; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh13G001130 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh13G001130
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionHaloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein
Genome locationCmo_Chr13:639971..642852
RNA-Seq ExpressionCmoCh13G001130
SyntenyCmoCh13G001130
Gene Ontology termsGO:0016787 - hydrolase activity (molecular function)
InterPro domainsIPR006439 - HAD hydrolase, subfamily IA
IPR010237 - Pyrimidine 5-nucleotidase
IPR023214 - HAD superfamily
IPR036412 - HAD-like superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583417.1 hypothetical protein SDJN03_19349, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.2e-15999.64Show/hide
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KAG7019180.1 SPAC24B11.05 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]5.5e-14796.69Show/hide
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XP_022964693.1 uncharacterized protein LOC111464700 [Cucurbita moschata]2.2e-159100Show/hide
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XP_022970556.1 uncharacterized protein LOC111469497 [Cucurbita maxima]2.5e-15597.51Show/hide
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XP_023521917.1 uncharacterized protein LOC111785758 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.5e-15798.58Show/hide
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4E1J3 uncharacterized protein C24B11.05-like isoform X11.3e-13883.63Show/hide
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        DP+LRNLLHSLPIRKL+FTNGDMAHA RAL+RLGLEDCFEGILCFETLNP K TV +E AGSV+FDI+Q+MS+ NSDIDLPKTP++CKPFEEA+KQVFE+
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A0A5A7VPY6 Haloacid dehalogenase-like hydrolase superfamily protein1.9e-13783.51Show/hide
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        +LRNLLHSLPIRKL+FTNGDMAHA RAL+RLGLEDCFEGILCFETLNP K TV +E AGSV+FDI+Q+MS+ NSDIDLPKTP++CKPFEEA+KQVFE+AN
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A0A5D3BED8 Haloacid dehalogenase-like hydrolase superfamily protein1.9e-13783.51Show/hide
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        NGD+F Q SDAKYECLLFDLDDTLYP NSGL+KE++KNIQE+MIEKLG+EENVPELCISLYKIYGTT+AGL+AIGY+FDYDDFHSF HGRLPYD LKPDP
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Query:  VLRNLLHSLPIRKLLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNPSKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFEIAN
        +LRNLLHSLPIRKL+FTNGDMAHA RAL+RLGLEDCFEGILCFETLNP K TV +E AGSV+FDI+Q+MS+ NSDIDLPKTP++CKPFEEA+KQVFE+AN
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A0A6J1HLM8 uncharacterized protein LOC1114647001.0e-159100Show/hide
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A0A6J1I0X0 uncharacterized protein LOC1114694971.2e-15597.51Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q09893 Uncharacterized protein C24B11.052.3e-1528.17Show/hide
Query:  LLFDLDDTLYPLNSGLSKEVSKNIQEFMIEKLGI-EENVPELCISLYKIYGTTLAGLRAIGYDFDYDDFHSFAHGRLPYDR-LKPDPVLRNLLHSLPIRK
        + FDLD+ LYP +  +   ++  I  F  +KLGI  E    L    Y+ YG  + GL  + ++ D  D+       LP ++ +K D VLR +L  L +RK
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Query:  ----LLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNPSKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFEIANI-NPQKTLF
             +FTN  + HA R L+ LG+EDCF+GI                                 +  D     +I KP  E Y++V   A + +  K +F
Subjt:  ----LLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNPSKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFEIANI-NPQKTLF

Query:  FDDSVRNLQAGKSVG-LHTVLI----GSSQQINGVDHAFENIHNIREGLPEL
         DDS  N+   +  G  +TV +        Q     H   +IH  +  L E+
Subjt:  FDDSVRNLQAGKSVG-LHTVLI----GSSQQINGVDHAFENIHNIREGLPEL

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT5G02230.1 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein5.8e-9457.8Show/hide
Query:  MENGDQFTQFSDAKYECLLFDLDDTLYPLNSGLSKEVSKNIQEFMIEKLGI-EENVPELCISLYKIYGTTLAGLRAIGYDFDYDDFHSFAHGRLPYDRLK
        ME  +++   +  KY+CLLFDLDDTLYPL+SG+++E   NI+++M EKLGI ++ + EL   LYK YGTT+AGLRAIGY+FDYD++HSF HGRLPYD +K
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Query:  PDPVLRNLLHSLPIRKLLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNPSKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFE
        PD VLR+LL SLP+RK++FTN D  HA +AL++LGLEDCFEGI+CFETLN            S +FDI    +       LPKTP++CKP E A ++  E
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Query:  IANINPQKTLFFDDSVRNLQAGKSVGLHTVLIGSSQQINGVDHAFENIHNIREGLPELWDTMEKLENVSYSEKVAIETSVRA
        IANI+P +TLFF+DSVRN+QAGK VGL+TVL+G S ++ G D+A ENIHN++E +PELW++  K  +V YS KVA+ETSVRA
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AT5G02230.2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein5.8e-9457.8Show/hide
Query:  MENGDQFTQFSDAKYECLLFDLDDTLYPLNSGLSKEVSKNIQEFMIEKLGI-EENVPELCISLYKIYGTTLAGLRAIGYDFDYDDFHSFAHGRLPYDRLK
        ME  +++   +  KY+CLLFDLDDTLYPL+SG+++E   NI+++M EKLGI ++ + EL   LYK YGTT+AGLRAIGY+FDYD++HSF HGRLPYD +K
Subjt:  MENGDQFTQFSDAKYECLLFDLDDTLYPLNSGLSKEVSKNIQEFMIEKLGI-EENVPELCISLYKIYGTTLAGLRAIGYDFDYDDFHSFAHGRLPYDRLK

Query:  PDPVLRNLLHSLPIRKLLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNPSKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFE
        PD VLR+LL SLP+RK++FTN D  HA +AL++LGLEDCFEGI+CFETLN            S +FDI    +       LPKTP++CKP E A ++  E
Subjt:  PDPVLRNLLHSLPIRKLLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNPSKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFE

Query:  IANINPQKTLFFDDSVRNLQAGKSVGLHTVLIGSSQQINGVDHAFENIHNIREGLPELWDTMEKLENVSYSEKVAIETSVRA
        IANI+P +TLFF+DSVRN+QAGK VGL+TVL+G S ++ G D+A ENIHN++E +PELW++  K  +V YS KVA+ETSVRA
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AT5G59480.1 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein2.2e-10163.18Show/hide
Query:  DQFTQFSDAKYECLLFDLDDTLYPLNSGLSKEVSKNIQEFMIEKLGIEEN-VPELCISLYKIYGTTLAGLRAIGYDFDYDDFHSFAHGRLPYDRLKPDPV
        + F Q S+AKY+CLLFD+DDTLYPL+SGL+ EV KNIQE+M++KLGIEE+ V ELC+SLYKIYGTT+AGL+A+GYDFDYDDFH F HGRLPY  LKPDP+
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        LRN++ SLPIRK++FTN D AHA + + RLGLE CFE I+ FETLNP    E+ VD      +FDI  +M++ +S I+LPKT ++CKP E A++QVF++A
Subjt:  LRNLLHSLPIRKLLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNP--SKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFEIA

Query:  NINPQKTLFFDDSVRNLQAGKSVGLHTVLIGSSQQINGVDHAFENIHNIREGLPELWDTM-EKLENVSYSEKVAIET
        NINP+KTLFFDDS+RN+Q GK VGLHTV +G+S +  GVD A E+IHNIRE LP+LWD + +K + +   +KVAIET
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AT5G59480.2 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein7.0e-10063.18Show/hide
Query:  DQFTQFSDAKYECLLFDLDDTLYPLNSGLSKEVSKNIQEFMIEKLGIEEN-VPELCISLYKIYGTTLAGLRAIGYDFDYDDFHSFAHGRLPYDRLKPDPV
        + F Q S+AKY+CLLFD+DDTLYPL+SGL+ EV KNIQE+M++KLGIEE+ V ELC+SLYKIYGTT+AGL+A+GYDFDYDDFH F HGRLPY  LKPDP+
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Query:  LRNLLHSLPIRKLLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNP--SKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFEIA
        LRN++ SLPIRK +FTN D AHA + + RLGLE CFE I+ FETLNP    E+ VD      +FDI  +M++ +S I+LPKT ++CKP E A++QVF++A
Subjt:  LRNLLHSLPIRKLLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNP--SKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFEIA

Query:  NINPQKTLFFDDSVRNLQAGKSVGLHTVLIGSSQQINGVDHAFENIHNIREGLPELWDTM-EKLENVSYSEKVAIET
        NINP+KTLFFDDS+RN+Q GK VGLHTV +G+S +  GVD A E+IHNIRE LP+LWD + +K + +   +KVAIET
Subjt:  NINPQKTLFFDDSVRNLQAGKSVGLHTVLIGSSQQINGVDHAFENIHNIREGLPELWDTM-EKLENVSYSEKVAIET

AT5G59490.1 Haloacid dehalogenase-like hydrolase (HAD) superfamily protein5.8e-8655.16Show/hide
Query:  QFTQFSDAKYECLLFDLDDTLYPLNSGLSKEVSKNIQEFMIEKLGIEEN-VPELCISLYKIYGTTLAGLRAIGYDFDYDDFHSFAHGRLPYDRLKPDPVL
        +F   S  +YECLLFDLDDTLYPL+SGLS   S NI E+M+EKLGI+E+ V EL   LYK YGT++AGL+A+GY+FD D++H + HGRLPY+ LKPDPVL
Subjt:  QFTQFSDAKYECLLFDLDDTLYPLNSGLSKEVSKNIQEFMIEKLGIEEN-VPELCISLYKIYGTTLAGLRAIGYDFDYDDFHSFAHGRLPYDRLKPDPVL

Query:  RNLLHSLPIRKLLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNPSKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFEIANIN
        R+LL  LP+RKL+F+NGD  H  +AL RLG+EDCFE I+ FETLNP     ++EA  S V               LP+ P+ICKP E A+++ F+IA +N
Subjt:  RNLLHSLPIRKLLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNPSKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFEIANIN

Query:  PQKTLFFDDSVRNLQAGKSVGLHTVLIGSSQQINGVDHAFENIHNIREGLPELWD----TMEKLENVSYSEKVAIETSVRA
        P KTLFFDDS RN+Q GK+VGLHTVL+G S++I+G D+A E+IHN++E  PELW       ++ E + Y+ +++IETSV+A
Subjt:  PQKTLFFDDSVRNLQAGKSVGLHTVLIGSSQQINGVDHAFENIHNIREGLPELWD----TMEKLENVSYSEKVAIETSVRA


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAATGGTGATCAGTTCACGCAGTTTTCTGATGCTAAATATGAATGTCTTCTCTTTGATCTAGATGACACCCTTTATCCTTTAAATTCTGGTTTGTCAAAGGAAGT
CTCCAAGAACATTCAAGAATTTATGATTGAAAAGTTAGGAATTGAGGAGAACGTGCCTGAATTGTGCATTTCCTTGTACAAGATTTATGGGACAACACTGGCTGGTCTTA
GAGCTATCGGTTATGACTTCGACTACGATGATTTCCATAGTTTTGCTCATGGAAGGTTGCCTTATGATAGGCTCAAGCCTGACCCTGTATTAAGGAACCTTCTTCATAGC
TTACCGATTCGAAAACTTCTATTCACCAATGGTGATATGGCTCATGCAACTAGAGCGCTGCAGAGACTTGGGTTAGAGGACTGCTTTGAAGGGATTTTATGCTTTGAGAC
TTTGAATCCTAGTAAGGAAACAGTTGTTGATGAGGCAGCAGGGTCTGTAGTTTTTGATATAGATCAGTTTATGAGCAGTCTAAACTCTGATATTGATCTGCCGAAGACAC
CAATCATCTGCAAACCATTTGAAGAGGCATATAAGCAAGTTTTCGAGATCGCCAATATCAACCCGCAAAAAACTTTGTTCTTCGACGATAGCGTTCGTAATCTACAAGCC
GGGAAGTCGGTGGGCCTTCATACAGTACTGATTGGTAGTTCACAACAAATAAACGGGGTGGATCACGCGTTCGAGAACATCCATAACATCAGGGAAGGATTGCCCGAGCT
TTGGGACACCATGGAGAAGCTCGAAAACGTTTCGTACTCCGAAAAGGTAGCTATTGAGACTTCAGTTAGAGCTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
CCCGAAGGAAAGCGTCCGCCCGCAGCGGCGCCGACCACCGCACAACCCTGCATTCATTGCGGCGGAGCGTTGTAATTGTCGTACTGTATTGTTAATTAATGTGGCTTTGA
TTTCACTCACTTCCTCGACGACTGTTCATCAAAAGGCGTGAACACAATTGAGAACGTGTCTGTACCTTATAAGCCCACGATATCTGATTGCATCGCTCCAGACTTTTTAG
TTCCAATAACTTTTGTGCGTTTCAATTGATTTACCTTATTCAGGCGAATTTCTTCACAGGCGGATCGAGTTTGATTATTATTAAGTATTTTGAGATTTGTCGGTTGTTGA
AGTGTACCTGGAAATGGAGAATGGTGATCAGTTCACGCAGTTTTCTGATGCTAAATATGAATGTCTTCTCTTTGATCTAGATGACACCCTTTATCCTTTAAATTCTGGTT
TGTCAAAGGAAGTCTCCAAGAACATTCAAGAATTTATGATTGAAAAGTTAGGAATTGAGGAGAACGTGCCTGAATTGTGCATTTCCTTGTACAAGATTTATGGGACAACA
CTGGCTGGTCTTAGAGCTATCGGTTATGACTTCGACTACGATGATTTCCATAGTTTTGCTCATGGAAGGTTGCCTTATGATAGGCTCAAGCCTGACCCTGTATTAAGGAA
CCTTCTTCATAGCTTACCGATTCGAAAACTTCTATTCACCAATGGTGATATGGCTCATGCAACTAGAGCGCTGCAGAGACTTGGGTTAGAGGACTGCTTTGAAGGGATTT
TATGCTTTGAGACTTTGAATCCTAGTAAGGAAACAGTTGTTGATGAGGCAGCAGGGTCTGTAGTTTTTGATATAGATCAGTTTATGAGCAGTCTAAACTCTGATATTGAT
CTGCCGAAGACACCAATCATCTGCAAACCATTTGAAGAGGCATATAAGCAAGTTTTCGAGATCGCCAATATCAACCCGCAAAAAACTTTGTTCTTCGACGATAGCGTTCG
TAATCTACAAGCCGGGAAGTCGGTGGGCCTTCATACAGTACTGATTGGTAGTTCACAACAAATAAACGGGGTGGATCACGCGTTCGAGAACATCCATAACATCAGGGAAG
GATTGCCCGAGCTTTGGGACACCATGGAGAAGCTCGAAAACGTTTCGTACTCCGAAAAGGTAGCTATTGAGACTTCAGTTAGAGCTTAATTAGTACTTATGATATCAAGT
TGTACGTACTATGATGACAATACTTGATAGTGCAAAGCCGTTGGCAACTGCAATGAATGCTGGTTAATAGAACACATCTTTCCTTTTGGATTCCTG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENGDQFTQFSDAKYECLLFDLDDTLYPLNSGLSKEVSKNIQEFMIEKLGIEENVPELCISLYKIYGTTLAGLRAIGYDFDYDDFHSFAHGRLPYDRLKPDPVLRNLLHS
LPIRKLLFTNGDMAHATRALQRLGLEDCFEGILCFETLNPSKETVVDEAAGSVVFDIDQFMSSLNSDIDLPKTPIICKPFEEAYKQVFEIANINPQKTLFFDDSVRNLQA
GKSVGLHTVLIGSSQQINGVDHAFENIHNIREGLPELWDTMEKLENVSYSEKVAIETSVRA