CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh13G009380
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	serine/threonine-protein kinase fray2
Genome location	Cmo_Chr13:8220083..8226655
RNA-Seq Expression	CmoCh13G009380
Synteny	CmoCh13G009380
Gene Ontology terms	GO:0000380 - alternative mRNA splicing, via spliceosome (biological process) GO:0016310 - phosphorylation (biological process) GO:0005634 - nucleus (cellular component) GO:0005737 - cytoplasm (cellular component) GO:0016301 - kinase activity (molecular function)
InterPro domains	IPR010530 - NADH-ubiquinone reductase complex 1 MLRQ subunit IPR034604 - Serine/Arginine-related protein 53

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG6584244.1 hypothetical protein SDJN03_20176, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]

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KAG7019840.1 hypothetical protein SDJN02_18804 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

9.2e-141

91.34

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XP_022924149.1 serine/threonine-protein kinase fray2 [Cucurbita moschata]

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XP_023000850.1 serine/threonine-protein kinase fray2 [Cucurbita maxima]

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XP_023519444.1 serine/threonine-protein kinase fray2 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

7.8e-140

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TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LTD9 Uncharacterized protein

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        K  KV+R+KTE VDYSRLIEGYD MSPAERVKAKMKLQLAET                              AAEDDATLVKHIGQSFRFSAIEARKEEQ
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A0A1S3AV81 serine/threonine-protein kinase fray2

5.7e-120

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A0A5D3BJE5 Serine/threonine-protein kinase fray2

5.7e-120

78.41

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A0A6J1E8B9 serine/threonine-protein kinase fray2

2.8e-143

90.62

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        FGAPVGQLLSTTDNEVELENEKSKESCDGGVATNLLSEK +
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A0A6J1KJG1 serine/threonine-protein kinase fray2

1.1e-139

89.15

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        TESVDYSRLIEGYDKMSPAERVKAKMKLQLAET                              AAEDDATLVKHIGQSFRFSAIEARKEEQIKAAHDEAM
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Query:  FGAPVGQLLSTTDNEVELENEKSKESCDGGVATNLLSEKSV
        FGAPVGQLLSTTDNEVELE+EKSKESCDGGVATNLLSEK +
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SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT3G29970.1 B12D protein

8.9e-17

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        VYPL  A+G    +  FQL RN  +NP+ R+ KE+R  G+L+N  EGEKY +H  RK++R + P++MPS+N FF+
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AT3G48120.1 unknown protein

1.0e-44

46.49

Show/hide

Query:  MEESKAAAYYEELTRKGEGAARFKRGLGFSSSDSNTDVVSASKGSALPSSSSFLSSFVKASSPSKASEFEKQAQLEAIQNKLKKKKPSSPDVDERGPRAL
        MEE KAAAYY+ELTRKGEGAARFK+GLGFS+  +        +GSA+ SSSSFL+ FVKAS+ +K+++  K +++ +I++KLKKK           PR  
Subjt:  MEESKAAAYYEELTRKGEGAARFKRGLGFSSSDSNTDVVSASKGSALPSSSSFLSSFVKASSPSKASEFEKQAQLEAIQNKLKKKKPSSPDVDERGPRAL

Query:  ERDRRKSSPRRRSLSKERERHSHSRRRSTSRDRERHSRRRSRSRDRYGDKHRDKGRERSD--SDRDRRRRRSRSSSRERKRSDDNRSKGGEKQKDHKVDR
        ER  R+SS RRR  S+ER+    S RR     R R S RRS   DR   + R +  ER +   DR+ RRR +RS S   +R  + RS+   K+K      
Subjt:  ERDRRKSSPRRRSLSKERERHSHSRRRSTSRDRERHSRRRSRSRDRYGDKHRDKGRERSD--SDRDRRRRRSRSSSRERKRSDDNRSKGGEKQKDHKVDR

Query:  RKTESVDYSRLIEGYDKMSPAERVKAKMKLQLAETA-----------------------------AEDDATLVKHIGQSFRFSAIEARKEEQIKAAHDEA
              DYSRLI+GYD+MS AE+VKAKMKLQL ETA                             A+DDA LVK +GQS+RFSAIEA++EEQ+KAAHDEA
Subjt:  RKTESVDYSRLIEGYDKMSPAERVKAKMKLQLAETA-----------------------------AEDDATLVKHIGQSFRFSAIEARKEEQIKAAHDEA

