; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; ; CuGenDBv2

CmoCh14G005800 (gene) of Cucurbita moschata (Rifu) v1 genome

Gene IDCmoCh14G005800
OrganismCucurbita moschata Rifu (Cucurbita moschata (Rifu) v1)
DescriptionCystathionine gamma-synthase
Genome locationCmo_Chr14:2954403..2958241
RNA-Seq ExpressionCmoCh14G005800
SyntenyCmoCh14G005800
Gene Ontology termsGO:0009086 - methionine biosynthetic process (biological process)
GO:0019346 - transsulfuration (biological process)
GO:0003962 - cystathionine gamma-synthase activity (molecular function)
GO:0030170 - pyridoxal phosphate binding (molecular function)
InterPro domainsIPR000277 - Cys/Met metabolism, pyridoxal phosphate-dependent enzyme
IPR015421 - Pyridoxal phosphate-dependent transferase, major domain
IPR015422 - Pyridoxal phosphate-dependent transferase, small domain
IPR015424 - Pyridoxal phosphate-dependent transferase
IPR044639 - Cystathionine gamma-synthase 1/2


Homology Show/hide homology
GenBank top hitse value%identityAlignment
KAG6580951.1 Cystathionine gamma-synthase 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. sororia]2.6e-14486.64Show/hide
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KAG7017695.1 Cystathionine gamma-synthase 1, chloroplastic, partial [Cucurbita argyrosperma subsp. argyrosperma]1.2e-14487.5Show/hide
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XP_022934695.1 cystathionine gamma-synthase 1, chloroplastic-like isoform X1 [Cucurbita moschata]1.8e-14587.62Show/hide
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XP_022934696.1 cystathionine gamma-synthase 1, chloroplastic-like isoform X2 [Cucurbita moschata]1.8e-14587.62Show/hide
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XP_023528162.1 cystathionine gamma-synthase 1, chloroplastic-like [Cucurbita pepo subsp. pepo]2.0e-14486.97Show/hide
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A0A0A0LG06 Uncharacterized protein5.8e-14284.36Show/hide
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A0A5A7UJ70 Cystathionine gamma-synthase 15.8e-14284.04Show/hide
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A0A6J1F2I5 cystathionine gamma-synthase 1, chloroplastic-like isoform X28.7e-14687.62Show/hide
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A0A6J1F8G5 cystathionine gamma-synthase 1, chloroplastic-like isoform X18.7e-14687.62Show/hide
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A0A6J1J077 cystathionine gamma-synthase 1, chloroplastic-like3.6e-14486.32Show/hide
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A2RM21 Cystathionine beta-lyase1.6e-5640.6Show/hide
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P0A4K2 Cystathionine beta-lyase1.6e-5640.6Show/hide
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P55217 Cystathionine gamma-synthase 1, chloroplastic1.7e-12773.94Show/hide
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Q1M0P5 Cystathionine gamma-synthase1.5e-5438.87Show/hide
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          L LGAD+V+HS TKY+GGH+DV+AG V + +  L  EI    + IGG L P  ++L+ RG+KTL LR+Q    +AL +A+ LE HPK++ VYYPGLP+
Subjt:  KALSLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAGCV-SGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVYYPGLPS

Query:  HPEHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSL-----------------------DLHQTERLKYGIKDNLVRFSIGIEDFEDLKADILQALDA
        HP + LAK+QM GF G++SF + K   + +  ++ L L                        + +T+R   GI+D LVR S+GIE  +DL  D+ QA   
Subjt:  HPEHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSL-----------------------DLHQTERLKYGIKDNLVRFSIGIEDFEDLKADILQALDA

Query:  I
        I
Subjt:  I

Q9C876 Probable cystathionine gamma-synthase 22.5e-10561.76Show/hide
Query:  MCASTMMLLALVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGT
        M AS +MLLALVP  GHIV T DCY++TRIF+E  L K+GIT T ID  D+  L+  +  + VSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVS++CHR G LVCID T
Subjt:  MCASTMMLLALVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGT

Query:  FATPLNQKALSLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAGCVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVY
         ATP+NQK L+LGADLV HSATKYIGGHND LAG +SGS++LVS+IRNLH ++GG LNPNAAYL+IRGMKT+HLRV+QQNS+ ++MA++LEAHPK+  VY
Subjt:  FATPLNQKALSLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAGCVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVY

Query:  YPGLPSHPEHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSL----------------------DLHQTERLKYGIKDNLVRFSIGIEDFEDLKADIL
        Y GLPSHPEH +AKRQMTG GG++SFE+          +  L +                      D+ + ERLK G +DNLVRFS GIEDFED+KAD+L
Subjt:  YPGLPSHPEHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSL----------------------DLHQTERLKYGIKDNLVRFSIGIEDFEDLKADIL

Query:  QALDAI
        QAL+ I
Subjt:  QALDAI

Arabidopsis top hitse value%identityAlignment
AT1G33320.1 Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein1.7e-10661.76Show/hide
Query:  MCASTMMLLALVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGT
        M AS +MLLALVP  GHIV T DCY++TRIF+E  L K+GIT T ID  D+  L+  +  + VSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVS++CHR G LVCID T
Subjt:  MCASTMMLLALVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGT

Query:  FATPLNQKALSLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAGCVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVY
         ATP+NQK L+LGADLV HSATKYIGGHND LAG +SGS++LVS+IRNLH ++GG LNPNAAYL+IRGMKT+HLRV+QQNS+ ++MA++LEAHPK+  VY
Subjt:  FATPLNQKALSLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAGCVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVY

Query:  YPGLPSHPEHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSL----------------------DLHQTERLKYGIKDNLVRFSIGIEDFEDLKADIL
        Y GLPSHPEH +AKRQMTG GG++SFE+          +  L +                      D+ + ERLK G +DNLVRFS GIEDFED+KAD+L
Subjt:  YPGLPSHPEHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSL----------------------DLHQTERLKYGIKDNLVRFSIGIEDFEDLKADIL

Query:  QALDAI
        QAL+ I
Subjt:  QALDAI

AT3G01120.1 Pyridoxal phosphate (PLP)-dependent transferases superfamily protein1.2e-12873.94Show/hide
Query:  MCASTMMLLALVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGT
        MCAST+MLLALVPAGGHIVTTTDCYRKTRIF+E  LPK+GIT T IDPAD+  LE A+ E  VSLFFTESPTNPFLRCVDI+LVS++CH+ G LVCIDGT
Subjt:  MCASTMMLLALVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGT

Query:  FATPLNQKALSLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAGCVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVY
        FATPLNQKAL+LGADLV+HSATKYIGGHNDVLAGC+ GSLKLVSEIRNLHHV+GG LNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNS+A RMA++LEAHPK+  VY
Subjt:  FATPLNQKALSLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAGCVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVY

Query:  YPGLPSHPEHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSL-----------------------DLHQTERLKYGIKDNLVRFSIGIEDFEDLKADI
        YPGLPSHPEH LAKRQMTGFGGVVSFE+    +     +  L +                       DL Q ERLKYGIKDNLVRFS G+EDFED+KADI
Subjt:  YPGLPSHPEHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSL-----------------------DLHQTERLKYGIKDNLVRFSIGIEDFEDLKADI

Query:  LQALDAI
        LQAL+AI
Subjt:  LQALDAI

AT3G57050.1 cystathionine beta-lyase1.4e-4233.77Show/hide
Query:  LVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGTFATPLNQKAL
        L+  G  IV   D Y  +   +  ++P+ G+    ++   ++ +  A+      L + ESPTNP  +  DI+ +SEM H  GALV +D +  +P+  + L
Subjt:  LVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGTFATPLNQKAL

