; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh13G011870 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh13G011870
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionCLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 45
Genome locationCmo_Chr13:9416813..9418281
RNA-Seq ExpressionCmoCh13G011870
SyntenyCmoCh13G011870
Gene Ontology termsNA
InterPro domainsIPR038821 - CLE-related protein 45-like


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAA0036085.1 CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 45 [Cucumis melo var. makuwa]1.6e-3086.49Show/hide
Query:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
        PEGT+GL+NIDLALRWDK  IPIF+SFKFVK+ASVEDDWG  LAFAPAPSTG DPT+LNKRRIRRGSDPIHNKC
Subjt:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC

KAG6584463.1 hypothetical protein SDJN03_20395, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.8e-3598.65Show/hide
Query:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
        PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAP TGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
Subjt:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC

KAG6607448.1 E3 ubiquitin-protein ligase MARCHF9, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]8.3e-2479.45Show/hide
Query:  EGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
        +GT+GL+NI LALRWDKL IPI NSFK VK     DDW  TLAFAPAPS GFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
Subjt:  EGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC

KAG7037105.1 hypothetical protein SDJN02_00726, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]8.3e-2479.45Show/hide
Query:  EGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
        +GT+GL+NI LALRWDKL IPI NSFK VK     DDW  TLAFAPAPS GFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
Subjt:  EGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC

KGN64003.1 hypothetical protein Csa_013092 [Cucumis sativus]2.4e-3186.49Show/hide
Query:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
        PEGT+GL+NIDLALRWDK  IPIFNSFKFVK+ SVEDDWGR LAFAPAPSTG DPT+LNKRR+RRGSDPIHNKC
Subjt:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LQI0 Uncharacterized protein1.2e-3186.49Show/hide
Query:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
        PEGT+GL+NIDLALRWDK  IPIFNSFKFVK+ SVEDDWGR LAFAPAPSTG DPT+LNKRR+RRGSDPIHNKC
Subjt:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC

A0A2P6P2N1 Uncharacterized protein6.5e-1454.05Show/hide
Query:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
        PE  SGL ++DLALRWDK      NS   VK  +VED   + L+ APAP+  FDP++ NKR +R+GSDPIHN+C
Subjt:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC

A0A5D3BHX9 CLAVATA3/ESR (CLE)-related protein 457.6e-3186.49Show/hide
Query:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
        PEGT+GL+NIDLALRWDK  IPIF+SFKFVK+ASVEDDWG  LAFAPAPSTG DPT+LNKRRIRRGSDPIHNKC
Subjt:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC

M5WYZ5 Uncharacterized protein8.4e-1454.05Show/hide
Query:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
        PE  SGL ++DLALRWDK  +    S   VK  +VED   + L+ APAPS  FDP + NKR++R+GSDPIHN+C
Subjt:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC

W9QNR1 Uncharacterized protein2.9e-1454.05Show/hide
Query:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC
        P+  S L + DLALRWDK ++P      F K  ++E D  R L  APAPS  FDP + NKRR+RRGSDPIHN+C
Subjt:  PEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC

SwissProt top hitse value%identityAlignment
No hits found
Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
No hits found

Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGTTAATTCAGAGCCTCCAGAAGGAACCAGTGGGCTGAGCAACATCGATCTAGCACTCAGATGGGATAAGCTACGTATTCCCATTTTCAATAGCTTCAAGTTTGTGAA
GGAGGCATCCGTTGAGGACGATTGGGGGAGAACACTGGCTTTTGCACCAGCACCTTCGACGGGTTTCGATCCAACCCGATTGAATAAAAGAAGGATTCGAAGGGGATCTG
ATCCCATTCACAACAAATGCTGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGTTAATTCAGAGCCTCCAGAAGGAACCAGTGGGCTGAGCAACATCGATCTAGCACTCAGATGGGATAAGCTACGTATTCCCATTTTCAATAGCTTCAAGTTTGTGAA
GGAGGCATCCGTTGAGGACGATTGGGGGAGAACACTGGCTTTTGCACCAGCACCTTCGACGGGTTTCGATCCAACCCGATTGAATAAAAGAAGGATTCGAAGGGGATCTG
ATCCCATTCACAACAAATGCTGA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MVNSEPPEGTSGLSNIDLALRWDKLRIPIFNSFKFVKEASVEDDWGRTLAFAPAPSTGFDPTRLNKRRIRRGSDPIHNKC