; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh14G002480 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh14G002480
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionF-box protein PP2-A15
Genome locationCmo_Chr14:1142921..1146021
RNA-Seq ExpressionCmoCh14G002480
SyntenyCmoCh14G002480
Gene Ontology termsGO:0005515 - protein binding (molecular function)
InterPro domainsIPR001810 - F-box domain
IPR025886 - Phloem protein 2-like
IPR036047 - F-box-like domain superfamily


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG7017409.1 F-box protein PP2-A15 [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]4.7e-18499.67Show/hide
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A0A6J1J6M4 F-box protein PP2-A15-like isoform X23.3e-16792.88Show/hide
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Q9CAN4 F-box protein PP2-A114.4e-7647.93Show/hide
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Q9FJ80 F-box protein PP2-A141.5e-7145.67Show/hide
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Q9LEX0 F-box protein PP2-A136.2e-7850.71Show/hide
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Q9LF92 F-box protein PP2-A159.8e-12467.64Show/hide
Query:  MGAFLSYLAEVANGSTNDPGLGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLLDLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFD
        MG+ LS L +  NG    PGLGDIPESCVACVF+YLTPP+ICNLA LNR+FRGAASSDSVW+ KLP NYQDLLDLLPP+RY +LSKKDI+A+LSRP+PFD
Subjt:  MGAFLSYLAEVANGSTNDPGLGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLLDLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFD

Query:  DGNKEVWLDRITGKICMSISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRF
        D NKEVW+DR+TG++CM+ISA+ MSITGI+DRRYWNWI TEES                 RF+VVAYLQQIWWFEVDG V+F  P  +Y+L+FR+HLGRF
Subjt:  DGNKEVWLDRITGKICMSISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRF

Query:  YKRLGRRGCSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNESVSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIV
         KRLGRR C FE THGWD+KPVRF +STSDGQ+A+ E+ LD+    +    HKRG WIEY+VGEF VN S  +TEI++SMKQIDCTHSKGG+CVDSVFI 
Subjt:  YKRLGRRGCSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNESVSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIV

Query:  P-SNLKERK
        P  ++KE K
Subjt:  P-SNLKERK

Q9LN77 F-box protein PP2-A124.6e-8151.03Show/hide
Query:  PGLGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLLDLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDRITGKICMS
        PGLGD+PE+CVA +   L P +IC  ++LNRAFRGA+ +D VW+SKLP NY+D+L+ +     +NL K+ +YA LSR   FDD  K+VW+D+ T  +C+S
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Query:  ISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRGCSFEHTHGWD
        ISAK +SITGIDDRRYW+ I T+ES                 RF+ VAYLQQIWWFEVDG + FPFP   Y++ FRL LGR  K  GRR C+ E  HGWD
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Query:  VKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNES-VSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIVPSNLKER
        +KPVRF++ T DGQ ++ +  L E           RG WI Y  G+  V ES  S+T+I+FSM QIDCTH+KGG+ +DSV + PS+ K++
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Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G12710.1 phloem protein 2-A123.3e-8251.03Show/hide
Query:  PGLGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLLDLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDRITGKICMS
        PGLGD+PE+CVA +   L P +IC  ++LNRAFRGA+ +D VW+SKLP NY+D+L+ +     +NL K+ +YA LSR   FDD  K+VW+D+ T  +C+S
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Query:  ISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRGCSFEHTHGWD
        ISAK +SITGIDDRRYW+ I T+ES                 RF+ VAYLQQIWWFEVDG + FPFP   Y++ FRL LGR  K  GRR C+ E  HGWD
Subjt:  ISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRGCSFEHTHGWD

Query:  VKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNES-VSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIVPSNLKER
        +KPVRF++ T DGQ ++ +  L E           RG WI Y  G+  V ES  S+T+I+FSM QIDCTH+KGG+ +DSV + PS+ K++
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AT1G63090.1 phloem protein 2-A113.2e-7747.93Show/hide
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        PGLGD+PESCVA +   L P +IC  ++LN AF GA+ +D VW+SKLP +Y+ +L+ +      NL K+DI+  LSR   FD+GNK+ W+D+ TG +C+ 
Subjt:  PGLGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLLDLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDRITGKICMS

Query:  ISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRGCSFEHTHGWD
         SAK +SITGIDDRRYW+ I ++                 D RF  VAY+QQIWWF+VDG + FPFPA  Y++ FRL LG+  KR G +    E  HGW+
Subjt:  ISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRGCSFEHTHGWD

Query:  VKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNES-VSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIVPSNLKER
        +KPVRF++ST DGQ ++ +  L E            G W  Y  G+F V +S  S+T+I+FSM QIDCTH+KGG+CVDSV + PS+ K+R
Subjt:  VKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNES-VSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIVPSNLKER

AT3G53000.1 phloem protein 2-A156.9e-12567.64Show/hide
Query:  MGAFLSYLAEVANGSTNDPGLGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLLDLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFD
        MG+ LS L +  NG    PGLGDIPESCVACVF+YLTPP+ICNLA LNR+FRGAASSDSVW+ KLP NYQDLLDLLPP+RY +LSKKDI+A+LSRP+PFD
Subjt:  MGAFLSYLAEVANGSTNDPGLGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLLDLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFD

Query:  DGNKEVWLDRITGKICMSISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRF
        D NKEVW+DR+TG++CM+ISA+ MSITGI+DRRYWNWI TEES                 RF+VVAYLQQIWWFEVDG V+F  P  +Y+L+FR+HLGRF
Subjt:  DGNKEVWLDRITGKICMSISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRF

Query:  YKRLGRRGCSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNESVSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIV
         KRLGRR C FE THGWD+KPVRF +STSDGQ+A+ E+ LD+    +    HKRG WIEY+VGEF VN S  +TEI++SMKQIDCTHSKGG+CVDSVFI 
Subjt:  YKRLGRRGCSFEHTHGWDVKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNESVSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIV

Query:  P-SNLKERK
        P  ++KE K
Subjt:  P-SNLKERK

AT3G61060.1 phloem protein 2-A134.4e-7950.71Show/hide
Query:  LGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLL-DLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDRITGKICMSI
        L D+PE+CVA +   L PP+IC LARLNR FR A+S+D +W+SKLP+NY+ +   +        L KKD+YA LS+P  FDDG KE+W+D+ TG++C+SI
Subjt:  LGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLL-DLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDRITGKICMSI

Query:  SAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRGCSFEHTHGWDV
        S+KA+ ITGIDDRRYW+ I T+ES                 RF   AY+QQIWWFEV G  +  FP+  Y+L FR+ LG+  KRLGRR C+ EH HGWD+
Subjt:  SAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRGCSFEHTHGWDV

Query:  KPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNESVSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIVP
        KPVRF+++TSD QQA     L+ N           G W  Y VG+F V     +T I+FSM QIDCTH+KGG+C+DSV I+P
Subjt:  KPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNESVSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIVP

AT3G61060.2 phloem protein 2-A131.1e-7750.53Show/hide
Query:  LGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLL-DLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNK-EVWLDRITGKICMS
        L D+PE+CVA +   L PP+IC LARLNR FR A+S+D +W+SKLP+NY+ +   +        L KKD+YA LS+P  FDDG K E+W+D+ TG++C+S
Subjt:  LGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLL-DLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNK-EVWLDRITGKICMS

Query:  ISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRGCSFEHTHGWD
        IS+KA+ ITGIDDRRYW+ I T+ES                 RF   AY+QQIWWFEV G  +  FP+  Y+L FR+ LG+  KRLGRR C+ EH HGWD
Subjt:  ISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRGCSFEHTHGWD

Query:  VKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNESVSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIVP
        +KPVRF+++TSD QQA     L+ N           G W  Y VG+F V     +T I+FSM QIDCTH+KGG+C+DSV I+P
Subjt:  VKPVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNESVSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIVP


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGGGAGCCTTTCTCTCTTACTTGGCTGAAGTTGCCAATGGCTCCACCAACGATCCTGGCCTCGGAGACATACCCGAGAGTTGCGTCGCCTGTGTTTTTCTTTACCTGAC
TCCGCCACAGATTTGCAACCTTGCGCGGCTTAACAGAGCGTTTCGCGGCGCCGCCTCGTCGGATTCCGTTTGGCAATCAAAATTGCCTTCAAATTATCAAGATCTTCTCG
ATTTGCTGCCCCCCCAACGGTATCAAAATCTGTCAAAGAAGGACATATACGCACTGCTATCTCGGCCGGTGCCATTCGATGATGGAAATAAGGAGGTGTGGCTGGACAGA
ATCACGGGAAAGATTTGCATGTCAATATCAGCTAAGGCCATGTCTATAACTGGAATTGATGATAGAAGATACTGGAATTGGATTTCGACTGAAGAGTCTCGGGGTGGTTT
GCATTTTGATGGAAGATGTATCTATGCCTCTATGGACGGGAGGTTCAATGTTGTGGCATATCTGCAGCAAATTTGGTGGTTTGAAGTAGATGGGATGGTGAAATTCCCTT
TTCCTGCTGATATCTATACACTGACCTTCAGGCTTCACCTTGGAAGGTTCTACAAGCGGCTCGGCCGACGTGGATGCAGCTTCGAGCATACTCATGGTTGGGATGTAAAG
CCTGTACGGTTCGAAATGTCTACTTCTGATGGACAGCAAGCGACACATGAATTCTGTTTAGACGAGAACAGATTTATTGATGTAAGTGAACACCACAAGCGTGGGTGTTG
GATAGAATACAAGGTAGGTGAATTCTTTGTCAACGAGTCGGTATCGACCACGGAAATTAGATTTTCCATGAAACAGATTGACTGCACGCATTCTAAAGGTGGGGTTTGTG
TAGATTCTGTATTTATAGTTCCCAGTAACTTGAAAGAGCGTAAAACATGA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGGGAGCCTTTCTCTCTTACTTGGCTGAAGTTGCCAATGGCTCCACCAACGATCCTGGCCTCGGAGACATACCCGAGAGTTGCGTCGCCTGTGTTTTTCTTTACCTGAC
TCCGCCACAGATTTGCAACCTTGCGCGGCTTAACAGAGCGTTTCGCGGCGCCGCCTCGTCGGATTCCGTTTGGCAATCAAAATTGCCTTCAAATTATCAAGATCTTCTCG
ATTTGCTGCCCCCCCAACGGTATCAAAATCTGTCAAAGAAGGACATATACGCACTGCTATCTCGGCCGGTGCCATTCGATGATGGAAATAAGGAGGTGTGGCTGGACAGA
ATCACGGGAAAGATTTGCATGTCAATATCAGCTAAGGCCATGTCTATAACTGGAATTGATGATAGAAGATACTGGAATTGGATTTCGACTGAAGAGTCTCGGGGTGGTTT
GCATTTTGATGGAAGATGTATCTATGCCTCTATGGACGGGAGGTTCAATGTTGTGGCATATCTGCAGCAAATTTGGTGGTTTGAAGTAGATGGGATGGTGAAATTCCCTT
TTCCTGCTGATATCTATACACTGACCTTCAGGCTTCACCTTGGAAGGTTCTACAAGCGGCTCGGCCGACGTGGATGCAGCTTCGAGCATACTCATGGTTGGGATGTAAAG
CCTGTACGGTTCGAAATGTCTACTTCTGATGGACAGCAAGCGACACATGAATTCTGTTTAGACGAGAACAGATTTATTGATGTAAGTGAACACCACAAGCGTGGGTGTTG
GATAGAATACAAGGTAGGTGAATTCTTTGTCAACGAGTCGGTATCGACCACGGAAATTAGATTTTCCATGAAACAGATTGACTGCACGCATTCTAAAGGTGGGGTTTGTG
TAGATTCTGTATTTATAGTTCCCAGTAACTTGAAAGAGCGTAAAACATGAGGAATTCCAAAAAGTAGTCAACCAAAGATGTTTCTGCAATCCTCCTTAGTTTACCTCAAA
GGATTATAACATGGAAATTTACAGGTTGATACCATTTCTAGGCTTTTGACATTTCGTTTGTCGTCTTGGTTTTCCTCGATGGGATATCTGGTGAAGTGGTGTACGTTTTC
AACCGCAGATTCAATAGAGTATTGTAATGGATTACAGGACAAACCCACACAACCAGATTGGTTTTGATGAGAGGCTTGAAAGCAAAAGAAGAAACAGGTTCTTCTCTTTG
ACATCCTCAAAAGTAGTATTAATGATGGACTTGTCTGGCTATGATGTGGGGAGGAAGTATAGTTATGTTTTGATTTCGTTTTCGTTTTTGTTGAACGAATTATGCAGTTA
TTGCTATGCCCCCAATGAATGAGGTCAATTCGTTTGAAGTTCGGTTCATTTACGATTGTGTTGGCTCAAATCCAGTCCCGTTTTGTCAAACTCAAAAAGTTGATCTTCAA
GTATAGTAAAACATCATTCGAGCATAGTTCAATAGATAAAATACTAATTATCGGATGTTTTGATCTCTATTCTCTAGATTTATAAACAAGTTT
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MGAFLSYLAEVANGSTNDPGLGDIPESCVACVFLYLTPPQICNLARLNRAFRGAASSDSVWQSKLPSNYQDLLDLLPPQRYQNLSKKDIYALLSRPVPFDDGNKEVWLDR
ITGKICMSISAKAMSITGIDDRRYWNWISTEESRGGLHFDGRCIYASMDGRFNVVAYLQQIWWFEVDGMVKFPFPADIYTLTFRLHLGRFYKRLGRRGCSFEHTHGWDVK
PVRFEMSTSDGQQATHEFCLDENRFIDVSEHHKRGCWIEYKVGEFFVNESVSTTEIRFSMKQIDCTHSKGGVCVDSVFIVPSNLKERKT