CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh13G000330
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like
Genome location	Cmo_Chr13:217968..222089
RNA-Seq Expression	CmoCh13G000330
Synteny	CmoCh13G000330
Gene Ontology terms	GO:0006413 - translational initiation (biological process) GO:0016020 - membrane (cellular component) GO:0003743 - translation initiation factor activity (molecular function) GO:0004497 - monooxygenase activity (molecular function) GO:0005506 - iron ion binding (molecular function) GO:0016705 - oxidoreductase activity, acting on paired donors, with incorporation or reduction of molecular oxygen (molecular function) GO:0020037 - heme binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000504 - RNA recognition motif domain IPR001876 - Zinc finger, RanBP2-type IPR012677 - Nucleotide-binding alpha-beta plait domain superfamily IPR035979 - RNA-binding domain superfamily IPR036443 - Zinc finger, RanBP2-type superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAA0060008.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X3 [Cucumis melo var. makuwa]

1.3e-208

81.82

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGG-------------GYGGKGGDGGYGGGGR--GGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSG-------GGGYQGGD
        MSGMYDQGGDAA PSYGAPGGGGGYGGG             GYGGKGGDGGYGGGGR  GGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGG G       GGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGG-------------GYGGKGGDGGYGGGGR--GGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSG-------GGGYQGGD

Query:  RGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRG
        RGGRG+GRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGAS  GGGGG                    GGYNRGGGD GYGG+RNGRG
Subjt:  RGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRG

Query:  GSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGD
        GSFHGGRSGTHDGGRNEGG+RGGNSYGGHQGGEDSGY QVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGP+GGY GDSLGD
Subjt:  GSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGD

Query:  GRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRI
        GR +AGRGGPS GYDGGYNAGGRGGYN+GGR GGSYN  GGRGGGYGST AAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLP DVTIDELRELFGGIGQIGRI
Subjt:  GRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRI

Query:  KQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHGPEKLANVITMVVVEADMEVVGIGAEI
        KQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDP AAHSAG    +YDLRGY+I+VAMAEKSAPRAPPTYNHG        + +V  A  E    GAEI
Subjt:  KQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHGPEKLANVITMVVVEADMEVVGIGAEI

Query:  AIGMEPLDLIDISMVEIDLVLTEKFGIEHFIGRRIISKLLVAKVGVDVSDTSLLAPNASIS
        A G E LDLIDISMVEID VLTE+FGIEHFIGRRIISKLLVAKVGVDV    L+  +ASIS
Subjt:  AIGMEPLDLIDISMVEIDLVLTEKFGIEHFIGRRIISKLLVAKVGVDVSDTSLLAPNASIS

KAG6583343.1 TATA-binding protein-associated factor 2N, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

1.9e-217

95.91

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD
        MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD

Query:  WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGG------------GGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGT
        WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGAS GGGG            GGG GG+NRGG DGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGT
Subjt:  WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGG------------GGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGT

Query:  HDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGP
        HDGGRNEGGNRG NSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGY GDSLGDGRSSAGRGGP
Subjt:  HDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGP

Query:  SAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQW
        SAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQW
Subjt:  SAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQW

Query:  PWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
        PWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPP YNHG
Subjt:  PWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG

XP_022964823.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like [Cucurbita moschata]

1.6e-224

100

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD
        MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD

Query:  WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG
        WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG
Subjt:  WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG

Query:  GNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGG
        GNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGG
Subjt:  GNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGG

Query:  RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
        RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
Subjt:  RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG

Query:  NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
        NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
Subjt:  NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG

XP_022970611.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like isoform X1 [Cucurbita maxima]

7.2e-212

95.13

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD
        MSGMYDQGGDAAPPSYG PGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGY GRGGGGGGGYGGRGGSGGG YQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD

Query:  WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG
        WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGG             GG+NRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG
Subjt:  WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG

Query:  GNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGG
        GNSYGGHQGGEDSG+SQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGY GDSLGDGRS+AGRGGPSAGYDGGYNAGG
Subjt:  GNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGG

Query:  RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
        RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGG YGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
Subjt:  RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG

Query:  NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
        NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGY+ISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
Subjt:  NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG

XP_023519697.1 transcription initiation factor TFIID subunit 15b [Cucurbita pepo subsp. pepo]

8.7e-218

98.01

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGY-GGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDG
        MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGY GGGGYGGKGGDGGYGGGGRG GGGRG+GGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDG
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGY-GGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDG

Query:  DWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNR
        DWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGAS     GGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNR
Subjt:  DWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNR

Query:  GGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAG
        GGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGY GDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAG
Subjt:  GGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAG

Query:  GRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEM
        GRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEM
Subjt:  GRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEM

Query:  GNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
        GNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
Subjt:  GNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LYC4 Uncharacterized protein

6.0e-188

85.26

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGG------------GYGGKGGDGGYGGGGR----GGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSG-------GGGYQGG
        MSGMYDQGGDAA PSYGAPGGGGGYGGG            GYGGKGGDGGYGGGGR    GGGGGRGYGGR  GGGGGYGGRGG G       GGGYQGG
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGG------------GYGGKGGDGGYGGGGR----GGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSG-------GGGYQGG

Query:  DRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGR
        DRGGRG+GRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGAS   GGGGGG                  GGYNRGGGD GYGG+RNGR
Subjt:  DRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGR

Query:  GGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLG
        GGSFHGGRSGTHDGGRNEGG+RGGNSYGGHQGGEDSGY QVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGS+DYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGP+GGY GDSLG
Subjt:  GGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLG

Query:  DGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGR
        DGR +A RGGPSAGYDGGYNAGGRGGYN+GGR GGSYN  GGR GGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLP DVT DELRELFGGIGQIGR
Subjt:  DGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGR

Query:  IKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
        IKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDP AAHSAGGFYNNYDLRGY+I+VAMAEKSAPRAPP YNHG
Subjt:  IKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG

A0A1S3C4S9 transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X1

2.6e-191

86.29

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGG-------------GYGGKGGDGGYGGGGR--GGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSG-------GGGYQGGD
        MSGMYDQGGDAA PSYGAPGGGGGYGGG             GYGGKGGDGGYGGGGR  GGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGG G       GGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGG-------------GYGGKGGDGGYGGGGR--GGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSG-------GGGYQGGD

Query:  RGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRG
        RGGRG+GRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGAS  GGGGG                    GGYNRGGGD GYGG+RNGRG
Subjt:  RGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRG

Query:  GSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGD
        GSFHGGRSGTHDGGRNEGG+RGGNSYGGHQGGEDSGY QVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGP+GGY GDSLGD
Subjt:  GSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGD

Query:  GRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRI
        GR +AGRGGPS GYDGGYNAGGRGGYN+GGR GGSYN  GGRGGGYGST AAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLP DVTIDELRELFGGIGQIGRI
Subjt:  GRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRI

Query:  KQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
        KQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDP AAHSAGGFYNNYDLRGY+I+VAMAEKSAPRAPPTYNHG
Subjt:  KQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG

A0A5A7UXQ0 Transcription initiation factor TFIID subunit 15b isoform X3

6.1e-209

81.82

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGG-------------GYGGKGGDGGYGGGGR--GGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSG-------GGGYQGGD
        MSGMYDQGGDAA PSYGAPGGGGGYGGG             GYGGKGGDGGYGGGGR  GGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGG G       GGGYQGGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGG-------------GYGGKGGDGGYGGGGR--GGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSG-------GGGYQGGD

Query:  RGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRG
        RGGRG+GRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGAS  GGGGG                    GGYNRGGGD GYGG+RNGRG
Subjt:  RGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRG

Query:  GSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGD
        GSFHGGRSGTHDGGRNEGG+RGGNSYGGHQGGEDSGY QVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGP+GGY GDSLGD
Subjt:  GSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGD

Query:  GRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRI
        GR +AGRGGPS GYDGGYNAGGRGGYN+GGR GGSYN  GGRGGGYGST AAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLP DVTIDELRELFGGIGQIGRI
Subjt:  GRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRI

Query:  KQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHGPEKLANVITMVVVEADMEVVGIGAEI
        KQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDP AAHSAG    +YDLRGY+I+VAMAEKSAPRAPPTYNHG        + +V  A  E    GAEI
Subjt:  KQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHGPEKLANVITMVVVEADMEVVGIGAEI

Query:  AIGMEPLDLIDISMVEIDLVLTEKFGIEHFIGRRIISKLLVAKVGVDVSDTSLLAPNASIS
        A G E LDLIDISMVEID VLTE+FGIEHFIGRRIISKLLVAKVGVDV    L+  +ASIS
Subjt:  AIGMEPLDLIDISMVEIDLVLTEKFGIEHFIGRRIISKLLVAKVGVDVSDTSLLAPNASIS

