; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh14G002680 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh14G002680
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionRibosome production factor 2 homolog
Genome locationCmo_Chr14:1210656..1213069
RNA-Seq ExpressionCmoCh14G002680
SyntenyCmoCh14G002680
Gene Ontology termsGO:0000027 - ribosomal large subunit assembly (biological process)
GO:0000463 - maturation of LSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA) (biological process)
GO:0032774 - RNA biosynthetic process (biological process)
GO:0005730 - nucleolus (cellular component)
GO:0019843 - rRNA binding (molecular function)
InterPro domainsIPR007109 - Brix domain
IPR039770 - Ribosome biogenesis protein Rpf2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6580669.1 Ribosome production factor 2-like protein, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]7.7e-17295.82Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQ             KVGDMAIPDKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

KAG7017424.1 Ribosome production factor 2-like protein [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.3e-17195.82Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQ             KVGDMA+PDKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

XP_022934916.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita moschata]5.9e-17296.12Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQ             KVGDMAIPDKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

XP_022983029.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita maxima]3.8e-17195.22Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQ             KVGDMAIPDKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        GVKRERREAKMK+KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

XP_023540188.1 ribosome production factor 2 homolog [Cucurbita pepo subsp. pepo]3.8e-16389.55Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSR+N+GIKPFE+GGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDH IYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQ             KVGD+A+PDKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        GVKRERREAKMKN+DD PASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

TrEMBL top hitse value%identityAlignment
A0A0A0LAR1 Ribosome production factor 2 homolog1.2e-15988.66Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        ML+IRTPKN KV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTELYHLKKES+VKYSRKNDGIKPFESGGD+SLEFFSLKTDCSII+YGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        +NLVI RTY+  IYD+VEVGIENFKSMHSF YDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD FRGEVVENLNL+GLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMV+RRHRLP+DGLRKEAMKTAKD+AKKKEKNVS+D IQGKIGRIYIPDQ             KVGDMAI DKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        GVKRERREAKMKN+DDGPASKKPKEDSEKPKE+SE
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

A0A6J1F357 Ribosome production factor 2 homolog2.9e-17296.12Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQ             KVGDMAIPDKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

A0A6J1FZZ6 Ribosome production factor 2 homolog3.5e-16289.25Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSR+N+GIKPFE+GGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDH IYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQ             KVGD+A+PDKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        GVKRER EAKMKN+D+GPASKK KEDSEKPKE+SE
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

A0A6J1J655 Ribosome production factor 2 homolog1.8e-17195.22Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVIGRTYDHKIYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQ             KVGDMAIPDKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
        GVKRERREAKMK+KDDGPASKKPKEDSEKPKENSE
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENSE

A0A6J1KZU6 Ribosome production factor 2 homolog4.1e-16389.52Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        MLK+RTPKNGKV+RELEKRAPK+VETGKKTLILHGTKTSGVLN VLTE+YHLKKES+VKYSR+N+GIKPFE+GGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLVI RTYDH IYDL+EVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLD+FRGEVVEN+NLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCALR+KKSGSVVPRMELVEVGPSMD+VVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAI GKIGRIYIPDQ             KVGD+A+PDKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENS
        GVKRERREAKMKN+DD PASKKPKEDSEKPKE+S
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKPKENS

SwissProt top hitse value%identityAlignment
Q2YDN6 Ribosome production factor 2 homolog3.4e-5339.81Show/hide
Query:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        ++  PK  + +R LEKR PK+ E  K  +++ G   +  +  VL ++Y LKK   + Y +KN   +PFE    +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+ + D++E+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V N+ LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSKGV
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L SD L K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  + +               K KG+
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSKGV

Query:  KRERREAKMKNKDDGPASKKPKED
        K  +R A+ K +D+   SK+ K++
Subjt:  KRERREAKMKNKDDGPASKKPKED

Q9AWM9 Ribosome production factor 2 homolog1.3e-11867.69Show/hide
Query:  IRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL
        IR P++ + +REL K APK+VETGKKTLILHGTKTS VLN+VL +L+HLK++++VKYS+KND I+PFESGG++SLEFFSLKTDCS+IVYGSHSKKRP+NL
Subjt:  IRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNL

Query:  VIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA
        V+GRTYDH IYDLVEVG+EN+KS+ S+ YDKKL+P++GSKPF  FIGE FE+VEELKHLKEVLLDLF+GEVVENLNLAG+DRV+VCTAISP  V++ HCA
Subjt:  VIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCA

Query:  LRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSKGVK
        LRLK+SG+ +PR+ELVEVGPSMD+VVRRHR P + L+KEAMKTA D AKK  KNV++D + GK+G++YIPDQ             ++  M++ +  KG+K
Subjt:  LRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSKGVK

Query:  RERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSE
        RERREAK KNKD    SKK K + E
Subjt:  RERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSE

Q9H7B2 Ribosome production factor 2 homolog5.7e-5340.12Show/hide
Query:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        ++  PK  + +R LEKR PK+ E  K  +++ G   +  +  VL ++Y LKK   V Y +KN   +PFE    +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+ + D++E+GIENF S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V N+ LAGL+ V   TA++  K++    
Subjt:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSKGV
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L SD L K +MK  K    KK+KN+S D      GRI++  Q +  + +               K KG+
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSKGV

Query:  KRERREAKMKNKDDGPASKKPKED
        K  +R A+   +D    SK+ K++
Subjt:  KRERREAKMKNKDDGPASKKPKED

Q9JJ80 Ribosome production factor 2 homolog1.8e-5441.05Show/hide
Query:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN
        K+  PK  + +R LEKR PK+ E  K  +++ G   +  +  VL ++Y LKK   V Y +KN   +PFE    +SLEFFS K+DCS+ ++GSH+KKRP+N
Subjt:  KIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDN

Query:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC
        LVIGR YD+ + D++E+GIE F S+      K   P  G+KP + F G+ F+  E+ + LK +L+D FRG  V N+ LAGL+ V   TA++  KV+    
Subjt:  LVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHC

Query:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSKGV
         L LKKSG   PR+EL E+GPS+D+V+RR  L SD L K +MK  K    KK KN+SQD      GRI++  Q +  + +               K KG+
Subjt:  ALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSKGV

Query:  KRERREAKMKNKDDGPASKKPKED
        K  +R A+    D G  SK+ K++
Subjt:  KRERREAKMKNKDDGPASKKPKED

Q9LUG5 Ribosome production factor 2 homolog1.0e-12669.21Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M++IRTPK GK +R LE RAPK+VETGKKTLILHGTKTS  L++V+TELY LKK  +++YSR+N+ I+PFESGG++SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+GR YDH++YDL+EVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKHLKEVL DLFRGEVV+NLNL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCAL+LKKSGS+VPRMELVEVGPSMD+V+RR+RLP+D L KEAM+T+KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ +M              + DKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSE
        G KRER++AK+K+K++   +KK K  SE
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSE

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT3G23620.1 Ribosomal RNA processing Brix domain protein7.3e-12869.21Show/hide
Query:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP
        M++IRTPK GK +R LE RAPK+VETGKKTLILHGTKTS  L++V+TELY LKK  +++YSR+N+ I+PFESGG++SLEFFS KTDCSI VYGSH+KKRP
Subjt:  MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRP

Query:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT
        DNLV+GR YDH++YDL+EVGIENFKS+ +F+YDKK +P  G+KPFI FIGEGFENV ELKHLKEVL DLFRGEVV+NLNL GLDR YVC+AISP KVFLT
Subjt:  DNLVIGRTYDHKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLT

Query:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK
        HCAL+LKKSGS+VPRMELVEVGPSMD+V+RR+RLP+D L KEAM+T+KD+ KKKEKNV QDA+ GK G+IY+PDQK+ +M              + DKSK
Subjt:  HCALRLKKSGSVVPRMELVEVGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSK

Query:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSE
        G KRER++AK+K+K++   +KK K  SE
Subjt:  GVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSE


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTTGAAGATTAGAACTCCCAAGAATGGAAAAGTTAGACGAGAGCTTGAGAAACGTGCCCCCAAAATTGTTGAGACGGGGAAGAAGACGCTGATACTTCATGGCACAAA
AACAAGCGGCGTGTTGAATGCAGTACTGACGGAACTCTATCACCTGAAGAAAGAAAGTTCCGTGAAGTATTCTCGTAAGAATGATGGAATTAAACCATTTGAAAGTGGCG
GCGATTCGTCTTTGGAATTTTTCTCTCTCAAAACTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCTGATAACCTTGTCATAGGGAGAACCTATGAT
CACAAAATCTATGACCTAGTTGAGGTTGGGATTGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTCTCGCCACGGGTGGGGTCAAAGCCTTTCATTAC
TTTCATTGGGGAAGGATTTGAGAATGTGGAAGAGCTAAAGCATTTAAAGGAAGTTTTGCTTGATTTATTCCGGGGGGAGGTTGTAGAGAATTTAAATCTTGCAGGGTTGG
ACCGTGTGTATGTATGTACAGCCATCTCACCGAATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCATTGCGATTGAAGAAGTCAGGTTCAGTAGTTCCAAGAATGGAACTAGTTGAA
GTTGGTCCTTCCATGGATATGGTGGTTCGCCGCCACCGACTTCCTAGTGATGGTCTAAGGAAGGAAGCCATGAAAACAGCCAAGGATCAGGCTAAGAAGAAGGAGAAGAA
TGTTAGCCAGGATGCAATTCAGGGCAAGATCGGAAGGATCTATATTCCTGATCAAAAGGTTCATGATATGAATTCTCATATCATGTTTATCACCAAAGTTGGAGATATGG
CTATACCCGACAAATCAAAGGGAGTGAAGAGAGAACGACGTGAAGCGAAAATGAAAAATAAAGATGACGGACCAGCCTCTAAAAAACCAAAGGAAGATTCAGAAAAGCCG
AAGGAAAATTCGGAATAG
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
TTGCAGTCGCCGGAAGTGTCGATATTCTTCTGAGCATCAAAACCCTAAATCATCTCCGTCATCTCGTCGTTGTGGATCATGTTGAAGATTAGAACTCCCAAGAATGGAAA
AGTTAGACGAGAGCTTGAGAAACGTGCCCCCAAAATTGTTGAGACGGGGAAGAAGACGCTGATACTTCATGGCACAAAAACAAGCGGCGTGTTGAATGCAGTACTGACGG
AACTCTATCACCTGAAGAAAGAAAGTTCCGTGAAGTATTCTCGTAAGAATGATGGAATTAAACCATTTGAAAGTGGCGGCGATTCGTCTTTGGAATTTTTCTCTCTCAAA
ACTGATTGCAGTATTATCGTGTATGGTTCTCACTCAAAGAAACGACCTGATAACCTTGTCATAGGGAGAACCTATGATCACAAAATCTATGACCTAGTTGAGGTTGGGAT
TGAAAATTTCAAGTCAATGCATTCTTTCACATATGATAAGAAACTCTCGCCACGGGTGGGGTCAAAGCCTTTCATTACTTTCATTGGGGAAGGATTTGAGAATGTGGAAG
AGCTAAAGCATTTAAAGGAAGTTTTGCTTGATTTATTCCGGGGGGAGGTTGTAGAGAATTTAAATCTTGCAGGGTTGGACCGTGTGTATGTATGTACAGCCATCTCACCG
AATAAAGTATTTCTCACTCATTGTGCATTGCGATTGAAGAAGTCAGGTTCAGTAGTTCCAAGAATGGAACTAGTTGAAGTTGGTCCTTCCATGGATATGGTGGTTCGCCG
CCACCGACTTCCTAGTGATGGTCTAAGGAAGGAAGCCATGAAAACAGCCAAGGATCAGGCTAAGAAGAAGGAGAAGAATGTTAGCCAGGATGCAATTCAGGGCAAGATCG
GAAGGATCTATATTCCTGATCAAAAGGTTCATGATATGAATTCTCATATCATGTTTATCACCAAAGTTGGAGATATGGCTATACCCGACAAATCAAAGGGAGTGAAGAGA
GAACGACGTGAAGCGAAAATGAAAAATAAAGATGACGGACCAGCCTCTAAAAAACCAAAGGAAGATTCAGAAAAGCCGAAGGAAAATTCGGAATAGTTCAATATTAGTGG
AATAGTTTTGATCCGATTCTCCTCTTGCTAACTTGAGTCAGCTGTTGTGAGTTGCAGGGTAGCACGCCAAATATATGGAGAGAGCAGACAAATTATTTATTGCTTATATA
CAATTTTGTTTTTGTTCTTCAATCTGATTCTTACATGCTGAGCCTATCTTTTATCATCTTAATCATTCAAGCTCTTTCAAAGTTTGATCGTGAACCTCATTGATTCTGTT
GTTGTGTAGCAAACAGAAGTTCTTTCAAAGTATGTATATGTTAGCAAGATGAGCTTACGATAGCATTGCAGTGCA
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MLKIRTPKNGKVRRELEKRAPKIVETGKKTLILHGTKTSGVLNAVLTELYHLKKESSVKYSRKNDGIKPFESGGDSSLEFFSLKTDCSIIVYGSHSKKRPDNLVIGRTYD
HKIYDLVEVGIENFKSMHSFTYDKKLSPRVGSKPFITFIGEGFENVEELKHLKEVLLDLFRGEVVENLNLAGLDRVYVCTAISPNKVFLTHCALRLKKSGSVVPRMELVE
VGPSMDMVVRRHRLPSDGLRKEAMKTAKDQAKKKEKNVSQDAIQGKIGRIYIPDQKVHDMNSHIMFITKVGDMAIPDKSKGVKRERREAKMKNKDDGPASKKPKEDSEKP
KENSE