; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh13G003930 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh13G003930
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionX-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1-like
Genome locationCmo_Chr13:4958178..4958918
RNA-Seq ExpressionCmoCh13G003930
SyntenyCmoCh13G003930
Gene Ontology termsGO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsNA


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583719.1 hypothetical protein SDJN03_19651, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.2e-9388.1Show/hide
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        QD+SP SSSSSSSSSFGY SFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHE                EHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEV    
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          EEEEEEEG RRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
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KAG7019366.1 hypothetical protein SDJN02_18326, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.8e-9489.64Show/hide
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        ME RVEAINMDSYESLDLDRTSST+NNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVL
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Query:  QDSSPSSSSSSSSSSFGYSSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEV----
        QD+SP SSSSSSSSSFGY SFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQ               EHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEV    
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Query:  -EEEEEEEGKRRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
         EEEEEEEG RRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
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XP_022927104.1 X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1-like [Cucurbita moschata]4.0e-109100Show/hide
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Query:  QDSSPSSSSSSSSSSFGYSSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEVEEEE
        QDSSPSSSSSSSSSSFGYSSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEVEEEE
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        EEEGKRRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
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XP_031736046.1 uncharacterized protein LOC105434473 [Cucumis sativus]4.8e-3858.5Show/hide
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        ++N+++Y+ +    +SS N  + VE LKRMVK    + VF L+L LFFS FSLFPHSF+VYFSTFLFS+L H +ERK+MFLICN GILFLLATSSV    
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            SSSSSSSSFG Y  F HS    HH+ FEHD+VA  +   +SD    QE EE ++E     E                 +EE EEDEGCFT+EVEEE
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Query:  EEE------EGKRRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
        EEE      EGKRR+LE+VVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT  LIAV
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XP_038877796.1 glutamic acid-rich protein-like [Benincasa hispida]2.9e-5167.31Show/hide
Query:  MENRVEAINMDSYESLDL------DRTSSTNNN----VERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGI
        ME   EA N+DS +SL+L       RTSS + N    VE L RMVKF     VFSLVLALFFSFFSLFPHSF+VYFSTF+FSLLNH MERK+MFLICNGI
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Query:  LFLLATSSVLQDSSPSSSSSSSSSSFGYSSF-SHS--VHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEE
        LFLLATSSV++D      SSSSSSSFG  SF SHS   HH Q EHDLVA A DG DS+ES +Q  EE E+E E+ H DE E              EE EE
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Query:  DEGCFTEEVE-EEEEEEGKRRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
        DEGCFT+EVE ++EEEEGKRR+LEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT QLIAV
Subjt:  DEGCFTEEVE-EEEEEEGKRRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A061GIF6 Uncharacterized protein7.3e-0841.8Show/hide
Query:  MDSY-ESLDLDRTSSTNNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVLQDSSPSSS
        MD Y + + L       +    LKR ++ +VS+ + S  L     FF +FPHSF+VYFSTFLFS   H +ERK+MFLICNGIL  LA SSV   SSPS S
Subjt:  MDSY-ESLDLDRTSSTNNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVLQDSSPSSS

Query:  SSSSSSSFGYSSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEH----------EDEHEDEHE-----EQEEDEEDEGCFT
           +  S   ++ + +       +++V   SD  D+D     E EE ED +E+E E++ E ++          ED+ E E E     E  E +E E    
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Query:  EEVEEEEEEEGKRRDL---EVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
         + E++ +EEG    L   E V STE+LN+K EEFIRKMKEE+RIEA   QQLIAV
Subjt:  EEVEEEEEEEGKRRDL---EVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV

A0A0A0LVQ2 Uncharacterized protein1.5e-2150.22Show/hide
Query:  AINMDSYESLDLDRTSSTN--NNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICN-GILFLLATSSVLQDS
        ++N+++Y+ +    +SS N  + VE LKRMVK    + VF L+L LFFS FSLFPHSF+VYFSTFLFS+L H +ERK+MFLICN GILFLLATSSV    
Subjt:  AINMDSYESLDLDRTSSTN--NNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICN-GILFLLATSSVLQDS

Query:  SPSSSSSSSSSSFG-YSSFSHS---VHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEVEEE
            SSSSSSSSFG Y  F HS    HH+ FEHD+VA  +   +SD    QE EE ++E     E                 +EE EEDEGCFT+EVEEE
Subjt:  SPSSSSSSSSSSFG-YSSFSHS---VHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEVEEE

Query:  EEE--EGKRRDLEVVVSTEELNKKIEE
        EEE  EGK+R  +  +     +++IE+
Subjt:  EEE--EGKRRDLEVVVSTEELNKKIEE

A0A6J1CN51 nardilysin-like5.9e-2650.99Show/hide
Query:  MENRVEAINMDSYESLDLDRTSSTN--NNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSS
        ME   +A ++DS ESL+LD    TN  + V+RLK MVKF+VS+CVF LV+ALF S FSLFPHSFT+YFS  LFSLLNH ++R +MFL+CNGIL LLATS 
Subjt:  MENRVEAINMDSYESLDLDRTSSTN--NNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSS

Query:  VLQDSSPSSSSSSSSSSFGYSSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHED-EHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEV-
        +                      S+S+ H  +                  E   EE E+E ED+ +D       D           E+E+DEGCFT+EV 
Subjt:  VLQDSSPSSSSSSSSSSFGYSSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHED-EHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEV-

Query:  EEEEEEEGKR-RDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT--QQLIAV
        EEEEEEEGKR  +LEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRI+AA     QL+AV
Subjt:  EEEEEEEGKR-RDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQT--QQLIAV

A0A6J1EH25 X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1-like1.9e-109100Show/hide
Query:  MENRVEAINMDSYESLDLDRTSSTNNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVL
        MENRVEAINMDSYESLDLDRTSSTNNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVL
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Query:  QDSSPSSSSSSSSSSFGYSSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEVEEEE
        QDSSPSSSSSSSSSSFGYSSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEVEEEE
Subjt:  QDSSPSSSSSSSSSSFGYSSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEVEEEE

Query:  EEEGKRRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
        EEEGKRRDLEVVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
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A0A6P3ZZX9 glutamic acid-rich protein-like6.0e-1043.04Show/hide
Query:  NNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVLQDSSPSSSSSSSSSSFGYSSFSHS
        N+N++ L+R ++  +S+ + SL L  + S  SLFPHSF+VYFST LFS+    +ERK+MFL+CNGIL  LA SSV        SS+SSS+  G       
Subjt:  NNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVLQDSSPSSSSSSSSSSFGYSSFSHS

Query:  VHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEH-----------EDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFT---EEVEEEEEEEGKRRDLE
              E +L  D     +    EE+E EE EDE EDE E++             D H++   +  + + E  E+EG ++   ++  EE+E EG     E
Subjt:  VHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEH-----------EDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFT---EEVEEEEEEEGKRRDLE

Query:  -VVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV
         VV ST+ELNKK EEFIRKMKEE+RIEA   QQLIAV
Subjt:  -VVVSTEELNKKIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAGAATAGGGTTGAAGCCATAAACATGGATTCATATGAAAGTTTGGATCTTGATAGAACATCATCAACAAACAATAATGTTGAGAGGTTGAAAAGGATGGTGAAGTT
CATAGTGTCAATTTGTGTGTTTTCTTTGGTTTTGGCATTGTTTTTTTCCTTCTTCTCTCTCTTCCCTCATTCATTTACTGTCTATTTCTCCACTTTCCTCTTCTCTCTCC
TCAACCATGGCATGGAGAGAAAGTTCATGTTCTTGATCTGTAATGGAATCCTGTTTCTTCTTGCCACTTCCTCTGTTCTTCAAGATTCTTCTCCTTCATCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCCTCCTCTTTTGGGTATTCTTCATTTTCCCATTCTGTTCATCATGATCAATTTGAACATGATCTTGTGGCTGATGCCTCTGATGGGTATGATTCTGATGAGTC
AGAAGAACAAGAACATGAAGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGAACAAGAAG
AAGATGAAGAAGATGAAGGGTGTTTTACAGAGGAGGTTGAAGAAGAAGAGGAGGAAGAAGGAAAAAGGAGGGATTTAGAGGTGGTGGTGAGTACAGAAGAATTGAACAAG
AAAATAGAAGAGTTTATAAGGAAAATGAAGGAGGAAATGAGGATTGAAGCAGCTCAAACTCAGCAGCTCATTGCAGTGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGAGAATAGGGTTGAAGCCATAAACATGGATTCATATGAAAGTTTGGATCTTGATAGAACATCATCAACAAACAATAATGTTGAGAGGTTGAAAAGGATGGTGAAGTT
CATAGTGTCAATTTGTGTGTTTTCTTTGGTTTTGGCATTGTTTTTTTCCTTCTTCTCTCTCTTCCCTCATTCATTTACTGTCTATTTCTCCACTTTCCTCTTCTCTCTCC
TCAACCATGGCATGGAGAGAAAGTTCATGTTCTTGATCTGTAATGGAATCCTGTTTCTTCTTGCCACTTCCTCTGTTCTTCAAGATTCTTCTCCTTCATCTTCTTCTTCT
TCTTCTTCCTCCTCTTTTGGGTATTCTTCATTTTCCCATTCTGTTCATCATGATCAATTTGAACATGATCTTGTGGCTGATGCCTCTGATGGGTATGATTCTGATGAGTC
AGAAGAACAAGAACATGAAGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGATGAACATGAAGAACAAGAAG
AAGATGAAGAAGATGAAGGGTGTTTTACAGAGGAGGTTGAAGAAGAAGAGGAGGAAGAAGGAAAAAGGAGGGATTTAGAGGTGGTGGTGAGTACAGAAGAATTGAACAAG
AAAATAGAAGAGTTTATAAGGAAAATGAAGGAGGAAATGAGGATTGAAGCAGCTCAAACTCAGCAGCTCATTGCAGTGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MENRVEAINMDSYESLDLDRTSSTNNNVERLKRMVKFIVSICVFSLVLALFFSFFSLFPHSFTVYFSTFLFSLLNHGMERKFMFLICNGILFLLATSSVLQDSSPSSSSS
SSSSSFGYSSFSHSVHHDQFEHDLVADASDGYDSDESEEQEHEEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEDEHEEQEEDEEDEGCFTEEVEEEEEEEGKRRDLEVVVSTEELNK
KIEEFIRKMKEEMRIEAAQTQQLIAV