; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh13G008540 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh13G008540
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptionprotein TAPETUM DETERMINANT 1-like
Genome locationCmo_Chr13:7836028..7837361
RNA-Seq ExpressionCmoCh13G008540
SyntenyCmoCh13G008540
Gene Ontology termsGO:0001709 - cell fate determination (biological process)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
InterPro domainsIPR040361 - Tapetum determinant 1


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7019756.1 Protein TAPETUM DETERMINANT 1 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-80100Show/hide
Query:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
        MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
Subjt:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF

Query:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
        KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
Subjt:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK

XP_022923940.1 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like [Cucurbita moschata]1.3e-80100Show/hide
Query:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
        MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
Subjt:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF

Query:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
        KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
Subjt:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK

XP_023000941.1 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like [Cucurbita maxima]3.1e-7795.83Show/hide
Query:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
        M+ SPPSFLR+ L S IGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
Subjt:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF

Query:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
        KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
Subjt:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK

XP_023520053.1 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]1.5e-7695.14Show/hide
Query:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
        M+ SPPSFLR+ L S IGAP+RKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
Subjt:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF

Query:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
        KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
Subjt:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK

XP_038893959.1 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like [Benincasa hispida]3.2e-7493.62Show/hide
Query:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
        M+SSPPSFLRLGLN+TI APHRKLLLTR+ATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGC+IYGIHFKCGWFSSAHLINPR+F
Subjt:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF

Query:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC
        KRL YDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANT+PYPLSVSSV C
Subjt:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3B0P8 protein TAPETUM DETERMINANT 14.5e-7494.33Show/hide
Query:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
        MDSSPPSFL L LN+T  APHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGC+IYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
Subjt:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF

Query:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC
        KRL YDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSV+C
Subjt:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC

A0A5A7UPF3 Protein TAPETUM DETERMINANT 14.5e-7494.33Show/hide
Query:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
        MDSSPPSFL L LN+T  APHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGC+IYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
Subjt:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF

Query:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC
        KRL YDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSV+C
Subjt:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC

A0A6J1C840 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like isoform X12.0e-7494.33Show/hide
Query:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
        M+SSPPS+L LGLN+TI APHRKLLLT+EATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
Subjt:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF

Query:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC
        KRL YDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANT+PYPLSVSSVVC
Subjt:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC

A0A6J1EDD3 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like6.5e-81100Show/hide
Query:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
        MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
Subjt:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF

Query:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
        KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
Subjt:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK

A0A6J1KH78 protein TAPETUM DETERMINANT 1-like1.5e-7795.83Show/hide
Query:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
        M+ SPPSFLR+ L S IGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF
Subjt:  MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVF

Query:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
        KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK
Subjt:  KRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK

SwissProt top hitse value%identityAlignment
A8MS78 Uncharacterized protein At1g058354.3e-0538.89Show/hide
Query:  YTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYD--DCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPL
        + VEV+N C   C I  +  KC  F  + L++P   + L     +C+VNDG PL    TLSF Y+NT+ + L
Subjt:  YTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYD--DCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPL

Q1G3T1 TPD1 protein homolog 11.7e-3857.78Show/hide
Query:  SFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYD
        SF+ +  N T  A  RKLLL+ +  I + T   G+ C+K DIV+ QG T PLP+G+P+YTVE+ N+CV+ C+I  IH  CGWFSS  L+NPRVF+RL YD
Subjt:  SFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYD

Query:  DCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC
        DCLVNDG+PL  G +LSFQYAN++ YPLSV+SV C
Subjt:  DCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC

Q2QR54 TPD1 protein homolog 1A2.5e-2956.44Show/hide
Query:  DIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTG------CDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVV
        DI I QG   PLP+G+P YTV+V+N C  G      C I GIH +CGWFSS  L++PRVF+RL +DDCL+NDG+PL+ G T+SF+Y N++PY LSVS   
Subjt:  DIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTG------CDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVV

Query:  C
        C
Subjt:  C

Q6TLJ2 Protein TAPETUM DETERMINANT 11.8e-4062.7Show/hide
Query:  HRKLLLTREATIE-----EPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYDDCLVNDGKP
        HRK+LL    T +     EP RI GEKC  +DIV+NQ  T P+P GIP Y VE+ N C++GC I  IH  CGWFSSA LINPRVFKR+HYDDCLVN+GKP
Subjt:  HRKLLLTREATIE-----EPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYDDCLVNDGKP

Query:  LVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC
        L +G TLSF YANT+PY LSV+ V C
Subjt:  LVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC

Q8S6P9 TPD1 protein homolog 1B3.5e-2342.45Show/hide
Query:  RIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSV
        R+  + C++ ++V+ Q     LP+GIPTY+VE++N C T C +Y +H  CG F+SA L++P  F+R+ ++DCLV  G  L     +SFQY+N++ YPL+V
Subjt:  RIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYDDCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSV

Query:  SSVVCK
        ++V C+
Subjt:  SSVVCK

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G05835.1 PHD finger protein3.0e-0638.89Show/hide
Query:  YTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYD--DCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPL
        + VEV+N C   C I  +  KC  F  + L++P   + L     +C+VNDG PL    TLSF Y+NT+ + L
Subjt:  YTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYD--DCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPL

AT1G32583.1 FUNCTIONS IN: molecular_function unknown1.2e-3957.78Show/hide
Query:  SFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYD
        SF+ +  N T  A  RKLLL+ +  I + T   G+ C+K DIV+ QG T PLP+G+P+YTVE+ N+CV+ C+I  IH  CGWFSS  L+NPRVF+RL YD
Subjt:  SFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYD

Query:  DCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC
        DCLVNDG+PL  G +LSFQYAN++ YPLSV+SV C
Subjt:  DCLVNDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC

AT4G24972.1 tapetum determinant 11.3e-4162.7Show/hide
Query:  HRKLLLTREATIE-----EPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYDDCLVNDGKP
        HRK+LL    T +     EP RI GEKC  +DIV+NQ  T P+P GIP Y VE+ N C++GC I  IH  CGWFSSA LINPRVFKR+HYDDCLVN+GKP
Subjt:  HRKLLLTREATIE-----EPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYDDCLVNDGKP

Query:  LVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC
        L +G TLSF YANT+PY LSV+ V C
Subjt:  LVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVC


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGACTCGAGTCCACCTAGTTTTCTTCGGCTGGGTTTGAACAGCACAATAGGTGCCCCTCATCGCAAGCTTCTCCTGACTAGAGAAGCAACAATTGAGGAACCAACCAG
AATTTGGGGTGAAAAGTGCACAAAATCAGACATAGTGATTAACCAAGGCCCCACAGCTCCACTTCCAACTGGTATCCCCACCTACACTGTTGAAGTGGTGAACGCTTGTG
TCACTGGTTGTGATATCTATGGAATTCACTTCAAATGCGGCTGGTTCAGCTCAGCGCACCTCATCAATCCCAGAGTCTTCAAGCGCCTTCATTACGACGACTGCCTCGTG
AATGACGGCAAGCCTCTTGTCTACGGCGGTACACTCTCTTTCCAGTATGCAAACACTTACCCTTACCCGCTTTCAGTCTCCTCAGTTGTCTGCAAACTGAAATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGACTCGAGTCCACCTAGTTTTCTTCGGCTGGGTTTGAACAGCACAATAGGTGCCCCTCATCGCAAGCTTCTCCTGACTAGAGAAGCAACAATTGAGGAACCAACCAG
AATTTGGGGTGAAAAGTGCACAAAATCAGACATAGTGATTAACCAAGGCCCCACAGCTCCACTTCCAACTGGTATCCCCACCTACACTGTTGAAGTGGTGAACGCTTGTG
TCACTGGTTGTGATATCTATGGAATTCACTTCAAATGCGGCTGGTTCAGCTCAGCGCACCTCATCAATCCCAGAGTCTTCAAGCGCCTTCATTACGACGACTGCCTCGTG
AATGACGGCAAGCCTCTTGTCTACGGCGGTACACTCTCTTTCCAGTATGCAAACACTTACCCTTACCCGCTTTCAGTCTCCTCAGTTGTCTGCAAACTGAAATGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MDSSPPSFLRLGLNSTIGAPHRKLLLTREATIEEPTRIWGEKCTKSDIVINQGPTAPLPTGIPTYTVEVVNACVTGCDIYGIHFKCGWFSSAHLINPRVFKRLHYDDCLV
NDGKPLVYGGTLSFQYANTYPYPLSVSSVVCKLK