; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G010730 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G010730
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionprotein RALF-like 33
Genome locationCmo_Chr12:9860979..9861344
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G010730
SyntenyCmoCh12G010730
Gene Ontology termsGO:0019722 - calcium-mediated signaling (biological process)
GO:0005576 - extracellular region (cellular component)
InterPro domainsIPR008801 - Rapid ALkalinization Factor


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586247.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.9e-62100Show/hide
Query:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
        MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP
Subjt:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQP

Query:  GAQANPYSRGCSAITRCRS
        GAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  GAQANPYSRGCSAITRCRS

KAG7021083.1 Protein RALF-like 33, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]9.9e-61100Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITR
        QPGAQANPYSRGCSAITR
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITR

XP_022937540.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita moschata]1.1e-62100Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_022966015.1 protein RALF-like 33 [Cucurbita maxima]4.0e-6299.17Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGI HSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

XP_038889183.1 protein RALF-like 33 [Benincasa hispida]3.2e-5994.21Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVFV+FSCSSTAVH GLGI HSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LFW9 Uncharacterized protein2.2e-5891.74Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLICAAVF++FSCSST VH GLGIQHSL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A5A7TYI2 Rapid ALkalinization Factor1.2e-5690.08Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNS TFFLI AAVF++FSCSSTAVH G+GIQ+SL WIPNQSTCKG+IAECFGGEEFEFDSEI+RRILATSQYISYGALRRN VPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGC+AITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1DA82 protein RALF-like 336.0e-5690.91Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGF+S T FLICAAVFVVF+CSSTAVHGGLGI HSL WIP+QS+CKG+IAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGAL+RNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPY RGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1FH12 protein RALF-like 335.1e-63100Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

A0A6J1HQE4 protein RALF-like 331.9e-6299.17Show/hide
Query:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
        MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGI HSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC
Subjt:  MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNC

Query:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        QPGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  QPGAQANPYSRGCSAITRCRS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q8L9P8 Protein RALF-like 331.1e-3060.33Show/hide
Query:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
        M G ++    +I A + V F      +   +  Q S  ++P +S C GTIAEC      EEFE DSEI+RRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
Subjt:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        C+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q945T0 Rapid alkalinization factor7.9e-2980Show/hide
Query:  CKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS
        CKG+I EC    EEFE DSE +RRILAT +YISYGAL++N+VPCSRRGASYYNC+PGAQANPYSRGCSAITRCRS
Subjt:  CKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCRS

Q9LUS7 Rapid alkalinization factor 232.7e-2968.42Show/hide
Query:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C+GTIAEC             +G    GEEFE DSEI+RRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q9MA62 Protein RALF-like 226.7e-2878.95Show/hide
Query:  STCKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        S C G+IAEC    EE EFDS+ISRRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITRCR
Subjt:  STCKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

Q9SRY3 Protein RALF-like 19.4e-3060.83Show/hide
Query:  SSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWI------PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQ
        S T FL    + VVF  SS  V  G    + LG +       N S C G+IAEC G EE E DSEI+RRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ
Subjt:  SSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWI------PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQ

Query:  PGAQANPYSRGCSAITRCRS
         GAQANPYSRGCS I RCRS
Subjt:  PGAQANPYSRGCSAITRCRS

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G02900.1 rapid alkalinization factor 16.6e-3160.83Show/hide
Query:  SSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWI------PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQ
        S T FL    + VVF  SS  V  G    + LG +       N S C G+IAEC G EE E DSEI+RRILAT++YISY +L+RN+VPCSRRGASYYNCQ
Subjt:  SSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWI------PNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQ

Query:  PGAQANPYSRGCSAITRCRS
         GAQANPYSRGCS I RCRS
Subjt:  PGAQANPYSRGCSAITRCRS

AT2G33775.1 ralf-like 191.0e-1560.94Show/hide
Query:  GGEEFEFDSEISRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC
        G  ++  DSE +RR LA  + YISYGALR+N VPCSRRG SYY+C+   +ANPY RGCS IT C
Subjt:  GGEEFEFDSEISRRILATSQ-YISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRC

AT3G05490.1 ralf-like 224.8e-2978.95Show/hide
Query:  STCKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        S C G+IAEC    EE EFDS+ISRRILA  +YISYGA+RRN+VPCSRRGASYYNCQ GAQANPYSRGCS ITRCR
Subjt:  STCKGTIAECFG-GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

AT3G16570.1 rapid alkalinization factor 231.9e-3068.42Show/hide
Query:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        P ++ C+GTIAEC             +G    GEEFE DSEI+RRILAT +YISYGALRRNT+PCSRRGASYYNC+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  PNQSTCKGTIAEC-------------FG----GEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYSRGCSAITRCR

AT4G15800.1 ralf-like 337.9e-3260.33Show/hide
Query:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
        M G ++    +I A + V F      +   +  Q S  ++P +S C GTIAEC      EEFE DSEI+RRILAT++YISYGALRRNTVPCSRRGASYYN
Subjt:  MAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAEC---FGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYN

Query:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR
        C+ GAQANPYSRGCSAITRCR
Subjt:  CQPGAQANPYSRGCSAITRCR


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCCTCGACATTCTTCCTGATCTGCGCCGCTGTGTTTGTGGTCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCACGGCGGCCTCGGGATCCAACA
CAGCCTCGGATGGATTCCTAACCAATCGACCTGCAAAGGCACAATAGCGGAGTGTTTCGGAGGAGAGGAGTTCGAATTCGATTCGGAAATCAGCCGCCGTATCTTGGCCA
CCAGTCAGTACATCAGTTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACCGTCCCGTGCTCGAGACGCGGTGCATCATACTACAACTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAACCCTTACAGC
CGTGGATGCAGCGCCATTACAAGGTGCAGGAGTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGCAATGGCCGGATTCAATTCCTCGACATTCTTCCTGATCTGCGCCGCTGTGTTTGTGGTCTTCAGCTGCTCCTCAACCGCCGTCCACGGCGGCCTCGGGATCCAACA
CAGCCTCGGATGGATTCCTAACCAATCGACCTGCAAAGGCACAATAGCGGAGTGTTTCGGAGGAGAGGAGTTCGAATTCGATTCGGAAATCAGCCGCCGTATCTTGGCCA
CCAGTCAGTACATCAGTTACGGCGCTCTGCGGAGGAACACCGTCCCGTGCTCGAGACGCGGTGCATCATACTACAACTGCCAGCCCGGAGCTCAGGCCAACCCTTACAGC
CGTGGATGCAGCGCCATTACAAGGTGCAGGAGTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MAMAGFNSSTFFLICAAVFVVFSCSSTAVHGGLGIQHSLGWIPNQSTCKGTIAECFGGEEFEFDSEISRRILATSQYISYGALRRNTVPCSRRGASYYNCQPGAQANPYS
RGCSAITRCRS