Query:  SLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAG--CVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVYYPGLPSHP
         LGAD+V+HSATK+I GH+DV+AG   V G  KL  E+  L +  G  L P   +L +RG+KT+ LR+++Q  +A ++A  L +HP++K VYY GLP HP
Subjt:  SLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAG--CVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVYYPGLPSHP

Query:  EHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSLDLHQTERLKY---------------------------------GIKDNLVRFSIGIEDFEDLKA
         H+L   Q  G G V SF               ++L  H  E  KY                                 G+ ++LVR S GIED +DL +
Subjt:  EHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSLDLHQTERLKY---------------------------------GIKDNLVRFSIGIEDFEDLKA

Query:  DI
        D+
Subjt:  DI

AT3G57050.2 cystathionine beta-lyase1.4e-4233.77Show/hide
Query:  LVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGTFATPLNQKAL
        L+  G  IV   D Y  +   +  ++P+ G+    ++   ++ +  A+      L + ESPTNP  +  DI+ +SEM H  GALV +D +  +P+  + L
Subjt:  LVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGTFATPLNQKAL

Query:  SLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAG--CVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVYYPGLPSHP
         LGAD+V+HSATK+I GH+DV+AG   V G  KL  E+  L +  G  L P   +L +RG+KT+ LR+++Q  +A ++A  L +HP++K VYY GLP HP
Subjt:  SLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAG--CVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVYYPGLPSHP

Query:  EHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSLDLHQTERLKY---------------------------------GIKDNLVRFSIGIEDFEDLKA
         H+L   Q  G G V SF               ++L  H  E  KY                                 G+ ++LVR S GIED +DL +
Subjt:  EHNLAKRQMTGFGGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSLDLHQTERLKY---------------------------------GIKDNLVRFSIGIEDFEDLKA

Query:  DI
        D+
Subjt:  DI

AT3G57050.3 cystathionine beta-lyase1.3e-3738.73Show/hide
Query:  LVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGTFATPLNQKAL
        L+  G  IV   D Y  +   +  ++P+ G+    ++   ++ +  A+      L + ESPTNP  +  DI+ +SEM H  GALV +D +  +P+  + L
Subjt:  LVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGTFATPLNQKAL

Query:  SLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAG--CVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVYYPGLPSHP
         LGAD+V+HSATK+I GH+DV+AG   V G  KL  E+  L +  G  L P   +L +RG+KT+ LR+++Q  +A ++A  L +HP++K VYY GLP HP
Subjt:  SLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAG--CVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVYYPGLPSHP

