; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh13G006570 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh13G006570
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionVQ motif-containing protein 4-like
Genome locationCmo_Chr13:6937633..6938397
RNA-Seq ExpressionCmoCh13G006570
SyntenyCmoCh13G006570
Gene Ontology termsGO:0005634 - nucleus (cellular component)
InterPro domainsIPR008889 - VQ
IPR039611 - VQ motif-containing protein 4/11/13/19/31/33
IPR039827 - VQ motif-containing protein 4/13


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6583990.1 VQ motif-containing protein 4, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-13499.21Show/hide
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XP_022927619.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita moschata]1.1e-135100Show/hide
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XP_023001738.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita maxima]7.0e-13398.05Show/hide
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XP_023520333.1 VQ motif-containing protein 4-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.7e-13498.82Show/hide
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XP_038876999.1 VQ motif-containing protein 4 [Benincasa hispida]3.0e-11287.75Show/hide
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         PA    NSDS SKTHIPPIKSLP+RQQSGFKLYERRNS+NKLKINPVFPVFGS  HSGFSPRK EILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCS
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TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LV54 VQ domain-containing protein4.2e-10785.14Show/hide
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        ME+SS+ Q+NP P  SSLLPSPS+R+++STT+S+STS GL    P  +HLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASV  A 
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        GN KLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRD EPRLLPLFP+TSPRVPG
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A0A5A7UQT0 VQ motif-containing protein 4 isoform X23.4e-10985.04Show/hide
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        ME+SS+ Q+NP P  SSLLPSP++R+++STT+S+STS GL    P  +HLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASV  A 
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           NSDS SKTHIPPIKSLP+RQQSGFKLYERRNS+NKLKINPVFPVFGS  HSGFSPRK EILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKN
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        GN KLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRD EPRLLPLFP+TSPRVPGSSS S
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A0A6J1CGC6 VQ motif-containing protein 4-like isoform X15.4e-10783.01Show/hide
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        ME+SS  QEN  PS SSLLPSPSSR+T++++ S+STS G+Q + PPP        HLHSPK ITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQ
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        AS  PAA A  NS+SVSK+HIPPIKSLP+RQQSGFKLYERRNS+NKL+INP+ PVFGS  +SGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGL
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A0A6J1EII3 VQ motif-containing protein 4-like5.6e-136100Show/hide
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A0A6J1KRE6 VQ motif-containing protein 4-like3.4e-13398.05Show/hide
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SwissProt top hitse value%identityAlignment
O23660 VQ motif-containing protein 138.5e-3347.42Show/hide
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        + L+P P    +    TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+       +P   P +S       IPPIK++  K+Q S F+L ERRNSM + 
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Query:  LKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLP
        L INP        THSG     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD EPRLL 
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Query:  LFPMTSPRVPGSS
        LFPMT    P  S
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Q5M750 VQ motif-containing protein 41.8e-6258.63Show/hide
Query:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQAS---VNPA-AAPSNSDSVSK
        +++L+PSP    ++++   SS+S   +    P  H+      TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S    NP    P    + S 
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Query:  THIPPIKSLPKRQQ-----SGFKLYERRNSMNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKL
          IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNSM  LKINP+ PVF +  +S FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N        +  
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Query:  DAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSPRVPGSSSIS
        +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV GSSS S
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Q9FHZ3 VQ motif-containing protein 331.4e-3043.97Show/hide
Query:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAP-SNSDSVSKTHI
        S+S + S   +M +     SS  +  Q + P  H  H           NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS         + A +P +N++  S   I
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Query:  PPIKSLPKRQQSGFKLYERR---NSM---NKLKINP---------VFPVFGSTTHSG--FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFD
        PPIK     + + FKLYERR   N+M   N L IN          +F    S+ H    FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF+
Subjt:  PPIKSLPKRQQSGFKLYERR---NSM---NKLKINP---------VFPVFGSTTHSG--FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFD

Query:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSP
        +S     S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRD +P LLPLFP+ SP
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Q9FNP0 VQ motif-containing protein 317.5e-1337.97Show/hide
Query:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLPKRQQSGFKLYERRNSMNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSP
        TTFVQ DT++F+++VQ LTG  E       N AAA +   +V KT      ++ KR  S  KL+ERR  M + K+  V P             KP   +P
Subjt:  TTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLPKRQQSGFKLYERRNSMNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSP

Query:  SILDFPALALSPVTPLIPDPF--DRSGLANCSYLKN--GNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSPRVPG
        S       + S  T L+  P     S  +N S ++    +   + E EEKAIKE+ FYLHPSP + P   EP LL LFP+TSP   G
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Q9LDZ1 VQ motif-containing protein 199.1e-3547.19Show/hide
Query:  SSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLPKRQQSGFKLYE
        SSSS+S     +    HH      ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S  P   PS   +     IPPIK+   ++ SG KLYE
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Query:  RR-------NSMNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE
        RR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+                    EE+ I +
Subjt:  RR-------NSMNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE

Query:  KGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSPRV
        KG+YLH SP +TPRD EP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  KGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSPRV

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G28280.1 VQ motif-containing protein1.3e-6358.63Show/hide
Query:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQAS---VNPA-AAPSNSDSVSK
        +++L+PSP    ++++   SS+S   +    P  H+      TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S    NP    P    + S 
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Query:  THIPPIKSLPKRQQ-----SGFKLYERRNSMNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKL
          IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNSM  LKINP+ PVF +  +S FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N        +  
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Query:  DAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSPRVPGSSSIS
        +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV GSSS S
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AT1G28280.2 VQ motif-containing protein2.0e-6158.26Show/hide
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        +++L+PSP    ++++   SS+S   +    P  H+      TRSES NPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGS E  K  S    NP    P    + S 
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Query:  THIPPIKSLPKRQQ-----SGFKLYERRNSMNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKL
          IPPIK++P ++Q     SGF+LYERRNSM  LKINP+ PVF +  +S FSPRKPEILSPSILDFP+L LSPVTPLIPDPFDRSG +N        +  
Subjt:  THIPPIKSLPKRQQ-----SGFKLYERRNSMNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKL

Query:  DAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSPRV
        +  AEEKA+KE+GFYLHPSP TTP D EPRLLPLFP+TSPRV
Subjt:  DAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSPRV

AT2G33780.1 VQ motif-containing protein6.1e-3447.42Show/hide
Query:  QQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLP-KRQQSGFKLYERRNSM-NK
        + L+P P    +    TR    + Y TTF++ D SSFKQVVQ+LTG P+       +P   P +S       IPPIK++  K+Q S F+L ERRNSM + 
Subjt:  QQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLP-KRQQSGFKLYERRNSM-NK

Query:  LKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLP
        L INP        THSG     PEIL+P+IL+FPAL LSP TPL+ DPF R G  + S   + +     + +E++IKEKGFYL PSP+TTPRD EPRLL 
Subjt:  LKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLP

Query:  LFPMTSPRVPGSS
        LFPMT    P  S
Subjt:  LFPMTSPRVPGSS

AT3G15300.1 VQ motif-containing protein6.5e-3647.19Show/hide
Query:  SSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLPKRQQSGFKLYE
        SSSS+S     +    HH      ITRS+    YPTTFVQAD+SSFKQVVQMLTGS       S  P   PS   +     IPPIK+   ++ SG KLYE
Subjt:  SSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSKTHIPPIKSLPKRQQSGFKLYE

Query:  RR-------NSMNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE
        RR       N  N L IN +    G      FSPR  EILSPS LDFP LAL SPVTPL         DPFD+                    EE+ I +
Subjt:  RR-------NSMNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALAL-SPVTPLIP-------DPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKE

Query:  KGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSPRV
        KG+YLH SP +TPRD EP+LLPLFP+TSPR+
Subjt:  KGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSPRV

AT5G53830.1 VQ motif-containing protein9.7e-3243.97Show/hide
Query:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAP-SNSDSVSKTHI
        S+S + S   +M +     SS  +  Q + P  H  H           NPYPTTFVQADTS+FKQVVQMLTGS         + A +P +N++  S   I
Subjt:  SSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAP-SNSDSVSKTHI

Query:  PPIKSLPKRQQSGFKLYERR---NSM---NKLKINP---------VFPVFGSTTHSG--FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFD
        PPIK     + + FKLYERR   N+M   N L IN          +F    S+ H    FSPR        +LSPS+LDFP L L SPVTPL    DPF+
Subjt:  PPIKSLPKRQQSGFKLYERR---NSM---NKLKINP---------VFPVFGSTTHSG--FSPRKPE-----ILSPSILDFPALAL-SPVTPL--IPDPFD

Query:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSP
        +S     S L  GN    +  E+KAI +KGFYLHPSP +TPRD +P LLPLFP+ SP
Subjt:  RSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFYLHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGAATCCTCTTCAGTTTTACAAGAAAACCCATGTCCTTCTTCTTCTTCTCTCCTTCCTTCTCCAAGTAGCCGCATGACTCACAGTACTACCAGCAGTAGCAGCACCAG
CTATGGACTCCAACAACTCATGCCTCCACCGCATCACTTGCACTCGCCCAAACCCATCACTCGATCCGAATCTGTTAACCCTTACCCCACTACCTTTGTTCAAGCTGATA
CCTCTTCTTTCAAGCAAGTAGTTCAAATGCTCACTGGATCCCCTGAAACCGCCAAGCAAGCCTCTGTTAACCCTGCTGCTGCGCCTTCCAACTCTGATTCTGTGTCCAAA
ACGCACATTCCGCCTATTAAATCTTTACCCAAAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTATGAATAAACTTAAAATTAACCCGGTGTTTCCCGT
TTTCGGTTCCACTACTCATTCGGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAAATTCTTTCTCCGAGTATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTCTCAGTCCTGTCACGCCGCTGATTC
CCGACCCGTTTGATCGATCTGGGTTGGCGAATTGTAGCTACTTGAAGAATGGGAATGCTAAGTTGGATGCAGAGGCGGAAGAGAAAGCGATTAAAGAAAAGGGGTTTTAC
TTGCATCCATCGCCGACCACCACTCCTCGTGACTACGAGCCTCGGCTGTTGCCACTGTTCCCAATGACATCTCCTAGAGTGCCAGGTTCATCATCCATTTCATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
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ACGCACATTCCGCCTATTAAATCTTTACCCAAAAGGCAGCAATCTGGATTCAAGCTCTACGAGCGTAGGAACTCTATGAATAAACTTAAAATTAACCCGGTGTTTCCCGT
TTTCGGTTCCACTACTCATTCGGGGTTTTCTCCGAGGAAACCTGAAATTCTTTCTCCGAGTATTCTGGACTTTCCGGCGCTCGCTCTCAGTCCTGTCACGCCGCTGATTC
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Protein sequenceShow/hide protein sequence
MESSSVLQENPCPSSSSLLPSPSSRMTHSTTSSSSTSYGLQQLMPPPHHLHSPKPITRSESVNPYPTTFVQADTSSFKQVVQMLTGSPETAKQASVNPAAAPSNSDSVSK
THIPPIKSLPKRQQSGFKLYERRNSMNKLKINPVFPVFGSTTHSGFSPRKPEILSPSILDFPALALSPVTPLIPDPFDRSGLANCSYLKNGNAKLDAEAEEKAIKEKGFY
LHPSPTTTPRDYEPRLLPLFPMTSPRVPGSSSIS