; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh14G001950 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh14G001950
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Descriptiont-SNARE coiled-coil homology domain-containing protein
Genome locationCmo_Chr14:879672..881721
RNA-Seq ExpressionCmoCh14G001950
SyntenyCmoCh14G001950
Gene Ontology termsGO:0006886 - intracellular protein transport (biological process)
GO:0006906 - vesicle fusion (biological process)
GO:0048278 - vesicle docking (biological process)
GO:0012505 - endomembrane system (cellular component)
GO:0016021 - integral component of membrane (cellular component)
GO:0031201 - SNARE complex (cellular component)
GO:0000149 - SNARE binding (molecular function)
GO:0005484 - SNAP receptor activity (molecular function)
InterPro domainsIPR000727 - Target SNARE coiled-coil homology domain
IPR006012 - Syntaxin/epimorphin, conserved site


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6580598.1 Syntaxin-71, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.1e-13298.85Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLY TVEADIE ALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKN GWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

KAG7017354.1 Syntaxin-71 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]2.5e-13093.8Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLY TVEADIE ALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKR+KGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQ--------------LRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQ              LRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQ--------------LRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

XP_022935683.1 syntaxin-71-like [Cucurbita moschata]1.0e-134100Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

XP_022983599.1 syntaxin-71 [Cucurbita maxima]6.1e-13298.08Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARL+ TVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEE+PKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT SSSKKNGGW SSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

XP_023526249.1 syntaxin-71-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]8.5e-13499.62Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLY TVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A1S3CFA3 syntaxin-71-like7.5e-12894.62Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLY TVEADIEAALQKAEDAS+EKNRASVVALNAEIR TKARLLE++PKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT +++K NGGW SS SR EIKFDSDGRFD+EYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

A0A5A7TS26 Syntaxin-713.4e-12893.87Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYD+EKQRDLNVSGDDAFARLY TVEADIEAALQKAEDAS+EKNRASVVALNAEIR TKARLLEE+PKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT +++K NGGW SS SR EIKFDSDGRFD+EYFQHTE+SSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYK
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYK
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYK

A0A6J1FB72 syntaxin-71-like4.8e-135100Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

A0A6J1FSW5 syntaxin-71-like1.3e-12795Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLY TVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIR TKARLLEEIPKLQRLA+KRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALP+RIQAIPDGT +S+KKNGGW SS SR EIKFDSDGRFD+EYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL+ TVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

A0A6J1J7V9 syntaxin-712.9e-13298.08Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARL+ TVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEE+PKLQRLAVKRVKGLST
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
        EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT SSSKKNGGW SSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEE

Query:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
Subjt:  IDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q54IX6 Probable syntaxin-8B2.0e-0525Show/hide
Query:  DAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALN--AEIRHTKARLLEEIPKLQ-RLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKK
        D   +L +++ ADI+      E + +++N   +V  N  A++R+    +  EI +LQ  L     + +  ++L  R + V +L      I      +S  
Subjt:  DAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALN--AEIRHTKARLLEEIPKLQ-RLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKK

Query:  NGGWNSSTSRAEIKFDSDG---RFDNEYF---QHTEESSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDK
        +   N+++ + E+  +++G    + N  F   + TE + QF        Q++ MR  +QD+ LD++S+ +   KNMAH M+ E+D+   ++D+++   D 
Subjt:  NGGWNSSTSRAEIKFDSDG---RFDNEYF---QHTEESSQF-------RQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDK

Query:  AASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIIL
         +  L+N N R+ +T+ Q   S    + I++L I++
Subjt:  AASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIIL

Q94KK5 Syntaxin-731.0e-8968.06Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF+RLY  VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIR TKARLLE IPKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFD---SDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+   SS+   GGW +STS + I+FD   SD R  +EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFD---SDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRL+DTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++Y
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

Q94KK6 Syntaxin-725.8e-8563.12Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M VID++ RVD IC+KYDKYD++K R++  SGDDAF+RL+ ++++DIEA L+KAE AS EKNRA+ VA+NAE+R TKARL E++ KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKK-NGGW-NSSTSRAEIKFD-SDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG    +K+ N  W  +S     IKFD S+   D+ +FQ +EESSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKK-NGGW-NSSTSRAEIKFD-SDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTNVRL+  + Q+RSSRNFCIDIILLC+ILGI +Y+Y
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

Q9SF29 Syntaxin-713.1e-10777.1Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYDV+KQR+ N+SGDDAFARLY   E  IE AL+KAE  ++EKNRA+ VA+NAEIR TKARL EE+PKLQRLAVKRVKGL+T
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGW--NSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K    W  +S+TSR +IKFDSDGRFD++YFQ + ESSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGW--NSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAAYLY
Subjt:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G13890.1 soluble N-ethylmaleimide-sensitive factor adaptor protein 306.7e-0427.18Show/hide
Query:  TVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLL-------EEIPKLQRLAVKRVKGLST-EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT----TSSSK
        T E   + A+ KAE+ ++  N    +A   +IR   AR L       E+I +   +AV   K LS  E L      + + P + +   + T    T    
Subjt:  TVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLL-------EEIPKLQRLAVKRVKGLST-EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGT----TSSSK

Query:  KNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL
             N    R ++   + GR  ++     ++ +   Q+ E  K KQD GL  +S+ L  LK+MA DM  EID+Q   +D +   VD+  S ++  N R 
Subjt:  KNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRL

Query:  RDTVNQ
        R  +++
Subjt:  RDTVNQ

AT3G09740.1 syntaxin of plants 712.2e-10877.1Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M+VID+LTRVD+IC+KYDKYDV+KQR+ N+SGDDAFARLY   E  IE AL+KAE  ++EKNRA+ VA+NAEIR TKARL EE+PKLQRLAVKRVKGL+T
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGW--NSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN
        E+L  RNDLVLALP RI+AIPDGT    K    W  +S+TSR +IKFDSDGRFD++YFQ + ESSQFRQEYEMRK+KQ+QGLDMISEGLD LKNMA DMN
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGW--NSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMN

Query:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        EE+DRQVPLMDEIDTKVD+A SDLKNTNVRL+DTVNQLRSSRNFCIDI+LLCI+LGIAAYLY
Subjt:  EEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

AT3G45280.1 syntaxin of plants 724.1e-8663.12Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M VID++ RVD IC+KYDKYD++K R++  SGDDAF+RL+ ++++DIEA L+KAE AS EKNRA+ VA+NAE+R TKARL E++ KLQ+LAVK++KGL+ 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKK-NGGW-NSSTSRAEIKFD-SDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+  +R DLV+AL DR+QAIPDG    +K+ N  W  +S     IKFD S+   D+ +FQ +EESSQFRQEYEMR+ KQD+GLD+ISEGLD LKN+A DM
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKK-NGGW-NSSTSRAEIKFD-SDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        NEE+D+QVPLM+E++TKVD A SDLKNTNVRL+  + Q+RSSRNFCIDIILLC+ILGI +Y+Y
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

AT3G61450.1 syntaxin of plants 737.2e-9168.06Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF+RLY  VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIR TKARLLE IPKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFD---SDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+   SS+   GGW +STS + I+FD   SD R  +EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQ + LD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFD---SDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRL+DTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++Y
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY

AT3G61450.2 syntaxin of plants 732.4e-9469.2Show/hide
Query:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST
        M VIDL+TRVD+IC+KY+KYD+ +QRD NVSGDDAF+RLY  VE  +E  LQK ED S E N+A  VA+NAEIR TKARLLE IPKLQRL++K+VKGLS 
Subjt:  MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLST

Query:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFD---SDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM
        E+L  RNDLVL+L D+I+AIP+   SS+   GGW +STS + I+FD   SD R  +EYFQ T ES QF+QEYEM+++KQDQGLD I+EGLDTLKNMA D+
Subjt:  EDLTTRNDLVLALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFD---SDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDM

Query:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY
        NEE+DRQ PLMDEIDTK+DKAA+DLK+TNVRL+DTV +LRSSRNFCIDIILLCI+LGIAA++Y
Subjt:  NEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAASDLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLY


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGAGTGTGATCGACCTTTTGACCAGAGTAGACGCGATCTGCCAGAAGTACGACAAATATGATGTAGAGAAGCAGAGAGATCTCAATGTCTCTGGTGACGATGCTTTCGC
TCGACTCTATGACACCGTCGAAGCCGACATTGAAGCCGCTCTCCAGAAAGCGGAGGATGCTTCCAGAGAGAAGAATAGGGCATCGGTTGTGGCGTTGAATGCGGAGATTC
GTCATACCAAGGCTCGATTACTAGAGGAGATCCCCAAGTTGCAGAGATTAGCTGTAAAGAGGGTTAAAGGACTATCAACTGAAGATCTTACCACTAGAAATGATTTGGTG
CTTGCATTGCCGGATAGGATTCAAGCTATACCAGATGGAACTACTTCTTCCTCAAAGAAGAATGGGGGTTGGAACTCCTCAACTTCACGTGCTGAAATCAAATTTGACTC
GGATGGGCGATTTGATAATGAGTACTTCCAACACACTGAGGAGTCGAGTCAATTCAGACAAGAGTATGAAATGCGGAAAATGAAGCAGGATCAAGGATTAGACATGATAT
CAGAGGGGTTGGATACTCTGAAGAACATGGCGCATGATATGAATGAGGAAATAGACAGGCAAGTTCCTTTGATGGACGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTGCATCT
GACCTTAAGAACACCAACGTTAGATTAAGGGACACAGTTAACCAGCTAAGGTCCAGCAGAAATTTCTGCATTGATATCATTTTGTTGTGTATAATCTTGGGTATTGCTGC
CTATTTATACAAGTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
GTTTTATTTGTTTGTTTGTTTTGTGAGAATATAGTCGTAATTTTATCATAAATTTAAAGCTTTTAAACTGAAAGTTTGCCTCGGTGAGTAGAACAATCAGCGGGAATTTT
GTTCAATCAGCGGCGGTACTGGCACTGGCGCACAACTTTTGTAGATATTCGGAACCGCGTTCACCGTTGAAGCTCACCGGAAACCCTATCGAAGCACGGAGGCGAATAAT
CGAAGATGAGTGTGATCGACCTTTTGACCAGAGTAGACGCGATCTGCCAGAAGTACGACAAATATGATGTAGAGAAGCAGAGAGATCTCAATGTCTCTGGTGACGATGCT
TTCGCTCGACTCTATGACACCGTCGAAGCCGACATTGAAGCCGCTCTCCAGAAAGCGGAGGATGCTTCCAGAGAGAAGAATAGGGCATCGGTTGTGGCGTTGAATGCGGA
GATTCGTCATACCAAGGCTCGATTACTAGAGGAGATCCCCAAGTTGCAGAGATTAGCTGTAAAGAGGGTTAAAGGACTATCAACTGAAGATCTTACCACTAGAAATGATT
TGGTGCTTGCATTGCCGGATAGGATTCAAGCTATACCAGATGGAACTACTTCTTCCTCAAAGAAGAATGGGGGTTGGAACTCCTCAACTTCACGTGCTGAAATCAAATTT
GACTCGGATGGGCGATTTGATAATGAGTACTTCCAACACACTGAGGAGTCGAGTCAATTCAGACAAGAGTATGAAATGCGGAAAATGAAGCAGGATCAAGGATTAGACAT
GATATCAGAGGGGTTGGATACTCTGAAGAACATGGCGCATGATATGAATGAGGAAATAGACAGGCAAGTTCCTTTGATGGACGAGATTGACACTAAGGTGGACAAGGCTG
CATCTGACCTTAAGAACACCAACGTTAGATTAAGGGACACAGTTAACCAGCTAAGGTCCAGCAGAAATTTCTGCATTGATATCATTTTGTTGTGTATAATCTTGGGTATT
GCTGCCTATTTATACAAGTAA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MSVIDLLTRVDAICQKYDKYDVEKQRDLNVSGDDAFARLYDTVEADIEAALQKAEDASREKNRASVVALNAEIRHTKARLLEEIPKLQRLAVKRVKGLSTEDLTTRNDLV
LALPDRIQAIPDGTTSSSKKNGGWNSSTSRAEIKFDSDGRFDNEYFQHTEESSQFRQEYEMRKMKQDQGLDMISEGLDTLKNMAHDMNEEIDRQVPLMDEIDTKVDKAAS
DLKNTNVRLRDTVNQLRSSRNFCIDIILLCIILGIAAYLYK