Query:  EHNL
         H+L
Subjt:  EHNL


Sequences Show/hide sequences
CDS sequenceShow/hide CDS sequence
ATGTGTGCCAGCACGATGATGCTGCTGGCGTTGGTTCCGGCTGGAGGGCATATCGTGACGACCACAGATTGCTACAGGAAGACGAGAATTTTTATTGAGACCTTACTTCC
CAAAATGGGAATCACGGCTACCACCATTGATCCTGCAGATATGAACGCCCTAGAAGTAGCTCTGAAAGAGAATAATGTTTCTCTTTTCTTCACTGAATCCCCAACTAATC
CATTTCTGAGATGCGTTGACATTAAACTCGTTTCAGAGATGTGTCATCGACATGGAGCATTGGTGTGCATTGATGGTACATTTGCCACACCATTGAACCAGAAGGCACTT
TCACTCGGGGCTGACCTGGTTCTTCACTCTGCCACCAAGTATATTGGGGGCCACAATGATGTCCTTGCTGGTTGTGTAAGTGGTTCTCTGAAACTGGTTTCCGAGATTCG
GAATCTTCATCATGTGATAGGCGGTGCCTTAAATCCAAATGCTGCTTACTTGATTATACGAGGCATGAAGACGTTGCATCTTCGTGTTCAGCAGCAGAATTCCTCAGCTC
TTAGGATGGCAAAGCTTTTAGAGGCTCATCCTAAGATCAAATGTGTTTATTACCCTGGACTGCCTAGTCATCCCGAGCACAATCTTGCTAAAAGGCAGATGACTGGTTTT
GGGGGCGTAGTTAGCTTCGAGGTAAGGAAAACGACCGATGATCCATCTCATCATTTGAAGGGTCTGTCCCTGGATCTTCATCAGACAGAGAGGCTGAAGTATGGGATAAA
GGACAACTTGGTGCGCTTCAGCATTGGAATTGAAGACTTCGAGGATTTGAAGGCTGATATTCTGCAGGCTCTTGATGCCATTTAA
mRNA sequenceShow/hide mRNA sequence
ATGTGTGCCAGCACGATGATGCTGCTGGCGTTGGTTCCGGCTGGAGGGCATATCGTGACGACCACAGATTGCTACAGGAAGACGAGAATTTTTATTGAGACCTTACTTCC
CAAAATGGGAATCACGGCTACCACCATTGATCCTGCAGATATGAACGCCCTAGAAGTAGCTCTGAAAGAGAATAATGTTTCTCTTTTCTTCACTGAATCCCCAACTAATC
CATTTCTGAGATGCGTTGACATTAAACTCGTTTCAGAGATGTGTCATCGACATGGAGCATTGGTGTGCATTGATGGTACATTTGCCACACCATTGAACCAGAAGGCACTT
TCACTCGGGGCTGACCTGGTTCTTCACTCTGCCACCAAGTATATTGGGGGCCACAATGATGTCCTTGCTGGTTGTGTAAGTGGTTCTCTGAAACTGGTTTCCGAGATTCG
GAATCTTCATCATGTGATAGGCGGTGCCTTAAATCCAAATGCTGCTTACTTGATTATACGAGGCATGAAGACGTTGCATCTTCGTGTTCAGCAGCAGAATTCCTCAGCTC
TTAGGATGGCAAAGCTTTTAGAGGCTCATCCTAAGATCAAATGTGTTTATTACCCTGGACTGCCTAGTCATCCCGAGCACAATCTTGCTAAAAGGCAGATGACTGGTTTT
GGGGGCGTAGTTAGCTTCGAGGTAAGGAAAACGACCGATGATCCATCTCATCATTTGAAGGGTCTGTCCCTGGATCTTCATCAGACAGAGAGGCTGAAGTATGGGATAAA
GGACAACTTGGTGCGCTTCAGCATTGGAATTGAAGACTTCGAGGATTTGAAGGCTGATATTCTGCAGGCTCTTGATGCCATTTAAAGCCTAAGCACTGCCCCATTCCAAA
TACAGATAATCAAGTCCTCTCTCTGTTTATTTGTCATCATCTTGCTTTGGTCTTGAGTGGTTGGTGCGTCGATTGAATCCCTTATCCCCATTCCCTCAGGAACAAAAAAT
AAACTCAGACAGACATTGTTGTTATTTTCTTTGACAAAAGACACAAGGTCTTTATTTTTTTACTACTGAAATAAGGTGGTTAGTCGTTACTATATGCATTTATGAACGGT
AGAAAAGTCTTTTAAAGGTAGAAAAGTCTTTTAAAACATTTCAAAATGATGTCACAAACTTAAACATTTAAAAAAAAAAATGATATTATTAATAGCAATACAG
Protein sequenceShow/hide protein sequence
MCASTMMLLALVPAGGHIVTTTDCYRKTRIFIETLLPKMGITATTIDPADMNALEVALKENNVSLFFTESPTNPFLRCVDIKLVSEMCHRHGALVCIDGTFATPLNQKAL
SLGADLVLHSATKYIGGHNDVLAGCVSGSLKLVSEIRNLHHVIGGALNPNAAYLIIRGMKTLHLRVQQQNSSALRMAKLLEAHPKIKCVYYPGLPSHPEHNLAKRQMTGF
GGVVSFEVRKTTDDPSHHLKGLSLDLHQTERLKYGIKDNLVRFSIGIEDFEDLKADILQALDAI