CuGenDBv2

Gene ID	CmoCh14G002010
Organism	Cucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
Description	60S ribosomal protein L12-like
Genome location	Cmo_Chr14:908732..909232
RNA-Seq Expression	CmoCh14G002010
Synteny	CmoCh14G002010
Gene Ontology terms	GO:0006412 - translation (biological process) GO:0022625 - cytosolic large ribosomal subunit (cellular component) GO:0003735 - structural constituent of ribosome (molecular function) GO:0070180 - large ribosomal subunit rRNA binding (molecular function)
InterPro domains	IPR000911 - Ribosomal protein L11/L12 IPR020783 - Ribosomal protein L11, C-terminal IPR020784 - Ribosomal protein L11, N-terminal IPR020785 - Ribosomal protein L11, conserved site IPR036769 - Ribosomal protein L11, C-terminal domain superfamily IPR036796 - Ribosomal protein L11/L12, N-terminal domain superfamily

Homology

Show/hide homology

GenBank top hits

e value

%identity

Alignment

XP_022935531.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Cucurbita moschata]

3.9e-84

100

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_022950157.1 60S ribosomal protein L12-3 [Cucurbita moschata]

1.1e-83

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_023528339.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]

4.3e-83

99.4

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSV CTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_038883892.1 60S ribosomal protein L12-1-like [Benincasa hispida]

8.7e-84

99.4

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

XP_038900338.1 60S ribosomal protein L12-3 [Benincasa hispida]

3.3e-83

98.19

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIA++MRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI DGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

TrEMBL top hits

e value

%identity

Alignment

A0A0A0LAX8 Uncharacterized protein

2.7e-83

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQVV+VFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A6J1F4X7 60S ribosomal protein L12-1-like

1.9e-84

100

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A6J1GE12 60S ribosomal protein L12-3

5.5e-84

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A6J1J2K8 60S ribosomal protein L12-1-like

1.9e-84

100

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

A0A6J1KW77 60S ribosomal protein L12-3

5.5e-84

98.8

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVE+PQD
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

SwissProt top hits

e value

%identity

Alignment

O50003 60S ribosomal protein L12

1.8e-79

90.96

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDPSQVVDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETA +WKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        H+G+ISLDDVIEIA++M+ RSMAK+L+G+VKEIL TCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI+DGDVEIP D
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

P0CT83 60S ribosomal protein L12-A

1.6e-64

72.89

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPKFDP++V  +F+R  GGEV   S+LAPKIGPLGLSPKK+GEDIAK T K+WKGLRVTVKLT+QNRQA VSVVPSA+ALVIKALKEP RDRKK KN+ 
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        H+GN+SLD++IE+AR MR +S+AK+LSG+VKEILGT  SVGCTVDGK+P D+Q+EI +G++EIPQ+
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

P50883 60S ribosomal protein L12-1

1.0e-79

89.16

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Q9FF52 60S ribosomal protein L12-3

1.8e-79

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI+ GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Q9LFH5 60S ribosomal protein L12-2

2.3e-79

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Arabidopsis top hits

e value

%identity

Alignment

AT2G37190.1 Ribosomal protein L11 family protein

7.4e-81

89.16

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKD+QQEI DG+VEIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

AT3G53430.1 Ribosomal protein L11 family protein

1.6e-80

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDV EIAR+MRPRS+AK+LSG+V+EILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEI +G++EIP++
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

AT5G60670.1 Ribosomal protein L11 family protein

1.3e-80

88.55

Show/hide

Query:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK
        MPPK DPSQ+VDV+VRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGL+PKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKV+VVPSAAALVIKALKEPERDRKK KNIK
Subjt:  MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIK

Query:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD
        HNGNIS DDVIEIA++MRPRS+AK+LSG+VKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQ+EI+ GD++IP +
Subjt:  HNGNISLDDVIEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

Sequences

Show/hide sequences

CDS sequence

Show/hide CDS sequence

ATGCCGCCGAAGTTCGACCCAAGTCAGGTGGTTGATGTGTTTGTTCGTGTGACTGGAGGTGAGGTCGGAGCTGCTAGTTCTCTGGCTCCGAAGATCGGTCCTCTTGGTCT
TTCCCCTAAGAAGATCGGAGAAGACATTGCTAAAGAGACCGCCAAGGAATGGAAAGGTCTTAGGGTTACTGTAAAGCTCACCGTCCAAAATCGTCAGGCGAAGGTCTCCG
TTGTGCCTTCTGCGGCGGCTTTGGTAATTAAGGCCTTGAAGGAGCCGGAGCGTGACAGGAAGAAGACTAAGAACATCAAGCACAATGGAAACATTTCTCTTGATGATGTG
ATTGAGATTGCTAGGGTTATGCGGCCCAGATCGATGGCTAAGGACCTCTCAGGTAGTGTCAAAGAGATCCTTGGTACTTGCGTCTCTGTTGGTTGTACTGTTGATGGCAA
GGACCCTAAGGATCTTCAACAGGAAATTTCTGACGGCGACGTTGAAATCCCCCAAGATTGA

mRNA sequence

Show/hide mRNA sequence

Protein sequence

Show/hide protein sequence

MPPKFDPSQVVDVFVRVTGGEVGAASSLAPKIGPLGLSPKKIGEDIAKETAKEWKGLRVTVKLTVQNRQAKVSVVPSAAALVIKALKEPERDRKKTKNIKHNGNISLDDV
IEIARVMRPRSMAKDLSGSVKEILGTCVSVGCTVDGKDPKDLQQEISDGDVEIPQD

CmoCh14G002010 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome