAGCAGCAGCCATGGC
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CTGCAAGAACACACTCCTTCACCATCAGAGCCATACAAGCTGATAAGCCAACTTACCAAGTGATTCAGCCCATCAATGGAGACCCCTTCATTGGAAGCCTTGAGACTCCA
GTAACCTCAAGCCCTCTGATAGCCTGGTACCTCTCAAACCTCCCAGCTTACAGGACAGCAGTCAGTCCATTGCTGAGGGGAATTGAAGTCGGTTTGGCACATGGTTTTTT
TCTCGTCGGTCCGTTTGTTAAAGCTGGTCCTCTGAGGAACACAGCCTACGCCGGAGGAGCTGGCTCGCTGGCCGCTGGCGGCCTCATTGTCATTTTGAGCATCTGCTTGA
CAATGTATGGAGTTGCATCCTTCAATGAAGGAGAGCCATCCACTGCACCGTCGTTGACCTTGACCGGTCGGAAGAAGACCCCGGATCAGCTGCAAACAGCTGACGGGTGG
GCAAAATTCTCTGGCGGGTTCTTCTTTGGCGGGATCTCCGGCGTGATCTGGGCGTACTTCCTCCTCTATGTCTTGGACCTTCCTTACTTCGTCAAGTAGATTTTGCATCA
TTTTTCTGTTTCTGCAATGCAACTTCCATGTCTGTGTTAAGGAAACATAAAATTGTATATTTCATTTCAAACCTCTTTGTTAGATCCTTTGTCATTGCATATTGATTTCC
CTTTTGAAACTGTTGTGTTCTCATGTTCCATTTGTTTCTTCACAAACTATATAGCTTCAGTGGCTGCACTGTAAATTGGAGGGAGAACATTATCAGCATACTAGAAAGTG
CTTTTAATTGAATTGCCTATGATAATTTTAGATCACATAAAACCAATTTTAAGCACTTTCTTCGAGACCAC
Protein sequenceShow/hide protein sequence
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