A0A6J1HM15 transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like

8.0e-225

100

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD
        MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD

Query:  WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG
        WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG
Subjt:  WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG

Query:  GNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGG
        GNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGG
Subjt:  GNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGG

Query:  RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
        RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
Subjt:  RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG

Query:  NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
        NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
Subjt:  NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG

A0A6J1I126 transcription initiation factor TFIID subunit 15b-like isoform X1

3.5e-212

95.13

Show/hide

Query:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD
        MSGMYDQGGDAAPPSYG PGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGY GRGGGGGGGYGGRGGSGGG YQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD
Subjt:  MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGD

Query:  WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG
        WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGG             GG+NRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG
Subjt:  WVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRG

Query:  GNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGG
        GNSYGGHQGGEDSG+SQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGY GDSLGDGRS+AGRGGPSAGYDGGYNAGG
Subjt:  GNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGG

Query:  RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
        RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGG YGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG
Subjt:  RGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMG

Query:  NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
        NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGY+ISVAMAEKSAPRAPPTYNHG
Subjt:  NNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAPPTYNHG

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

Q94KD0 Transcription initiation factor TFIID subunit 15b

2.0e-84

57.65

Show/hide

Query:  MSGMYDQ--GGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGR
        M+GMY+Q  GG A  PSYG  G G   GGGGYG  GGD GY  GGRG  GG  YGGRGG GGGGG G RGG GGGGYQGGDRGGRGS        GG GR
Subjt:  MSGMYDQ--GGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGR

Query:  DGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        DGDW CPNP CGN+NFARRVECNKCGA +P G S G    GG                   GGY+RGGGD   GG R GR  S   GRS  ++  R +GG
Subjt:  DGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGG
        +R G SYG     E+  Y Q PP +A  PS  G +GSYPP        YG +AVPPP SYSG   PP+YGGP GGY  D+     S+ GRGG S GYDGG
Subjt:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGG

Query:  YNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIY
                 ++  R   SY               A   +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLP DVT DEL++LFGGIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIY
Subjt:  YNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIY

Query:  TDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAP
        TDE GN KGDAC++YEDP AAHSAGGF+NNY++RG  ISV MAEKSAPRAP
Subjt:  TDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAP

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G58470.1 TBP-associated factor 15B

1.4e-85

57.65

Show/hide

Query:  MSGMYDQ--GGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGR
        M+GMY+Q  GG A  PSYG  G G   GGGGYG  GGD GY  GGRG  GG  YGGRGG GGGGG G RGG GGGGYQGGDRGGRGS        GG GR
Subjt:  MSGMYDQ--GGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGR

Query:  DGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        DGDW CPNP CGN+NFARRVECNKCGA +P G S G    GG                   GGY+RGGGD   GG R GR  S   GRS  ++  R +GG
Subjt:  DGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGG
        +R G SYG     E+  Y Q PP +A  PS  G +GSYPP        YG +AVPPP SYSG   PP+YGGP GGY  D+     S+ GRGG S GYDGG
Subjt:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGG

Query:  YNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIY
                 ++  R   SY               A   +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLP DVT DEL++LFGGIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIY
Subjt:  YNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIY

Query:  TDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAP
        TDE GN KGDAC++YEDP AAHSAGGF+NNY++RG  ISV MAEKSAPRAP
Subjt:  TDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAP

AT5G58470.2 TBP-associated factor 15B

1.4e-85

57.65

Show/hide

Query:  MSGMYDQ--GGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGR
        M+GMY+Q  GG A  PSYG  G G   GGGGYG  GGD GY  GGRG  GG  YGGRGG GGGGG G RGG GGGGYQGGDRGGRGS        GG GR
Subjt:  MSGMYDQ--GGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGG-GGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGR

Query:  DGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG
        DGDW CPNP CGN+NFARRVECNKCGA +P G S G    GG                   GGY+RGGGD   GG R GR  S   GRS  ++  R +GG
Subjt:  DGDWVCPNPGCGNLNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGG

Query:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGG
        +R G SYG     E+  Y Q PP +A  PS  G +GSYPP        YG +AVPPP SYSG   PP+YGGP GGY  D+     S+ GRGG S GYDGG
Subjt:  NRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPPSSA--PSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGG

Query:  YNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIY
                 ++  R   SY               A   +VKQCD +CDD+CDN+RIY+SNLP DVT DEL++LFGGIGQ+GRIKQKRGYKDQWP+NIKIY
Subjt:  YNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAAEPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIY

Query:  TDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAP
        TDE GN KGDAC++YEDP AAHSAGGF+NNY++RG  ISV MAEKSAPRAP
Subjt:  TDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEKSAPRAP

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGTCTGGGATGTACGATCAAGGAGGGGACGCTGCTCCTCCGTCTTACGGTGCCCCTGGGGGTGGTGGGGGATACGGTGGTGGTGGTTATGGTGGAAAAGGTGGTGACGG
TGGATATGGAGGCGGAGGCCGGGGAGGCGGCGGCGGTAGAGGCTATGGTGGACGAGGTGGCGGCGGAGGTGGAGGCTACGGTGGTCGAGGTGGCAGTGGCGGAGGGGGTT
ATCAAGGAGGAGATCGCGGAGGGCGAGGCAGTGGACGTGGTGGCGGAGGTGGTCGTGGCGGAAGCGGCAGAGATGGTGATTGGGTCTGCCCTAATCCTGGCTGCGGGAAT
TTGAACTTTGCTAGGAGAGTGGAGTGTAATAAGTGTGGTGCACCCTCACCTGGGGGTGCTAGCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTTTAATAGAGGTGG
AGCTGATGGTGGTTATAATAGAGGTGGAGGTGATGGGGGTTACAATAGAGGTGGAGGTGATGGGGGTTACGGTGGTAATCGTAATGGCAGAGGTGGTAGTTTCCATGGTG
GTCGAAGTGGAACTCATGATGGAGGCCGAAATGAAGGAGGGAACAGAGGTGGTAACTCGTATGGTGGTCACCAGGGAGGAGAAGATAGTGGTTACAGTCAGGTTCCCCCT
TCCTCGGCACCCTCATCTGGTGGCCTTGCTGGCTCTTATCCACCATCTTACCATGGTGGAAGTGCAGATTACGGGACTGATGCAGTTCCTCCTCCTGCAAGCTACAGTGG
AACTACATACCCTCCAACTTATGGTGGTCCATCTGGTGGCTATAGTGGTGATAGTCTAGGTGATGGGCGGAGTTCTGCCGGTCGGGGTGGACCATCAGCTGGATATGACG
GCGGCTACAATGCAGGTGGTAGAGGTGGCTATAATTCTGGTGGTAGAGGAGGAGGAAGCTATAATACTGGTGGTGGTAGAGGTGGCGGTTATGGAAGTACACCGGCAGCA
GAGCCAGCGCAAGTTAAACAGTGCGATGATAATTGTGATGATTCGTGTGATAACTCTAGAATCTATGTTTCTAATTTGCCAACAGATGTGACAATTGATGAATTGAGAGA
ACTATTTGGTGGAATTGGTCAAATTGGAAGAATTAAGCAGAAGAGGGGCTACAAGGATCAGTGGCCTTGGAACATTAAAATATATACAGATGAGATGGGAAATAACAAAG
GCGATGCATGTGTATCATACGAAGATCCCCAAGCAGCGCATTCTGCTGGCGGTTTCTATAACAATTATGATTTGAGAGGCTATAACATCAGTGTTGCAATGGCTGAGAAG
TCTGCACCGAGGGCTCCACCTACATACAACCATGGGCCTGAGAAATTGGCAAATGTAATTACCATGGTGGTGGTAGAGGCGGATATGGAGGTGGTGGGGATAGGCGCAGA
GATAGCTATAGGGATGGAGCCTCTGGACCTGATAGACATCAGCATGGTGGAAATCGATCTCGTCCTTACTGAGAAATTCGGCATTGAGCATTTTATAGGCAGGCGGATAA
TCTCCAAACTGCTTGTTGCTAAGGTAGGTGTTGATGTTTCAGATACATCTCTGTTGGCTCCTAATGCAAGCATATCTTAA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

CTAACACCACGTCCTCTATAACGTCTCTCTCTCTCTCTCGAGTTAGCCCTAAAAAAAGCTGATGTCTGGGATGTACGATCAAGGAGGGGACGCTGCTCCTCCGTCTTACG
GTGCCCCTGGGGGTGGTGGGGGATACGGTGGTGGTGGTTATGGTGGAAAAGGTGGTGACGGTGGATATGGAGGCGGAGGCCGGGGAGGCGGCGGCGGTAGAGGCTATGGT
GGACGAGGTGGCGGCGGAGGTGGAGGCTACGGTGGTCGAGGTGGCAGTGGCGGAGGGGGTTATCAAGGAGGAGATCGCGGAGGGCGAGGCAGTGGACGTGGTGGCGGAGG
TGGTCGTGGCGGAAGCGGCAGAGATGGTGATTGGGTCTGCCCTAATCCTGGCTGCGGGAATTTGAACTTTGCTAGGAGAGTGGAGTGTAATAAGTGTGGTGCACCCTCAC
CTGGGGGTGCTAGCGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTGGTTTTAATAGAGGTGGAGCTGATGGTGGTTATAATAGAGGTGGAGGTGATGGGGGTTACAATAGA
GGTGGAGGTGATGGGGGTTACGGTGGTAATCGTAATGGCAGAGGTGGTAGTTTCCATGGTGGTCGAAGTGGAACTCATGATGGAGGCCGAAATGAAGGAGGGAACAGAGG
TGGTAACTCGTATGGTGGTCACCAGGGAGGAGAAGATAGTGGTTACAGTCAGGTTCCCCCTTCCTCGGCACCCTCATCTGGTGGCCTTGCTGGCTCTTATCCACCATCTT
ACCATGGTGGAAGTGCAGATTACGGGACTGATGCAGTTCCTCCTCCTGCAAGCTACAGTGGAACTACATACCCTCCAACTTATGGTGGTCCATCTGGTGGCTATAGTGGT
GATAGTCTAGGTGATGGGCGGAGTTCTGCCGGTCGGGGTGGACCATCAGCTGGATATGACGGCGGCTACAATGCAGGTGGTAGAGGTGGCTATAATTCTGGTGGTAGAGG
AGGAGGAAGCTATAATACTGGTGGTGGTAGAGGTGGCGGTTATGGAAGTACACCGGCAGCAGAGCCAGCGCAAGTTAAACAGTGCGATGATAATTGTGATGATTCGTGTG
ATAACTCTAGAATCTATGTTTCTAATTTGCCAACAGATGTGACAATTGATGAATTGAGAGAACTATTTGGTGGAATTGGTCAAATTGGAAGAATTAAGCAGAAGAGGGGC
TACAAGGATCAGTGGCCTTGGAACATTAAAATATATACAGATGAGATGGGAAATAACAAAGGCGATGCATGTGTATCATACGAAGATCCCCAAGCAGCGCATTCTGCTGG
CGGTTTCTATAACAATTATGATTTGAGAGGCTATAACATCAGTGTTGCAATGGCTGAGAAGTCTGCACCGAGGGCTCCACCTACATACAACCATGGGCCTGAGAAATTGG
CAAATGTAATTACCATGGTGGTGGTAGAGGCGGATATGGAGGTGGTGGGGATAGGCGCAGAGATAGCTATAGGGATGGAGCCTCTGGACCTGATAGACATCAGCATGGTG
GAAATCGATCTCGTCCTTACTGAGAAATTCGGCATTGAGCATTTTATAGGCAGGCGGATAATCTCCAAACTGCTTGTTGCTAAGGTAGGTGTTGATGTTTCAGATACATC
TCTGTTGGCTCCTAATGCAAGCATATCTTAA

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MSGMYDQGGDAAPPSYGAPGGGGGYGGGGYGGKGGDGGYGGGGRGGGGGRGYGGRGGGGGGGYGGRGGSGGGGYQGGDRGGRGSGRGGGGGRGGSGRDGDWVCPNPGCGN
LNFARRVECNKCGAPSPGGASGGGGGGGGGGGFNRGGADGGYNRGGGDGGYNRGGGDGGYGGNRNGRGGSFHGGRSGTHDGGRNEGGNRGGNSYGGHQGGEDSGYSQVPP
SSAPSSGGLAGSYPPSYHGGSADYGTDAVPPPASYSGTTYPPTYGGPSGGYSGDSLGDGRSSAGRGGPSAGYDGGYNAGGRGGYNSGGRGGGSYNTGGGRGGGYGSTPAA
EPAQVKQCDDNCDDSCDNSRIYVSNLPTDVTIDELRELFGGIGQIGRIKQKRGYKDQWPWNIKIYTDEMGNNKGDACVSYEDPQAAHSAGGFYNNYDLRGYNISVAMAEK
SAPRAPPTYNHGPEKLANVITMVVVEADMEVVGIGAEIAIGMEPLDLIDISMVEIDLVLTEKFGIEHFIGRRIISKLLVAKVGVDVSDTSLLAPNASIS

CmoCh13G000330 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome