; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh13G007380 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh13G007380
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionLate embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family
Genome locationCmo_Chr13:7302285..7304569
RNA-Seq ExpressionCmoCh13G007380
SyntenyCmoCh13G007380
Gene Ontology termsGO:0098542 - defense response to other organism (biological process)
GO:0009506 - plasmodesma (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0046658 - anchored component of plasma membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR004864 - Late embryogenesis abundant protein, LEA_2 subgroup
IPR044839 - Protein NDR1-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6584065.1 NDR1/HIN1-like protein 26, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]5.5e-11697.22Show/hide
Query:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
        MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFS+LGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
Subjt:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR

Query:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD
        NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSG TLNVDRHRWMEF++ERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSK HGMHANCD
Subjt:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD

Query:  VSVGRDGLILPSSMDV
        VSVGRDGLILPSS DV
Subjt:  VSVGRDGLILPSSMDV

KAG7019665.1 Protein NDR1, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.9e-11697.69Show/hide
Query:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
        MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFS+LGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
Subjt:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR

Query:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD
        NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSG TLNVDRHRWMEF+KERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSK HGMHANCD
Subjt:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD

Query:  VSVGRDGLILPSSMDV
        VSVGRDGLILPSS DV
Subjt:  VSVGRDGLILPSSMDV

XP_022933195.1 NDR1/HIN1-like protein 26 [Cucurbita moschata]1.4e-119100Show/hide
Query:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
        MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
Subjt:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR

Query:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD
        NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD
Subjt:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD

Query:  VSVGRDGLILPSSMDV
        VSVGRDGLILPSSMDV
Subjt:  VSVGRDGLILPSSMDV

XP_023001303.1 NDR1/HIN1-like protein 26 [Cucurbita maxima]1.2e-11597.22Show/hide
Query:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
        MNTPTQLAETKTPE+RPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
Subjt:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR

Query:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD
        NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSG TLNVDRHRWMEF+KERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAW+SK HGMHANCD
Subjt:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD

Query:  VSVGRDGLILPSSMDV
        VSVGRDGLILPSS DV
Subjt:  VSVGRDGLILPSSMDV

XP_023519616.1 NDR1/HIN1-like protein 26 [Cucurbita pepo subsp. pepo]4.6e-11596.3Show/hide
Query:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
        MNTPTQLAET TPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGII FILWLSLRPHRPRFFIHHFS+LGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
Subjt:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR

Query:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD
        NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSG TLNVDRHRWMEF+KERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSK HGMHANCD
Subjt:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD

Query:  VSVGRDGLILPSSMDV
        VSVGRDGL+LPSS DV
Subjt:  VSVGRDGLILPSSMDV

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S4DSX4 NDR1/HIN1-like protein 123.5e-9278.73Show/hide
Query:  MNTPTQLA--ETKTPEQR---PIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVF
        MN+P+ L    T TPEQR   P K HH+ RYYA RVK+SLTTRVSKLICA+FL LL I+GIITFILWLSLRPHRPRFFIH FSV G GLDNG++N +IVF
Subjt:  MNTPTQLA--ETKTPEQR---PIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVF

Query:  NVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGM
        N TARNSNLNIGIYYD+M GSVYYK+QKIGSTPLLD YYEGPKTTKVLTAALSG TLNVDR +WME + ERSKG V FRLEI+STIRFRISAWDSK HGM
Subjt:  NVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGM

Query:  HANCDVSVGRDGLILPSSMDV
        HANC VSVG DG+ILPSS DV
Subjt:  HANCDVSVGRDGLILPSSMDV

A0A5A7UTL7 NDR1/HIN1-like protein 123.5e-9278.73Show/hide
Query:  MNTPTQLA--ETKTPEQR---PIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVF
        MN+P+ L    T TPEQR   P K HH+ RYYA RVK+SLTTRVSKLICA+FL LL I+GIITFILWLSLRPHRPRFFIH FSV G GLDNG++N +IVF
Subjt:  MNTPTQLA--ETKTPEQR---PIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVF

Query:  NVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGM
        N TARNSNLNIGIYYD+M GSVYYK+QKIGSTPLLD YYEGPKTTKVLTAALSG TLNVDR +WME + ERSKG V FRLEI+STIRFRISAWDSK HGM
Subjt:  NVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGM

Query:  HANCDVSVGRDGLILPSSMDV
        HANC VSVG DG+ILPSS DV
Subjt:  HANCDVSVGRDGLILPSSMDV

A0A6J1F496 NDR1/HIN1-like protein 266.7e-120100Show/hide
Query:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
        MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
Subjt:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR

Query:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD
        NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD
Subjt:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD

Query:  VSVGRDGLILPSSMDV
        VSVGRDGLILPSSMDV
Subjt:  VSVGRDGLILPSSMDV

A0A6J1K2E7 NDR1/HIN1-like protein 266.6e-9176.61Show/hide
Query:  MNTPTQLA--ETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVT
        M +P+QL    T TPE+RPIKRHHT RYY  RVK+SLTTR+SKLICA+FL LL IVGIITFILWLSLRPHRPRFFIH FSV GLGL+ G++N +I FNVT
Subjt:  MNTPTQLA--ETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVT

Query:  ARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHAN
        ARNSNLNIGIYY S+ GSVYY++QKIGSTPLLD YYEGPKTTKVL A LSG TLN++  RWMEF  +RSKG V FRLEI+STIRFRIS WDSK HGMHAN
Subjt:  ARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHAN

Query:  CDVSVGRDGLILPSSMDV
        CDVSVG DG+ILPS+ DV
Subjt:  CDVSVGRDGLILPSSMDV

A0A6J1KQ48 NDR1/HIN1-like protein 265.9e-11697.22Show/hide
Query:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
        MNTPTQLAETKTPE+RPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR
Subjt:  MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTAR

Query:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD
        NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSG TLNVDRHRWMEF+KERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAW+SK HGMHANCD
Subjt:  NSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCD

Query:  VSVGRDGLILPSSMDV
        VSVGRDGLILPSS DV
Subjt:  VSVGRDGLILPSSMDV

SwissProt top hitse value%identityAlignment
O48915 Protein NDR11.0e-1129.31Show/hide
Query:  CAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLD-NGYKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSM-VGSVYYKNQKIGSTPL-------LDEYY
        C   L  +F  G+ +  LWLSLR  +P+  I +F +  LG D N   N  + F V   N N + GIYYD + +        KI S+ L       + ++Y
Subjt:  CAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLD-NGYKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSM-VGSVYYKNQKIGSTPL-------LDEYY

Query:  EGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCDVSVGRDGL
        +G K       A   G +    ++ +        G+  FRL++ + +RF+I  W +K +G+    DV V  DG+
Subjt:  EGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCDVSVGRDGL

Q8GYA4 Cysteine-rich receptor-like protein kinase 107.9e-0946.05Show/hide
Query:  PPAPGKRRFSTMLIVAIVAPITISILLFVLGCCFLRQRARKRHSAVKEDSFV-NEMTTMESLQFDFKTIDAATNKF
        PP  GK   S +L++AIV PI +++LLF+ G CFL +RARK  S     +F  +++TT +SLQ D++TI  AT+ F
Subjt:  PPAPGKRRFSTMLIVAIVAPITISILLFVLGCCFLRQRARKRHSAVKEDSFV-NEMTTMESLQFDFKTIDAATNKF

Q9FI03 NDR1/HIN1-like protein 263.3e-1527.87Show/hide
Query:  TPRYYAQRVKDSLTTRVSKL---ICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNG---YKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSMVGS
        +P++ A++   ++  R  KL       F GLL I+    F++WL L P RP F +    +  L L        N  +   + ++N N  +GIYYD ++  
Subjt:  TPRYYAQRVKDSLTTRVSKL---ICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNG---YKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSMVGS

Query:  VYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANC
          Y+ Q+I S   L  +Y+  +   +LTA L G  L V +    + ++ERS G +   +++   +R++I  W S  +  + NC
Subjt:  VYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANC

Q9SJ54 NDR1/HIN1-like protein 122.6e-1224.69Show/hide
Query:  ICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDN-GYKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTK
        IC V +G + IV I  F++W+ L+P +PRF +   +V    L             + +RN N  IGIYYD +     Y+NQ+I     +   Y+G K   
Subjt:  ICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDN-GYKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTK

Query:  VLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCDVSV
        V +  + G ++ +     +    E+++G V   +     +R+++    +  + +H  C   +
Subjt:  VLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCDVSV

Q9SRN1 NDR1/HIN1-like protein 22.2e-1128.3Show/hide
Query:  VSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLD-NGYKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGP
        +  LIC + + +  I+G+   ILWL  RP+  +F++   ++     D N   +  +  N T RN N  +G+YYD    S YY +Q+ GS   +  +Y+G 
Subjt:  VSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLD-NGYKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGP

Query:  KTTKVLTAALSGGTLNV--DRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFR---ISAWDSK
        K T V+   + G  L V  D  R  +   +   G      ++  ++RF+   I +W  K
Subjt:  KTTKVLTAALSGGTLNV--DRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFR---ISAWDSK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G61760.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family8.6e-5950Show/hide
Query:  NTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTARN
        N    L     P  RPI RHH+      RVK+SLTTRVSKLICA+FL LL  +GIITFILW+SL+PHRPR  I  FS+ GL   +G++   I F +TA N
Subjt:  NTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTARN

Query:  SNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCDV
         N N+GIYYDSM GSVYYK ++IGST L + +Y+ PK T  +  ALS   + V++ RWME  ++R++G + FRL++ S IRF++  W SK H M+A+C +
Subjt:  SNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCDV

Query:  SVGRDGLILPSSMD
         +G DG++L ++ D
Subjt:  SVGRDGLILPSSMD

AT3G44220.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family2.6e-1526.99Show/hide
Query:  RVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDN-GYKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEG
        ++ K I A+ LG L  V  + F++W  L PH PRF +   ++    +    Y    +   +++RN N  IGI+YD +     Y+NQ++    LL   Y+G
Subjt:  RVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDN-GYKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEG

Query:  PKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANC
             + +  L G T+ V  +     +++ + G V   ++I   +R+++  W S  + +H NC
Subjt:  PKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANC

AT4G01410.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family2.6e-1530.69Show/hide
Query:  KLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGL-DNGYKNPEIV-----FNVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYY
        + IC     +L I+GII  ILWL  RPH+PR      +V+G  + D  +  P ++     F+V ARN N  + I+YD +   V YK+Q I     L    
Subjt:  KLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGL-DNGYKNPEIV-----FNVTARNSNLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYY

Query:  EGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCDV-------SVGRDGLILPSSMDV
         G K+T V+   + G  + V          + + G V  R+ I   +R++  A  +  +G +A CDV       S G+  L+ PS+  V
Subjt:  EGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCDV-------SVGRDGLILPSSMDV

AT4G05220.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family7.2e-6654.55Show/hide
Query:  TPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTARNS
        T   +  +  P  +P+KRHH+  YYA RV++SL+TR+SK ICA+FL +LF VG+I FILWLSLRPHRPRF I  F V GL    G +N  I FNVT  N 
Subjt:  TPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTARNS

Query:  NLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCDVS
        N ++G+Y+DSM GS+YYK+Q++G  PLL+ +++ P  T ++T  L+G +L V+ +RW EF+ +R++G VGFRL+I STIRF++  W SKHH MHANC++ 
Subjt:  NLNIGIYYDSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCDVS

Query:  VGRDGLILP
        VGRDGLILP
Subjt:  VGRDGLILP

AT5G53730.1 Late embryogenesis abundant (LEA) hydroxyproline-rich glycoprotein family2.4e-1627.87Show/hide
Query:  TPRYYAQRVKDSLTTRVSKL---ICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNG---YKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSMVGS
        +P++ A++   ++  R  KL       F GLL I+    F++WL L P RP F +    +  L L        N  +   + ++N N  +GIYYD ++  
Subjt:  TPRYYAQRVKDSLTTRVSKL---ICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNG---YKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYYDSMVGS

Query:  VYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANC
          Y+ Q+I S   L  +Y+  +   +LTA L G  L V +    + ++ERS G +   +++   +R++I  W S  +  + NC
Subjt:  VYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAACACTCCCACCCAATTGGCGGAGACGAAGACGCCAGAACAGCGCCCAATCAAGCGCCACCACACGCCGCGCTATTACGCACAGCGTGTCAAGGACAGCCTAACCAC
GCGCGTCTCCAAGCTCATATGCGCCGTCTTCTTGGGCTTGTTGTTCATTGTGGGTATCATAACGTTTATTCTGTGGCTTAGTTTACGACCCCACCGGCCCCGATTTTTCA
TTCACCATTTTTCAGTTTTGGGTTTGGGCCTCGATAACGGCTACAAAAATCCCGAAATTGTCTTCAACGTCACGGCCCGAAACTCCAATCTCAACATTGGGATCTACTAC
GATTCCATGGTCGGTTCGGTTTATTATAAGAACCAGAAAATCGGGTCCACGCCGCTGCTGGATGAGTACTATGAAGGCCCGAAGACTACCAAGGTGCTGACGGCGGCGCT
TAGTGGAGGGACGTTGAACGTCGACCGGCATCGGTGGATGGAATTTACTAAAGAGCGGTCTAAGGGAGCCGTGGGTTTCCGGTTGGAGATTTCGTCGACCATCCGGTTTA
GAATATCCGCTTGGGATAGTAAGCACCATGGTATGCACGCTAATTGTGACGTGTCGGTGGGCCGTGATGGGTTGATTTTGCCTTCTTCCATGGACGTGAGTGAAGGAGAA
TTGCGTCAAACCTCTGAGACGAATTCCGTACCGCCGCCGGCGCCAGGGAAAAGAAGATTCTCAACGATGTTAATTGTGGCCATTGTGGCTCCTATTACCATCTCCATCCT
GCTCTTCGTTCTGGGATGTTGCTTCCTGCGCCAGAGAGCTAGGAAGAGACACTCTGCTGTAAAGGAAGATAGCTTTGTTAATGAGATGACCACCATGGAATCTCTGCAAT
TTGATTTCAAAACAATCGATGCAGCTACTAACAAGTTTTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGAACACTCCCACCCAATTGGCGGAGACGAAGACGCCAGAACAGCGCCCAATCAAGCGCCACCACACGCCGCGCTATTACGCACAGCGTGTCAAGGACAGCCTAACCAC
GCGCGTCTCCAAGCTCATATGCGCCGTCTTCTTGGGCTTGTTGTTCATTGTGGGTATCATAACGTTTATTCTGTGGCTTAGTTTACGACCCCACCGGCCCCGATTTTTCA
TTCACCATTTTTCAGTTTTGGGTTTGGGCCTCGATAACGGCTACAAAAATCCCGAAATTGTCTTCAACGTCACGGCCCGAAACTCCAATCTCAACATTGGGATCTACTAC
GATTCCATGGTCGGTTCGGTTTATTATAAGAACCAGAAAATCGGGTCCACGCCGCTGCTGGATGAGTACTATGAAGGCCCGAAGACTACCAAGGTGCTGACGGCGGCGCT
TAGTGGAGGGACGTTGAACGTCGACCGGCATCGGTGGATGGAATTTACTAAAGAGCGGTCTAAGGGAGCCGTGGGTTTCCGGTTGGAGATTTCGTCGACCATCCGGTTTA
GAATATCCGCTTGGGATAGTAAGCACCATGGTATGCACGCTAATTGTGACGTGTCGGTGGGCCGTGATGGGTTGATTTTGCCTTCTTCCATGGACGTGAGTGAAGGAGAA
TTGCGTCAAACCTCTGAGACGAATTCCGTACCGCCGCCGGCGCCAGGGAAAAGAAGATTCTCAACGATGTTAATTGTGGCCATTGTGGCTCCTATTACCATCTCCATCCT
GCTCTTCGTTCTGGGATGTTGCTTCCTGCGCCAGAGAGCTAGGAAGAGACACTCTGCTGTAAAGGAAGATAGCTTTGTTAATGAGATGACCACCATGGAATCTCTGCAAT
TTGATTTCAAAACAATCGATGCAGCTACTAACAAGTTTTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MNTPTQLAETKTPEQRPIKRHHTPRYYAQRVKDSLTTRVSKLICAVFLGLLFIVGIITFILWLSLRPHRPRFFIHHFSVLGLGLDNGYKNPEIVFNVTARNSNLNIGIYY
DSMVGSVYYKNQKIGSTPLLDEYYEGPKTTKVLTAALSGGTLNVDRHRWMEFTKERSKGAVGFRLEISSTIRFRISAWDSKHHGMHANCDVSVGRDGLILPSSMDVSEGE
LRQTSETNSVPPPAPGKRRFSTMLIVAIVAPITISILLFVLGCCFLRQRARKRHSAVKEDSFVNEMTTMESLQFDFKTIDAATNKF