Query:  MFGAPVGQ--LLSTTDNEVELENEKSKESCDGGVATNLLSEK
        MFG P GQ    +T D+  E+ N K  E      A +LLSEK
Subjt:  MFGAPVGQ--LLSTTDNEVELENEKSKESCDGGVATNLLSEK

AT3G48140.1 B12D protein

1.9e-30

79.49

Show/hide

Query:  VYPLFAAVGVAVGICGFQLVRNICINPEVRVTKENRAAGVLDNFAEGEKYTEHFLRKFVRNKSPEIMPSINNFFTDPS
        VYPLFAA GVAVGIC F L+RNI  NPEVR TKENRAAG+LDN AEGEKY E+FLRKFVRNK PEIMP +N FFTDP+
Subjt:  VYPLFAAVGVAVGICGFQLVRNICINPEVRVTKENRAAGVLDNFAEGEKYTEHFLRKFVRNKSPEIMPSINNFFTDPS

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGAGGAATCGAAAGCGGCGGCGTACTACGAGGAGCTCACTCGTAAAGGAGAAGGAGCGGCAAGGTTCAAACGAGGCCTTGGTTTTTCCTCCTCCGACTCCAATACTGA
TGTGGTCTCCGCGTCCAAGGGATCCGCTCTGCCTTCGTCGTCGTCCTTTCTCAGTTCTTTTGTTAAAGCCTCAAGCCCTTCCAAGGCCTCCGAGTTTGAAAAGCAAGCGC
AGCTCGAGGCCATTCAGAACAAGCTCAAGAAGAAGAAACCAAGCTCTCCCGATGTGGATGAGAGAGGCCCTAGGGCTTTGGAGAGAGATCGTCGGAAATCGAGCCCTAGA
CGAAGGTCTTTGAGTAAAGAGAGGGAGAGACATTCGCATTCGAGGAGGCGGAGTACGAGTAGAGATAGGGAGAGACATTCAAGGCGGCGAAGTAGAAGCCGAGATAGGTA
CGGGGATAAGCATAGGGATAAGGGTAGGGAGAGGAGTGATTCAGACAGGGACAGACGTCGTCGACGGAGTAGAAGCTCGTCGCGAGAGAGGAAGAGATCGGACGACAATA
GAAGTAAGGGAGGGGAAAAACAGAAAGACCATAAAGTTGATAGAAGGAAGACTGAAAGTGTTGATTATTCAAGATTAATCGAAGGATATGACAAGATGTCTCCAGCTGAA
AGAGTCAAAGCAAAGATGAAACTACAACTTGCTGAAACTGCTGCAGAAGATGATGCAACATTAGTAAAGCATATTGGACAAAGCTTTCGATTCTCCGCTATTGAGGCTAG
AAAAGAAGAGCAAATCAAAGCTGCTCACGACGAGGCGATGTTTGGAGCACCAGTGGGACAACTATTAAGTACAACCGATAACGAGGTCGAGCTGGAGAACGAAAAGTCGA
AGGAATCATGTGATGGCGGTGTGGCAACAAATCTATTGAGTGAGAAGTCGGTAAGAACTACACCAAGGAACTGCAATGGCCATCTTGATTCACCAATTTCTTCACTCGCA
ATGGGTCTTTGGCTCCTGATAATTACAGACACCCAGAACATCAGTATCAAGTCTGCCCGTATCCAACGTTGGAAAAGTGTACTTTTTGTAGTTTACCCACTTTTCGCGGC
GGTAGGAGTGGCCGTCGGAATCTGCGGGTTTCAGTTAGTCCGTAACATCTGCATCAATCCTGAAGTCAGAGTGACCAAGGAGAATAGAGCCGCTGGAGTCCTGGATAACT
TTGCTGAGGGAGAGAAGTATACCGAGCATTTCCTGAGGAAATTCGTGCGCAACAAGTCACCAGAAATTATGCCGTCAATCAACAACTTCTTCACAGACCCAAGTCGAAAC
TAA

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CmoCh13G009380 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome