CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh13G011150
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	Unknown protein
Genome location	Cmo_Chr13:9115489..9115869
RNA-Seq Expression	CmoCh13G011150
Synteny	CmoCh13G011150
Gene Ontology terms	NA
InterPro domains	NA

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

KAG7019990.1 Transcription factor TCP5, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]

6.4e-63

99.18

Show/hide

Query:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGG
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGG
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGG

XP_022923781.1 uncharacterized protein LOC111431390, partial [Cucurbita moschata]

4.8e-66

100

Show/hide

Query:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK

XP_023001049.1 uncharacterized protein LOC111495303 [Cucurbita maxima]

1.2e-64

97.62

Show/hide

Query:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPA+TKEKAIVPTSNPETVFDIKYY+RDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK

XP_023520186.1 uncharacterized protein LOC111783486 [Cucurbita pepo subsp. pepo]

3.4e-64

96.83

Show/hide

Query:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYR+ CPA+TKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK

XP_038895860.1 uncharacterized protein LOC120084028 [Benincasa hispida]

1.7e-63

95.24

Show/hide

Query:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSS FQTLKRY KKPWEITGPCADPEY+LAVPSA+EYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKET+FD
Subjt:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A1S3BR63 uncharacterized protein LOC103492624

2.2e-61

92.06

Show/hide

Query:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKA+SS  QTL+RYIKKPWEITGPCADPEY+ AVPSA+EYRV CPAT KEKAI+PTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK

A0A5D3BI32 Uncharacterized protein

2.2e-61

92.06

Show/hide

Query:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKA+SS  QTL+RYIKKPWEITGPCADPEY+ AVPSA+EYRV CPAT KEKAI+PTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK

A0A6J1E7N6 uncharacterized protein LOC111431390

2.3e-66

100

Show/hide

Query:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK

A0A6J1GSY9 uncharacterized protein LOC111456682

1.9e-60

89.68

Show/hide

Query:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSS FQTLKR+IKKPWEITGPCADPEY+ AVPSA+EYRVFCPATTK+K IVPTSNP+TVFDIKYY+RDQRRNRPPIRR ILKKPD+E+MMKETKFD
Subjt:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK

A0A6J1KK07 uncharacterized protein LOC111495303

5.7e-65

97.62

Show/hide

Query:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
        MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPA+TKEKAIVPTSNPETVFDIKYY+RDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD
Subjt:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFD

Query:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
        PADFPKVYLTAAIEED+NARGGGYQK
Subjt:  PADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK

SwissProt top hits	e value	%identity	Alignment
No hits found

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT5G08060.1 unknown protein

2.7e-43

64.57

Show/hide

Query:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETK-F
        ++ A+SS  Q L+RYIKKPW+ITGPCA PEY  AVP A EYR+ CPAT  E+AIVP+S+PETV++I Y+ RDQRRNRPPIRR +L K +V +MM E K F
Subjt:  MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETK-F

Query:  DPADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK
        D +DFPKVYLT  +EED++ RGGGY+K
Subjt:  DPADFPKVYLTAAIEEDMNARGGGYQK

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGGCCAAAGCTTCTTCCTCCTTCTTCCAAACCCTAAAGCGCTACATCAAGAAGCCTTGGGAGATCACCGGCCCGTGTGCAGATCCAGAGTACAAATTGGCCGTC
CCGAGTGCCATAGAGTACAGGGTCTTTTGCCCCGCCACTACGAAGGAGAAAGCGATTGTCCCTACCTCCAATCCCGAGACCGTCTTTGATATTAAGTATTACACC
CGCGACCAGCGTCGCAATCGCCCTCCAATTCGACGCACCATCCTCAAGAAACCTGACGTCGAGAAGATGATGAAGGAGACCAAGTTCGACCCTGCTGACTTCCCC
AAAGTCTATCTGACTGCCGCGATCGAGGAGGATATGAATGCCCGTGGAGGTGGTTATCAAAAGTAG

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MAKASSSFFQTLKRYIKKPWEITGPCADPEYKLAVPSAIEYRVFCPATTKEKAIVPTSNPETVFDIKYYTRDQRRNRPPIRRTILKKPDVEKMMKETKFDPADFP
KVYLTAAIEEDMNARGGGYQK

CmoCh13G011150 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome