; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh12G013050 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh12G013050
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptioncytochrome B5-like protein
Genome locationCmo_Chr12:11457202..11459171
RNA-Seq ExpressionCmoCh12G013050
SyntenyCmoCh12G013050
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0043231 - intracellular membrane-bounded organelle (cellular component)
GO:0020037 - heme binding (molecular function)
GO:0046872 - metal ion binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001199 - Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain
IPR018506 - Cytochrome b5, heme-binding site
IPR036400 - Cytochrome b5-like heme/steroid binding domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6586450.1 Mitochondrial import inner membrane translocase subunit TIM17-2, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]1.5e-5599.12Show/hide
Query:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
        MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNN NKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
Subjt:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV

Query:  FDMIDDFYVGDLRL
        FDMIDDFYVGDLRL
Subjt:  FDMIDDFYVGDLRL

KAG7021304.1 Cytochrome B5-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.5e-5599.12Show/hide
Query:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
        MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNN NKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
Subjt:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV

Query:  FDMIDDFYVGDLRL
        FDMIDDFYVGDLRL
Subjt:  FDMIDDFYVGDLRL

XP_022937481.1 cytochrome B5-like protein isoform X1 [Cucurbita moschata]1.3e-5497.44Show/hide
Query:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDR---NAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHA
        MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDR   NAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHA
Subjt:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDR---NAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHA

Query:  TRVFDMIDDFYVGDLRL
        TRVFDMIDDFYVGDLRL
Subjt:  TRVFDMIDDFYVGDLRL

XP_022937485.1 cytochrome B5-like protein isoform X2 [Cucurbita moschata]3.1e-56100Show/hide
Query:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
        MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
Subjt:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV

Query:  FDMIDDFYVGDLRL
        FDMIDDFYVGDLRL
Subjt:  FDMIDDFYVGDLRL

XP_022966021.1 cytochrome B5-like protein isoform X2 [Cucurbita maxima]3.4e-5598.25Show/hide
Query:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
        MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLN+TNKASKVY KDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
Subjt:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV

Query:  FDMIDDFYVGDLRL
        FDMIDDFYVGDLRL
Subjt:  FDMIDDFYVGDLRL

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3C893 cytochrome B5-like protein8.8e-4986.09Show/hide
Query:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKV-YSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATR
        M+I++AAL+L VL GAL LIPRDRNAQKVQLN  NK+SKV YSKDEVSVHNKRTDCW+IIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAIL HAGDDSTEGFYGPQHATR
Subjt:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKV-YSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATR

Query:  VFDMIDDFYVGDLRL
        VFDMI+DFY+GDL+L
Subjt:  VFDMIDDFYVGDLRL

A0A6J1FAG5 cytochrome B5-like protein isoform X16.3e-5597.44Show/hide
Query:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDR---NAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHA
        MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDR   NAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHA
Subjt:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDR---NAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHA

Query:  TRVFDMIDDFYVGDLRL
        TRVFDMIDDFYVGDLRL
Subjt:  TRVFDMIDDFYVGDLRL

A0A6J1FBC0 cytochrome B5-like protein isoform X21.5e-56100Show/hide
Query:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
        MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
Subjt:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV

Query:  FDMIDDFYVGDLRL
        FDMIDDFYVGDLRL
Subjt:  FDMIDDFYVGDLRL

A0A6J1HN83 cytochrome B5-like protein isoform X21.7e-5598.25Show/hide
Query:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
        MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLN+TNKASKVY KDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV
Subjt:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRV

Query:  FDMIDDFYVGDLRL
        FDMIDDFYVGDLRL
Subjt:  FDMIDDFYVGDLRL

A0A6J1HQM7 cytochrome B5-like protein isoform X17.0e-5495.73Show/hide
Query:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDR---NAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHA
        MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDR   NAQKVQLN+TNKASKVY KDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHA
Subjt:  MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDR---NAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHA

Query:  TRVFDMIDDFYVGDLRL
        TRVFDMIDDFYVGDLRL
Subjt:  TRVFDMIDDFYVGDLRL

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O22704 Cytochrome B5-like protein3.5e-3462.5Show/hide
Query:  MIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKAS---------KVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFY
        MI V  L+LG L  AL LI   R            +S         K YSK EV+VHNKR DCWIIIK+KVYD+TSYVEEHPGGDAIL HAGDDST+GF+
Subjt:  MIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKAS---------KVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFY

Query:  GPQHATRVFDMIDDFYVGDL
        GPQHATRVFDMI+DFY+G+L
Subjt:  GPQHATRVFDMIDDFYVGDL

P49098 Cytochrome b56.1e-1546.05Show/hide
Query:  SKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHA-GDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL
        +KV++  EVS HN   DCW++I  KVYDVT ++++HPGGD +L  A G D+T+ F    H++    M+D++YVGD+
Subjt:  SKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHA-GDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL

P49100 Cytochrome b51.2e-1545.78Show/hide
Query:  LNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGG-DAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL
        ++N NK  KVY+ +EV+ HN + DCW+II  KVY+V+ ++E+HPGG D +L+  G D+T+ F    H+T    M+D++YVGD+
Subjt:  LNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGG-DAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL

Q9FDW8 Cytochrome b5 isoform A1.6e-1544.74Show/hide
Query:  SKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGG-DAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL
        +K+YS +E + HNK+ DCW++I  KVYDV+SY++EHPGG D +LA AG D+T+ F    H+    ++++ +++G+L
Subjt:  SKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGG-DAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL

Q9ZNW2 Acyl-lipid (9-3)-desaturase6.1e-1550Show/hide
Query:  EVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL
        EV+VHNK +DCWI++KNKVYDV+++ +EHPGG  I  + G D T+ F    HA   + ++ DFY+GD+
Subjt:  EVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G26340.1 cytochrome B5 isoform A1.1e-1644.74Show/hide
Query:  SKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGG-DAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL
        +K+YS +E + HNK+ DCW++I  KVYDV+SY++EHPGG D +LA AG D+T+ F    H+    ++++ +++G+L
Subjt:  SKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGG-DAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL

AT1G60660.1 cytochrome B5-like protein2.5e-3562.5Show/hide
Query:  MIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKAS---------KVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFY
        MI V  L+LG L  AL LI   R            +S         K YSK EV+VHNKR DCWIIIK+KVYD+TSYVEEHPGGDAIL HAGDDST+GF+
Subjt:  MIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKAS---------KVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFY

Query:  GPQHATRVFDMIDDFYVGDL
        GPQHATRVFDMI+DFY+G+L
Subjt:  GPQHATRVFDMIDDFYVGDL

AT2G32720.1 cytochrome B5 isoform B6.3e-1542.11Show/hide
Query:  SKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGG-DAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL
        +K+++  EVS HN+  DCWI+I  KVY+VT ++E+HPGG D +L+  G D+T+ F    H+    +M++ +YVG++
Subjt:  SKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGG-DAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL

AT5G48810.1 cytochrome B5 isoform D1.3e-1546.67Show/hide
Query:  KVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGD-AILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL
        KV++  EVS H+   DCWI+I  KVYDVT ++++HPGGD  IL   G D+T+ F    H++    M+D++YVGD+
Subjt:  KVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGD-AILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL

AT5G53560.1 cytochrome B5 isoform E1.7e-1546.67Show/hide
Query:  KVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGD-AILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL
        KV S +EVS HNK  DCW+II  KVYDVT ++++HPGGD  +L+  G D+T  F    H+    DM+D +++G++
Subjt:  KVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGD-AILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVGDL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGATGATCATTGTAGCCGCATTGGTTCTCGGTGTGTTGTTTGGCGCTCTGATTTTAATCCCACGCGACCGAAATGCACAAAAGGTTCAATTAAATAATACCAACAAGGC
ATCTAAAGTGTACAGTAAAGACGAGGTTTCGGTTCATAACAAGAGAACTGATTGCTGGATCATTATCAAGAACAAGGTGTACGATGTTACGTCCTATGTTGAAGAACATC
CAGGAGGAGATGCCATCCTAGCACATGCTGGGGATGATTCTACAGAAGGGTTTTATGGGCCACAACATGCAACTCGAGTCTTCGACATGATCGACGACTTCTATGTTGGA
GATTTGAGGCTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGATGATCATTGTAGCCGCATTGGTTCTCGGTGTGTTGTTTGGCGCTCTGATTTTAATCCCACGCGACCGAAATGCACAAAAGGTTCAATTAAATAATACCAACAAGGC
ATCTAAAGTGTACAGTAAAGACGAGGTTTCGGTTCATAACAAGAGAACTGATTGCTGGATCATTATCAAGAACAAGGTGTACGATGTTACGTCCTATGTTGAAGAACATC
CAGGAGGAGATGCCATCCTAGCACATGCTGGGGATGATTCTACAGAAGGGTTTTATGGGCCACAACATGCAACTCGAGTCTTCGACATGATCGACGACTTCTATGTTGGA
GATTTGAGGCTGTAATATCCAAGAAACATCTGGCTTTGCGCTATCACGAGAGAACGTATTTCGCAGCGTTCCAGCTCTAGAGATGCCTTTCAGGGAAGATATCAAATGAT
TTGAATTGTCTGGTTAGCATTCTTGCGATGTTGTAACATTTGTAGCTGTACACTTTCATTTAGATCTTGTAGCTGTACACTTTCATTTAGATCTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MMIIVAALVLGVLFGALILIPRDRNAQKVQLNNTNKASKVYSKDEVSVHNKRTDCWIIIKNKVYDVTSYVEEHPGGDAILAHAGDDSTEGFYGPQHATRVFDMIDDFYVG
DLRL